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Oryza sativa
cluster # 2070 cluster # 2070       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2070#0 length = 917 sequences # 2  

consensusID : consensus_2070#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 917
fasta sequence
                              [AAGGGACAAGGTGCGAAAGATGGAGTATAAAAATAGGGAGGATTTTAGGCATGATGTGGCTCAGATAGCACTGAATGCACATACATACAATCTTAACCGCCATCCCCACATCCCTCCGCTTGCTGATGAGCTCTTGGAGTTGTGTGATTATCTTCTTGAGGAAAGCGCGGATGTGCTAGATGATGCGGAATACGCGATCGAGGACTAGTGCACACTAACCAGATATGGCATTTAGATCTTGCTATATTCTAACTTAGATGCTGTAATGCTGACCTGTAGGAGGGGGGAAGAGCACCTGTAGAATTTTTCATTTTAGGCTCTGGCTATGGTATACCTGGGATCCCCAATTCCAACTATTTTGCCTCTTGTTGGTATTGGGAGTTGGGAGTTGGAATGTACACAAACTCTAGGTTAGACATTGAGGGCCCACTGTAACTATTGGCCTCTTGCTGTAAAAATGTAGCGATGTAATTTTTTGTCCATATCCATGG-CCTTGGGTGTCTCAAATTCTGATGTTGTAGCATTACATCCTATGTGAATGGCATCTAACC--ATGAGTCAAAGGTGCAACACGTCAAAGCATGTGCTAAAGGTTGTACCCGGTCTAACCTGATTGGTGAAGGTCCCTTCAAATCCTGCATGATTAGAGGCTTACCATGCAACTATGCGAAGTCAAAACCTGTAATTGTAACTGTAACGTGAGAGATGGTGTACCGGCAGTACAAGTTGTTTGAGTTGCTGCCAGATGATGATGTATTTGATGTTGCATGCTTTGAATGAGTATTCACCGCTCAACGATATCATTGGATGGTGCAGTTCATAGTTTCATACCTTTGGTTTTTGGTTTGTGATGTTGTAGCAACAGAACAACAAGTAATCATCCATTAAACAATCAAGTCCCTTTCTCCTAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK108404             [AAGGGACAAGGTGCGAAAGATGGAGTATAAAAATAGGGAGGATTTTAGGCATGATGTGGCTCAGATAGCACTGAATGCACATACATACAATCTTAACCGCCATCCCCACATCCCTCCGCTTGCTGATGAGCTCTTGGAGTTGTGTGATTATCTTCTTGAGGAAAGCGCGGATGTGCTAGATGATGCGGAATACGCGATCGAGGACTAGTGCACACTAACCAGATATGGCATTTAGATCTTGCTATATTCTAACTTAGATGCTGTAATGCTGACCTGTAGGAGGGGGGAAGAGCACCTGTAGAATTTTTCATTTTAGGCTCTGGCTATGGTATACCTGGGATCCCCAATTCCAACTATTTTGCCTCTTGTTGGTATTGGGAGTTGGGAGTTGGAATGTACACAAACTCTAGGTTAGACATTGAGGGCCCACTGTAACTATTGGCCTCTTGCTGTAAAAATGTAGCGATGTAATTTTTTGTCCATATCCATGG CCTTGGGTGTCTCAAATTCTGATGTTGTAGCATTACATCCTATGTGAATGGCATCTAACC  ATGAGTCAAAGGTGCAACACGTCAAAGCATGTGCTAAAGGTTGTACCCGGTCTAACCTGATTGGTGAAGGTCCCTTCAAATCCTGCATGATTAGAGGCTTACCATGCAACTATGCGAAGTCAAAACCTGTAATTGTAACTGTAACGTGAGAGATGGTGTACCGGCAGTACAAGTTGTTTGAGTTGCTGCCAGATGATGATGTATTTGATGTTGCATGCTTTGAATGAGTATTCA                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BQ908975             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CATTGAGGNCCCACTGTAACTATTGGCCTCTTGCTGTAAAAATGTAGCGATGTAATTTTTTGTCCATATCCATGGCCCTTGGGTGTCTCAAATTCTGATGTTGTAGCATTACATCCTATGTGAATGGCATCTAACCATATGAGTCAAAGGTGCAACACGTCAAAGTATGTGCTAAAGGTTGTACCCGGTCTAACCTGATTGGTGAAGGTCCCTTCAAATCCTGCATGATTAGAGGCTTACCATACAACTATGCGAAGTCAAAACCTGTAATTGTAACTGTAACGTGAGAGATGGTGTACCGGCAGTACAAGTTGTTTGAGTTGCTGCCAGATGATGATGTATTTGATGTTGCATGCTTTGAATGAGTATTCACCGCTCAACGATATCATTGGATGGTGCAGTTCATAGTTTCATACCTTTGGTTTTTGGTTTGTGATGTTGTAGCAACAGAACAACAAGTAATCATCCATTAAACAATCAAGTCCCTTTCTCCTAAAAAAAAAA]


>consensus_2070#0 AAGGGACAAGGTGCGAAAGATGGAGTATAAAAATAGGGAGGATTTTAGGCATGATGTGGC TCAGATAGCACTGAATGCACATACATACAATCTTAACCGCCATCCCCACATCCCTCCGCT TGCTGATGAGCTCTTGGAGTTGTGTGATTATCTTCTTGAGGAAAGCGCGGATGTGCTAGA TGATGCGGAATACGCGATCGAGGACTAGTGCACACTAACCAGATATGGCATTTAGATCTT GCTATATTCTAACTTAGATGCTGTAATGCTGACCTGTAGGAGGGGGGAAGAGCACCTGTA GAATTTTTCATTTTAGGCTCTGGCTATGGTATACCTGGGATCCCCAATTCCAACTATTTT GCCTCTTGTTGGTATTGGGAGTTGGGAGTTGGAATGTACACAAACTCTAGGTTAGACATT GAGGGCCCACTGTAACTATTGGCCTCTTGCTGTAAAAATGTAGCGATGTAATTTTTTGTC CATATCCATGGCCTTGGGTGTCTCAAATTCTGATGTTGTAGCATTACATCCTATGTGAAT GGCATCTAACCATGAGTCAAAGGTGCAACACGTCAAAGCATGTGCTAAAGGTTGTACCCG GTCTAACCTGATTGGTGAAGGTCCCTTCAAATCCTGCATGATTAGAGGCTTACCATGCAA CTATGCGAAGTCAAAACCTGTAATTGTAACTGTAACGTGAGAGATGGTGTACCGGCAGTA CAAGTTGTTTGAGTTGCTGCCAGATGATGATGTATTTGATGTTGCATGCTTTGAATGAGT ATTCACCGCTCAACGATATCATTGGATGGTGCAGTTCATAGTTTCATACCTTTGGTTTTT GGTTTGTGATGTTGTAGCAACAGAACAACAAGTAATCATCCATTAAACAATCAAGTCCCT TTCTCCTAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)