Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 1765 cluster # 1765       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1765#0 length = 1889 sequences # 2  
consensusID : consensus_1765#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1889
fasta sequence 
                              [CCGCCGGCGAGCCCACGCCGCCCACCGCCGGAGACGGCCATGCCCCCCGTCGCAATCCAGCTCTACAGCCTCCTCTTCAAGCTCATCCTCCGCCGCCGCCTCTCCTCCCTCTCCGCCTCCGCCGCCTCCTCCTCCTCCTCATTCGGCGTCTCCTCCCGCGCCGCCGCCGACCACCACCACCCCTCGCCGCCTTCCAATCCCTCCTTCTCCTCCGCCGCCGGCGCTGACGCTGTTGCCACCAAGGACCTCCACCCCGACCCGCTCTCCTCCCTCCACCTCCGCCTCTTCCTCCCCAACCCGCACCACAGCGCCGCCCCCGCCGCCGCCGCGAACGCTCCGCCTCCGCTGCGGCGGAACTCGTTCCCGCAGCCAGCGCACGACGGGGGCAGCCCCGCGGCGGCGGTGGGGCAGGAGCTCTCCCGCCGCGCCAGCGCGA-GCTTCAGCGGGGTGTCGCCCTCCGCCGCGCCGTGCTACGGCGGGTACCGGCCGACGGCGCGCTCCGGGAGGAGGCTGCCGGTGATCGTGCAGTTCCACGGGGGCGCGTTCGCCACGGGCGCGGCCGACAGCGCCGCCAACGACGCCTTCTGCCGCCGCGTCGCGCGGCT-CTGCGACGCCATCGTGGTGGCCGTCGGGTACCGGCTCGCGCCGGAGAGCAGGTACCCCGCCGCGTTCGAGGACGGGGTCACGGTGCTCAAATGGATCGCCAAGCAGGCCAACCTCGCCGCGTGCGGGCGGACGATGGCGAGGGGGGCGGGCTCTGGAGGGGCCGATTCGTTCGGCGCGGCGTTGGTCGAGCCGTGGCTAGCTGCGCACGCCGATCCATCCAGGTGTGTTCTCCTTGGTGTCAGCTGCGGAGCGAACATTGCTGACTATGTGGCTCGAAAAGCTGTTGAGGCTGGGAAACTCCTCGACCCCATCAAGGTCGTCGCTCAGGTTTTGATGTATCCATTTTTCATGGGGACTAGTCCCACGCAATCGGAACTGAAGCTGGCAAACTCCTATTTCTATGACAAGTCAACGTGCTTACTGGCCTGGAAACTCTTCTTGCCTGAGGGTGAATTCAGCTTGGATCATCCAGCTGCAAACCCTCTTGTTCCCGGTAAAGGTCCCCCTTTGAAGCTCATTCCTCCAACATTGACAGTTGTTGCGGAGCTGGACTGGATGAAGGACCGCGCGATCGCTTACTCGGAGGAGCTCCGCAAGGTAAATGTGGATGCCCCTGTTCTCGAGTACAAGGATGCGGTCCATGAGTTCGCCACGCTGGACGTCTTGCTGAAAACACCACTGGCTCAGGCTTGCGCCGAAGATATAGCCATCTGGGTTAAGAAGTACATATCACTGCGTGGCCATGAATTATCATATTGACTGTGTCGCGGTGCGCTTTCAACGAGATTTTCACCTGAGCTGCGCCCTTCAAGGCTTCGCAATGGTCACTCCACTACTTCATTTACCTCCCATGCTGCACTGAAACCATTTGATGAAGCAGGGAGAGGTACACTGGCCGAGTGGTAACATGGGTGCTGAAGAAAGGAGGGGGAGAGAGAGAGATGCTCTGTGATGTAAGTTGGTTCTTTTATGGCAATTTAGGTTGCCTGGGGTCAAGGATCTGAGTGTAATCTAGTACAGGACGGTTGTTGTATATTTCCACGTTCTAATGGCATCTCAAGTTTTCATGTATTCGCTTCCCTGTCCATAGATCTGCTTGGCCTGATCAAAGCGGTTTATTCTGTTTCTGTTTTTACCCCCTGGTAATGAGTTGATATGCAAAACGCATCTTATAAATGGGAGGAGTGATCAAACGGTGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTCTGTATGTATGTATGTATGTATATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTC]

[+] EMBL AK100022             [CCGCCGGCGAGCCCACGCCGCCCACCGCCGGAGACGGCCATGCCCCCCGTCGCAATCCAGCTCTACAGCCTCCTCTTCAAGCTCATCCTCCGCCGCCGCCTCTCCTCCCTCTCCGCCTCCGCCGCCTCCTCCTCCTCCTCATTCGGCGTCTCCTCCCGCGCCGCCGCCGACCACCACCACCCCTCGCCGCCTTCCAATCCCTCCTTCTCCTCCGCCGCCGGCGCTGACGCTGTTGCCACCAAGGACCTCCACCCCGACCCGCTCTCCTCCCTCCACCTCCGCCTCTTCCTCCCCAACCCGCACCACAGCGCCGCCCCCGCCGCCGCCGCGAACGCTCCGCCTCCGCTGCGGCGGAACTCGTTCCCGCAGCCAGCGCACGACGGGGGCAGCCCCGCGGCGGCGGTGGGGCAGGAGCTCTCCCGCCGCGCCAGCGCGA GCTTCAGCGGGGTGTCGCCCTCCGCCGCGCCGTGCTACGGCGGGTACCGGCCGACGGCGCGCTCCGGGAGGAGGCTGCCGGTGATCGTGCAGTTCCACGGGGGCGCGTTCGCCACGGGCGCGGCCGACAGCGCCGCCAACGACGCCTTCTGCCGCCGCGTCGCGCGGCT CTGCGACGCCATCGTGGTGGCCGTCGGGTACCGGCTCGCGCCGGAGAGCAGGTACCCCGCCGCGTTCGAGGACGGGGTCACGGTGCTCAAATGGATCGCCAAGCAGGCCAACCTCGCCGCGTGCGGGCGGACGATGGCGAGGGGGGCGGGCTCTGGAGGGGCCGATTCGTTCGGCGCGGCGTTGGTCGAGCCGTGGCTAGCTGCGCACGCCGATCCATCCAGGTGTGTTCTCCTTGGTGTCAGCTGCGGAGCGAACATTGCTGACTATGTGGCTCGAAAAGCTGTTGAGGCTGGGAAACTCCTCGACCCCATCAAGGTCGTCGCTCAGGTTTTGATGTATCCATTTTTCATGGGGACTAGTCCCACGCAATCGGAACTGAAGCTGGCAAACTCCTATTTCTATGACAAGTCAACGTGCTTACTGGCCTGGAAACTCTTCTTGCCTGAGGGTGAATTCAGCTTGGATCATCCAGCTGCAAACCCTCTTGTTCCCGGTAAAGGTCCCCCTTTGAAGCTCATTCCTCCAACATTGACAGTTGTTGCGGAGCTGGACTGGATGAAGGACCGCGCGATCGCTTACTCGGAGGAGCTCCGCAAGGTAAATGTGGATGCCCCTGTTCTCGAGTACAAGGATGCGGTCCATGAGTTCGCCACGCTGGACGTCTTGCTGAAAACACCACTGGCTCAGGCTTGCGCCGAAGATATAGCCATCTGGGTTAAGAAGTACATATCACTGCGTGGCCATGAATTATCATATTGACTGTGTCGCGGTGCGCTTTCAACGAGATTTTCACCTGAGCTGCGCCCTTCAAGGCTTCGCAATGGTCACTCCACTACTTCATTTACCTCCCATGCTGCACTGAAACCATTTGATGAAGCAGGGAGAGGTACACTGGCCGAGTGGTAACATGGGTGCTGAAGAAAGGAGGGGGAGAGAGAGAGATGCTCTGTGATGTAAGTTGGTTCTTTTATGGCAATTTAGGTTGCCTGGGGTCAAGGATCTGAGTGTAATCTAGTACAGGACGGTTGTTGTATATTTCCACGTTCTAATGGCATCTCAAGTTTTCATGTATTCGCTTCCCTGTCCATAGATCTGCTTGGCCTGATCAAAGCGGTTTATTCTGTTTCTGTTTTTACCCCCTGGTAATGAGTTGATATGCAAAACGCATCTTATAAATGGGAGGAGTGATCAAACGGTGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTCTGTATGTATGTATGTATGTATATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTC]
[+] EMBL C72291               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ngnCCGCGCCAG GCGANGCTTCAGCGGGGTGTCGCCCTCCGCCGCGCCGTGCTACGGGGGGTACCTGCCGACGGCGCGCTCCGGGAGGAGGCTGCCGGTGATCGTGCAGTTCCACGGGGGCGCGTTCGCCACGGGCGCGGCCGACAGCGCCGNCAACGACGCCTTCTGCCGCCGCGTCGCGC GCTNCTGCGACGCCATCGTGGTGGCCGTCGGGTACCGGCTCGCGCCGGAGAGCAGGTACCCCGNCGCGTTCGAGGACGGGGTCACGGTGCTCAAATGGATCGCCAAGCAGGCCAACCTCGCCGCGTGCGGGCGGACGATGGCGAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]




>consensus_1765#0
CCGCCGGCGAGCCCACGCCGCCCACCGCCGGAGACGGCCATGCCCCCCGTCGCAATCCAG
CTCTACAGCCTCCTCTTCAAGCTCATCCTCCGCCGCCGCCTCTCCTCCCTCTCCGCCTCC
GCCGCCTCCTCCTCCTCCTCATTCGGCGTCTCCTCCCGCGCCGCCGCCGACCACCACCAC
CCCTCGCCGCCTTCCAATCCCTCCTTCTCCTCCGCCGCCGGCGCTGACGCTGTTGCCACC
AAGGACCTCCACCCCGACCCGCTCTCCTCCCTCCACCTCCGCCTCTTCCTCCCCAACCCG
CACCACAGCGCCGCCCCCGCCGCCGCCGCGAACGCTCCGCCTCCGCTGCGGCGGAACTCG
TTCCCGCAGCCAGCGCACGACGGGGGCAGCCCCGCGGCGGCGGTGGGGCAGGAGCTCTCC
CGCCGCGCCAGCGCGAGCTTCAGCGGGGTGTCGCCCTCCGCCGCGCCGTGCTACGGCGGG
TACCGGCCGACGGCGCGCTCCGGGAGGAGGCTGCCGGTGATCGTGCAGTTCCACGGGGGC
GCGTTCGCCACGGGCGCGGCCGACAGCGCCGCCAACGACGCCTTCTGCCGCCGCGTCGCG
CGGCTCTGCGACGCCATCGTGGTGGCCGTCGGGTACCGGCTCGCGCCGGAGAGCAGGTAC
CCCGCCGCGTTCGAGGACGGGGTCACGGTGCTCAAATGGATCGCCAAGCAGGCCAACCTC
GCCGCGTGCGGGCGGACGATGGCGAGGGGGGCGGGCTCTGGAGGGGCCGATTCGTTCGGC
GCGGCGTTGGTCGAGCCGTGGCTAGCTGCGCACGCCGATCCATCCAGGTGTGTTCTCCTT
GGTGTCAGCTGCGGAGCGAACATTGCTGACTATGTGGCTCGAAAAGCTGTTGAGGCTGGG
AAACTCCTCGACCCCATCAAGGTCGTCGCTCAGGTTTTGATGTATCCATTTTTCATGGGG
ACTAGTCCCACGCAATCGGAACTGAAGCTGGCAAACTCCTATTTCTATGACAAGTCAACG
TGCTTACTGGCCTGGAAACTCTTCTTGCCTGAGGGTGAATTCAGCTTGGATCATCCAGCT
GCAAACCCTCTTGTTCCCGGTAAAGGTCCCCCTTTGAAGCTCATTCCTCCAACATTGACA
GTTGTTGCGGAGCTGGACTGGATGAAGGACCGCGCGATCGCTTACTCGGAGGAGCTCCGC
AAGGTAAATGTGGATGCCCCTGTTCTCGAGTACAAGGATGCGGTCCATGAGTTCGCCACG
CTGGACGTCTTGCTGAAAACACCACTGGCTCAGGCTTGCGCCGAAGATATAGCCATCTGG
GTTAAGAAGTACATATCACTGCGTGGCCATGAATTATCATATTGACTGTGTCGCGGTGCG
CTTTCAACGAGATTTTCACCTGAGCTGCGCCCTTCAAGGCTTCGCAATGGTCACTCCACT
ACTTCATTTACCTCCCATGCTGCACTGAAACCATTTGATGAAGCAGGGAGAGGTACACTG
GCCGAGTGGTAACATGGGTGCTGAAGAAAGGAGGGGGAGAGAGAGAGATGCTCTGTGATG
TAAGTTGGTTCTTTTATGGCAATTTAGGTTGCCTGGGGTCAAGGATCTGAGTGTAATCTA
GTACAGGACGGTTGTTGTATATTTCCACGTTCTAATGGCATCTCAAGTTTTCATGTATTC
GCTTCCCTGTCCATAGATCTGCTTGGCCTGATCAAAGCGGTTTATTCTGTTTCTGTTTTT
ACCCCCTGGTAATGAGTTGATATGCAAAACGCATCTTATAAATGGGAGGAGTGATCAAAC
GGTGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTCTGTATGTATGTATGTATGTA
TATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)