cluster # 2036

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 2036 cluster # 2036 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_2036#0 length = 899 sequences # 2

consensusID : consensus_2036#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 899
fasta sequence

                              [ACTCGCTCAACCTCGTCGCCGGCTGGCTCGTCCTCTTCGGCGGCGGCTGCGAGGGAGGTCGCCATCTTGATGATACTTGGGTGGCATATGTTGGAAATGGAGCTGGGAATAGATCATCTGCTGTGTTTAGCTGGCAGCAATTAGACTCTGGCACTCCAAGTGGTCGTTTCGGTCATTCATGCTCTATAGTTGGAGATGCATTAGTCCTTTTTGGTGGAATCAATGATCAGGGGCAGCGTTTGAATGA-ACATGGATAGGTCAAATCATTTGTGAAGAGTCTCGCAGGATGAAGATCTCATGGAGACTGCTGGAGGTAGGCCCACATGCACCATATCCTCGTGGAGCTCATGCAGCCTGCTGTGTGGATGATAAGTTTATTGTAATTCATGGTGGCATAGGGCAGTCTGGAAGCCGGCTTGGGGATACATGGCTTCTTGATCTCTCTAATGGCCTCCGATCTGGCA-TTGGCACCAAATAGAGGATACTGAGCCTTTGCCTTTATCTCGTTCTGGACACACTTTAACTTGGATTGGTGGGAGTCGCATGGTTCTTTTAGG-GGTAGAGGGATCAGAATTTGATGTGCCTTAATTGATGTTTGGCTG-TTGATATCAATGAAAGGTACCCAAAATGGAAGGAGCTAAAGTATGACCTGTCTAGTGTTCTAGGTGAAATGCCTTTTCCACGGGTTGGGCATTCAGCAACGCTTGTCTTAGGTGGTAAAATCCTAGTGTATGGTGGAGAGGACTCCCAAAGGCGACGGAAGGATGACTTTTGGACCTTAGATTTACCTGCTCTGCTTCAATTTGAGTCAGGTTCCAAGAAAATGACAAAAAGGATGTGGAAAAAGCTAAGAATTGATGGTCAATGCCCAAATTACAGGTCCTTTCATGGGGCATGTG]

[-] EMBL BU667359             [ACTCGCTCAACCTCGTCGCCGGCTGGCTCGTCCTCTTCGGCGGCGGCTGCGAGGGAGGTCGCCATCTTGATGATACTTGGGTGGCATATGTTGGAAATGGAGCTGGGAATAGATCATCTGCTGTGTTTAGCTGGCAGCAATTAGACTCTGGCACTCCAAGTGGTCGTTTCGGTCATTCATGCTCTATAGTTGGAGATGCATTAGTCCTTTTTGGTGGAATCAATGATCAGGGGCAGCGTTTGAATGA ACATGGATAGGTCAAATCATTTGTGAAGAGTCTCGCAGGATGAAGATCTCATGGAGACTGCTGGAGGTAGGCCCACATGCACCATATCCTCGTGGAGCTCATGCAGCCTGCTGTGTGGATGATAAGTTTATTGTAATTCATGGTGGCATAGGGCAGTCTGGAAGCCGGCTTGGGGATACATGGCTTCTTGATCTCTCTAATGGCCTCCGATCTGGCA TTGGCACCAAATAGAGGATACTGAGCCTTTGCCTTTATCTCGTTCTGGACACACTTTAACTTGGATTGGTGGGAGTCGCATGGTTCTTTTAGG GGTAGAGGGATCAGAATTTGATGTGCCTTAATTGATGTTTGGCTG TTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CB627143             [                                                                    GATGATACTTGGGTGGCATATGTTGGAAATGGAGCTGGGAATAGATCATCTGCTGTGTTTAGCTGGCAGCAATTAGACTCTGGCACTCCAAGTGGTCGTTTCGGTCATTCATGCTCTATAGTTGGAGATGCATTAGTCCTTTTTGGTGGAATCAATGATCAGGGGCAGCGTTTGAATGACACATGGATAGGTCAAATCATTTGTGAAGAGTCTCGCAGGATGAAGATCTCATGGAGACTGCTGGAGGTAGGCCCACATGCACCATATCCTCGTGGAGCTCATGCAGCCTGCTGTGTGGATGATAAGTTTATTGTAATTCATGGTGGCATAGGGCAGTCTGGAAGCCGGCTTGGGGATACATGGCTTCTTGATCTCTCTAATGGCCTCCGATCTGGCATTTGGCACCAAATAGAGGATACTGAGCCTTTGCCTTTATCTCGTTCTGGCCACACTTTAACTTGGATTGGTGGGAGTCGCATGGTTCTTTTTGGTGGTAGA GGATCAGAATTTGATGTG CTTAA TGATGTCTGGCTGCTTGATATCAATGAAAGGTACCCAAAATGGAAGGAGCTAAAGTATGACCTGTCTAGTGTTCTAGGTGAAATGCCTTTTCCACGGGTTGGGCATTCAGCAACGCTTGTCTTAGGTGGTAAAATCCTAGTGTATGGTGGAGAGGACTCCCAAAGGCGACGGAAGGATGACTTTTGGACCTTAGATTTACCTGCTCTGCTTCAATTTGAGTCAGGTTCCAAGAAAATGACAAAAAGGATGTGGAAAAAGCTAAGAATTGATGGTCAATGCCCAAATTACAGGTCCTTTCATGGGGCATGTG]




>consensus_2036#0
ACTCGCTCAACCTCGTCGCCGGCTGGCTCGTCCTCTTCGGCGGCGGCTGCGAGGGAGGTC
GCCATCTTGATGATACTTGGGTGGCATATGTTGGAAATGGAGCTGGGAATAGATCATCTG
CTGTGTTTAGCTGGCAGCAATTAGACTCTGGCACTCCAAGTGGTCGTTTCGGTCATTCAT
GCTCTATAGTTGGAGATGCATTAGTCCTTTTTGGTGGAATCAATGATCAGGGGCAGCGTT
TGAATGAACATGGATAGGTCAAATCATTTGTGAAGAGTCTCGCAGGATGAAGATCTCATG
GAGACTGCTGGAGGTAGGCCCACATGCACCATATCCTCGTGGAGCTCATGCAGCCTGCTG
TGTGGATGATAAGTTTATTGTAATTCATGGTGGCATAGGGCAGTCTGGAAGCCGGCTTGG
GGATACATGGCTTCTTGATCTCTCTAATGGCCTCCGATCTGGCATTGGCACCAAATAGAG
GATACTGAGCCTTTGCCTTTATCTCGTTCTGGACACACTTTAACTTGGATTGGTGGGAGT
CGCATGGTTCTTTTAGGGGTAGAGGGATCAGAATTTGATGTGCCTTAATTGATGTTTGGC
TGTTGATATCAATGAAAGGTACCCAAAATGGAAGGAGCTAAAGTATGACCTGTCTAGTGT
TCTAGGTGAAATGCCTTTTCCACGGGTTGGGCATTCAGCAACGCTTGTCTTAGGTGGTAA
AATCCTAGTGTATGGTGGAGAGGACTCCCAAAGGCGACGGAAGGATGACTTTTGGACCTT
AGATTTACCTGCTCTGCTTCAATTTGAGTCAGGTTCCAAGAAAATGACAAAAAGGATGTG
GAAAAAGCTAAGAATTGATGGTCAATGCCCAAATTACAGGTCCTTTCATGGGGCATGTG

clustalw multiple alignements is not computed in this case