cluster # 1799

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 1799 cluster # 1799 Sequences # 2 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1799#0 length = 3029 sequences # 2
consensusID : consensus_1799#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 3029
fasta sequence
                              [CTGTTCGTCCTCCGCCGCGGACCCCGACGCCGTGGCCGCCGAGGTGGCCACCCTCCTCTCCCGCTGCTCCGGCGACTGGAGGCTCGCCGTCTCCTCCTCCGACCTCCCCTCCCGCCTCTCCCCCGCCGCCATCTCCTCCCTCGTCCGACGACGCCCGTCCCCCTCCTCCCCGCGCCTCCACCCTAAGCTCCTCCTCGACTTCTTCTACTGGTCCAGCCCCCAGCTCGCGCCGTCGGCCCCCGCCCCCGATGCCTTCGCCCACCTGGCCATGTCCCTGTGCGCCGGCTCACTCTTCAACCTGGCCAACGGCCTCCTCATCAAGATGATCCGCGCCTACCCGTCACCTCCCGTCGTCCTCGCCTCCATCCATCGCGCGCTATCGGATTCTGGCCACCGTTCGCCGGCGGTGCTCGACGTCCTCGTGGATACCTACAAGAAGTCTGGGAGGGTGCAGGACGCCGCGGAGGTCGTCCTGATGATGAGAGATCGGGGCATGGCTCCCAGCATTCGGTGCTGCAACGCGCTGTTGAAGGATCTGCTGCGCGCGGACGCCATGGCTCTGCTTTGGAAGGTGCGAGAGTTCATGGTTGGCGCTGGGATTTCCCCGGATGTGTATACGTACTCGACTCTGATCGAAGCCTACTGCAAGGTCCGGGAATTTGATACTGCCAAGAAGGTGCTTGTGGAAATGCGTGAGAGGGGGTGCGGCCTGAACACCGTAACCTACAATGTGCTGATTGCTGGGTTATGCAGGTCTGGGGCTGTCGAAGAGGCGTTTGGGTTCAAGAAGGACATGGAGGATTATGGACTAGTTCCTGACGGGTTTACCTATGGCGCACTCATTAATGGACTGTGCAAGAGCCGTAGGTCAAATGAGGCGAAGGCATTGTTGGACGAGATGTCTTGTGCTGAGCTAAAGCCTAATGTCGTAGTTTATGCCAATCTGATTGATGGGTTTATGAGGGAGGGCAATGCAGATGAGGCGTTTAAGATGATAAAGGAGATGGTTGCTGCTGGTGTGCAGCCAAACAAAATTACCTATGACAATCTTGTTCGGGGACTATGTAAGATGGGGCAGATGGACAGGGCTTCTCTACCTTTGAAGCAAATGGTCAGAGATAGCCATAGGCCTGATACCATCACGTACAATCTCATTATTGAAGGACATTTCCGTCATCATAGCAAAAAGGATGCTTTTCGGCTTCTTAGTGAAATGGAGAATGCTGGTATTTCCCCTAATGTATATACTTATAGCATAATGATTCATGGGCTATGCCAAAGTGGTGAACCAGAAAAGGCAAGTGATCTCCTTGAGGAAATGACTACAAAAGGATTGAAGCCTAATGCATTTGTTTATGCGCCTCTTATCTCAGGGTACTGTAGAGAAGGTAATGTTTCATTGGCATGTGAAATTTTTGATAAGATGACAAAGGTGAATGTACTCCCTGATTTGTACTGCTACAATTCTCTTATATTTGGACTATCTAAGGTGGGAAGGGTGGAGGAATCTACAAAGTACTTTGCTCAGATGCAGGAGAGAGGATTGCTGCCAAATGAATTCACATACAGTGGCCTCATTCATGGGTATCTAAAGAATGGTGATCTAGAAAGTGCTGAACAGTTAGTGCAGCGGATGCTTGACACTGGACTAAAACCAAATGATGTTATCTACATTGATCTCCTAGAAAGCTACTTTAAGTCAGATGATATTGAAAAGGTGTCCTCTACTTTCAAGTCCATGTTAGACCAGGGAGTTATGCTTGACAACCGTATCTATGGAATCTTGATTCATAATCTGTCCAGTTCTGGAAATATGGAAGCAGCATTTAGGGTTCTTTCAGGGATTGAGAAGAATGGATCTGTTCCGGATGTGCATGTGTACAGCTCGTTGATATCAGGTCTTTGCAAGACAGCTGACAGGGAAAAAGCTTTTGGTATTCTTGATGAAATGTCTAAGAAGGGAGTAGATCCTAATATTGTATGCTATAATGCCCTAATTGATGGGCTGTGCAAGTCTGGTGATATTTCTTATGCCCGCAATGTCTTCAATAGCATATTAGCTAAGGGATTAGTGCCAAACTGTGTGACATACACAAGTTTGATTGATGGAAGCTGCAAAGTTGGTGACATCAGCAATGCATTCTATCTTTATAATGAAATGCTAGCAACAGGTATAACACCAGATGCTTTTGTCTATAGTGTACTTACCACTGGCTGCTCTAGTGCTGGTGACCTTGAGCAGGCAATGTTTCTGATTGAGGAAATGTTTCTTAGGGGACATGCAAGTATTTCTTCTTTCAATAATTTAGTTGATGGTTTCTGCAAACGTGGAAAGATGCAGGAAACTTTGAAGTTGTTGCATGTGATAATGGGCAGGGGCCTAGTACCTAATGCCCTGACTATTGAAAACATCATCAGTGGACTTAGTGAGGCTGGAAAACTCAGTGAAGTGCACACAATTTTTGTTGAGTTGCAGCAGAAAACTTCAGAAAGCGCTGCCCGCCACTTTTCCTCATTGTTTATGGACATGATAAATCAAGGAAAAATTCCTCTTGATGTGGTTGATGACATGATTCGAGATCATTGTAAAGAAGGAAATCTGGACAAGGCTTTAATGCTGCGAGATGTTATTGTTGCGAAAAGTGCACCAATGGGCTGCTCGTCCTATCTTGCTATAGTGGACAATCTATGCCGGAAGGGAAAATTAAGTGAAGCGTTGAATTTGCTGAAAGAAATGGACAAGAGAGGTATTTGTCCCAGTGAGAATCAATGCTTGATACTATTAACTAATCTTCATACATCTGGATATATCCAAGAACACAATACGGTACTTGATAATATGTTGTGTCACAAGTGGTTACAGAAGGACAGCAAATTCTGTAATTCAGCTGGTGATAATCTGGAATCTGTCAATGCAGAATAAACATAGAGCAGAATCCTTCCTATAAAAGAAAGTCTGATTCTATTATTCATGTTGCGAATGCATGTCGTAGCCTTGTTTTTGTTTATTGATGAGGAATTAAACAGAT]

[+] EMBL AK120733             [CTGTTCGTCCTCCGCCGCGGACCCCGACGCCGTGGCCGCCGAGGTGGCCACCCTCCTCTCCCGCTGCTCCGGCGACTGGAGGCTCGCCGTCTCCTCCTCCGACCTCCCCTCCCGCCTCTCCCCCGCCGCCATCTCCTCCCTCGTCCGACGACGCCCGTCCCCCTCCTCCCCGCGCCTCCACCCTAAGCTCCTCCTCGACTTCTTCTACTGGTCCAGCCCCCAGCTCGCGCCGTCGGCCCCCGCCCCCGATGCCTTCGCCCACCTGGCCATGTCCCTGTGCGCCGGCTCACTCTTCAACCTGGCCAACGGCCTCCTCATCAAGATGATCCGCGCCTACCCGTCACCTCCCGTCGTCCTCGCCTCCATCCATCGCGCGCTATCGGATTCTGGCCACCGTTCGCCGGCGGTGCTCGACGTCCTCGTGGATACCTACAAGAAGTCTGGGAGGGTGCAGGACGCCGCGGAGGTCGTCCTGATGATGAGAGATCGGGGCATGGCTCCCAGCATTCGGTGCTGCAACGCGCTGTTGAAGGATCTGCTGCGCGCGGACGCCATGGCTCTGCTTTGGAAGGTGCGAGAGTTCATGGTTGGCGCTGGGATTTCCCCGGATGTGTATACGTACTCGACTCTGATCGAAGCCTACTGCAAGGTCCGGGAATTTGATACTGCCAAGAAGGTGCTTGTGGAAATGCGTGAGAGGGGGTGCGGCCTGAACACCGTAACCTACAATGTGCTGATTGCTGGGTTATGCAGGTCTGGGGCTGTCGAAGAGGCGTTTGGGTTCAAGAAGGACATGGAGGATTATGGACTAGTTCCTGACGGGTTTACCTATGGCGCACTCATTAATGGACTGTGCAAGAGCCGTAGGTCAAATGAGGCGAAGGCATTGTTGGACGAGATGTCTTGTGCTGAGCTAAAGCCTAATGTCGTAGTTTATGCCAATCTGATTGATGGGTTTATGAGGGAGGGCAATGCAGATGAGGCGTTTAAGATGATAAAGGAGATGGTTGCTGCTGGTGTGCAGCCAAACAAAATTACCTATGACAATCTTGTTCGGGGACTATGTAAGATGGGGCAGATGGACAGGGCTTCTCTACCTTTGAAGCAAATGGTCAGAGATAGCCATAGGCCTGATACCATCACGTACAATCTCATTATTGAAGGACATTTCCGTCATCATAGCAAAAAGGATGCTTTTCGGCTTCTTAGTGAAATGGAGAATGCTGGTATTTCCCCTAATGTATATACTTATAGCATAATGATTCATGGGCTATGCCAAAGTGGTGAACCAGAAAAGGCAAGTGATCTCCTTGAGGAAATGACTACAAAAGGATTGAAGCCTAATGCATTTGTTTATGCGCCTCTTATCTCAGGGTACTGTAGAGAAGGTAATGTTTCATTGGCATGTGAAATTTTTGATAAGATGACAAAGGTGAATGTACTCCCTGATTTGTACTGCTACAATTCTCTTATATTTGGACTATCTAAGGTGGGAAGGGTGGAGGAATCTACAAAGTACTTTGCTCAGATGCAGGAGAGAGGATTGCTGCCAAATGAATTCACATACAGTGGCCTCATTCATGGGTATCTAAAGAATGGTGATCTAGAAAGTGCTGAACAGTTAGTGCAGCGGATGCTTGACACTGGACTAAAACCAAATGATGTTATCTACATTGATCTCCTAGAAAGCTACTTTAAGTCAGATGATATTGAAAAGGTGTCCTCTACTTTCAAGTCCATGTTAGACCAGGGAGTTATGCTTGACAACCGTATCTATGGAATCTTGATTCATAATCTGTCCAGTTCTGGAAATATGGAAGCAGCATTTAGGGTTCTTTCAGGGATTGAGAAGAATGGATCTGTTCCGGATGTGCATGTGTACAGCTCGTTGATATCAGGTCTTTGCAAGACAGCTGACAGGGAAAAAGCTTTTGGTATTCTTGATGAAATGTCTAAGAAGGGAGTAGATCCTAATATTGTATGCTATAATGCCCTAATTGATGGGCTGTGCAAGTCTGGTGATATTTCTTATGCCCGCAATGTCTTCAATAGCATATTAGCTAAGGGATTAGTGCCAAACTGTGTGACATACACAAGTTTGATTGATGGAAGCTGCAAAGTTGGTGACATCAGCAATGCATTCTATCTTTATAATGAAATGCTAGCAACAGGTATAACACCAGATGCTTTTGTCTATAGTGTACTTACCACTGGCTGCTCTAGTGCTGGTGACCTTGAGCAGGCAATGTTTCTGATTGAGGAAATGTTTCTTAGGGGACATGCAAGTATTTCTTCTTTCAATAATTTAGTTGATGGTTTCTGCAAACGTGGAAAGATGCAGGAAACTTTGAAGTTGTTGCATGTGATAATGGGCAGGGGCCTAGTACCTAATGCCCTGACTATTGAAAACATCATCAGTGGACTTAGTGAGGCTGGAAAACTCAGTGAAGTGCACACAATTTTTGTTGAGTTGCAGCAGAAAACTTCAGAAAGCGCTGCCCGCCACTTTTCCTCATTGTTTATGGACATGATAAATCAAGGAAAAATTCCTCTTGATGTGGTTGATGACATGATTCGAGATCATTGTAAAGAAGGAAATCTGGACAAGGCTTTAATGCTGCGAGATGTTATTGTTGCGAAAAGTGCACCAATGGGCTGCTCGTCCTATCTTGCTATAGTGGACAATCTATGCCGGAAGGGAAAATTAAGTGAAGCGTTGAATTTGCTGAAAGAAATGGACAAGAGAGGTATTTGTCCCAGTGAGAATCAATGCTTGATACTATTAACTAATCTTCATACATCTGGATATATCCAAGAACACAATACGGTACTTGATAATATGTTGTGTCACAAGTGGTTACAGAAGGACAGCAAATTCTGTAATTCAGCTGGTGATAATCTGGAATCTGTCAATGCAGAATAAACATAGAGCAGAATCCTTCCTATAAAAGAAAGTCTGATTCTATTATTCATGTTGCGAATGCATGTCGTAGCCTTGTTTTTGTTTATTGATGAGGAATTAAACAGAT]
[+] EMBL CB682996             [CTGTTCGTCCTCCGCCGCGGACCCCGACGCCGTGGCCGCCGAGGTGGCCACCCTCCTCTCCCGCTGCTCCGGCGACTGGAGGCTCGCCGTCTCCTCCTCCGACCTCCCCTCCCGCCTCTCCCCCGCCGCCATCTCCTCCCTCGTCCGACGACGCCCGTCCCCCTCCTCCCCGCGCCTCCACCCTAAGCTCCTCCTCGACTTCTTCTACTGGTCCAGCCCCCAGCTCGCGCCGTCGGCCCCCGCCCCCGATGCCTTCGCCCACCTGGCCATGTCCCTGTGCGCCGGCTCACTCTTCAACCTGGCCAACGGCCTCCTCATCAAGATGATCCGCGCCTACCCGTCACCTCCCGTCGTCCTCGCCTCCATCCATCGCGCGCTATCGGATTCTGGCCACCGTTCGCCGGCGGTGCTCGACGTCCTCGTGGATACCTACAAGAAGTCTGGGAGGGTGCAGGACGCCGCGGAGGTCGTCCTGATGATGAGAGATCGGGGCATGGCTCCCAGCATTCGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]




>consensus_1799#0
CTGTTCGTCCTCCGCCGCGGACCCCGACGCCGTGGCCGCCGAGGTGGCCACCCTCCTCTC
CCGCTGCTCCGGCGACTGGAGGCTCGCCGTCTCCTCCTCCGACCTCCCCTCCCGCCTCTC
CCCCGCCGCCATCTCCTCCCTCGTCCGACGACGCCCGTCCCCCTCCTCCCCGCGCCTCCA
CCCTAAGCTCCTCCTCGACTTCTTCTACTGGTCCAGCCCCCAGCTCGCGCCGTCGGCCCC
CGCCCCCGATGCCTTCGCCCACCTGGCCATGTCCCTGTGCGCCGGCTCACTCTTCAACCT
GGCCAACGGCCTCCTCATCAAGATGATCCGCGCCTACCCGTCACCTCCCGTCGTCCTCGC
CTCCATCCATCGCGCGCTATCGGATTCTGGCCACCGTTCGCCGGCGGTGCTCGACGTCCT
CGTGGATACCTACAAGAAGTCTGGGAGGGTGCAGGACGCCGCGGAGGTCGTCCTGATGAT
GAGAGATCGGGGCATGGCTCCCAGCATTCGGTGCTGCAACGCGCTGTTGAAGGATCTGCT
GCGCGCGGACGCCATGGCTCTGCTTTGGAAGGTGCGAGAGTTCATGGTTGGCGCTGGGAT
TTCCCCGGATGTGTATACGTACTCGACTCTGATCGAAGCCTACTGCAAGGTCCGGGAATT
TGATACTGCCAAGAAGGTGCTTGTGGAAATGCGTGAGAGGGGGTGCGGCCTGAACACCGT
AACCTACAATGTGCTGATTGCTGGGTTATGCAGGTCTGGGGCTGTCGAAGAGGCGTTTGG
GTTCAAGAAGGACATGGAGGATTATGGACTAGTTCCTGACGGGTTTACCTATGGCGCACT
CATTAATGGACTGTGCAAGAGCCGTAGGTCAAATGAGGCGAAGGCATTGTTGGACGAGAT
GTCTTGTGCTGAGCTAAAGCCTAATGTCGTAGTTTATGCCAATCTGATTGATGGGTTTAT
GAGGGAGGGCAATGCAGATGAGGCGTTTAAGATGATAAAGGAGATGGTTGCTGCTGGTGT
GCAGCCAAACAAAATTACCTATGACAATCTTGTTCGGGGACTATGTAAGATGGGGCAGAT
GGACAGGGCTTCTCTACCTTTGAAGCAAATGGTCAGAGATAGCCATAGGCCTGATACCAT
CACGTACAATCTCATTATTGAAGGACATTTCCGTCATCATAGCAAAAAGGATGCTTTTCG
GCTTCTTAGTGAAATGGAGAATGCTGGTATTTCCCCTAATGTATATACTTATAGCATAAT
GATTCATGGGCTATGCCAAAGTGGTGAACCAGAAAAGGCAAGTGATCTCCTTGAGGAAAT
GACTACAAAAGGATTGAAGCCTAATGCATTTGTTTATGCGCCTCTTATCTCAGGGTACTG
TAGAGAAGGTAATGTTTCATTGGCATGTGAAATTTTTGATAAGATGACAAAGGTGAATGT
ACTCCCTGATTTGTACTGCTACAATTCTCTTATATTTGGACTATCTAAGGTGGGAAGGGT
GGAGGAATCTACAAAGTACTTTGCTCAGATGCAGGAGAGAGGATTGCTGCCAAATGAATT
CACATACAGTGGCCTCATTCATGGGTATCTAAAGAATGGTGATCTAGAAAGTGCTGAACA
GTTAGTGCAGCGGATGCTTGACACTGGACTAAAACCAAATGATGTTATCTACATTGATCT
CCTAGAAAGCTACTTTAAGTCAGATGATATTGAAAAGGTGTCCTCTACTTTCAAGTCCAT
GTTAGACCAGGGAGTTATGCTTGACAACCGTATCTATGGAATCTTGATTCATAATCTGTC
CAGTTCTGGAAATATGGAAGCAGCATTTAGGGTTCTTTCAGGGATTGAGAAGAATGGATC
TGTTCCGGATGTGCATGTGTACAGCTCGTTGATATCAGGTCTTTGCAAGACAGCTGACAG
GGAAAAAGCTTTTGGTATTCTTGATGAAATGTCTAAGAAGGGAGTAGATCCTAATATTGT
ATGCTATAATGCCCTAATTGATGGGCTGTGCAAGTCTGGTGATATTTCTTATGCCCGCAA
TGTCTTCAATAGCATATTAGCTAAGGGATTAGTGCCAAACTGTGTGACATACACAAGTTT
GATTGATGGAAGCTGCAAAGTTGGTGACATCAGCAATGCATTCTATCTTTATAATGAAAT
GCTAGCAACAGGTATAACACCAGATGCTTTTGTCTATAGTGTACTTACCACTGGCTGCTC
TAGTGCTGGTGACCTTGAGCAGGCAATGTTTCTGATTGAGGAAATGTTTCTTAGGGGACA
TGCAAGTATTTCTTCTTTCAATAATTTAGTTGATGGTTTCTGCAAACGTGGAAAGATGCA
GGAAACTTTGAAGTTGTTGCATGTGATAATGGGCAGGGGCCTAGTACCTAATGCCCTGAC
TATTGAAAACATCATCAGTGGACTTAGTGAGGCTGGAAAACTCAGTGAAGTGCACACAAT
TTTTGTTGAGTTGCAGCAGAAAACTTCAGAAAGCGCTGCCCGCCACTTTTCCTCATTGTT
TATGGACATGATAAATCAAGGAAAAATTCCTCTTGATGTGGTTGATGACATGATTCGAGA
TCATTGTAAAGAAGGAAATCTGGACAAGGCTTTAATGCTGCGAGATGTTATTGTTGCGAA
AAGTGCACCAATGGGCTGCTCGTCCTATCTTGCTATAGTGGACAATCTATGCCGGAAGGG
AAAATTAAGTGAAGCGTTGAATTTGCTGAAAGAAATGGACAAGAGAGGTATTTGTCCCAG
TGAGAATCAATGCTTGATACTATTAACTAATCTTCATACATCTGGATATATCCAAGAACA
CAATACGGTACTTGATAATATGTTGTGTCACAAGTGGTTACAGAAGGACAGCAAATTCTG
TAATTCAGCTGGTGATAATCTGGAATCTGTCAATGCAGAATAAACATAGAGCAGAATCCT
TCCTATAAAAGAAAGTCTGATTCTATTATTCATGTTGCGAATGCATGTCGTAGCCTTGTT
TTTGTTTATTGATGAGGAATTAAACAGAT
clustalw multiple alignements is not computed in this case