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consensusID : consensus_16185#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! 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AK063217 [ CGCACTTATTTAATACTCAGTGCGGATACAGAATTAATGTACATGAACACGAAGTAAAAGCGACGACGTATGACGACGAACAAGAAGAAGCAAATTAAGCCATCAACCACATGCATACATGTAATTATGGGGAGAAAGTAATTAAGCATATAAACCGTTCGTTCTTGCGTTCATTCGATCGGGATCGATCTAGTATTGGTCGGCGGCGTGCTTCTTGGCGTCCTTCTTCTCGTGGTGCTCGTGGAAGGCGAACCCCGCGGCGCCCAGCGC CT GGTGCTTGTGGTGCTTCTTCTCCTTGTCGTAGTCCACCACGCCGGAGCTCTCCTCCTCCCCGTCCTTCTTGTGGTGGAACAGGTGGTGGTGCTTCTTCTCCTCAGCCATGGCTAGCTACTCACTGATTAATAATCTTAGCTTCCTTCAGACAGAGTTAGTCGGTTGCCGGTG] [-] EMBL CB238400 [ GAACACGAAGTAAAAGCGACGACGTATGACGACGAACAAGAAGGAGCAAATTAAGCCATCAACCACATGCATACATGTAATTATGGGGAGAAAGTAATTAAGCATATAAACCGTTCGTTCTTGC ] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_16185#0 TTTTTGTTTTTTTTAAACGGAAACCAAAATTTCTGTGTGCAGCACAAACGCACTTATTTA 60 consensus_16185#4 ------------------------------------------CACAAACGCACTTATTTA 18 consensus_16185#1 TTTTTGTTTTTTTTTTT------------TTTCTGTGTGCAGCACAAACGCACTTATTTA 48 consensus_16185#3 ------------------------------------------------CGCACTTATTTA 12 consensus_16185#2 -------TTTTTTT---------------TTTCTGTGTGCAGCACAAACGCACTTATTTA 38 ************ consensus_16185#0 ATACTCAG-TGCGGATACAGAATTAATGTACATGAACACGAAGTAAAAGCGACGACGTAT 119 consensus_16185#4 ATACTCAG-TGCGGATACAGAATTAATGTACATGAACACGAAGTAAAAGCGACGACGTAT 77 consensus_16185#1 ATACTCAG-TGCGGATACAGAATTAATGTACATGAACACGAA-TAAAAGCGACGACGTAT 106 consensus_16185#3 ATACTCAG-TGCGGATACAGAATTAATGTACATGAACACGAAGTAAAAGCGACGACGTAT 71 consensus_16185#2 ATACTCAGGTGCGGATACAGAATTAATGTACATGAACACGAAGTACAAGCGACGACGTAT 98 ******** ********************************* ** ************** consensus_16185#0 GACGACGAACAAGAAGAAGCAAATTAAGCCATCAACCACATGCATACATGTAATTATGGG 179 consensus_16185#4 GACGACGAACAAGAAGAAGCAAATTAAGCCATCAACCACATGCATACATGTAATTATGGG 137 consensus_16185#1 GACGACGAACAAGAAGAAGCAAATTAAGCCATCAACCACATGCATACATGTAATTANGGG 166 consensus_16185#3 GACGACGAACAAGAAGAAGCAAATTAAGCCATCAACCACATGCATACATGTAATTATGGG 131 consensus_16185#2 GACGACGAACAAGAAGAAGCAAATTAAGCCATCAACCACATGCATACATGTAATTATGGG 158 ******************************************************** *** consensus_16185#0 GAGAAAGTAATTAAGCATATAAACCGTTCGTTCTTGCGTTCATTCGATCGGGATCGATCT 239 consensus_16185#4 GAGAAAGTAATTAAGCATATAAACCGTTCGTTCTTGCGTTCATTCGATCGGGATCGATCT 197 consensus_16185#1 GAGAAAGTAATTAAGCATATAAACCGTTCGTTCTTGCGTTCATTCGATCGGGATCGATCT 226 consensus_16185#3 GAGAAAGTAATTAAGCATATAAACCGTTCGTTCTTGCGTTCATTCGATCGGGATCGATCT 191 consensus_16185#2 GAGAAAGTAATTAAGCATATAAACCGTTCGTTCTTGCGTTCATTCGATCGGGATCGATCT 218 ************************************************************ consensus_16185#0 AGTATTGGTCGGCGGCGTGCTTCT-TGGCGTCCTTCTTCTCGTGGTGCTCGTGGAAGGCG 298 consensus_16185#4 AGTATTGGTCGGCGGCGTGCTTCT-TGGCGTCCTTCTTCTCGTGGTGCTCGTGGAAGGCG 256 consensus_16185#1 AGTATTGGTCGGCGGCGTGCTTCT-TGGCGTCCTTCTTCTCGTGGTGCTCGTGGAAGGCG 285 consensus_16185#3 AGTATTGGTCGGCGGCGTGCTTCT-TGGCGTCCTTCTTCTCGTGGTGCTCGTGGAAGGCG 250 consensus_16185#2 AGTATTGGTCGGCGGCGTGCTTCTGTGGCGTCCTTCTTCTCGTGGTGCTCGTGGAAGG-G 277 ************************ ********************************* * consensus_16185#0 AACCCCGCGGCGCCCAGCGCGGCCACCGCCGCCACCTCCTCCTTCACCTTGTGCCCGTGC 358 consensus_16185#4 AACCCCGCGGCGCCCAGCGCGGC------------------------------------- 279 consensus_16185#1 AACCCCGCGGCGCCCAGCGCGGCCACCGCCGCCACCTCCTCCTTCACCTTGTGCCCGTGC 345 consensus_16185#3 ----------CGTTCTCCGTGTCC------------------------------------ 264 consensus_16185#2 AACCCCG--GGGCCCAGCGCGGC-ACCGCCGC--ACTCCTCCTTCACCTTGTGCCCGTGC 332 * * ** * * consensus_16185#0 GCGTTCTCCG-TGTCCTTCTTCGCCTGGTGCTTCTCGTGGAGAGCGTAGGCGCCGGCGGC 417 consensus_16185#4 ------------------------------------------------------------ consensus_16185#1 GCGTTCTCCG-TGTCCTTCTTCGCCTGGTGCTTCTCGTGGAGAGCGTAGGCGCCGGCGGC 404 consensus_16185#3 ----------------TTCTTCGCCTGGTGCTTCTCGTGGAGAGCGTAGGCGCCGGCGGC 308 consensus_16185#2 GCGTTCTCCGGTGTCCTTCTTCGCCTGGTGCTTCTCGTGGAGAGCGTAGGCGCCGGCGG- 391 consensus_16185#0 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Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||