These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_16085#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 12 consensus length = 989 fasta sequence [TTGCGGTGGATACCTAGGTACCCAGAGACGAGGAAGGGCGTAGCAAGCGACGAAATGCTTCGGGGAGTTGAAAATACACAGCTGCACTACTTGCACTGAAGTAGCTAGAGCTTGCAAGTAAAGATGGCTACCACCAAGCATTTTGTGTTGCTAATAATCCTTGTCCTCCTTAGCATAGGAATGACCACTAGTGCTAGAACTCTCTTGGGTTATGGCATTGGAGGAGAAGGTGGCGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGTAGCGGCGGAGGAGGTGGTTATGGTGGATCAGGGTACGGCTCTGGATCGGGGTATGGCGAGGGAGGTGGTGCTGGCGCTGGTGGGTATGGCCATGGTGGTGGTGGAGGCGGCGGCGGTGGTGAAGGTGGTGGTTCTGGCTCCGGGTATGGTTCTGGACAAGGTTCTGGATCAGGATATGGCTCTGGTGCTTTTGGAGCTGGTGGTTATGGAAGCGGTGGAGGTGG-CGGAGGTGGTGGTGCAGGATCT-GGGTATGGCTCAGGTGAGGGTTATGGCTCTGGATATGGATCAGGTGCAGGTGGTGCTAGTGGTGGTGGAGGTGGACATGGTGGTGGTGGCGGCGGCGGTCAAGGTGGTGGGTATGGTAGCGGCTCAGGCTATGGATCTGGCAGCGGATATGGTCAAGGTGGCGGTGCTTATGGTGGAGGATATGGAAGCGGTGGTGGTGGTGNA-GCGGCGGCGGCCAAGGCGGAGG-ATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGGTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAAGGTTGAAATACAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL AK061298 [TTGCGGTGGATACCTAGGTACCCAGAGACGAGGAAGGGCGTAGCAAGCGACGAAATGCTTCGGGGAGTTGAAAATACACAGCTGCACTACTTGCACTGAAGTAGCTAGAGCTTGCAAGTAAAGATGGCTACCACCAAGCATTTTGTGTTGCTAATAATCCTTGTCCTCCTTAGCATAGGAATGACCACTAGTGCTAGAACTCTCTTGGGTTATGGCATTGGAGGAGAAGGTGGCGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGTAGCAGCGGAGGAGGTGGTTATGGTGGATCAGGGTACGGCTCTGGATCGGGGTATGGCGAGGGAGGTGGTGCTGGCGCTGGTGGGTATGGCCATGGTGGTGGTGGAGGCGGCGGCGGTGGTGAAGGTGGTGGTTCTGGCTCCGGGTATGGTTCTGGACAAGGTTCTGGATCAGGATATGGCTCTGGTGCTTTTGGAGCTGGTGGTTATGGAAGCGGTGGAGGTGG CGGAGGTGGTGGTGCAGGATCT GGGTATGGCTCAGGTGAGGGTTATGGCTCTGGATATGGATCAGGTGCAGGTGGTGCTAGTGGTGGTGGAGGTGGACATGGTGGTGGTGGCGGCGGCGGTCAAGGTGGTGGGTATGGTAGCGGCTCAGGCTATGGATCTGGCAGCGGATATGGTCAAGGTGGCGGTGCTTATGGTGGAGGA ] [+] EMBL CF313353 [ GAGTAGAAAATACACAGCTGCACTACTTGCACTGAAGTAGCTAGAGCTTGCAAGTAAAGATGGCTACCACCAAGCATTTTGTGTTGCTAATAATCCTTGTCCTCCTTAGCATAGGAATGACCACTAGTGCTAGAACTCTCTTGGGTTATGGCATTGGAGGAGAAGGTGGCGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGTAGCGGCGGAGGAGGTGGTTATGGTGGATCAGGGTACGGCTCTGGATCGGGGTATGGCGAGGGAGGTGGTGCTGGCGCTGGTGGGTATGGCCATGGTGGTGGTGGAGGCGGCGGCGGTGGTGAAGGTGGTGGTTCTGGCTCCGGGTATGG ] [+] EMBL AU101265 [ TGTGTTGCTAATAATCCTTGTCCTCCTTAGCATAGGAATGACCACTAGTGCTAGAACTCTCTTGGGTTATGGCATTGGAGGAGAAGGTGGCGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGTAGCGGCGGAGGAGGTGGTTATGGTGGATCAGGGTACGGCTCTGGATCGGGGTATGGCGAGGGAGGTGGTGCTGGCGCTGGTGGGTATGGCCATGGTGGTGGTGGAGGCGGCGGCGGTGGTGAAGGTGGTGGTTCTGGCTCCGGGTATGGTTCTGGACAAGGTTCTGGATCAGGATATGGCTCTGGTGCTTTTGGAGCTGGTGGTTATGGAAGCGGTGGAGGTGGCCGGAGGTGGTGGTGCAGGATCTNGGGTATGGCTCAGGTGAGGG TATGGC ] [+] EMBL AU164190 [ CGGCGGCGGTCAAGGTGGTGGGTATGGTAGCGGCTCAGGCTATGGATCTGGCAGCGGATATGGTCAAGGTGGCGGTGCTTATGGTGGAGGATATGGAAGCGGTGGTGGTGGTGNAGGCGGCGGCGGCCAAGGCGGAGG ATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGGTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAAGGTTGAAATACAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL AU182092 [ nCGGTGGTGGTGGTGGA GCGGCGGCGGCCAAGGCGGAGG ATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGGTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAAGGTTGAAATACAAAAAAA ] [-] EMBL D42550 [ tggacGGTGGTCG GCA GCTGCGGCGGCGCGGGCGGTGGTCGCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGGTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGNTTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAA ] [+] EMBL AU161899 [ CAAGGCGGAGG ATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGGTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAAGGTTGAAATACAAAAAAA ] [+] EMBL AU161806 [ CAAGGCGGAGG ATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGGTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCGTGGGACTTGTGCACTCATATATNATGATTGTNT ACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCNCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAAGGTTGAANTACAAAAAAA ] [-] EMBL CF313354 [ AAGGCGGAGG ATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGGTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAAGGTTGAAATACAAAAAA ] [+] EMBL AU097587 [ AGGCGGAGG ATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGGTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAAGGTTGAAATACAAAAA ] [+] EMBL AU223400 [ GG ATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGGTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAAGGTTGAAATACAAAAAAAA ] [+] EMBL AU223310 [ GG ATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGGTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAAGGTTGAAATACAAAAAA ] consensusID : consensus_16085#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 980 fasta sequence [TTCTCTCCCTCACTCACTCTCTCCCCCTCATCTTCCTTCTCTCCCTCCTCACTCTCTCCCTCACAGATCGGGCCATGGCGTCCTCCCGAGCGCCGGCCGCTGTTGCCTCCCCACCTCCCGACCGGCGGCCGGCGCCGCCTCCCCTCTTCCCGACCGCCGGCCGCCGGATCTAGCCTACGAGGTGCGGACCCGACCACCACGGCCTCTTCCCCGACCGTCGGTCACCGCCGCCTCCCCGCTTCCCGAGCGCTGGCCGCTGACGCGTCCCCGCGTCCCGACCGTCGGCCGCCGCCGCCTCCCCACCTCCCAACCGTCGGTCGCCGGATCTGGCCGCCGCGCGGCCTCTCCCCCGACCGTCAGTCGCCGCCGCCTCCCTGCCTCCCGAGCGCCGGCCACTGACTCGTCCCCGCCTCCCGACCATCGGCTGTCGCTGCCTCCCCGCCACCCGACCGCCGGCCGCCGGATCTGGCCTATGAGGCGTGGATCCGACCACCGCGGCCACGACCCCAACTGTCGGCCACTTCCTCCTCCGCCACCACATCGCCAACCGCCGGATCCGGCCACCGCAGCCTCTCCCCCGAGTGCCGGCCGCTTCCTCCTCCGCCACTGCACCGCCAACCGCCGGATCCGGCCTCGACAAGTTTGTGGGGCGCGGATCCGACCACCGCGGCCTCTCCCCCGACCGTCGGCCGCTTCCTCCTCTGCCACCGTACCACCAACCGCTGGATCCGGGCGAGGATCCGGCCACCGCCTCCTCCACCACTGCACCACCGCCAGATGAATATGATTGTTATGATTTTTGTGATTTTGTTTTGTGCCCAAATCATTGTGAATGTGAAGTGATTTTGTTCTTTGGCCAGATGAATGTGATTGCGATGATTTTTGTGATTCTGTCTTGTGTCAAAATGACTGTGAATGTGATTATTTTTGTGATTTGTGATGCCTAATGGTCTACGACTAGCTAGGCTTATAATATTATT] [+] EMBL AK062819 [TTCTCTCCCTCACTCACTCTCTCCCCCTCATCTTCCTTCTCTCCCTCCTCACTCTCTCCCTCACAGATCGGGCCATGGCGTCCTCCCGAGCGCCGGCCGCTGTTGCCTCCCCACCTCCCGACCGGCGGCCGGCGCCGCCTCCCCTCTTCCCGACCGCCGGCCGCCGGATCTAGCCTACGAGGTGCGGACCCGACCACCACGGCCTCTTCCCCGACCGTCGGTCACCGCCGCCTCCCCGCTTCCCGAGCGCTGGCCGCTGACGCGTCCCCGCGTCCCGACCGTCGGCCGCCGCCGCCTCCCCACCTCCCAACCGTCGGTCGCCGGATCTGGCCGCCGCGCGGCCTCTCCCCCGACCGTCAGTCGCCGCCGCCTCCCTGCCTCCCGAGCGCCGGCCACTGACTCGTCCCCGCCTCCCGACCATCGGCTGTCGCTGCCTCCCCGCCACCCGACCGCCGGCCGCCGGATCTGGCCTATGAGGCGTGGATCCGACCACCGCGGCCACGACCCCAACTGTCGGCCACTTCCTCCTCCGCCACCACATCGCCAACCGCCGGATCCGGCCACCGCAGCCTCTCCCCCGAGTGCCGGCCGCTTCCTCCTCCGCCACTGCACCGCCAACCGCCGGATCCGGCCTCGACAAGTTTGTGGGGCGCGGATCCGACCACCGCGGCCTCTCCCCCGACCGTCGGCCGCTTCCTCCTCTGCCACCGTACCACCAACCGCTGGATCCGGGCGAGGATCCGGCCACCGCCTCCTCCACCACTGCACCACCGCCAGATGAATATGATTGTTATGATTTTTGTGATTTTGTTTTGTGCCCAAATCATTGTGAATGTGAAGTGATTTTGTTCTTTGGCCAGATGAATGTGATTGCGATGATTTTTGTGATTCTGTCTTGTGTCAAAATGACTGTGAATGTGATTATTTTTGTGATTTGTGATGCCTAATGGTCTACGACTAGCTAGGCTTATAATATTATT] consensusID : consensus_16085#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 796 fasta sequence [GCTACCACCAAGCATTTTGTGTTGCTAATAATCCTTGTCCTCCTTAGCATAGGAATGACCACTAGTGCTAGAACTCTCTTGGGTTATGGCATTGGAGGAGAAGGTGGCGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGTAGCGGCGGAGGAGGTGGTTATGGTGGATCAGGGTACGGCTCTGGNTCGGGGTATGGCGAGGGAGGTGGTGCTGGCGCTGGTGGGTATGGCCATGGTGGTGGTGGAGGCGGCGGCGGTGGTGAAGGTGGTGGTTCTGGCTCCGGGTATGGTTCTGGACAAGGTTCTGGATCAGGATATGGCTCTGGTGCTTTTGGAGCTGGTGGTTA-TGGAAGCGGCCACGA-CCCCAACTNTC-GGCCACTTCCTCCTCCGCCACCACATCG-CAACCGCCGGATCC-GGCCACCG--ANCCCTCT--CCCCCG--AGTGCCGGCCGCTTCCTCCTCCGCCACTGCA-CCGCC-AACCG-CCGGATCC-GGCCTCGACAAGTTTGTGGGGCGC-GGATCCGA-CCA-CCGC-GGCCTCT--CCCCCGACC-GTCGGCCGCTTCCTCCTCTGCCACCGTACCACCAACCGCTGGATCCGGGCGAGGATCCGGCCACCGCCTCCTCCACCACTGCACCACCGCCAGATGAATATGATTGTTATGATTTTTGTGATTTTGTTTTGTGCCCAAATCATTGTGAATGTGAAGTGATTTTGTTCTTTGGCCAGATGAATGTGATTGCGATGATTTTTGTGATTCTGTCTTGTGTCAAAATGACTGTGAATGTGATTATTTTTGTGATTTGTGATGCCTAAAAAA] [+] EMBL AU094241 [GCTACCACCAAGCATTTTGTGTTGCTAATAATCCTTGTCCTCCTTAGCATAGGAATGACCACTAGTGCTAGAACTCTCTTGGGTTATGGCATTGGAGGAGAAGGTGGCGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGTAGCGGCGGAGGAGGTGGTTATGGTGGATCAGGGTACGGCTCTGGNTCGGGGTATGGCGAGGGAGGTGGTGCTGGCGCTGGTGGGTATGGCCATGGTGGTGGTGGAGGCGGCGGCGGTGGTGAAGGTGGTGGTTCTGGCTCCGGGTATGGTTCTGGACAAGGTTCTGGNTCAGGATATGGCTCTGGTGCTTTTGGAGCTGGTGGTTA TGGAAGCGGCCACGA CCCAACTNTC GGCCACTTCCTCCTCCGCCACCACATCG CAACCGCCGGATCC GCCACCG ANCC ] [+] EMBL AU090492 [GCTACCACCAAGCATTTTGTGTTGCTAATAATCCTTGTCCTCCTTAGCATAGGAATGACCACTAGTGCTAGAACTCTCTTGGGTTATGGCATTGGAGGAGAAGGTGGCGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGTAGCGGCGGAGGAGGTGGTTATGGTGGATCAGGGTACGGCTCTGGATCGGGGTATGGCGAGGGAGGTGGTGCTGGCGCTGGTGGGTATGGCCATGGTGGTGGTGGAGGCGGCGGCGGTGGTGAAGGTGGTGGTTCTGGCTCCGGGTATGGTTCTTGACAAGGTTCTTGATCAGGATATGGCTCTGGTGCTTTTTGAGCTNGTTGTTATTGGAAGCGGCCAGGACCCCCAACTTTC GGCCAC ] [+] EMBL AU094242 [ AGGTGGTGG TCTGGCTCCGGGTATGGTTCTGGACAAGGTTCTGGATCAGGATATGGCTCTGGTGCTTTTGAAGCTGGTGGTTA TGGAAGCGGCCACGA CCCCAACTGTCGGGCCACTTCCTCCTCCGCCACCACATCGCCAACCGCCGGATCC GGCCACCG CAGCCTCT CCCCCG AGTGCCGGCCGCTTCCTCCTCCGCCACTGCA CCGCC AACCG CCGGATCC GGCCTCGACAAGTTTGTGGGGCGC GGATCCGA CCA CCGC GGCCTCT CCCCCGACC GTCGGCCGCTTCCTCCTCTGCCACCGTACCACCAACCGCTGGATCCGGGCGAGGATCCGGCCACCGCCTCCTCCACCACTGCACCACCGCCAGATGAATATGATTGTTATGATTTTTGTGATTTTGTTTTGTGCCCAAATCATTGTGAATGTGAAGTGATTTTGTTCTTTGGCCAGATGAATGTGATTGCGATGATTTTTGTGATTCTGTCTTGTGTCAAAATGACTGTGAATGTGATTATTTTTGTGATTTGTGATGCCTAAAAAA] [+] EMBL AU182859 [ gGGATCCGGGCCACCGCAAGCCNTTTTCCCCCCGNAAGTGGCCGCCGCTTCCTCCTCCGCCACTGCACCCGCCAAACCGCCCGGATCCGGGCCTCGACAAGTTTGTGGGGNGCGGGATCCGACCCACCCGCGGGCCTCTCCCCCCCGACCGGTC GCCGCTTCCTCCTCTGCCACCGTACCACCAACCGCTGGATCCGGGCGAGGATCCGGCCACCGCCTCCTCCACCACTGCACCACCGCCAGATGAATATGATTGTTATGATTTTTGTGATTTTGTTTTGTGCCCAAATCATTGTGAATGTGAAGTGATTTTGTTCTTTGGCCAGATGAATGTGATTGCGATGATTTTTGTGATTCTGTCTTGTGTCAAAATGACTGTGAATGTGATTATTTTTGTGATTTGTGATGCCTAAAAAA] consensusID : consensus_16085#3 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 505 fasta sequence [GGTTATGGCTCTGGATATGGATCAGGTGCAGGTGGTGCTAGTGGTGGTGNAGGTGGACATGGTGGTGGTGGCGGCGGCGGTCAAGGTGGTGGGTATGGTAGCGGCTCAGGCTATGGATCTGGCAGCGGATATGGTCAAGGTGNCGGTGCTTATGGTGGAGGATATGGAAGCGGTGGTGGTGGTGNAGGCGGCGGCGGCCAAGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGG-TGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTA-CCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAA-GGTTGAAATACAAATACTTATGCATTTGTTCTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL AU165702 [GGTTATGGCTCTGGATATGGATCAGGTGCAGGTGGTGCTAGTGGTGGTGNAGGTGGACATGGTGGTGGTGGCGGCGGCGGTCAAGGTGGTGGGTATGGTAGCGGCTCAGGCTATGGATCTGGCAGCGGATATGGTCAAGGTGNCGGTGCTTATGGTGGAGGATATGGAAGCGGTGGTGGTGGTGNAGGCGGCGGCGGCCAAGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGG TGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTA CCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAA GGTTGAAATACAAATACTTATGCATTTGTTCTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL AU069211 [ GGTGGTGCCGCCGNCGGTCAAGGTGGTGGGTATGGTAGCGGCTCAGGCTATGGATCTGGCAGCGGATATGGTCAAGGTGCCGGTGCTTATGGTGGAGGATAT GAAGCGGTGGTGGTGGTGNAGGCGNCGGCGGCCAAGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGG TGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTA CCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAA GGTTGAAATACAAATACTTATGCATTTGTTCTCTTAAAAA ] [+] EMBL AU182557 [ CAAGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGG TGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTA CCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAA GGTTGAAATACAAATACTTATGCATTTGTTCTCTTAAAAAAA ] [+] EMBL AU161040 [ CAAGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGA GAGGTTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTA CCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTTCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAAGGGTTGAAATACAAATACTTATGCATTTTGTCCCTTAAAAA ] [+] EMBL AU164847 [ CAAGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGG TGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTA CCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAA GGTTGAAAAAAAA ] [+] EMBL AU069594 [ CAAGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGA GAGGNTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTA CCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTTCTTGATTGGGCTTGCTGCTGCCCAATATATGCGCTTCCCAAGTATAAATAAATCAAAAATAA GGTT ] [+] EMBL AU069210 [ CAAGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAAG TGGT GGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATAT CACAA CTTGGTTTCGTGAATATATGTAATGCTTCTTGAATGGGCTTGCTGCTG CCAATAT ] [+] EMBL AU165701 [ CAAGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTGGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGG TGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTA CCGTGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGATTATATGTAATGCTT ] [+] EMBL AU070613 [ GCGGAGGNTCTGGNTATGGTNCTGGNTCTAGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGG NGGTGGGCACTACTAGTCCTNTACTCNGCAATNGAGCAATTCTA CCTNGGGACTTGTGCACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCNTGATTATATGTAATGCTTCT ] consensusID : consensus_16085#4 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 262 fasta sequence [GCACTACTTGCACTGAAGTAGCTAGAGCTTGCAAGTAAAGATGGCTACCACCAAGCATTTTGTGTTGCTAATAATCCTTGTCCTCCTTAGCATAGGAATGACCACTAGTGCTAGAACTCTCTTGGGTTATGGCATTGGAGGAGAAGGTGGCGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGTAGCGGCGGAGGAGGTGGTGGGTATGGTAGCGGCTCAGGCTATGGATCTGGCAGCGGATATGGTCAAGGTGGCGGTGCTTATGGTGGAGGA] [+] EMBL AK070851 [GCACTACTTGCACTGAAGTAGCTAGAGCTTGCAAGTAAAGATGGCTACCACCAAGCATTTTGTGTTGCTAATAATCCTTGTCCTCCTTAGCATAGGAATGACCACTAGTGCTAGAACTCTCTTGGGTTATGGCATTGGAGGAGAAGGTGGCGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGTAGCGGCGGAGGAGGTGGTGGGTATGGTAGCGGCTCAGGCTATGGATCTGGCAGCGGATATGGTCAAGGTGGCGGTGCTTATGGTGGAGGA] consensusID : consensus_16085#5 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 257 fasta sequence [CAAGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTNGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGGTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATNGAGCCATTCTACCGTGGGACTTGTGCNCTCATATATGATGATTGTNTTACATTGGTATATACACAAGCCTGTTTTCGTGAANTATATGTTATGCTTCTTTGAATGGGCTTGCTGCTGCCCCAATATATGCGCCTTNCCCAAGGTTTTAAATTAAATCCANAAATA] [+] EMBL AU164189 [CAAGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTCTGGCTCTNGCTACGGGTATGGATCCGGAGGAGGTGGTGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATNGAGCCATTCTACCGTGGGACTTGTGCNCTCATATATGATGATTGTNTTACATTGGTATATACACAAGCCTGTTTTCGTGAANTATATGTTATGCTTCTTTGAATGGGCTTGCTGCTGCCCCAATATATGCGCCTTNCCCAAGGTTTTAAATTAAATCCANAAATA] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_16085#3 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#5 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#0 TTGCGGTGGATACCTAGGTACCCAGAGACGAGGAAGGGCGTAGCAAGCGACGAAATGCTT 60 consensus_16085#4 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#1 -----------------------------------------------------TTCTCTC 7 consensus_16085#2 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#3 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#5 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#0 CGGGGAGTTGAAAATACACAGCTGCACTACTTGCACTGAAGTAGCTAGAGCTTGCAAGTA 120 consensus_16085#4 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#1 CCTCACTCACTCTCTCCCCCTCATCTTCCTTCTCTCCCTCCTCACTCTCTCCCTCACAGA 67 consensus_16085#2 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#3 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#5 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#0 AAGATGGCTACCACCAAGCATTTTGTGTTGCTAATAATCCTTGTCCTCCTTAGCATAGGA 180 consensus_16085#4 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#1 TCGGGCCATGGCGTCCTCCCGAGCGCCGGCCGCTGTTGCCTCCCCACCTCCCGACCGGCG 127 consensus_16085#2 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#3 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#5 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#0 ATGACCACTAGTGCTAGAACTCTCTTGGGTTATGGCATTGGAGGAGAAGGTGGCGGTGGT 240 consensus_16085#4 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#1 GCCGGCGCCGCCTCCCCTCTTCCCGACCGCCGGCCGCCGGATCTAGCCTACGAGGTGCGG 187 consensus_16085#2 ----------------------GCTACCACCAAGCATTTTGTGTTGCTAATAATCCTTGT 38 consensus_16085#3 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#5 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#0 GGAGGAGGAGGTGGTAGCGGCGGAGGAGGTGGTTATGGTGGATCAGGGTACGGCTCTGGA 300 consensus_16085#4 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#1 ACCCGACCACCACGGCCTCTTCCCCGACCGTCGGTCACCGCCGCCTCCCCGCTTCCCGAG 247 consensus_16085#2 CCTCCTTAGCATAGGAATGACCACTAGTGCTAGAACTCTCTTGGGTTATGGCATTGGAGG 98 consensus_16085#3 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#5 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#0 TCGGGGTATGGCGAGGGAGGTGGTGCTGGCGCTGGTGGGTATGGCCATGGTGGTGGTGGA 360 consensus_16085#4 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#1 CGCTGGCCGCTGACGCGTCCCCGCGTCCCG-ACCGTCGGCCGCCGCCGCCTCCCCACCTC 306 consensus_16085#2 AGAAGGTGGCGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGTAGCGGCGGAGGAGGTGGTTATGGTGGATC 158 consensus_16085#3 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#5 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#0 GGCGGCGGCGGTGGTGAAGGTGGTGGTTCTGGCTCCGGGTATGGTTCTGGACAAGGTTCT 420 consensus_16085#4 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#1 CCAACCGTCGGTCGCCGGATCTGGCCGCCGCGCGGCCTCTCCCCCGACCGTCAGTCGCCG 366 consensus_16085#2 ---AGGGTACGGCTCTGGNTCGGGGTATGGCGAGGGAGGTGGTGCTGGCGCTGGTGGGTA 215 consensus_16085#3 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#5 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#0 GGATCAGGATATGGCTCTGGTGCTTTTGGAGCTGGTGGTTATGGAAGCGGTGGAGGTGGC 480 consensus_16085#4 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#1 CCGCCTCCCTGCCTCCCGAG-CGCCGGCCACTGACTCGTCCCCGCCTCCCGACCATCGGC 425 consensus_16085#2 TGGCCATGGTGGTGGTGGAGGCGGCGGCGGTGGTGAAGGTGGTGGTTCTGG--CTCCGGG 273 consensus_16085#3 ---------------------------------------GGTTATGGCTCTGGATATGGA 21 consensus_16085#5 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#0 GGAGGTGGTGGTGCAGGATCTGGGTATGGCTCAGGTGAGGGTTATGGCTCTGGATATGGA 540 consensus_16085#4 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#1 TGTCGCTGCCTCCCCGCCACCCGACCGCCGGCCGCCGGATCTGGC-CTATGAGGCGTGGA 484 consensus_16085#2 TATGGTTCTGGACAAGGTTCTGGATCA--GGATAT-GGCTCTGGTGCTTTTGGAGCTGGT 330 consensus_16085#3 TCAGGTGCAGGTGGTGCTAGTGGTGGTGNAGGTGGACATGGTGGTGGTGGCGGCGGCGGT 81 consensus_16085#5 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#0 TCAGGTGCAGGTGGTGCTAGTGGTGGTGGAGGTGGACATGGTGGTGGTGGCGGCGGCGGT 600 consensus_16085#4 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#1 TCCGACCACCGCGGCCACGACCCCAACTGTCGGCCACTTCCTCCTCCGCCACCACATCGC 544 consensus_16085#2 GGTTATGGAAGCGGCCACGACCCCAACTNTCGGCCACTTCCTCCTCCGCCACCACATCGC 390 consensus_16085#3 CAAGGTGGTGGGTATGGTAGCGGCTCAGGCTATGGATCTGGCAGCGGATATGGTCAAGGT 141 consensus_16085#5 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#0 CAAGGTGGTGGGTATGGTAGCGGCTCAGGCTATGGATCTGGCAGCGGATATGGTCAAGGT 660 consensus_16085#4 ------------------------------------------------------------ consensus_16085#1 CAACCGCCGGATCCGGCCACCGCAGCCTCTCCCCCGAGTGCCGGCCGCTTCCTCCTCCGC 604 consensus_16085#2 -AACCGCCGGATCCGGCCACCGANCCCTCTCCCCCGAGTGCCGGCCGCTTCCTCCTCCGC 449 consensus_16085#3 GNCGGTGCTTATGGTGGA-GGATATGGAAGCGGTGGTGGTGGTGNAGGCGGCGGCGGCCA 200 consensus_16085#5 ----------------------------------------------------------CA 2 consensus_16085#0 GGCGGTGCTTATGGTGGA-GGATATGGAAGCGGTGGTGGTGGTGNAG-CGGCGGCGGCCA 718 consensus_16085#4 --------------------------------------------------GCACTACTTG 10 consensus_16085#1 CACTGCACCGCCAACCGCCGGATCCGGCCTCGACAAGTTTGTGGGGCGCGGATCCGACCA 664 consensus_16085#2 CACTGCACCGCCAACCGCCGGATCCGGCCTCGACAAGTTTGTGGGGCGCGGATCCGACCA 509 consensus_16085#3 AGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTC-TGGCTCTGGCTACGGGTAT-GGATCCGGAGGAGGT 258 consensus_16085#5 AGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTC-TGGCTCTNGCTACGGGTAT-GGATCCGGAGGAGGT 60 consensus_16085#0 AGGCGGAGGATCTGGCTATGGTTC-TGGCTCTGGCTACGGGTAT-GGATCCGGAGGAGGT 776 consensus_16085#4 CACTGAAGTAGCTAGAGCTTGCAAGTAAAGATGGCTACCACCAA-GCATTTTGTGTTGCT 69 consensus_16085#1 CCGCGGCCTCTCCCCCGACCGTCGGCCGCTTCCTCCTCTGCCACCGTACCACCAACCGCT 724 consensus_16085#2 CCGCGGCCTCTCCCCCGACCGTCGGCCGCTTCCTCCTCTGCCACCGTACCACCAACCGCT 569 * * * * * * * * * * consensus_16085#3 GG---TGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCGTGGGACTTGTG 315 consensus_16085#5 GG---TGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATNGAGCCATTCTACCGTGGGACTTGTG 117 consensus_16085#0 GG---TGGGCACTACTAGTCCTATACTCGGCAATGGAGCAATTCTACCGTGGGACTTGTG 833 consensus_16085#4 AA---TAATCCTTGTCCTCCTTAGCATAGGAATGACCACTAGTGCTAGAACTCTCTTGGG 126 consensus_16085#1 GGATCCGGGCGAGGATCCGGCCACCGCCTCCTCCACCACTGCACCACCGCCAGATGAATA 784 consensus_16085#2 GGATCCGGGCGAGGATCCGGCCACCGCCTCCTCCACCACTGCACCACCGCCAGATGAATA 629 * * * consensus_16085#3 CACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGA-TTAT 374 consensus_16085#5 CNCTCATATATGATGATTGTNTTACATTGGTATATACACAAGCCTGTTTTCGTGAANTAT 177 consensus_16085#0 CACTCATATATGATGATTGTGTAACATTGGTATATACACAAGCTTGTTTTCGTGA-TTAT 892 consensus_16085#4 TTATGGCATTGGAGGAGAAGGTGGCGGTGGTGGAGG-AGGAGGTGGTAGCGGCGGAGGAG 185 consensus_16085#1 TGATTGT-TATGATTTTTGTGATTTTGTTTTGTGCCCAAATCATTGTGAATGTGAAGTGA 843 consensus_16085#2 TGATTGT-TATGATTTTTGTGATTTTGTTTTGTGCCCAAATCATTGTGAATGTGAAGTGA 688 * * ** * * * ** * * consensus_16085#3 ATGTAATGCTTCTT-GATTGGGCTTGCTGCTGCCC-AATATATGCGCTTCCCAAGTATAA 432 consensus_16085#5 ATGTTATGCTTCTTTGAATGGGCTTGCTGCTGCCCCAATATATGCGCCTTNCCCAAGGTT 237 consensus_16085#0 ATGTAATGCTTCTT-GATTGGGCTTGCTGCTGCCC-AATATATGCGCTTCCCAAGTATAA 950 consensus_16085#4 GTGGTGGGTATGGT-AGCGGCTCAGGCTATGGATCTGGCA-GCGGATATGGTCAAGGTGG 243 consensus_16085#1 TTTTGTTCTTTGGCCAGATGAATGTGATTGCGATGATTTTTGTGATTCTGTCTTGTGTCA 903 consensus_16085#2 TTTTGTTCTTTGGCCAGATGAATGTGATTGCGATGATTTTTGTGATTCTGTCTTGTGTCA 748 * * * * * * * * consensus_16085#3 ATA-AATCAAAAATAAGGTTGAAATACAAATACTTATGCATTTGTTCTCTTAAAAAAAAA 491 consensus_16085#5 TTA-AATTAAATCCANAAATA--------------------------------------- 257 consensus_16085#0 ATA-AATCAAAAATAAGGTTGAAATACAAAAAAAAAAAAA-------------------- 989 consensus_16085#4 CGG-TGCTTATGGTGGAGGA---------------------------------------- 262 consensus_16085#1 AAATGACTGTGAATGTGATTATTTTTGTGATTTGTGATGCCTAATGGTCTACGACTAGCT 963 consensus_16085#2 AAATGACTGTGAATGTGATTATTTTTGTGATTTGTGATGCCTAAAAAA------------ 796 consensus_16085#3 AAAAAAAAAAAAAA--- 505 consensus_16085#5 ----------------- consensus_16085#0 ----------------- consensus_16085#4 ----------------- consensus_16085#1 AGGCTTATAATATTATT 980 consensus_16085#2 ----------------- |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||