cluster # 2328

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 2328 cluster # 2328 Sequences # 2 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2328#0 length = 1329 sequences # 2
consensusID : consensus_2328#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1329
fasta sequence
                              [GGAGATGCTTAGAGGAAGGCACTGTGTTCCAGGGCGATCTGCTGAACTTTAGGAAAGATGGTTCTCCATTCATGGCAAAGCTCCAGTTAACACCCATTTATGGAGATGACGAAACAATAACCCACTATATGGGCATGCAGTTCTTCAATGACTCTAATGTTGATTTGGGGCCATTGTCTGTCTCTACAACAAAGGAGATTGTGAGATCTACTTTGATTACACCAGATAACACCATCCGACCAAGTCCAATGGGGAAGGGCTTCTGCTCAGAGCATTCTGATCTTTTCCTATTGAGTGATGAGGTACTTTGCCAGAAGATCCTATCAAGATTATCGCCCAGGGATATAGCATCTGTAAACTCTGTATGTAAACGGCTGTACCACTTAACAAGGAATGACGACCTTTGGAGAATGGTTTGTCAGAATGCATGGGGCAGTGAAGCAACTCAAGTTCTTGAGACTGTGGCTGGAACAAGAAGTTTGGCATGGGGGCGGTTAGCAAGAGAGTTGACCACCCTGGAAGCTGTCACCTGGAGGAAATTGACTGTTGGGGGTGCAGTGGAGCCTTCTCGCTGCAACTTCAGCGCTTGTGCGGCAGGGAACCGTGTTGTCCTTTTTGGAGGGGAAGGTGTTAACATGCAGCCAATGAATGATACATTTGTGCTTGATTTGAATGCCAGCAAGCCAGAATGGAGGCACATCAATGTGAGATCGGCTCCTCCTGGGCGCTGGGGTCATACCCTTTCTTGCCTAAATGGATCACGGTTGGTTTTGTTTGGTGGTTGTGGAAGGCAGGGCCTGCTCAATGATGTGTTCATGTTGGATTTGGATGCACAGCAACCAACTTGGCGTGAGATTCCTGGCCTTGCACCACCAGTTCCACGGTCATGGCATAGTTCTTGCACATTGGATGGAACAAAATTGGTGGTATCTGGTGGCTGTGCTGATTCTGGTGTGCTTCTCAGTGACACGTATCTTTTGGATGTAACAATGGAAAGACCTGTTTGGAGGGAGATACCTGCATCTTGGACTCCACCTTGTAGATTGGGGCACTCGCTCTCTGTCTACGATGGCAGGAAAATCCTGATGTTTGGTGGTCTTGCTAAAAGCGGTCCTCTACGACTAAGGTCTAATGATGTGTTCACATTGGATTTAAGTGAAAATAAGCCATGCTGGCGGTGTATCACCGGCAGTGGAATGCCAGGAGCCAGTAATCCAGCTGGAGTTGGTCCACCCCCTCGCCTTGACCATGTCGCTGTGAGCCTTCCTGGAGGGAGAATTTTGATATTTGGTGGATCAGTGGCAGGTCTTCACTCCGCTTCAAAGCTTT]

[+] EMBL CF306363             [GGAGATGCTTAGAGGAAGGCACTGTGTTCCAGGGCGATCTGCTGAACTTTAGGAAAGATGGTTCTCCATTCATGGCAAAGCTCCAGTTAACACCCATTTATGGAGATGACGAAACAATAACCCACTATATGGGCATGCAGTTCTTCAATGACTCTAATGTTGATTTGGGGCCATTGTCTGTCTCTACAACAAAGGAGATTGTGAGATCTACTTTGATTACACCAGATAACACCATCCGACCAAGTCCAATGGGGAAGGGCTTCTGCTCAGAGCATTCTGATCTTTTCCTATTGAGTGATGAGGTACTTTGCCAGAAGATCCTATCAAGATTATCGCCCAGGGATATAGCATCTGTAAACTCTGTATGTAAACGGCTGTACCACTTAACAAGGAATGACGACCTTTGGAGAATGGTTTGTCAGAATGCATGGGGCAGTGAAGCAACTCAAGTTCTTGAGACTGTGGCTGGAACAAGAAGTTTGGCATGGGGGCGGTTAGCAAGAGAGTTGACCACCCTGGAAGCTGTCACCTGGAGGAAATTGACTGTTGGGGGTGCAGTGGAGCCTTCTCGCTGCAACTTCAGCGCTTGTGCGGCAGGGAACCGTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CB656027             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CACCTGGAGGAAATTGACTGTTGGGGGTGCAGTGGAGCCTTCTCGCTGCAACTTCAGCGCTTGTGCGGCAGGGAACCGTGTTGTCCTTTTTGGAGGGGAAGGTGTTAACATGCAGCCAATGAATGATACATTTGTGCTTGATTTGAATGCCAGCAAGCCAGAATGGAGGCACATCAATGTGAGATCGGCTCCTCCTGGGCGCTGGGGTCATACCCTTTCTTGCCTAAATGGATCACGGTTGGTTTTGTTTGGTGGTTGTGGAAGGCAGGGCCTGCTCAATGATGTGTTCATGTTGGATTTGGATGCACAGCAACCAACTTGGCGTGAGATTCCTGGCCTTGCACCACCAGTTCCACGGTCATGGCATAGTTCTTGCACATTGGATGGAACAAAATTGGTGGTATCTGGTGGCTGTGCTGATTCTGGTGTGCTTCTCAGTGACACGTATCTTTTGGATGTAACAATGGAAAGACCTGTTTGGAGGGAGATACCTGCATCTTGGACTCCACCTTGTAGATTGGGGCACTCGCTCTCTGTCTACGATGGCAGGAAAATCCTGATGTTTGGTGGTCTTGCTAAAAGCGGTCCTCTACGACTAAGGTCTAATGATGTGTTCACATTGGATTTAAGTGAAAATAAGCCATGCTGGCGGTGTATCACCGGCAGTGGAATGCCAGGAGCCAGTAATCCAGCTGGAGTTGGTCCACCCCCTCGCCTTGACCATGTCGCTGTGAGCCTTCCTGGAGGGAGAATTTTGATATTTGGTGGATCAGTGGCAGGTCTTCACTCCGCTTCAAAGCTTT]




>consensus_2328#0
GGAGATGCTTAGAGGAAGGCACTGTGTTCCAGGGCGATCTGCTGAACTTTAGGAAAGATG
GTTCTCCATTCATGGCAAAGCTCCAGTTAACACCCATTTATGGAGATGACGAAACAATAA
CCCACTATATGGGCATGCAGTTCTTCAATGACTCTAATGTTGATTTGGGGCCATTGTCTG
TCTCTACAACAAAGGAGATTGTGAGATCTACTTTGATTACACCAGATAACACCATCCGAC
CAAGTCCAATGGGGAAGGGCTTCTGCTCAGAGCATTCTGATCTTTTCCTATTGAGTGATG
AGGTACTTTGCCAGAAGATCCTATCAAGATTATCGCCCAGGGATATAGCATCTGTAAACT
CTGTATGTAAACGGCTGTACCACTTAACAAGGAATGACGACCTTTGGAGAATGGTTTGTC
AGAATGCATGGGGCAGTGAAGCAACTCAAGTTCTTGAGACTGTGGCTGGAACAAGAAGTT
TGGCATGGGGGCGGTTAGCAAGAGAGTTGACCACCCTGGAAGCTGTCACCTGGAGGAAAT
TGACTGTTGGGGGTGCAGTGGAGCCTTCTCGCTGCAACTTCAGCGCTTGTGCGGCAGGGA
ACCGTGTTGTCCTTTTTGGAGGGGAAGGTGTTAACATGCAGCCAATGAATGATACATTTG
TGCTTGATTTGAATGCCAGCAAGCCAGAATGGAGGCACATCAATGTGAGATCGGCTCCTC
CTGGGCGCTGGGGTCATACCCTTTCTTGCCTAAATGGATCACGGTTGGTTTTGTTTGGTG
GTTGTGGAAGGCAGGGCCTGCTCAATGATGTGTTCATGTTGGATTTGGATGCACAGCAAC
CAACTTGGCGTGAGATTCCTGGCCTTGCACCACCAGTTCCACGGTCATGGCATAGTTCTT
GCACATTGGATGGAACAAAATTGGTGGTATCTGGTGGCTGTGCTGATTCTGGTGTGCTTC
TCAGTGACACGTATCTTTTGGATGTAACAATGGAAAGACCTGTTTGGAGGGAGATACCTG
CATCTTGGACTCCACCTTGTAGATTGGGGCACTCGCTCTCTGTCTACGATGGCAGGAAAA
TCCTGATGTTTGGTGGTCTTGCTAAAAGCGGTCCTCTACGACTAAGGTCTAATGATGTGT
TCACATTGGATTTAAGTGAAAATAAGCCATGCTGGCGGTGTATCACCGGCAGTGGAATGC
CAGGAGCCAGTAATCCAGCTGGAGTTGGTCCACCCCCTCGCCTTGACCATGTCGCTGTGA
GCCTTCCTGGAGGGAGAATTTTGATATTTGGTGGATCAGTGGCAGGTCTTCACTCCGCTT
CAAAGCTTT
clustalw multiple alignements is not computed in this case