|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_17043#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 40 consensus length = 714 fasta sequence
[TGGACTGAAGGAGTAGAAAACCTCTCAACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG-CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA-CCACTTCGATGGTGAT-CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC-GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG-TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT-GGCCGATTCTGTTGTTGCT-AAGATGGACG-AAAT-G-GGAGTTC-TTGCTAAGAT-GGACGAAAT-G-GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG-AAT-AT-GTTG-TTTTGCTTC-AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT-G-TTATCTTCAAT-AAATTATTGACCATATG--GGACGATCTAT-AGTGGAT-CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTGTCCATTGTGTCATCCGATGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTACGACATGATTAATATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACTGTCATGCCGTTAGTAGCGTATC]
[+] EMBL CF338155 [TGGACTGAAGGAGTAGAAAACCTCTCAACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAACATGGAAGGACAACCCTAGAACAACA ]
[+] EMBL CF335721 [ GGAGTAGAAAACCTCTCAACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGT ]
[+] EMBL CF333960 [ GAGTAGAAAACCTCTCAACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT ATNGTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGCTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATGNNGGACGATCTAT AGTGGATCCCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTG ]
[+] EMBL CF338130 [ CTCTCAACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAATNG GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAATNG GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAGAAAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTA ]
[+] EMBL CF336436 [ TCAACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT A ]
[+] EMBL CF312254 [ TCAACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTAaaaaa ]
[-] EMBL CF312255 [ CAACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTAaaaaaa ]
[+] EMBL CF317657 [ ACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTT ]
[+] EMBL CF337805 [ ACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCT ]
[+] EMBL CF317973 [ ACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTGTTTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT GNGGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT GNGGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTAT ]
[+] EMBL CF298883 [ ACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAATNG GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AATNAT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTATAAGTGGATCCCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCT ]
[+] EMBL CF307562 [ ACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAATNG GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAATNG GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCAT AG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTA ]
[+] EMBL CF316131 [ ACACAAAACTAAGAAATATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTCTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTGTCCATTGTGTCAaaaacaaaa ]
[+] EMBL CF336550 [ ACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATA ]
[+] EMBL CF334416 [ CAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAGG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCT ]
[+] EMBL OSS15850A [ GAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG GAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGNCAAGTTATGTTAAT G TATCTTC AT AAATTATTG CCCTATG GGGCGGTCTNT AGTGG T CCA CTGTT ]
[+] EMBL OSR2711A [ GAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG GAT AT GTTG ]
[+] EMBL CF301510 [ GAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAAT ]
[+] EMBL OSR2712A [ GAAACATAGCAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGG ]
[+] EMBL AU095453 [ AACATAGCTAGNTAACCAGGGAAGGTAGCATCAGNCAGCGGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTN CCACTTCGATGNTGATCCATGTGCATGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGA TACGCCACCGCAGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGAGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCNCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTNCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATATTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTTTCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCTAGTTATGTTAAT GTTTATCTCCAAT AAATTGTTGACCATATG GAGCGATCTAT AGTCGAT CCATCTGTTGGTCCCAACTATTTGTATGTCGTGCATGTGTTCGCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTATCCAATGTATCATCTGTTGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTGCAACATGATTATTATTAAAAAAAAAAAAA ]
[+] EMBL OSR1368A [ AACATAGCTAGGTAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAGCGGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCATGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTACGCCACCGCAGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGAGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTTCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTG ]
[+] EMBL AU164763 [ CATAGCTAGGTAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAGCGGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCATGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTACGCCACCGCAGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGAGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATATTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTTTCATAAG AAT ATGGTTGTTTTTGCTTC AAGTAATGGCCTAGGTATGGTAATGG TTANCTCCAATAAAATGGTTGAC ]
[+] EMBL AU164512 [ ATAGCTAGGTACCCAGGNAAGGTAGCATCAG CAGC GGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCATGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTACGCCACCGCAGCACAGTGCGGGCTGCTGCATATCCTCTCGAGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATATTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTTTCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCTAGTTATGTTAAT GTTTATCTCCAAT AAATTGTTGACCATATG GAGCGATCTAT AGTCGAT CCATCTGTTGGTCCCAACTATTTGTATGTCGTGCATGTGTTCGCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTATCCAATGTATCATCTGTTGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTGCAACATGATTATTATTAAAAAAAAAAAAAAAA ]
[+] EMBL OSR0186A [ ATAGCTAGGTAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAGCGGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCATGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTACGCCACCGCAGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGAGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGCCAAGCCTAAAACAACATATTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGC ]
[+] EMBL AU095434 [ TAGCTAGGTAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAGCGGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCATGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTACGCCACCCCAGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGAGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATATTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTTTCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCTAGTTATGTTAAT GTTTATCTCCAAT AAATTGTTGACCATATG GAGCGATCTAT AGTCGAT CCATCTGTTGGTCCCAACTATTTGTATGTCGTGCATGTGTTCGCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTATCCAATGTATCATCTGTTGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTGCAACATGATTATTATTAAAAAAAA ]
[+] EMBL OSR0820A [ AGCTAGGTAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAGCGGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCATGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTACGCCACCCCAGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGAGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGCCG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTA ]
[+] EMBL OSR2186A [ CAAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGA ]
[+] EMBL OSR13821A [ AAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGAT ]
[+] EMBL AU031740 [ AAGATACCCAGGGAAGGTACCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTNCCTGGTCATCTTGANCNTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTNCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCAaaaaa ]
[+] EMBL CA754586 [ AGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCCACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCANAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCCAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTgaaaaaaa ]
[+] EMBL AU162393 [ CCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTACCCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTNACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTGTCCATTGTGTCATCCGATGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTACGACATGATTAATATTAt ]
[+] EMBL AU101637 [ CCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G NGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACANGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG GTTTGCTTCAAAGTTATGGCCAAGT ]
[+] EMBL OSR1015A [ CCAGGGAAGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGTCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGNCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AA ]
[+] EMBL OSR0363A [ AGGTAGCATCAG CAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTCTTTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACANCATGCTTNCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATA ]
[+] EMBL OSR3195A [ GTAGCATCAG CAGCGGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTA CCACTTCGATGGTGAT CATGTGCATGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTACGCCACCGCAGCACAGTGC GGCTGCTGCATATCCTCTCGAGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCTGGGCCGATTCTGTTGTTGCTAAAGATGGACGAAAAT G GGAGTTC TTGCTAAGATGGGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAA ]
[-] EMBL CF334417 [ TGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAGG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTGTCCATTGTGTCATCCGATGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTACGACATGATTAATATTATTTGTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAACACTGTCATGCCGTTAGTAGCGTATC]
[-] EMBL CF336846 [ TGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTAACAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTGTCCATTGTGTCATCCGATGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTACGACATGATTAATATTAAAAAAA ]
[-] EMBL CF337115 [ TGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTG TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACCGTCCATTGTGTCATCCGATGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTACGACATGATTAAAA AAAAAAAAA ]
[+] EMBL AU198119 [ GGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTGTCCATTGTGTCATCCGATGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTACGACATGATTAATATTAAAAA ]
[+] EMBL AU184406 [ TGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCT GGCCGATTCTGTTGTTGCT AAGATGGACG AAAT G GGAGTTC TTGCTAAGAT GGACGAAAT G GGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAG AAT AT GTTG TTTTGCTTC AAGTTATGGCCAAGTTATGTTAAT G TTATCTTCAAT AAATTATTGACCATATG GGACGATCTAT AGTGGAT CCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTGTCCATTGTGTCATCCGATGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTACGACATGATTAATATTAAAAAAAAAA ]
consensusID : consensus_17043#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 634 fasta sequence
[CAAGGGGTCCGGCCAAGAATACCCAGGNAAGGTAGCCATCAGCACCAGGAGGCCAATGGAAGGGAAAGAGGACTACCACTTTCGATGGTGATCATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGCGGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTGTTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCTGGCCGATTCTGTTGTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTGTCCATTGTGTCATCCGATGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTACGACATGATTAATATTAT]
[+] EMBL AU101638 [CAAGGGGTCCGGCCAAGAATACCCAGGNAAGGTAGCCATCAGCACCAGGAGGCCAATGGAAGGGAAAGAGGACTACCACTTTCGATGGTGATCATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCCACCGCGGCACAGTGCGGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTGTTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCTGGCCGATTCTGTTGTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTGTCCATTGTGTCATCCGATGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTACGACATGATTAATATTAT]
consensusID : consensus_17043#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 600 fasta sequence
[AACATGATCACCAACGAACGCAGAATCATCGACAGGACGAAATGTATTCAAATAGGACTACCACTTCCATGCTGATCATGTGCCTGCTCATCTTGAGCCTCACTGTAGACTCCGCCACCGCACCACAGAGCGGCTGCTGCATATCCTCTCCGTTCACAGGATGTTGTTTTGGCTGCATTGCTGGTGGTGGCTCCTACTCACTCTGCAACAACACTTGCTGTTTACCCATGTCATTCTGCGCCGATTCTGGTGTTGCTAACATGGACGAAATGCTACGTCTTGCTAACATGGACGACATGCGAGTTCTTGCTAACATGGAACTACAAGTCTACAACGACATGCTTGCATTGCTACCACTCTTAATGCCTATCATAAGAATATGCTTGTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGGTATGGTAAAGCTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGCACGATCTATAGTGCATCCCTCTGTCGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCCCACAAGCATATTTAATTTCTCTGGCTGCTTTTACCAANCGCATAGCACGGTCTATTGTGCCGCGANCACTGACTCATGCCGTGAAAACTT]
[+] EMBL CA756310 [AACATGATCACCAACGAACGCAGAATCATCGACAGGACGAAATGTATTCAAATAGGACTACCACTTCCATGCTGATCATGTGCCTGCTCATCTTGAGCCTCACTGTAGACTCCGCCACCGCACCACAGAGCGGCTGCTGCATATCCTCTCCGTTCACAGGATGTTGTTTTGGCTGCATTGCTGGTGGTGGCTCCTACTCACTCTGCAACAACACTTGCTGTTTACCCATGTCATTCTGCGCCGATTCTGGTGTTGCTAACATGGACGAAATGCTACGTCTTGCTAACATGGACGACATGCGAGTTCTTGCTAACATGGAACTACAAGTCTACAACGACATGCTTGCATTGCTACCACTCTTAATGCCTATCATAAGAATATGCTTGTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGGTATGGTAAAGCTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGCACGATCTATAGTGCATCCCTCTGTCGGTCTCAACTCTATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCCCACAAGCATATTTAATTTCTCTGGCTGCTTTTACCAANCGCATAGCACGGTCTATTGTGCCGCGANCACTGACTCATGCCGTGAAAACTT]
consensusID : consensus_17043#3 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 577 fasta sequence
[AAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAGCAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTACCACTTCGATGGTGATCATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGNCCACCGCGGCACAGTGCGGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTGTTCTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCTGGCCGATTCTGTTGTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAACTCT-ATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTGTCCATTGTGTCAAAAACAAAAA]
[-] EMBL CF316132 [AAGATAACCAGGGAAGGTAGCATCAGCAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTACCACTTCGATGGTGATCATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGNCCACCGCGGCACAGTGCGGCTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTGTTCTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCTGGCCGATTCTGTTGTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAACTCT ATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTGTCCATTGTGTCAAAAACAAAAA]
[+] EMBL AU162441 [ GATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTTATCCTCAATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAACTCTNATGTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAaa ]
consensusID : consensus_17043#4 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 372 fasta sequence
[AAGATGGACNAAATGGGGAGTTCTTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTTCTTGCTAAGATGNAAGGACAAGCCTAAAACAACATATTTGCANTGCTACCAGTNTTAATGCCTTNTCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCTAGTTATGTTAATGTTTATCTCCAATAAATTGTTGNCCATATGGAGCGATCTATAGTCGATCCATCTGTTGGTCCCAACTATTTGTATGTCGTGCATGTGTTCGCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTATCCAATGTATCATCTGTTGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTGCAACATGATTATTATTAAAAA]
[+] EMBL AU031220 [AAGATGGACNAAATGGGGAGTTCTTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTTCTTGCTAAGATGNAAGGACAAGCCTAAAACAACATATTTGCANTGCTACCAGTNTTAATGCCTTNTCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCTAGTTATGTTAATGTTTATCTCCAATAAATTGTTGNCCATATGGAGCGATCTATAGTCGATCCATCTGTTGGTCCCAACTATTTGTATGTCGTGCATGTGTTCGCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAGGCCATAGCACTATCCAATGTATCATCTGTTGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTGCAACATGATTATTATTAAAAA]
consensusID : consensus_17043#5 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 343 fasta sequence
[TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCTGGCCGATTCTGTTGTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL AU101747 [TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACNCTTGTTGTTTCCCATGTATTCTGGCCGATTCTGTTGTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA ]
[+] EMBL OSS11973A [TTTTNGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGTCTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCTGGCCGATTCTGTTGTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGNTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAAAA ]
[+] EMBL OSS11947A [TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTCCGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCCATGTATTCTGGCCGATTCTGTTGTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAAAA ]
[+] EMBL AU101745 [ TCTGGCCGATTCTGTTGTTNCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGNCGAAATGGGAGTTCTTGCTAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACNACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCTATCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATNTGTTGGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA ]
[-] EMBL CF335722 [ AATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTTATTTTCAATAAATTATTGCCCATATGGGACGATTTATAGTGGATCCATCTGTTGGTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
consensusID : consensus_17043#6 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 185 fasta sequence
[TTGCTTCAAGTTACGGCCAAGGTATGTTAATGTTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGGTCGATCGAGAGTGGATCCATCGGTTGGTCCCAAATGTATGTAGGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTGGTTGCTTTAAAGCAGGCCAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAA]
[-] EMBL CF333961 [TTGCTTCAAGTTACGGCCAAGGTATGTTAATGTTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGGTCGATCGAGAGTGGATCCATCGGTTGGTCCCAAATGTATGTAGGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTGGTTGCTTTAAAGCAGGCCAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAA]
consensusID : consensus_17043#7 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 173 fasta sequence
[GTCGAGACGCGTGGGGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAACTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAANAAAAAANAAAAAAAAAAAAAAAAAANAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL AU095508 [GTCGAGACGCGTGGGGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTTATCTTCAATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAACTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAANAAAAAANAAAAAAAAAAAAAAAAAANAAAAAAAAAAA]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_17043#4 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#6 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#1 ------------------------------CAAGGGGTCCGGCCAAGAATACCCAGGNAA 30
consensus_17043#0 TGGACTGAAGGAGTAGAAAACCTCTCAACACAAAACTAAGAAACATAGCAAGATAACCAG 60
consensus_17043#3 -------------------------------------------------AAGATAACCAG 11
consensus_17043#2 ----------------------------------------------AACATGATCACCAA 14
consensus_17043#5 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#7 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#4 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#6 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#1 GGTAGCCATCAGCACCAGGAGGCCAATGGAAGGGAAAGAGGACTACCACTTTCGATGGTG 90
consensus_17043#0 GGAAGGTAGCATCAGCAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTACCACTTCGATGGTG 120
consensus_17043#3 GGAAGGTAGCATCAGCAACAGGAGGCAATGGAGGGAAAGAGGACTACCACTTCGATGGTG 71
consensus_17043#2 CGAACGCAGAATCATCGACAGGACGAAATGTATTCAAATAGGACTACCACTTCCATGCTG 74
consensus_17043#5 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#7 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#4 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#6 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#1 ATCATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCC-ACCGCGGCACAGTGCGG 149
consensus_17043#0 ATCATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGCC-ACCGCGGCACAGTGCGG 179
consensus_17043#3 ATCATGTGCCTGGTCATCTTGAGCCTCACTGTCGACTCCGNCCACCGCGGCACAGTGCGG 131
consensus_17043#2 ATCATGTGCCTGCTCATCTTGAGCCTCACTGTAGACTCCGCC-ACCGCACCACAGAGCGG 133
consensus_17043#5 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#7 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#4 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#6 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#1 CTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTGTTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTC 209
consensus_17043#0 CTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTGTTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTC 239
consensus_17043#3 CTGCTGCATATCCTCTCGGGCAAAAGCATGTTGTTCTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTC 191
consensus_17043#2 CTGCTGCATATCCTCTCCGTTCACAGGATGTTGTTTTGGCTGCATTGCTGGTGGTGGCTC 193
consensus_17043#5 ---------------------------------TTTTGGTTGTATTGCTGCTGGTGGCTC 27
consensus_17043#7 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#4 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#6 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#1 CGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCC---ATGTATTCTGGCCGATTCTGTTGT 266
consensus_17043#0 CGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCC---ATGTATTCTGGCCGATTCTGTTGT 296
consensus_17043#3 CGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCC---ATGTATTCTGGCCGATTCTGTTGT 248
consensus_17043#2 CTACTCACTCTGCAACAACACTTGCTGTTTACCCATGTCATTCTGCGCCGATTCTGGTGT 253
consensus_17043#5 CGACTCAGTCTGCAAGAACACTTGTTGTTTCCC---ATGTATTCTGGCCGATTCTGTTGT 84
consensus_17043#7 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#4 ----AAGATGGACNAAATGGGGAGTTCTTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTTTCTTGC 56
consensus_17043#6 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#1 TGCTAAGATGGACGAAATGGGAG--TTCTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTT-CTTGC 323
consensus_17043#0 TGCTAAGATGGACGAAATGGGAG--TTCTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTT-CTTGC 353
consensus_17043#3 TGCTAAGATGGACGAAATGGGAG--TTCTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTT-CTTGC 305
consensus_17043#2 TGCTAACATGGACGAAATGCTAC--GTCTTGCTAACATGGACGACATGCGAGTT-CTTGC 310
consensus_17043#5 TGCTAAGATGGACGAAATGGGAG--TTCTTGCTAAGATGGACGAAATGGGAGTT-CTTGC 141
consensus_17043#7 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#4 TAAGATGNAAGGACAAGCCTAAAACAACATATTTGCANTGCTACCAGTNTTAATGCCTTN 116
consensus_17043#6 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#1 TAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCT-A 382
consensus_17043#0 TAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCT-A 412
consensus_17043#3 TAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCT-A 364
consensus_17043#2 TAACATGGAACTACAAGTCTACAACGACATGCTTGCATTGCTACCACTCTTAATGCCT-A 369
consensus_17043#5 TAAGATGGAAGGACAAGCCTAAAACAACATGCTTGCATTGCTACCAGTCTTAATGCCT-A 200
consensus_17043#7 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#4 TCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCTAGTTATGTTAATGTTTATCTCCA 176
consensus_17043#6 ------------------TTGCTTCAAGTTACGGCCAAGGTATGTTAATGTT-ATCTTCA 41
consensus_17043#1 TCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTT-ATCTTCA 441
consensus_17043#0 TCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTT-ATCTTCA 471
consensus_17043#3 TCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTT-ATCTTCA 423
consensus_17043#2 TCATAAGAATATGCTTGTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGGTATGGTAAAGCT-ATCTTCA 428
consensus_17043#5 TCATAAGAATATGTTGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTT-ATCTTCA 259
consensus_17043#7 GTCGAGACGCGTGGGGTTTTGCTTCAAGTTATGGCCAAGTTATGTTAATGTT-ATCTTCA 59
************* **** ** **** *** * * **** **
consensus_17043#4 ATAAATTGTTGNCCATATGGAGCGATCTATAGTCGATCCATCTGTTGGTCCCAACTATTT 236
consensus_17043#6 ATAAATTATTGACCATATGGGTCGATCGAGAGTGGATCCATCGGTTGGTCCCAAATGTAT 101
consensus_17043#1 ATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAACTCTAT 501
consensus_17043#0 ATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAACTCTAT 531
consensus_17043#3 ATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAACTCTAT 483
consensus_17043#2 ATAAATTATTGACCATATGGCACGATCTATAGTGCATCCCTCTGTCGGTCTCAACTCTAT 488
consensus_17043#5 ATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAAAAAAAA 319
consensus_17043#7 ATAAATTATTGACCATATGGGACGATCTATAGTGGATCCATCTGTTGGTCTCAACTCTAA 119
******* *** ******** ***** * *** **** ** ** **** ***
consensus_17043#4 GTATGTCGTGCATGTGTTCGCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAG 296
consensus_17043#6 GTAGGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTGGTTGCTTTAAAGCAG 161
consensus_17043#1 GTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAG 561
consensus_17043#0 GTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAG 591
consensus_17043#3 GTATGTCGTGCATGTGTGCTCTCACAAGCATATTTAATTTCTCTTGCTGCTTTTAATAAG 543
consensus_17043#2 GTATGTCGTGCATGTGTGCTCCCACAAGCATATTTAATTTCTCTGGCTGCTTTTACCAAN 548
consensus_17043#5 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA------------------------------------ 343
consensus_17043#7 AAAAAAAAAAAAAAAANA-----AAAAANAAAAAAAAAAAAAAAAAANAAAAAAAAAAA- 173
* * *
consensus_17043#4 GCCATAGCACTATCCAATGTATCATCTGT-TGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTGCAAC 355
consensus_17043#6 GCCAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAA------------------------------------ 185
consensus_17043#1 GCCATAGCACTGTCCATTGTGTCATCCGA-TGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTACGAC 620
consensus_17043#0 GCCATAGCACTGTCCATTGTGTCATCCGA-TGGTCTCTGACCTTAGCAATTTATTACGAC 650
consensus_17043#3 GCCATAGCACTGTCCATTGTGTCAAAAAC-AAAAA------------------------- 577
consensus_17043#2 CGCATAGCACGGTCTATTGTGCCGCGANCACTGACTCATGCCGTGAAAACTT-------- 600
consensus_17043#5 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#7 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#4 ATGATTATTATTAAAAA------------------------------------------- 372
consensus_17043#6 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#1 ATGATTAATATTAT---------------------------------------------- 634
consensus_17043#0 ATGATTAATATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACTGTCATGCCGTTAGTAGCG 710
consensus_17043#3 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#2 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#5 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#7 ------------------------------------------------------------
consensus_17043#4 ----
consensus_17043#6 ----
consensus_17043#1 ----
consensus_17043#0 TATC 714
consensus_17043#3 ----
consensus_17043#2 ----
consensus_17043#5 ----
consensus_17043#7 ----
|
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||