Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 16085 cluster # 16085       Sequences # 28       consensus # 6


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_16085#0 length = 989 sequences # 12  
consensus_16085#1 length = 980 sequences # 1  
consensus_16085#2 length = 796 sequences # 4  
consensus_16085#3 length = 505 sequences # 9  
consensus_16085#4 length = 262 sequences # 1  
consensus_16085#5 length = 257 sequences # 1  

consensusID : consensus_16085#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 989
fasta sequence
                              [TTGCGGTGGATACCTAGGTACCCAGAGACGAGGAAGGGCGTAGCAAGCGACGAAATGCTTCGGGGAGTTGAAAATACACAGCTGCACTACTTGCACTGAAGTAGCTAGAGCTTGCAAGTAAAGATGGCTACCACCAAGCATTTTGTGTTGCTAATAATCCTTGTCCTCCTTAGCATAGGAATGACCACTAGTGCTAGAACTCTCTTGGGTTATGGCATTGGAGGAGAAGGTGGCGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGTAGCGGCGGAGGAGGTGGTTATGGTGGATCAGGGTACGGCTCTGGATCGGGGTATGGCGAGGGAGGTGGTGCTGGCGCTGGTGGGTATGGCCATGGTGGTGGTGGAGGCGGCGGCGGTGGTGAAGGTGGTGGTTCTGGCTCCGGGTATGGTTCTGGACAAGGTTCTGGATCAGGATATGGCTCTGGTGCTTTTGGAGCTGGTGGTTATGGAAGCGGTGGAGGTGG-CGGAGGTGGTGGTGCAGGATCT-GGGTATGGCTCAGGTGAGGGTTATGGCTCTGGATATGGATCAGGTGCAGGTGGTGCTAGTGGTGGTGGAGGTGGACATGGTGGTGGTGGCGGCGGCGGTCAAGGTGGTGGGTATGGTAGCGGCTCAGGCTATGGATCTGGCAGCGGATATGGTCAAGGTGGCGGTGCTTATGGTGGAGGATATGGAAGCGGTGGTGGTGGTGNA-GCGGCGGCGGCCAAGGCGGAGG-ATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGGTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAAGGTTGAAATACAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK061298             [TTGCGGTGGATACCTAGGTACCCAGAGACGAGGAAGGGCGTAGCAAGCGACGAAATGCTTCGGGGAGTTGAAAATACACAGCTGCACTACTTGCACTGAAGTAGCTAGAGCTTGCAAGTAAAGATGGCTACCACCAAGCATTTTGTGTTGCTAATAATCCTTGTCCTCCTTAGCATAGGAATGACCACTAGTGCTAGAACTCTCTTGGGTTATGGCATTGGAGGAGAAGGTGGCGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGTAGCAGCGGAGGAGGTGGTTATGGTGGATCAGGGTACGGCTCTGGATCGGGGTATGGCGAGGGAGGTGGTGCTGGCGCTGGTGGGTATGGCCATGGTGGTGGTGGAGGCGGCGGCGGTGGTGAAGGTGGTGGTTCTGGCTCCGGGTATGGTTCTGGACAAGGTTCTGGATCAGGATATGGCTCTGGTGCTTTTGGAGCTGGTGGTTATGGAAGCGGTGGAGGTGG CGGAGGTGGTGGTGCAGGATCT GGGTATGGCTCAGGTGAGGGTTATGGCTCTGGATATGGATCAGGTGCAGGTGGTGCTAGTGGTGGTGGAGGTGGACATGGTGGTGGTGGCGGCGGCGGTCAAGGTGGTGGGTATGGTAGCGGCTCAGGCTATGGATCTGGCAGCGGATATGGTCAAGGTGGCGGTGCTTATGGTGGAGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CF313353             [                                                                GAGTAGAAAATACACAGCTGCACTACTTGCACTGAAGTAGCTAGAGCTTGCAAGTAAAGATGGCTACCACCAAGCATTTTGTGTTGCTAATAATCCTTGTCCTCCTTAGCATAGGAATGACCACTAGTGCTAGAACTCTCTTGGGTTATGGCATTGGAGGAGAAGGTGGCGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGTAGCGGCGGAGGAGGTGGTTATGGTGGATCAGGGTACGGCTCTGGATCGGGGTATGGCGAGGGAGGTGGTGCTGGCGCTGGTGGGTATGGCCATGGTGGTGGTGGAGGCGGCGGCGGTGGTGAAGGTGGTGGTTCTGGCTCCGGGTATGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL AU101265             [                                                                                                                                               TGTGTTGCTAATAATCCTTGTCCTCCTTAGCATAGGAATGACCACTAGTGCTAGAACTCTCTTGGGTTATGGCATTGGAGGAGAAGGTGGCGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGTAGCGGCGGAGGAGGTGGTTATGGTGGATCAGGGTACGGCTCTGGATCGGGGTATGGCGAGGGAGGTGGTGCTGGCGCTGGTGGGTATGGCCATGGTGGTGGTGGAGGCGGCGGCGGTGGTGAAGGTGGTGGTTCTGGCTCCGGGTATGGTTCTGGACAAGGTTCTGGATCAGGATATGGCTCTGGTGCTTTTGGAGCTGGTGGTTATGGAAGCGGTGGAGGTGGCCGGAGGTGGTGGTGCAGGATCTNGGGTATGGCTCAGGTGAGGG TATGGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL AU164190             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CGGCGGCGGTCAAGGTGGTGGGTATGGTAGCGGCTCAGGCTATGGATCTGGCAGCGGATATGGTCAAGGTGGCGGTGCTTATGGTGGAGGATATGGAAGCGGTGGTGGTGGTGNAGGCGGCGGCGGCCAAGGCGGAGG ATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGGTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAAGGTTGAAATACAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL AU182092             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  nCGGTGGTGGTGGTGGA GCGGCGGCGGCCAAGGCGGAGG ATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGGTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAAGGTTGAAATACAAAAAAA      ]
[-] EMBL D42550               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tggacGGTGGTCG GCA GCTGCGGCGGCGCGGGCGGTGGTCGCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGGTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGNTTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAA                            ]
[+] EMBL AU161899             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CAAGGCGGAGG ATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGGTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAAGGTTGAAATACAAAAAAA      ]
[+] EMBL AU161806             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CAAGGCGGAGG ATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGGTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCGTGGGACTTGTGCACTCATATATNATGATTGTNT ACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCNCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAAGGTTGAANTACAAAAAAA      ]
[-] EMBL CF313354             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAGGCGGAGG ATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGGTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAAGGTTGAAATACAAAAAA       ]
[+] EMBL AU097587             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AGGCGGAGG ATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGGTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAAGGTTGAAATACAAAAA        ]
[+] EMBL AU223400             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GG ATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGGTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAAGGTTGAAATACAAAAAAAA     ]
[+] EMBL AU223310             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GG ATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGGTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAAGGTTGAAATACAAAAAA       ]


>consensus_16085#0 TTGCGGTGGATACCTAGGTACCCAGAGACGAGGAAGGGCGTAGCAAGCGACGAAATGCTT CGGGGAGTTGAAAATACACAGCTGCACTACTTGCACTGAAGTAGCTAGAGCTTGCAAGTA AAGATGGCTACCACCAAGCATTTTGTGTTGCTAATAATCCTTGTCCTCCTTAGCATAGGA ATGACCACTAGTGCTAGAACTCTCTTGGGTTATGGCATTGGAGGAGAAGGTGGCGGTGGT GGAGGAGGAGGTGGTAGCGGCGGAGGAGGTGGTTATGGTGGATCAGGGTACGGCTCTGGA TCGGGGTATGGCGAGGGAGGTGGTGCTGGCGCTGGTGGGTATGGCCATGGTGGTGGTGGA GGCGGCGGCGGTGGTGAAGGTGGTGGTTCTGGCTCCGGGTATGGTTCTGGACAAGGTTCT GGATCAGGATATGGCTCTGGTGCTTTTGGAGCTGGTGGTTATGGAAGCGGTGGAGGTGGC GGAGGTGGTGGTGCAGGATCTGGGTATGGCTCAGGTGAGGGTTATGGCTCTGGATATGGA TCAGGTGCAGGTGGTGCTAGTGGTGGTGGAGGTGGACATGGTGGTGGTGGCGGCGGCGGT CAAGGTGGTGGGTATGGTAGCGGCTCAGGCTATGGATCTGGCAGCGGATATGGTCAAGGT GGCGGTGCTTATGGTGGAGGATATGGAAGCGGTGGTGGTGGTGNAGCGGCGGCGGCCAAG GCGGAGGATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGGTGGTG GGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCGTGGGACTTGTGCACTCAT ATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATG CTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAA AATAAGGTTGAAATACAAAAAAAAAAAAA



consensusID : consensus_16085#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 980
fasta sequence
                              [TTCTCTCCCTCACTCACTCTCTCCCCCTCATCTTCCTTCTCTCCCTCCTCACTCTCTCCCTCACAGATCGGGCCATGGCGTCCTCCCGAGCGCCGGCCGCTGTTGCCTCCCCACCTCCCGACCGGCGGCCGGCGCCGCCTCCCCTCTTCCCGACCGCCGGCCGCCGGATCTAGCCTACGAGGTGCGGACCCGACCACCACGGCCTCTTCCCCGACCGTCGGTCACCGCCGCCTCCCCGCTTCCCGAGCGCTGGCCGCTGACGCGTCCCCGCGTCCCGACCGTCGGCCGCCGCCGCCTCCCCACCTCCCAACCGTCGGTCGCCGGATCTGGCCGCCGCGCGGCCTCTCCCCCGACCGTCAGTCGCCGCCGCCTCCCTGCCTCCCGAGCGCCGGCCACTGACTCGTCCCCGCCTCCCGACCATCGGCTGTCGCTGCCTCCCCGCCACCCGACCGCCGGCCGCCGGATCTGGCCTATGAGGCGTGGATCCGACCACCGCGGCCACGACCCCAACTGTCGGCCACTTCCTCCTCCGCCACCACATCGCCAACCGCCGGATCCGGCCACCGCAGCCTCTCCCCCGAGTGCCGGCCGCTTCCTCCTCCGCCACTGCACCGCCAACCGCCGGATCCGGCCTCGACAAGTTTGTGGGGCGCGGATCCGACCACCGCGGCCTCTCCCCCGACCGTCGGCCGCTTCCTCCTCTGCCACCGTACCACCAACCGCTGGATCCGGGCGAGGATCCGGCCACCGCCTCCTCCACCACTGCACCACCGCCAGATGAATATGATTGTTATGATTTTTGTGATTTTGTTTTGTGCCCAAATCATTGTGAATGTGAAGTGATTTTGTTCTTTGGCCAGATGAATGTGATTGCGATGATTTTTGTGATTCTGTCTTGTGTCAAAATGACTGTGAATGTGATTATTTTTGTGATTTGTGATGCCTAATGGTCTACGACTAGCTAGGCTTATAATATTATT]

[+] EMBL AK062819             [TTCTCTCCCTCACTCACTCTCTCCCCCTCATCTTCCTTCTCTCCCTCCTCACTCTCTCCCTCACAGATCGGGCCATGGCGTCCTCCCGAGCGCCGGCCGCTGTTGCCTCCCCACCTCCCGACCGGCGGCCGGCGCCGCCTCCCCTCTTCCCGACCGCCGGCCGCCGGATCTAGCCTACGAGGTGCGGACCCGACCACCACGGCCTCTTCCCCGACCGTCGGTCACCGCCGCCTCCCCGCTTCCCGAGCGCTGGCCGCTGACGCGTCCCCGCGTCCCGACCGTCGGCCGCCGCCGCCTCCCCACCTCCCAACCGTCGGTCGCCGGATCTGGCCGCCGCGCGGCCTCTCCCCCGACCGTCAGTCGCCGCCGCCTCCCTGCCTCCCGAGCGCCGGCCACTGACTCGTCCCCGCCTCCCGACCATCGGCTGTCGCTGCCTCCCCGCCACCCGACCGCCGGCCGCCGGATCTGGCCTATGAGGCGTGGATCCGACCACCGCGGCCACGACCCCAACTGTCGGCCACTTCCTCCTCCGCCACCACATCGCCAACCGCCGGATCCGGCCACCGCAGCCTCTCCCCCGAGTGCCGGCCGCTTCCTCCTCCGCCACTGCACCGCCAACCGCCGGATCCGGCCTCGACAAGTTTGTGGGGCGCGGATCCGACCACCGCGGCCTCTCCCCCGACCGTCGGCCGCTTCCTCCTCTGCCACCGTACCACCAACCGCTGGATCCGGGCGAGGATCCGGCCACCGCCTCCTCCACCACTGCACCACCGCCAGATGAATATGATTGTTATGATTTTTGTGATTTTGTTTTGTGCCCAAATCATTGTGAATGTGAAGTGATTTTGTTCTTTGGCCAGATGAATGTGATTGCGATGATTTTTGTGATTCTGTCTTGTGTCAAAATGACTGTGAATGTGATTATTTTTGTGATTTGTGATGCCTAATGGTCTACGACTAGCTAGGCTTATAATATTATT]


>consensus_16085#1 TTCTCTCCCTCACTCACTCTCTCCCCCTCATCTTCCTTCTCTCCCTCCTCACTCTCTCCC TCACAGATCGGGCCATGGCGTCCTCCCGAGCGCCGGCCGCTGTTGCCTCCCCACCTCCCG ACCGGCGGCCGGCGCCGCCTCCCCTCTTCCCGACCGCCGGCCGCCGGATCTAGCCTACGA GGTGCGGACCCGACCACCACGGCCTCTTCCCCGACCGTCGGTCACCGCCGCCTCCCCGCT TCCCGAGCGCTGGCCGCTGACGCGTCCCCGCGTCCCGACCGTCGGCCGCCGCCGCCTCCC CACCTCCCAACCGTCGGTCGCCGGATCTGGCCGCCGCGCGGCCTCTCCCCCGACCGTCAG TCGCCGCCGCCTCCCTGCCTCCCGAGCGCCGGCCACTGACTCGTCCCCGCCTCCCGACCA TCGGCTGTCGCTGCCTCCCCGCCACCCGACCGCCGGCCGCCGGATCTGGCCTATGAGGCG TGGATCCGACCACCGCGGCCACGACCCCAACTGTCGGCCACTTCCTCCTCCGCCACCACA TCGCCAACCGCCGGATCCGGCCACCGCAGCCTCTCCCCCGAGTGCCGGCCGCTTCCTCCT CCGCCACTGCACCGCCAACCGCCGGATCCGGCCTCGACAAGTTTGTGGGGCGCGGATCCG ACCACCGCGGCCTCTCCCCCGACCGTCGGCCGCTTCCTCCTCTGCCACCGTACCACCAAC CGCTGGATCCGGGCGAGGATCCGGCCACCGCCTCCTCCACCACTGCACCACCGCCAGATG AATATGATTGTTATGATTTTTGTGATTTTGTTTTGTGCCCAAATCATTGTGAATGTGAAG TGATTTTGTTCTTTGGCCAGATGAATGTGATTGCGATGATTTTTGTGATTCTGTCTTGTG TCAAAATGACTGTGAATGTGATTATTTTTGTGATTTGTGATGCCTAATGGTCTACGACTA GCTAGGCTTATAATATTATT



consensusID : consensus_16085#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 796
fasta sequence
                              [GCTACCACCAAGCATTTTGTGTTGCTAATAATCCTTGTCCTCCTTAGCATAGGAATGACCACTAGTGCTAGAACTCTCTTGGGTTATGGCATTGGAGGAGAAGGTGGCGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGTAGCGGCGGAGGAGGTGGTTATGGTGGATCAGGGTACGGCTCTGGNTCGGGGTATGGCGAGGGAGGTGGTGCTGGCGCTGGTGGGTATGGCCATGGTGGTGGTGGAGGCGGCGGCGGTGGTGAAGGTGGTGGTTCTGGCTCCGGGTATGGTTCTGGACAAGGTTCTGGATCAGGATATGGCTCTGGTGCTTTTGGAGCTGGTGGTTA-TGGAAGCGGCCACGA-CCCCAACTNTC-GGCCACTTCCTCCTCCGCCACCACATCG-CAACCGCCGGATCC-GGCCACCG--ANCCCTCT--CCCCCG--AGTGCCGGCCGCTTCCTCCTCCGCCACTGCA-CCGCC-AACCG-CCGGATCC-GGCCTCGACAAGTTTGTGGGGCGC-GGATCCGA-CCA-CCGC-GGCCTCT--CCCCCGACC-GTCGGCCGCTTCCTCCTCTGCCACCGTACCACCAACCGCTGGATCCGGGCGAGGATCCGGCCACCGCCTCCTCCACCACTGCACCACCGCCAGATGAATATGATTGTTATGATTTTTGTGATTTTGTTTTGTGCCCAAATCATTGTGAATGTGAAGTGATTTTGTTCTTTGGCCAGATGAATGTGATTGCGATGATTTTTGTGATTCTGTCTTGTGTCAAAATGACTGTGAATGTGATTATTTTTGTGATTTGTGATGCCTAAAAAA]

[+] EMBL AU094241             [GCTACCACCAAGCATTTTGTGTTGCTAATAATCCTTGTCCTCCTTAGCATAGGAATGACCACTAGTGCTAGAACTCTCTTGGGTTATGGCATTGGAGGAGAAGGTGGCGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGTAGCGGCGGAGGAGGTGGTTATGGTGGATCAGGGTACGGCTCTGGNTCGGGGTATGGCGAGGGAGGTGGTGCTGGCGCTGGTGGGTATGGCCATGGTGGTGGTGGAGGCGGCGGCGGTGGTGAAGGTGGTGGTTCTGGCTCCGGGTATGGTTCTGGACAAGGTTCTGGNTCAGGATATGGCTCTGGTGCTTTTGGAGCTGGTGGTTA TGGAAGCGGCCACGA  CCCAACTNTC GGCCACTTCCTCCTCCGCCACCACATCG CAACCGCCGGATCC  GCCACCG  ANCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AU090492             [GCTACCACCAAGCATTTTGTGTTGCTAATAATCCTTGTCCTCCTTAGCATAGGAATGACCACTAGTGCTAGAACTCTCTTGGGTTATGGCATTGGAGGAGAAGGTGGCGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGTAGCGGCGGAGGAGGTGGTTATGGTGGATCAGGGTACGGCTCTGGATCGGGGTATGGCGAGGGAGGTGGTGCTGGCGCTGGTGGGTATGGCCATGGTGGTGGTGGAGGCGGCGGCGGTGGTGAAGGTGGTGGTTCTGGCTCCGGGTATGGTTCTTGACAAGGTTCTTGATCAGGATATGGCTCTGGTGCTTTTTGAGCTNGTTGTTATTGGAAGCGGCCAGGACCCCCAACTTTC GGCCAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AU094242             [                                                                                                                                                                                                                                                           AGGTGGTGG TCTGGCTCCGGGTATGGTTCTGGACAAGGTTCTGGATCAGGATATGGCTCTGGTGCTTTTGAAGCTGGTGGTTA TGGAAGCGGCCACGA CCCCAACTGTCGGGCCACTTCCTCCTCCGCCACCACATCGCCAACCGCCGGATCC GGCCACCG  CAGCCTCT  CCCCCG  AGTGCCGGCCGCTTCCTCCTCCGCCACTGCA CCGCC AACCG CCGGATCC GGCCTCGACAAGTTTGTGGGGCGC GGATCCGA CCA CCGC GGCCTCT  CCCCCGACC GTCGGCCGCTTCCTCCTCTGCCACCGTACCACCAACCGCTGGATCCGGGCGAGGATCCGGCCACCGCCTCCTCCACCACTGCACCACCGCCAGATGAATATGATTGTTATGATTTTTGTGATTTTGTTTTGTGCCCAAATCATTGTGAATGTGAAGTGATTTTGTTCTTTGGCCAGATGAATGTGATTGCGATGATTTTTGTGATTCTGTCTTGTGTCAAAATGACTGTGAATGTGATTATTTTTGTGATTTGTGATGCCTAAAAAA]
[+] EMBL AU182859             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gGGATCCGGGCCACCGCAAGCCNTTTTCCCCCCGNAAGTGGCCGCCGCTTCCTCCTCCGCCACTGCACCCGCCAAACCGCCCGGATCCGGGCCTCGACAAGTTTGTGGGGNGCGGGATCCGACCCACCCGCGGGCCTCTCCCCCCCGACCGGTC GCCGCTTCCTCCTCTGCCACCGTACCACCAACCGCTGGATCCGGGCGAGGATCCGGCCACCGCCTCCTCCACCACTGCACCACCGCCAGATGAATATGATTGTTATGATTTTTGTGATTTTGTTTTGTGCCCAAATCATTGTGAATGTGAAGTGATTTTGTTCTTTGGCCAGATGAATGTGATTGCGATGATTTTTGTGATTCTGTCTTGTGTCAAAATGACTGTGAATGTGATTATTTTTGTGATTTGTGATGCCTAAAAAA]


>consensus_16085#2 GCTACCACCAAGCATTTTGTGTTGCTAATAATCCTTGTCCTCCTTAGCATAGGAATGACC ACTAGTGCTAGAACTCTCTTGGGTTATGGCATTGGAGGAGAAGGTGGCGGTGGTGGAGGA GGAGGTGGTAGCGGCGGAGGAGGTGGTTATGGTGGATCAGGGTACGGCTCTGGNTCGGGG TATGGCGAGGGAGGTGGTGCTGGCGCTGGTGGGTATGGCCATGGTGGTGGTGGAGGCGGC GGCGGTGGTGAAGGTGGTGGTTCTGGCTCCGGGTATGGTTCTGGACAAGGTTCTGGATCA GGATATGGCTCTGGTGCTTTTGGAGCTGGTGGTTATGGAAGCGGCCACGACCCCAACTNT CGGCCACTTCCTCCTCCGCCACCACATCGCAACCGCCGGATCCGGCCACCGANCCCTCTC CCCCGAGTGCCGGCCGCTTCCTCCTCCGCCACTGCACCGCCAACCGCCGGATCCGGCCTC GACAAGTTTGTGGGGCGCGGATCCGACCACCGCGGCCTCTCCCCCGACCGTCGGCCGCTT CCTCCTCTGCCACCGTACCACCAACCGCTGGATCCGGGCGAGGATCCGGCCACCGCCTCC TCCACCACTGCACCACCGCCAGATGAATATGATTGTTATGATTTTTGTGATTTTGTTTTG TGCCCAAATCATTGTGAATGTGAAGTGATTTTGTTCTTTGGCCAGATGAATGTGATTGCG ATGATTTTTGTGATTCTGTCTTGTGTCAAAATGACTGTGAATGTGATTATTTTTGTGATT TGTGATGCCTAAAAAA



consensusID : consensus_16085#3
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 505
fasta sequence
                              [GGTTATGGCTCTGGATATGGATCAGGTGCAGGTGGTGCTAGTGGTGGTGNAGGTGGACATGGTGGTGGTGGCGGCGGCGGTCAAGGTGGTGGGTATGGTAGCGGCTCAGGCTATGGATCTGGCAGCGGATATGGTCAAGGTGNCGGTGCTTATGGTGGAGGATATGGAAGCGGTGGTGGTGGTGNAGGCGGCGGCGGCCAAGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGG-TGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTA-CCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAA-GGTTGAAATACAAATACTTATGCATTTGTTCTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AU165702             [GGTTATGGCTCTGGATATGGATCAGGTGCAGGTGGTGCTAGTGGTGGTGNAGGTGGACATGGTGGTGGTGGCGGCGGCGGTCAAGGTGGTGGGTATGGTAGCGGCTCAGGCTATGGATCTGGCAGCGGATATGGTCAAGGTGNCGGTGCTTATGGTGGAGGATATGGAAGCGGTGGTGGTGGTGNAGGCGGCGGCGGCCAAGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGG TGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTA CCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAA GGTTGAAATACAAATACTTATGCATTTGTTCTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL AU069211             [                                                               GGTGGTGCCGCCGNCGGTCAAGGTGGTGGGTATGGTAGCGGCTCAGGCTATGGATCTGGCAGCGGATATGGTCAAGGTGCCGGTGCTTATGGTGGAGGATAT GAAGCGGTGGTGGTGGTGNAGGCGNCGGCGGCCAAGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGG TGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTA CCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAA GGTTGAAATACAAATACTTATGCATTTGTTCTCTTAAAAA                  ]
[+] EMBL AU182557             [                                                                                                                                                                                                      CAAGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGG TGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTA CCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAA GGTTGAAATACAAATACTTATGCATTTGTTCTCTTAAAAAAA                ]
[+] EMBL AU161040             [                                                                                                                                                                                                      CAAGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGA GAGGTTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTA CCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTTCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAAGGGTTGAAATACAAATACTTATGCATTTTGTCCCTTAAAAA                  ]
[+] EMBL AU164847             [                                                                                                                                                                                                      CAAGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGG TGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTA CCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAA GGTTGAAAAAAAA                                             ]
[+] EMBL AU069594             [                                                                                                                                                                                                      CAAGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGA GAGGNTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTA CCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAA GGTT                                                      ]
[+] EMBL AU069210             [                                                                                                                                                                                                      CAAGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAAG TGGT GGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATAT CACAA CTTGGTTTCGTGAATATATGTAATGCTTCTTGAATGGGCTTGCTGCTG CCAATAT                                                                                             ]
[+] EMBL AU165701             [                                                                                                                                                                                                      CAAGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGG TGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTA CCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTT                                                                                                                         ]
[+] EMBL AU070613             [                                                                                                                                                                                                          GCGGAGGNTCTGGNTATGGTNCTGGNTCTAGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGG NGGTGGGCACTACTAGTCCTNTACTCNGCAATNGAGCAATTCTA CCTNGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCNTGATTATATGTAATGCTTCT                                                                                                                       ]


>consensus_16085#3 GGTTATGGCTCTGGATATGGATCAGGTGCAGGTGGTGCTAGTGGTGGTGNAGGTGGACAT GGTGGTGGTGGCGGCGGCGGTCAAGGTGGTGGGTATGGTAGCGGCTCAGGCTATGGATCT GGCAGCGGATATGGTCAAGGTGNCGGTGCTTATGGTGGAGGATATGGAAGCGGTGGTGGT GGTGNAGGCGGCGGCGGCCAAGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGG TATGGATCCGGAGGAGGTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCT ACCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTT GTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCT TCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAAGGTTGAAATACAAATACTTATGCATTTGTTCTC TTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA



consensusID : consensus_16085#4
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 262
fasta sequence
                              [GCACTACTTGCACTGAAGTAGCTAGAGCTTGCAAGTAAAGATGGCTACCACCAAGCATTTTGTGTTGCTAATAATCCTTGTCCTCCTTAGCATAGGAATGACCACTAGTGCTAGAACTCTCTTGGGTTATGGCATTGGAGGAGAAGGTGGCGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGTAGCGGCGGAGGAGGTGGTGGGTATGGTAGCGGCTCAGGCTATGGATCTGGCAGCGGATATGGTCAAGGTGGCGGTGCTTATGGTGGAGGA]

[+] EMBL AK070851             [GCACTACTTGCACTGAAGTAGCTAGAGCTTGCAAGTAAAGATGGCTACCACCAAGCATTTTGTGTTGCTAATAATCCTTGTCCTCCTTAGCATAGGAATGACCACTAGTGCTAGAACTCTCTTGGGTTATGGCATTGGAGGAGAAGGTGGCGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGTAGCGGCGGAGGAGGTGGTGGGTATGGTAGCGGCTCAGGCTATGGATCTGGCAGCGGATATGGTCAAGGTGGCGGTGCTTATGGTGGAGGA]


>consensus_16085#4 GCACTACTTGCACTGAAGTAGCTAGAGCTTGCAAGTAAAGATGGCTACCACCAAGCATTT TGTGTTGCTAATAATCCTTGTCCTCCTTAGCATAGGAATGACCACTAGTGCTAGAACTCT CTTGGGTTATGGCATTGGAGGAGAAGGTGGCGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGTAGCGGCGG AGGAGGTGGTGGGTATGGTAGCGGCTCAGGCTATGGATCTGGCAGCGGATATGGTCAAGG TGGCGGTGCTTATGGTGGAGGA



consensusID : consensus_16085#5
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 257
fasta sequence
                              [CAAGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTNGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGGTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATNGAGCCATTCTACCGTGGGACTTGTGCNCTCATATATGATGATTGTNTTACATTGGTATATACACAAGCCTGTTTTCGTGAANTATATGTTATGCTTCTTTGAATGGGCTTGCTGCTGCCCCAATATATGCGCCTTNCCCAAGGTTTTAAATTAAATCCANAAATA]

[+] EMBL AU164189             [CAAGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTNGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGGTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATNGAGCCATTCTACCGTGGGACTTGTGCNCTCATATATGATGATTGTNTTACATTGGTATATACACAAGCCTGTTTTCGTGAANTATATGTTATGCTTCTTTGAATGGGCTTGCTGCTGCCCCAATATATGCGCCTTNCCCAAGGTTTTAAATTAAATCCANAAATA]


>consensus_16085#5 CAAGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTNGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGGT GGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATNGAGCCATTCTACCGTGGGACTTGTGCNC TCATATATGATGATTGTNTTACATTGGTATATACACAAGCCTGTTTTCGTGAANTATATG TTATGCTTCTTTGAATGGGCTTGCTGCTGCCCCAATATATGCGCCTTNCCCAAGGTTTTA AATTAAATCCANAAATA



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_16085#3      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#5      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#0      TTGCGGTGGATACCTAGGTACCCAGAGACGAGGAAGGGCGTAGCAAGCGACGAAATGCTT 60
consensus_16085#4      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#1      -----------------------------------------------------TTCTCTC 7
consensus_16085#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_16085#3      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#5      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#0      CGGGGAGTTGAAAATACACAGCTGCACTACTTGCACTGAAGTAGCTAGAGCTTGCAAGTA 120
consensus_16085#4      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#1      CCTCACTCACTCTCTCCCCCTCATCTTCCTTCTCTCCCTCCTCACTCTCTCCCTCACAGA 67
consensus_16085#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_16085#3      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#5      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#0      AAGATGGCTACCACCAAGCATTTTGTGTTGCTAATAATCCTTGTCCTCCTTAGCATAGGA 180
consensus_16085#4      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#1      TCGGGCCATGGCGTCCTCCCGAGCGCCGGCCGCTGTTGCCTCCCCACCTCCCGACCGGCG 127
consensus_16085#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_16085#3      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#5      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#0      ATGACCACTAGTGCTAGAACTCTCTTGGGTTATGGCATTGGAGGAGAAGGTGGCGGTGGT 240
consensus_16085#4      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#1      GCCGGCGCCGCCTCCCCTCTTCCCGACCGCCGGCCGCCGGATCTAGCCTACGAGGTGCGG 187
consensus_16085#2      ----------------------GCTACCACCAAGCATTTTGTGTTGCTAATAATCCTTGT 38
                                                                                   

consensus_16085#3      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#5      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#0      GGAGGAGGAGGTGGTAGCGGCGGAGGAGGTGGTTATGGTGGATCAGGGTACGGCTCTGGA 300
consensus_16085#4      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#1      ACCCGACCACCACGGCCTCTTCCCCGACCGTCGGTCACCGCCGCCTCCCCGCTTCCCGAG 247
consensus_16085#2      CCTCCTTAGCATAGGAATGACCACTAGTGCTAGAACTCTCTTGGGTTATGGCATTGGAGG 98
                                                                                   

consensus_16085#3      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#5      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#0      TCGGGGTATGGCGAGGGAGGTGGTGCTGGCGCTGGTGGGTATGGCCATGGTGGTGGTGGA 360
consensus_16085#4      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#1      CGCTGGCCGCTGACGCGTCCCCGCGTCCCG-ACCGTCGGCCGCCGCCGCCTCCCCACCTC 306
consensus_16085#2      AGAAGGTGGCGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGTAGCGGCGGAGGAGGTGGTTATGGTGGATC 158
                                                                                   

consensus_16085#3      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#5      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#0      GGCGGCGGCGGTGGTGAAGGTGGTGGTTCTGGCTCCGGGTATGGTTCTGGACAAGGTTCT 420
consensus_16085#4      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#1      CCAACCGTCGGTCGCCGGATCTGGCCGCCGCGCGGCCTCTCCCCCGACCGTCAGTCGCCG 366
consensus_16085#2      ---AGGGTACGGCTCTGGNTCGGGGTATGGCGAGGGAGGTGGTGCTGGCGCTGGTGGGTA 215
                                                                                   

consensus_16085#3      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#5      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#0      GGATCAGGATATGGCTCTGGTGCTTTTGGAGCTGGTGGTTATGGAAGCGGTGGAGGTGGC 480
consensus_16085#4      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#1      CCGCCTCCCTGCCTCCCGAG-CGCCGGCCACTGACTCGTCCCCGCCTCCCGACCATCGGC 425
consensus_16085#2      TGGCCATGGTGGTGGTGGAGGCGGCGGCGGTGGTGAAGGTGGTGGTTCTGG--CTCCGGG 273
                                                                                   

consensus_16085#3      ---------------------------------------GGTTATGGCTCTGGATATGGA 21
consensus_16085#5      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#0      GGAGGTGGTGGTGCAGGATCTGGGTATGGCTCAGGTGAGGGTTATGGCTCTGGATATGGA 540
consensus_16085#4      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#1      TGTCGCTGCCTCCCCGCCACCCGACCGCCGGCCGCCGGATCTGGC-CTATGAGGCGTGGA 484
consensus_16085#2      TATGGTTCTGGACAAGGTTCTGGATCA--GGATAT-GGCTCTGGTGCTTTTGGAGCTGGT 330
                                                                                   

consensus_16085#3      TCAGGTGCAGGTGGTGCTAGTGGTGGTGNAGGTGGACATGGTGGTGGTGGCGGCGGCGGT 81
consensus_16085#5      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#0      TCAGGTGCAGGTGGTGCTAGTGGTGGTGGAGGTGGACATGGTGGTGGTGGCGGCGGCGGT 600
consensus_16085#4      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#1      TCCGACCACCGCGGCCACGACCCCAACTGTCGGCCACTTCCTCCTCCGCCACCACATCGC 544
consensus_16085#2      GGTTATGGAAGCGGCCACGACCCCAACTNTCGGCCACTTCCTCCTCCGCCACCACATCGC 390
                                                                                   

consensus_16085#3      CAAGGTGGTGGGTATGGTAGCGGCTCAGGCTATGGATCTGGCAGCGGATATGGTCAAGGT 141
consensus_16085#5      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#0      CAAGGTGGTGGGTATGGTAGCGGCTCAGGCTATGGATCTGGCAGCGGATATGGTCAAGGT 660
consensus_16085#4      ------------------------------------------------------------
consensus_16085#1      CAACCGCCGGATCCGGCCACCGCAGCCTCTCCCCCGAGTGCCGGCCGCTTCCTCCTCCGC 604
consensus_16085#2      -AACCGCCGGATCCGGCCACCGANCCCTCTCCCCCGAGTGCCGGCCGCTTCCTCCTCCGC 449
                                                                                   

consensus_16085#3      GNCGGTGCTTATGGTGGA-GGATATGGAAGCGGTGGTGGTGGTGNAGGCGGCGGCGGCCA 200
consensus_16085#5      ----------------------------------------------------------CA 2
consensus_16085#0      GGCGGTGCTTATGGTGGA-GGATATGGAAGCGGTGGTGGTGGTGNAG-CGGCGGCGGCCA 718
consensus_16085#4      --------------------------------------------------GCACTACTTG 10
consensus_16085#1      CACTGCACCGCCAACCGCCGGATCCGGCCTCGACAAGTTTGTGGGGCGCGGATCCGACCA 664
consensus_16085#2      CACTGCACCGCCAACCGCCGGATCCGGCCTCGACAAGTTTGTGGGGCGCGGATCCGACCA 509
                                                                                   

consensus_16085#3      AGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTC-TGGCTCTGGCTACGGGTAT-GGATCCGGAGGAGGT 258
consensus_16085#5      AGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTC-TGGCTCTNGCTACGGGTAT-GGATCCGGAGGAGGT 60
consensus_16085#0      AGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTC-TGGCTCTGGCTACGGGTAT-GGATCCGGAGGAGGT 776
consensus_16085#4      CACTGAAGTAGCTAGAGCTTGCAAGTAAAGATGGCTACCACCAA-GCATTTTGTGTTGCT 69
consensus_16085#1      CCGCGGCCTCTCCCCCGACCGTCGGCCGCTTCCTCCTCTGCCACCGTACCACCAACCGCT 724
consensus_16085#2      CCGCGGCCTCTCCCCCGACCGTCGGCCGCTTCCTCCTCTGCCACCGTACCACCAACCGCT 569
                           *      *        *             *  *    *  * *         * *

consensus_16085#3      GG---TGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCGTGGGACTTGTG 315
consensus_16085#5      GG---TGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATNGAGCCATTCTACCGTGGGACTTGTG 117
consensus_16085#0      GG---TGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCGTGGGACTTGTG 833
consensus_16085#4      AA---TAATCCTTGTCCTCCTTAGCATAGGAATGACCACTAGTGCTAGAACTCTCTTGGG 126
consensus_16085#1      GGATCCGGGCGAGGATCCGGCCACCGCCTCCTCCACCACTGCACCACCGCCAGATGAATA 784
consensus_16085#2      GGATCCGGGCGAGGATCCGGCCACCGCCTCCTCCACCACTGCACCACCGCCAGATGAATA 629
                                *            *               *                     

consensus_16085#3      CACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGA-TTAT 374
consensus_16085#5      CNCTCATATATGATGATTGTNTTACATTGGTATATACACAAGCCTGTTTTCGTGAANTAT 177
consensus_16085#0      CACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGA-TTAT 892
consensus_16085#4      TTATGGCATTGGAGGAGAAGGTGGCGGTGGTGGAGG-AGGAGGTGGTAGCGGCGGAGGAG 185
consensus_16085#1      TGATTGT-TATGATTTTTGTGATTTTGTTTTGTGCCCAAATCATTGTGAATGTGAAGTGA 843
consensus_16085#2      TGATTGT-TATGATTTTTGTGATTTTGTTTTGTGCCCAAATCATTGTGAATGTGAAGTGA 688
                          *    *  **              *  *      *       **    * *      

consensus_16085#3      ATGTAATGCTTCTT-GATTGGGCTTGCTGCTGCCC-AATATATGCGCTTCCCAAGTATAA 432
consensus_16085#5      ATGTTATGCTTCTTTGAATGGGCTTGCTGCTGCCCCAATATATGCGCCTTNCCCAAGGTT 237
consensus_16085#0      ATGTAATGCTTCTT-GATTGGGCTTGCTGCTGCCC-AATATATGCGCTTCCCAAGTATAA 950
consensus_16085#4      GTGGTGGGTATGGT-AGCGGCTCAGGCTATGGATCTGGCA-GCGGATATGGTCAAGGTGG 243
consensus_16085#1      TTTTGTTCTTTGGCCAGATGAATGTGATTGCGATGATTTTTGTGATTCTGTCTTGTGTCA 903
consensus_16085#2      TTTTGTTCTTTGGCCAGATGAATGTGATTGCGATGATTTTTGTGATTCTGTCTTGTGTCA 748
                        *        *        *     * *   *           *    *           

consensus_16085#3      ATA-AATCAAAAATAAGGTTGAAATACAAATACTTATGCATTTGTTCTCTTAAAAAAAAA 491
consensus_16085#5      TTA-AATTAAATCCANAAATA--------------------------------------- 257
consensus_16085#0      ATA-AATCAAAAATAAGGTTGAAATACAAAAAAAAAAAAA-------------------- 989
consensus_16085#4      CGG-TGCTTATGGTGGAGGA---------------------------------------- 262
consensus_16085#1      AAATGACTGTGAATGTGATTATTTTTGTGATTTGTGATGCCTAATGGTCTACGACTAGCT 963
consensus_16085#2      AAATGACTGTGAATGTGATTATTTTTGTGATTTGTGATGCCTAAAAAA------------ 796
                                                                                   

consensus_16085#3      AAAAAAAAAAAAAA--- 505
consensus_16085#5      -----------------
consensus_16085#0      -----------------
consensus_16085#4      -----------------
consensus_16085#1      AGGCTTATAATATTATT 980
consensus_16085#2      -----------------
                                        




Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)