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Oryza sativa
cluster # 1588 cluster # 1588       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1588#0 length = 1598 sequences # 2  

consensusID : consensus_1588#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1598
fasta sequence
                              [TAGCCATTGGTTACCTTGCTCAGGCTATTGGTTTAGTCACAGCTGATGCTGGTCGCACGGCTTTCATTTCGTCCCTCACGGTGATCATTGTCCCTTTCTTGGATGGGATCCTTGGAGCAGAAATACCTGCCTATACATGGATTGGAGCACTTTTATCCCTTATTGGGGTTGGTATTCTGGAGTTAAGTGGTTCACCGCCATGTGTCGGTGATCTTCTGAACCTCCTTAGTGCCTTTGGTTTTGCAATTCATATGCTCAGGACTGAGCATATTTCCCGAAATATGAAGAAAGAGAATTTTCCAGCTCTTGTTGGATGCCAGGTGCTTGTTGTAGCATTTGTATCTGCAGTCTCATTCTTTATTAAATGCTCCGCCAAGAATGTGCACCAGTGGACTTCACAATTACAGTCACCGATGAAGTTATTTGGTGTGATGATACAGTTTCCCTGGTTGTCAATACTATACACAGGCATATTCTCAACTACCTTTTGTTTATGGGCAGAGGTGGCTGCTATGCGTGATGTATCAGCTACGGAAACTGCAATAATTTATGGTCTGGAACCTGTATGGGGTGCAGCTTTTGCATGGGCTATGCTTGGTGAGAGATGGGGCATGACAGGATTTGTTGGAGCTATCTTCATCATAGCTGGTAGCTTTATGGTTCAGATACTGGGATCATTTCCTGATGTATCTAGAGGGGACAGTTGACATGAAAATTGAAGAAGCAGATGAACCATTTTTTCATAAATAATTCAGCGAACTCTTATTAGTGATGATTGAAGTGTTGCTACCTAATAAGAAAGTAAATAGCTAGCATGACAGAGGAATCAAAGTTCGCTGCCTCAACGAAAAGTAAATAGCTAGCATGACAGAGGAATCAAAGTTCGCTGCCTCAACGAAGATAAAGGTGGCTTAGTAGTGACAGCAGCAAGAAGGTGCCTTGGATTAACTACCTGTTGGCTGGAGATAAGCAAAATTTTGGTATGCATAGCTTGACTTGAACATGCCGAGGCTTCATTCGACTAATCGGGTGGGATAAGATATAATGTATTACCCCTGTTCTCAAAAGAATTAATTCACTTTTATACACGAATCTGGACAAGTGCCTGTCAGATTCGTGTTGAAAAGTGAACTCTCTTGTGACGGATGTAGTAGGGTGTTTTTTTTTTATATCGACAACATTTGTTTTGAGTGTAAATTCAACCACATGATAATGAATGGGCAGTAGCAGTATCGAGTGTCTTTCCTTCAGGCCCTGTCGTCTTTCATCGTCATCGAGCTTGTCTCGCAGCAGAGGATCAGAAAACATGTCACCGTTCATCGTCAAGCGTGTCTCGCAGCAATCTGCCAGAAACATGTCTATCTTTCATGGACATCAGAGACACCTCCAGAGCCTGCACAAGTGTACGACTCTGTCCTCCAGCAATGGTGCCCACTGCCCTCCAAGGCTTCTCAGCAACGTATCCCTGCAAACATTATCCATTGCTACAACGACAGCATCTACCATCACCTGTGTGCCATAGTAAACCTCTCCTCTCACAAACTTCTCAATTTTTTTTTCAGATATGGACAATCTGATTTATTTTCATCGCCTCATTG]

[+] EMBL CF307011             [TAGCCATTGGTTACCTTGCTCAGGCTATTGGTTTAGTCACAGCTGATGCTGGTCGCACGGCTTTCATTTCGTCCCTCACGGTGATCATTGTCCCTTTCTTGGATGGGATCCTTGGAGCAGAAATACCTGCCTATACATGGATTGGAGCACTTTTATCCCTTATTGGGGTTGGTATTCTGGAGTTAAGTGGTTCACCGCCATGTGTCGGTGATCTTCTGAACCTCCTTAGTGCCTTTGGTTTTGCAATTCATATGCTCAGGACTGAGCATATTTCCCGAAATATGAAGAAAGAGAATTTTCCAGCTCTTGTTGGATGCCAGGTGCTTGTTGTAGCATTTGTATCTGCAGTCTCATTCTTTATTAAATGCTCCGCCAAGAATGTGCACCAGTGGACTTCACAATTACAGTCACCGATGAAGTTATTTGGTGTGATGATACAGTTTCCCTGGTTGTCAATACTATACACAGGCATATTCTCAACTACCTTTTGTTTATGGGCAGAGGTGGCTGCTATGCGTGATGTATCAGCTACGGAAACTGCAATAATTTATGGTCTGGAACCTGTATGGGGTGCAGCTTTTGCATGGGCTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL AK058415             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CCAAGAATGTGCACCAGTGGACTTCACAATTACAGTCACCGATGAAGTTATTTGGTGTGATGATACAGTTTCCCTGGTTGTCAATACTATACACAGGCATATTCTCAACTACCTTTTGTTTATGGGCAGAGGTGGCTGCTATGCGTGATGTATCAGCTACGGAAACTGCAATAATTTATGGTCTGGAACCTGTATGGGGTGCAGCTTTTGCATGGGCTATGCTTGGTGAGAGATGGGGCATGACAGGATTTGTTGGAGCTATCTTCATCATAGCTGGTAGCTTTATGGTTCAGATACTGGGATCATTTCCTGATGTATCTAGAGGGGACAGTTGACATGAAAATTGAAGAAGCAGATGAACCATTTTTTCATAAATAATTCAGCGAACTCTTATTAGTGATGATTGAAGTGTTGCTACCTAATAAGAAAGTAAATAGCTAGCATGACAGAGGAATCAAAGTTCGCTGCCTCAACGAAAAGTAAATAGCTAGCATGACAGAGGAATCAAAGTTCGCTGCCTCAACGAAGATAAAGGTGGCTTAGTAGTGACAGCAGCAAGAAGGTGCCTTGGATTAACTACCTGTTGGCTGGAGATAAGCAAAATTTTGGTATGCATAGCTTGACTTGAACATGCCGAGGCTTCATTCGACTAATCGGGTGGGATAAGATATAATGTATTACCCCTGTTCTCAAAAGAATTAATTCACTTTTATACACGAATCTGGACAAGTGCCTGTCAGATTCGTGTTGAAAAGTGAACTCTCTTGTGACGGATGTAGTAGGGTGTTTTTTTTTTATATCGACAACATTTGTTTTGAGTGTAAATTCAACCACATGATAATGAATGGGCAGTAGCAGTATCGAGTGTCTTTCCTTCAGGCCCTGTCGTCTTTCATCGTCATCGAGCTTGTCTCGCAGCAGAGGATCAGAAAACATGTCACCGTTCATCGTCAAGCGTGTCTCGCAGCAATCTGCCAGAAACATGTCTATCTTTCATGGACATCAGAGACACCTCCAGAGCCTGCACAAGTGTACGACTCTGTCCTCCAGCAATGGTGCCCACTGCCCTCCAAGGCTTCTCAGCAACGTATCCCTGCAAACATTATCCATTGCTACAACGACAGCATCTACCATCACCTGTGTGCCATAGTAAACCTCTCCTCTCACAAACTTCTCAATTTTTTTTTCAGATATGGACAATCTGATTTATTTTCATCGCCTCATTG]


>consensus_1588#0 TAGCCATTGGTTACCTTGCTCAGGCTATTGGTTTAGTCACAGCTGATGCTGGTCGCACGG CTTTCATTTCGTCCCTCACGGTGATCATTGTCCCTTTCTTGGATGGGATCCTTGGAGCAG AAATACCTGCCTATACATGGATTGGAGCACTTTTATCCCTTATTGGGGTTGGTATTCTGG AGTTAAGTGGTTCACCGCCATGTGTCGGTGATCTTCTGAACCTCCTTAGTGCCTTTGGTT TTGCAATTCATATGCTCAGGACTGAGCATATTTCCCGAAATATGAAGAAAGAGAATTTTC CAGCTCTTGTTGGATGCCAGGTGCTTGTTGTAGCATTTGTATCTGCAGTCTCATTCTTTA TTAAATGCTCCGCCAAGAATGTGCACCAGTGGACTTCACAATTACAGTCACCGATGAAGT TATTTGGTGTGATGATACAGTTTCCCTGGTTGTCAATACTATACACAGGCATATTCTCAA CTACCTTTTGTTTATGGGCAGAGGTGGCTGCTATGCGTGATGTATCAGCTACGGAAACTG CAATAATTTATGGTCTGGAACCTGTATGGGGTGCAGCTTTTGCATGGGCTATGCTTGGTG AGAGATGGGGCATGACAGGATTTGTTGGAGCTATCTTCATCATAGCTGGTAGCTTTATGG TTCAGATACTGGGATCATTTCCTGATGTATCTAGAGGGGACAGTTGACATGAAAATTGAA GAAGCAGATGAACCATTTTTTCATAAATAATTCAGCGAACTCTTATTAGTGATGATTGAA GTGTTGCTACCTAATAAGAAAGTAAATAGCTAGCATGACAGAGGAATCAAAGTTCGCTGC CTCAACGAAAAGTAAATAGCTAGCATGACAGAGGAATCAAAGTTCGCTGCCTCAACGAAG ATAAAGGTGGCTTAGTAGTGACAGCAGCAAGAAGGTGCCTTGGATTAACTACCTGTTGGC TGGAGATAAGCAAAATTTTGGTATGCATAGCTTGACTTGAACATGCCGAGGCTTCATTCG ACTAATCGGGTGGGATAAGATATAATGTATTACCCCTGTTCTCAAAAGAATTAATTCACT TTTATACACGAATCTGGACAAGTGCCTGTCAGATTCGTGTTGAAAAGTGAACTCTCTTGT GACGGATGTAGTAGGGTGTTTTTTTTTTATATCGACAACATTTGTTTTGAGTGTAAATTC AACCACATGATAATGAATGGGCAGTAGCAGTATCGAGTGTCTTTCCTTCAGGCCCTGTCG TCTTTCATCGTCATCGAGCTTGTCTCGCAGCAGAGGATCAGAAAACATGTCACCGTTCAT CGTCAAGCGTGTCTCGCAGCAATCTGCCAGAAACATGTCTATCTTTCATGGACATCAGAG ACACCTCCAGAGCCTGCACAAGTGTACGACTCTGTCCTCCAGCAATGGTGCCCACTGCCC TCCAAGGCTTCTCAGCAACGTATCCCTGCAAACATTATCCATTGCTACAACGACAGCATC TACCATCACCTGTGTGCCATAGTAAACCTCTCCTCTCACAAACTTCTCAATTTTTTTTTC AGATATGGACAATCTGATTTATTTTCATCGCCTCATTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)