cluster # 2029

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Oryza sativa
cluster # 2029 cluster # 2029 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_2029#0 length = 895 sequences # 2

consensusID : consensus_2029#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 895
fasta sequence

                              [CTCATCACAAGTATCTCCATCCATTCATCCAGTTAATTAATTAGCTAAGCTAGCTTTGCCGGAGACTGAAGAGAATTTGTTGGTTAATTAGAGTGAGGATTTCGTTGGGATCGATGGAGGGGAGGATTAGCAGTGCAACGCTGGTGGTGGCAGCGGTGTTGGCGATGCTGGTGCTGGTGCCGGCGGCGGCGCGCGCCGAGCGGTTCGTTGTCGGCGACGCGGCGCGGTGGACGTGGGGTTACAACTACACCGACTGGGTCATCAAGAAGGGCCCCTTCTTCCAAAACGACAGCCTTGTGTTCATGTACGACCCGCCGAACGCGACGACGCACGCGCACAGCGTGTACATGATGCGGAACGCGGCGGACTACCAGTCGTGCAACCTCAAGGCGGCGAAGCTGGTGGCCAACGTGATGCAGGGCGCCGGGTCGGGCTACGAGTTCGTCCTCCGGAAGCGCAAGCCCCACTACTTCGTCTGCGGCGAGCGCGGCGGCATCCACTGCACCATGGGCCAGATGAAGTTCATCGTCAAGCCCAAGAGCTCCGCCTGCCGCGACGACTGACCCGGCCCCCGCCCACCCCTCTCCGCCGCCGGCCGCCGGCCGCCGCCACCGAGATGTTGGGTTGGTCGCCGCCGGCCATGGTGCGGCTGCTAGCCTACGTCGATCTTCTTCTTCTTCTGCATGCCACCTTCTGGGAGTTCTGGTTCGATATCAGAACATCATTGTGCTTTGATAATATTGTAAGTTATTAATTGCAATATATACTATATGTCTAATTGTGTTGCGTTGCGTGTGGTGTATTTGTATGGGTCATTCGGTTGAAATAAACGATCGAGGGATTAATTGTACTGCGCATGTTCGTGGCGTGTGTTGATTTTTGTATATATGCAGTC]

[+] EMBL AK058410             [CTCATCACAAGTATCTCCATCCATTCATCCAGTTAATTAATTAGCTAAGCTAGCTTTGCCGGAGACTGAAGAGAATTTGTTGGTTAATTAGAGTGAGGATTTCGTTGGGATCGATGGAGGGGAGGATTAGCAGTGCAACGCTGGTGGTGGCAGCGGTGTTGGCGATGCTGGTGCTGGTGCCGGCGGCGGCGCGCGCCGAGCGGTTCGTTGTCGGCGACGCGGCGCGGTGGACGTGGGGTTACAACTACACCGACTGGGTCATCAAGAAGGGCCCCTTCTTCCAAAACGACAGCCTTGTGTTCATGTACGACCCGCCGAACGCGACGACGCACGCGCACAGCGTGTACATGATGCGGAACGCGGCGGACTACCAGTCGTGCAACCTCAAGGCGGCGAAGCTGGTGGCCAACGTGATGCAGGGCGCCGGGTCGGGCTACGAGTTCGTCCTCCGGAAGCGCAAGCCCCACTACTTCGTCTGCGGCGAGCGCGGCGGCATCCACTGCACCATGGGCCAGATGAAGTTCATCGTCAAGCCCAAGAGCTCCGCCTGCCGCGACGACTGACCCGGCCCCCGCCCACCCCTCTCCGCCGCCGGCCGCCGGCCGCCGCCACCGAGATGTTGGGTTGGTCGCCGCCGGCCATGGTGCGGCTGCTAGCCTACGTCGATCTTCTTCTTCTTCTGCATGCCACCTTCTGGGAGTTCTGGTTCGATATCAGAACATCATTGTGCTTTGATAATATTGTAAGTTATTAATTGCAATATATACTATATGTCTAATTGTGTTGCGTTGCGTGTGGTGTATTTGTATGGGTCATTCGGTTGAAATAAACGA                                                              ]
[+] EMBL AK101397             [ TCATCACAAGCATCTCCATCCATTCATCCAGTTAATTAATTAGCTAAGCTAGCCTTGCCGGAGACTGAAGAGAATTTGTTGGTTAATTAGAGTGAGGATTTCGTTGGGATCGATGGAGGGGAGGATTAGCAGTGCAACGCTGGTGGTGGCAGCGGTGTTGGCGATGCTGGTGCTGGTGCCGGCGGCGGCGCGCGCCGAGCGGTTCGTTGTCGGCGACGCGGCGCGGTGGACGTGGGGTTACAACTACACCGACTGGGTCATCAAGAAGGGCCCCTTCTTCCAAAACGACAGCCTTGTGTTCATGTACGACCCGCCGAACGCGACGACGCACGCGCACAGCGTGTACATGATGCGGAACGCGGCGGACTACCAGTCGTGCAACCTCAAGGCGGCGAAGCTGGTGGCCAACGTGATGCAGGGCGCCGGGTCGGGCTACGAGTTCGTCCTCCGGAAGCGCAAGCCCCACTACTTCGTCTGCGGCGAGCGCGGCGGCATCCACTGCACCATGGGCCAGATGAAGTTCATCGTCAAGCCCAAGAGCTCCGCCTGCCGCGACGACTGACCCGGCCCCCGCCCACCCCTCTCCGCCGCCGGCCGCCGGCCGCCGCCACCGAGATGTTGGGTTGGTCGCCGCCGGCCATGGTGCGGCTGCTAGCCTACGTCGATCTTCTTCTTCTTCTGCATGCCACCTTCTGGGAGTTCTGGTTCGATATCAGAACATCATTGTGCTTTGATAATATTGTAAGTTATTAATTGCAATATATACTATATGTCTAATTGTGTTGCGTTGCGTGTGGTGTATTTGTATGGGTCATTCGGTTGAAATAAACGATCGAGGGATTAATTGTACTGCGCATGTTCGTGGCGTGTGTTGATTTTTGTATATATGCAGTC]




>consensus_2029#0
CTCATCACAAGTATCTCCATCCATTCATCCAGTTAATTAATTAGCTAAGCTAGCTTTGCC
GGAGACTGAAGAGAATTTGTTGGTTAATTAGAGTGAGGATTTCGTTGGGATCGATGGAGG
GGAGGATTAGCAGTGCAACGCTGGTGGTGGCAGCGGTGTTGGCGATGCTGGTGCTGGTGC
CGGCGGCGGCGCGCGCCGAGCGGTTCGTTGTCGGCGACGCGGCGCGGTGGACGTGGGGTT
ACAACTACACCGACTGGGTCATCAAGAAGGGCCCCTTCTTCCAAAACGACAGCCTTGTGT
TCATGTACGACCCGCCGAACGCGACGACGCACGCGCACAGCGTGTACATGATGCGGAACG
CGGCGGACTACCAGTCGTGCAACCTCAAGGCGGCGAAGCTGGTGGCCAACGTGATGCAGG
GCGCCGGGTCGGGCTACGAGTTCGTCCTCCGGAAGCGCAAGCCCCACTACTTCGTCTGCG
GCGAGCGCGGCGGCATCCACTGCACCATGGGCCAGATGAAGTTCATCGTCAAGCCCAAGA
GCTCCGCCTGCCGCGACGACTGACCCGGCCCCCGCCCACCCCTCTCCGCCGCCGGCCGCC
GGCCGCCGCCACCGAGATGTTGGGTTGGTCGCCGCCGGCCATGGTGCGGCTGCTAGCCTA
CGTCGATCTTCTTCTTCTTCTGCATGCCACCTTCTGGGAGTTCTGGTTCGATATCAGAAC
ATCATTGTGCTTTGATAATATTGTAAGTTATTAATTGCAATATATACTATATGTCTAATT
GTGTTGCGTTGCGTGTGGTGTATTTGTATGGGTCATTCGGTTGAAATAAACGATCGAGGG
ATTAATTGTACTGCGCATGTTCGTGGCGTGTGTTGATTTTTGTATATATGCAGTC

clustalw multiple alignements is not computed in this case