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Oryza sativa
cluster # 236 cluster # 236       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_236#0 length = 4128 sequences # 2  

consensusID : consensus_236#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 4128
fasta sequence
                              [GAGGAGGCCAGCCAGCATTCGCTACGAGCAAAGAAGCGGAGAATCCAGCGAAGGCAAGCAGATCCAGGAGCTGCGAAGAGGCGGATTGATTTGTTTCGGTGGCCCAACTTGGCAGATCGAGAGCAAGTCTGGTTAGCTGCGCATCATCATCATCCTCCCTCTACTGATTTGAAGACGTGGCTGTGGCACCGGAATTGTTACTGGACTTTTGTGCTCCGACGCTTATACGTAATTCCCAGCGTGACAAGGTTATAAGATATTTTGACTTTGGTCAAAGTCAAACTGCTTCAAGTTTGATCAAGTTTATAGAAAAAAAAGGGTTTGAAGGAATCTCTAGACTCCAATCACCATGAGCTTATCCAAGACCATTGGGTTCATTAGTGGTGTCAATGAGTGTGTAAATTTATTTCAGTGGGCTAGATCTGCCATTTCATCTCTCCACACTAGATGGAGTGGCACGCAGGATCAAAAGCTTCAGGATGAAGTATTGCAATTGCAGAGTGGCCTGCAACGTCTCAAGGATACTCTTCCAGCAATGTATGATCTTATTGATAGAGCAGAGTGGAGAAGCCATGAAGACTGTGTGGCCAAACTCCTTCCAAATCTCAAGGACGCAGTGTACAATTCTGATGATCTTCTCGATGAGTTCAGATGGTACGAACAAAAGGTGGCACTGGAAGGTAATGCTGCAAGCCAATCTCCTTTTTTGGAATTCTTTGATTGTGTTATTCAAGGAAGATTCAATAAAGTGACTGATATCATTGAAAGGCTAAATAATGTTTCTAGCGAGCTGGAGAAGCTAGGGTTACGTGAAATTCCCCAGCGGTTTGACAAAACATTGAGGCCAGAAACTAGCTCTTTCCCAAGTGATAGAGAAATATACGGTCGTGACAATGAACTGGAGAAAGTGATGGAATTGCTTAGTGTACCTAAAAATTATACTGGTGTTCATTCCAAACGCAAGAGAGGAAGTAATGATGCATCAACAAGCACATCAACATCCAACCAAGTTAGTGTTCCTATTTTGCCGATAGTTGGAATTGGGGGTGTTGGAAAGACCACTTTGGCCCAACATATCTGCAACCACCTATTAGTTAAGTCTCACTTTGACCCAGTAATTTGGATATTCGTCTCAGATGACTTTGATGTCAAGAGATTAACTAAGGAGGCCATAGAATCCGCTTCTGGAAAAGAGGCAAAAACCGATCATTTGGATTCTATTCAGCATGTTCTTCGTGAAAATGTGAAAAATAAGAGGATCTTGATAATACTTGATGATGTATGGGATGATGCCTTAAAGGAAAATGGGCAGTGTTGGAAGAAGTTTTGTTCACCTTTAGCAAATGTATGCCAGGGAAGCATGATGTTAATTACCACTAGATCTTCCAAGGTTTCTAATGCACTCGGGACATTGGAACCCTTCACAGTGAATTGTTTGCAGAATGATATCTTTTGGGATTTCTTCAAATTATGTGCATTTGGGTCTGACAGTTCAAACAATGATCCTGAGTTAGAGTGCATTGGCAGAAGCATACTTCCTAAGTTAAAGGGTTCACCTCTAGCTGCGAAAACTCTTGGACGCTTGTTAAGAATGGACCATCACACGACGCATTGGAAAAATGTACAAAAGAGTGAACTGTGGGAGTTGAAACAAGAGGAGACTGACATTTTGCCAGCTCTTCAGTTGAGCTACATGTACTTACCCTTACATTTGAAGAGATGCTTCTCATTTTGTGCTGTGTACCCAAAGGATTATAATTTTGAAAAAGATAGTTTATGTGAAATTTGGGTAGCTGAAGGCTTTGTGGAACCTGAAGGGGACATTCCAATTCTAGATACGAGCAAAAAGTATTTTGAAGACCTTGTAAGCCGGTCCTTCTTTCAAAAAGTTTATGGTACATATGTAATCCATGATTTGATGCATGATATGGCACAACTAGTTTCAAAGCATGATTGTTTCATCATAAAAGACACAGGCGACTTTCAAAAAGTTCCTCACAATGTTCGCCATTTGATGATACTTGATAGCGAAAAGTTTGATTGTTCCAACTTATTGAGCCTATGCAAGCACACAAAGTTGCGTACTATACTCTGTAACAAGTCTCTATGGCATAAAACTTTAGCTTCTGTAATGGACCATTGGTGTACTGAACTTTGGCAGATACGTGTGTTTTCTTGTGCCTTCCTAAAGGAGATACCAAAGAGTATTGGAAATTTGAAACATCTTCGTTACCTTCAAATCTCTGGATCTTGTCATTTGAACAGTATTCCTCTACAGTTCTGTTGCCTCTACAATTTGCAGTGTTTTAATGCTTTGGAGTGTGTAGTTGAAAGCTTGCCTTGTGACTTTGATAGGTTGATCAATCTGCGGAGATATAAATCACAGGGATTTGTATACGATCGAATGGGACAACTGCATCTCGGTACACATTGGGAACATGAAGTTAGATTGATGAAGAATTTCAACCAATTCTATGGGGATTTGAGGCTATCCAATCTTGGTGCACTAAGTAAGGACCTTGCAGCTGAAATCAAACTAAACAGGAAGAGATATATTGGAAGTCTGACCCTGCAATGGTGCCTATGGATATCACAAGAGCACAATGAGATGGAAGTGTTCCAAGTCCTACATCCTCCCACCAGTCTTAGATCTCTGAAACTCATGTATTATCTAGGGGAATCTCTTCCATGCTGGTTTCAGGAACAAAATGGTTGTAATGAGATAGCAGGAGTAATTGCTAACAACAATAATGGCTGCATTTCTGTTTTCTCATCGCTGACCTACCTCGACATTTCTGATTGTGAAAAGTTATCAAACCTCAACCAGTTCCTGCAGGTAGCTCATGTACCATCCCTCGAAAGAATACGAATATCAAACTGTGGAAGGGTAGCATCAACTCCAAGGTTTGGTGACTTTCATTGCCTGGAAGAACTAATTCTGGATCATTGCAAGATATTTGACCATTCAGAAAGCTTGTCAATACCTTCCCTCAAGAAGCTCGTACTACATTATTCTGGGAATCCAATTAGCAAAATCGAGTGCCGCTCTCTCACATCTCTGTCCTTTGTGTGTCCGAGTGTGACGTCTATTCCCCTACAAGTGTGGAGTAGTAATCTTCCTGCTCTGCAGAATTTAGACATAAAGTGGTGTCCATCTCTTACATTTATTGGAGAATCTGAACCAGCGGACTTCACTAACCTTTCTCACCAAGTGAGCAGCAGCAGCAGCAGAATTAGAACATTCTCATCCCTTACTGTGCTAACCATTCACGGCTGCGAGAAATTGTTGACCCTTGATGATCTCCTGAAACAAGAATATCTACCTTTCATCAAGAGTATTAAGATTTCCTATTGTCAAGGGCTACTGTCCTTGCCCGGTGAAATGTTTGGGTCTTTTCCTTTCCTGAATGATTTGGGCATTTGGAACTGCCCAAGTCTCACTTGGCAGAGGGGATTGGTTTTACCATCATCTCTCCTAGAGCTCAACTTAATTGATTGTGGTTATTTCTCTACATGGCTTCCTAGCTGTTTGGAGAACGTCACTTCCCTGGTTATACTGAGAATAATTAAATGTCGGGGTATAACATATATTACAGATCAAACATTGAGCAGTAATCTTGCCTCACTCCAGGAATTATGCATTGAGGATTGCCCAGACCTTGTTTCAATCGGTAGGGGAAAGTTGATCGCAAAATTAAAGAAGGTGCGTATATTTGAAAGAAGGTAGATTTCATCAGCGTGGCTTCGCTGTTTCCCCATGCGTGGGTGGAATGGCTGGCAAGATTGGGTAATGGCTGCAGGAGTACTTGCAAAGAAGGCCATGAGTCCTATTTTCCTCCCTTTGTTGTCCTGCGATTTATTATGGCAAAACAAATTGTTGCAAGGCTGATAATGGTCTCTGAAAGGTTGCTCTCTTGTCCTGACAGTGCGGCATATCCGTTAGCATTTCCCCTTTCTGTTTTAAATAAGTTGGGGAGAAAACATTCATGTCATTTAAAACCTCTGTTAAGTTGTGTGTTTTTGTTTGATTAATCTTTAATCATGCTCGGAGCCTCGGACAACTATACGTTACCAAAGTTTTAATCGCAGTGGTCTACTACGGATATTTTCTGATGTATACCATACTAG]

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[+] EMBL AK063172             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AAGAGGCAAAAACCGATCATTTGGATTCTATTCAGCATGTTCTTCGTGAAAATGTGAAAAATAAGAGGATCTTGATAATACTTGATGATGTATGGGATGATGCCTTAAAGGAAAATGGGCAGTGTTGGAAGAAGTTTTGTTCACCTTTAGCAAATGTATGCCAGGGAAGCATGATGTTAATTACCACTAGATCTTCCAAGGTTTCTAATGCACTCGGGACATTGGAACCCTTCACAGTGAATTGTTTGCAGAATGATATCTTTTGGGATTTCTTCAAATTATGTGCATTTGGGTCTGACAGTTCAAACAATGATCCTGAGTTAGAGTGCATTGGCAGAAGCATACTTCCTAAGTTAAAGGGTTCACCTCTAGCTGCGAAAACTCTTGGACGCTTGTTAAGAATGGACCATCACACGACGCATTGGAAAAATGTACAAAAGAGTGAACTGTGGGAGTTGAAACAAGAGGAGACTGACATTTTGCCAGCTCTTCAGTTGAGCTACATGTACTTACCCTTACATTTGAAGAGATGCTTCTCATTTTGTGCTGTGTACCCAAAGGATTATAATTTTGAAAAAGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]


>consensus_236#0 GAGGAGGCCAGCCAGCATTCGCTACGAGCAAAGAAGCGGAGAATCCAGCGAAGGCAAGCA GATCCAGGAGCTGCGAAGAGGCGGATTGATTTGTTTCGGTGGCCCAACTTGGCAGATCGA GAGCAAGTCTGGTTAGCTGCGCATCATCATCATCCTCCCTCTACTGATTTGAAGACGTGG CTGTGGCACCGGAATTGTTACTGGACTTTTGTGCTCCGACGCTTATACGTAATTCCCAGC GTGACAAGGTTATAAGATATTTTGACTTTGGTCAAAGTCAAACTGCTTCAAGTTTGATCA AGTTTATAGAAAAAAAAGGGTTTGAAGGAATCTCTAGACTCCAATCACCATGAGCTTATC CAAGACCATTGGGTTCATTAGTGGTGTCAATGAGTGTGTAAATTTATTTCAGTGGGCTAG ATCTGCCATTTCATCTCTCCACACTAGATGGAGTGGCACGCAGGATCAAAAGCTTCAGGA TGAAGTATTGCAATTGCAGAGTGGCCTGCAACGTCTCAAGGATACTCTTCCAGCAATGTA TGATCTTATTGATAGAGCAGAGTGGAGAAGCCATGAAGACTGTGTGGCCAAACTCCTTCC AAATCTCAAGGACGCAGTGTACAATTCTGATGATCTTCTCGATGAGTTCAGATGGTACGA ACAAAAGGTGGCACTGGAAGGTAATGCTGCAAGCCAATCTCCTTTTTTGGAATTCTTTGA TTGTGTTATTCAAGGAAGATTCAATAAAGTGACTGATATCATTGAAAGGCTAAATAATGT TTCTAGCGAGCTGGAGAAGCTAGGGTTACGTGAAATTCCCCAGCGGTTTGACAAAACATT GAGGCCAGAAACTAGCTCTTTCCCAAGTGATAGAGAAATATACGGTCGTGACAATGAACT GGAGAAAGTGATGGAATTGCTTAGTGTACCTAAAAATTATACTGGTGTTCATTCCAAACG CAAGAGAGGAAGTAATGATGCATCAACAAGCACATCAACATCCAACCAAGTTAGTGTTCC TATTTTGCCGATAGTTGGAATTGGGGGTGTTGGAAAGACCACTTTGGCCCAACATATCTG CAACCACCTATTAGTTAAGTCTCACTTTGACCCAGTAATTTGGATATTCGTCTCAGATGA CTTTGATGTCAAGAGATTAACTAAGGAGGCCATAGAATCCGCTTCTGGAAAAGAGGCAAA AACCGATCATTTGGATTCTATTCAGCATGTTCTTCGTGAAAATGTGAAAAATAAGAGGAT CTTGATAATACTTGATGATGTATGGGATGATGCCTTAAAGGAAAATGGGCAGTGTTGGAA GAAGTTTTGTTCACCTTTAGCAAATGTATGCCAGGGAAGCATGATGTTAATTACCACTAG ATCTTCCAAGGTTTCTAATGCACTCGGGACATTGGAACCCTTCACAGTGAATTGTTTGCA GAATGATATCTTTTGGGATTTCTTCAAATTATGTGCATTTGGGTCTGACAGTTCAAACAA TGATCCTGAGTTAGAGTGCATTGGCAGAAGCATACTTCCTAAGTTAAAGGGTTCACCTCT AGCTGCGAAAACTCTTGGACGCTTGTTAAGAATGGACCATCACACGACGCATTGGAAAAA TGTACAAAAGAGTGAACTGTGGGAGTTGAAACAAGAGGAGACTGACATTTTGCCAGCTCT TCAGTTGAGCTACATGTACTTACCCTTACATTTGAAGAGATGCTTCTCATTTTGTGCTGT GTACCCAAAGGATTATAATTTTGAAAAAGATAGTTTATGTGAAATTTGGGTAGCTGAAGG CTTTGTGGAACCTGAAGGGGACATTCCAATTCTAGATACGAGCAAAAAGTATTTTGAAGA CCTTGTAAGCCGGTCCTTCTTTCAAAAAGTTTATGGTACATATGTAATCCATGATTTGAT GCATGATATGGCACAACTAGTTTCAAAGCATGATTGTTTCATCATAAAAGACACAGGCGA CTTTCAAAAAGTTCCTCACAATGTTCGCCATTTGATGATACTTGATAGCGAAAAGTTTGA TTGTTCCAACTTATTGAGCCTATGCAAGCACACAAAGTTGCGTACTATACTCTGTAACAA GTCTCTATGGCATAAAACTTTAGCTTCTGTAATGGACCATTGGTGTACTGAACTTTGGCA GATACGTGTGTTTTCTTGTGCCTTCCTAAAGGAGATACCAAAGAGTATTGGAAATTTGAA ACATCTTCGTTACCTTCAAATCTCTGGATCTTGTCATTTGAACAGTATTCCTCTACAGTT CTGTTGCCTCTACAATTTGCAGTGTTTTAATGCTTTGGAGTGTGTAGTTGAAAGCTTGCC TTGTGACTTTGATAGGTTGATCAATCTGCGGAGATATAAATCACAGGGATTTGTATACGA TCGAATGGGACAACTGCATCTCGGTACACATTGGGAACATGAAGTTAGATTGATGAAGAA TTTCAACCAATTCTATGGGGATTTGAGGCTATCCAATCTTGGTGCACTAAGTAAGGACCT TGCAGCTGAAATCAAACTAAACAGGAAGAGATATATTGGAAGTCTGACCCTGCAATGGTG CCTATGGATATCACAAGAGCACAATGAGATGGAAGTGTTCCAAGTCCTACATCCTCCCAC CAGTCTTAGATCTCTGAAACTCATGTATTATCTAGGGGAATCTCTTCCATGCTGGTTTCA GGAACAAAATGGTTGTAATGAGATAGCAGGAGTAATTGCTAACAACAATAATGGCTGCAT TTCTGTTTTCTCATCGCTGACCTACCTCGACATTTCTGATTGTGAAAAGTTATCAAACCT CAACCAGTTCCTGCAGGTAGCTCATGTACCATCCCTCGAAAGAATACGAATATCAAACTG TGGAAGGGTAGCATCAACTCCAAGGTTTGGTGACTTTCATTGCCTGGAAGAACTAATTCT GGATCATTGCAAGATATTTGACCATTCAGAAAGCTTGTCAATACCTTCCCTCAAGAAGCT CGTACTACATTATTCTGGGAATCCAATTAGCAAAATCGAGTGCCGCTCTCTCACATCTCT GTCCTTTGTGTGTCCGAGTGTGACGTCTATTCCCCTACAAGTGTGGAGTAGTAATCTTCC TGCTCTGCAGAATTTAGACATAAAGTGGTGTCCATCTCTTACATTTATTGGAGAATCTGA ACCAGCGGACTTCACTAACCTTTCTCACCAAGTGAGCAGCAGCAGCAGCAGAATTAGAAC ATTCTCATCCCTTACTGTGCTAACCATTCACGGCTGCGAGAAATTGTTGACCCTTGATGA TCTCCTGAAACAAGAATATCTACCTTTCATCAAGAGTATTAAGATTTCCTATTGTCAAGG GCTACTGTCCTTGCCCGGTGAAATGTTTGGGTCTTTTCCTTTCCTGAATGATTTGGGCAT TTGGAACTGCCCAAGTCTCACTTGGCAGAGGGGATTGGTTTTACCATCATCTCTCCTAGA GCTCAACTTAATTGATTGTGGTTATTTCTCTACATGGCTTCCTAGCTGTTTGGAGAACGT CACTTCCCTGGTTATACTGAGAATAATTAAATGTCGGGGTATAACATATATTACAGATCA AACATTGAGCAGTAATCTTGCCTCACTCCAGGAATTATGCATTGAGGATTGCCCAGACCT TGTTTCAATCGGTAGGGGAAAGTTGATCGCAAAATTAAAGAAGGTGCGTATATTTGAAAG AAGGTAGATTTCATCAGCGTGGCTTCGCTGTTTCCCCATGCGTGGGTGGAATGGCTGGCA AGATTGGGTAATGGCTGCAGGAGTACTTGCAAAGAAGGCCATGAGTCCTATTTTCCTCCC TTTGTTGTCCTGCGATTTATTATGGCAAAACAAATTGTTGCAAGGCTGATAATGGTCTCT GAAAGGTTGCTCTCTTGTCCTGACAGTGCGGCATATCCGTTAGCATTTCCCCTTTCTGTT TTAAATAAGTTGGGGAGAAAACATTCATGTCATTTAAAACCTCTGTTAAGTTGTGTGTTT TTGTTTGATTAATCTTTAATCATGCTCGGAGCCTCGGACAACTATACGTTACCAAAGTTT TAATCGCAGTGGTCTACTACGGATATTTTCTGATGTATACCATACTAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)