cluster # 2392

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Oryza sativa
cluster # 2392 cluster # 2392 Sequences # 2 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2392#0 length = 1455 sequences # 2
consensusID : consensus_2392#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1455
fasta sequence
                              [AACAAAGAAATATATTAACTAATTTATACTTAAACGTGCTATTTTAGACTTTTTAATAAAGGCCGGATTAATTTTACGAGTCTTTACAATTATTTGTACCATAAATTATATATCTATTTTTATTTTTCAAATAAATATATAATTTTAATATCTATATTAGATTTATTGCGTTCTAGACCTACATCCATCTTGAGTGCTCCACTAAATAAAAGAAAATATTAAAATTTGTCATTGAAAATCAAAATATGCTAGCTTATTTTTTAATGAAACTGTTAAACCCATTAAAAGTACATTATTAGACATCTAATGACTTTCTACCAACTTAATTAATTTCTTCATAAAAAAACTTTATTAATTCCTCAAAACATACACCTGGGGGCTATTTACATATACGAATTGATCTTGATGCTTTTGTAAATAAATGATATTTTAAATTTAAAAGATAAATAAACGATCTTAAAATGATCATAGCATCTAAATCATACATATGATTGCTCCTAGCACTCCTAAACACTTCTAAGTCGCTATGTGGCATTCTATTAATTACAAAAACACTCATATAATCGACCATCGGTTTCCACTTAAACCGATGGACCCAATTTTTATACCATCATATCTATCTTTTCGGAAAAAACAAATTCTATCAGAATCTCTGTCTGGCTCACTGCATAACATGCATGTGTGCGCTCCTATACCTTTTAAACCGGTAGAACCATTGTTTCTAACAAGTGTTTATTCATGGTACATGACATTTTAAAAATATTACTGTGCAATGATATTTCGACGTTATTGTATTCCTGCTAGGTTGCGTGGAGCCTCTCATTCACTCTACATGAAATGTTCATAGGTAGATCGCCTCTCAAAATATATCAATCATATTAGGCTATATAAACCCGTGCATTTTTTGTGTAGATTAATGTCCCACCCAATTCATCCTTTAACATATTATGATAATATATTATACAATTAAAAAAATAAAAACACCTTAATTTTTATTTTACACTTACTTTTACTTTCGTTGACATGTTTTCTAAAGAAAATAAATCTACCTTTTTTTTAAAATGATGAAGAATATTATAAATAATTACTTATAGATACTACTTATATTTGATATAATATAAATCTAATAGGTTAGAATATTATTAAAGAATTAATTAATGCTGACAAAAATAATGTATGGAGAAATTGTGGCAGATGTTCTCCTGTTAAATGTCGCTTTTATTAATACCTCAAACTTGGCGTACGACGCATGCCCGCGTGAATGCGCGGGCTACCTTCCTAGTTAAATAAATTGGACGTGATATATGATGTTGTATGCTTGCATGAGGTTAAATAAATAATTATTGCTAATGGGTGATGATGTGGCATGGTTATATGGCTATAATTATAACTTTATGAAAATATAGGTTAGATTGTGGCATGATTGCTGATTGCCATGGTTGACCTATATATAGT]

[+] EMBL CB661559             [AACAAAGAAATATATTAACTAATTTATACTTAAACGTGCTATTTTAGACTTTTTAATAAAGGCCGGATTAATTTTACGAGTCTTTACAATTATTTGTACCATAAATTATATATCTATTTTTATTTTTCAAATAAATATATAATTTTAATATCTATATTAGATTTATTGCGTTCTAGACCTACATCCATCTTGAGTGCTCCACTAAATAAAAGAAAATATTAAAATTTGTCATTGAAAATCAAAATATGCTAGCTTATTTTTTAATGAAACTGTTAAACCCATTAAAAGTACATTATTAGACATCTAATGACTTTCTACCAACTTAATTAATTTCTTCATAAAAAAACTTTATTAATTCCTCAAAACATACACCTGGGGGCTATTTACATATACGAATTGATCTTGATGCTTTTGTAAATAAATGATATTTTAAATTTAAAAGATAAATAAACGATCTTAAAATGATCATAGCATCTAAATCATACATATGATTGCTCCTAGCACTCCTAAACACTTCTAAGTCGCTATGTGGCATTCTATTAATTACAAAAACACTCATATAATCGACCATCGGTTTCCACTTAAACCGATGGACCCAATTTTTATACCATCATATCTATCTTTTCGGAAAAAACAAATTCTATCAGAATCTCTGTCTGGCTCACTGCATAACATGCATGTGTGCGCTCCTATACCTTTTAAACCGGTAGAACCATTGTTTCTAACAAGTGTTTATTCATGGTACATGACATTTTAAAAATATTACTGTGCAATGATATTTCGACGTTATTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CB661560             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GCTCCTATACC TTTAAACCGGTAGAACCATTGTTTCTAACAAGTGTTTATTCATGGTACATGACATTTTAAAAATATTACTGTGCAATGATATTTCGACGTTATTGTATTCCTGCTAGGTTGCGTGGAGCCTCTCATTCACTCTACATGAAATGTTCATAGGTAGATCGCCTCTCAAAATATATCAATCATATTAGGCTATATAAACCCGTGCATTTTTTGTGTAGATTAATGTCCCACCCAATTCATCCTTTAACATATTATGATAATATATTATACAATTAAAAAAATAAAAACACCTTAATTTTTATTTTACACTTACTTTTACTTTCGTTGACATGTTTTCTAAAGAAAATAAATCTACCTTTTTTTTAAAATGATGAAGAATATTATAAATAATTACTTATAGATACTACTTATATTTGATATAATATAAATCTAATAGGTTAGAATATTATTAAAGAATTAATTAATGCTGACAAAAATAATGTATGGAGAAATTGTGGCAGATGTTCTCCTGTTAAATGTCGCTTTTATTAATACCTCAAACTTGGCGTACGACGCATGCCCGCGTGAATGCGCGGGCTACCTTCCTAGTTAAATAAATTGGACGTGATATATGATGTTGTATGCTTGCATGAGGTTAAATAAATAATTATTGCTAATGGGTGATGATGTGGCATGGTTATATGGCTATAATTATAACTTTATGAAAATATAGGTTAGATTGTGGCATGATTGCTGATTGCCATGGTTGACCTATATATAGT]




>consensus_2392#0
AACAAAGAAATATATTAACTAATTTATACTTAAACGTGCTATTTTAGACTTTTTAATAAA
GGCCGGATTAATTTTACGAGTCTTTACAATTATTTGTACCATAAATTATATATCTATTTT
TATTTTTCAAATAAATATATAATTTTAATATCTATATTAGATTTATTGCGTTCTAGACCT
ACATCCATCTTGAGTGCTCCACTAAATAAAAGAAAATATTAAAATTTGTCATTGAAAATC
AAAATATGCTAGCTTATTTTTTAATGAAACTGTTAAACCCATTAAAAGTACATTATTAGA
CATCTAATGACTTTCTACCAACTTAATTAATTTCTTCATAAAAAAACTTTATTAATTCCT
CAAAACATACACCTGGGGGCTATTTACATATACGAATTGATCTTGATGCTTTTGTAAATA
AATGATATTTTAAATTTAAAAGATAAATAAACGATCTTAAAATGATCATAGCATCTAAAT
CATACATATGATTGCTCCTAGCACTCCTAAACACTTCTAAGTCGCTATGTGGCATTCTAT
TAATTACAAAAACACTCATATAATCGACCATCGGTTTCCACTTAAACCGATGGACCCAAT
TTTTATACCATCATATCTATCTTTTCGGAAAAAACAAATTCTATCAGAATCTCTGTCTGG
CTCACTGCATAACATGCATGTGTGCGCTCCTATACCTTTTAAACCGGTAGAACCATTGTT
TCTAACAAGTGTTTATTCATGGTACATGACATTTTAAAAATATTACTGTGCAATGATATT
TCGACGTTATTGTATTCCTGCTAGGTTGCGTGGAGCCTCTCATTCACTCTACATGAAATG
TTCATAGGTAGATCGCCTCTCAAAATATATCAATCATATTAGGCTATATAAACCCGTGCA
TTTTTTGTGTAGATTAATGTCCCACCCAATTCATCCTTTAACATATTATGATAATATATT
ATACAATTAAAAAAATAAAAACACCTTAATTTTTATTTTACACTTACTTTTACTTTCGTT
GACATGTTTTCTAAAGAAAATAAATCTACCTTTTTTTTAAAATGATGAAGAATATTATAA
ATAATTACTTATAGATACTACTTATATTTGATATAATATAAATCTAATAGGTTAGAATAT
TATTAAAGAATTAATTAATGCTGACAAAAATAATGTATGGAGAAATTGTGGCAGATGTTC
TCCTGTTAAATGTCGCTTTTATTAATACCTCAAACTTGGCGTACGACGCATGCCCGCGTG
AATGCGCGGGCTACCTTCCTAGTTAAATAAATTGGACGTGATATATGATGTTGTATGCTT
GCATGAGGTTAAATAAATAATTATTGCTAATGGGTGATGATGTGGCATGGTTATATGGCT
ATAATTATAACTTTATGAAAATATAGGTTAGATTGTGGCATGATTGCTGATTGCCATGGT
TGACCTATATATAGT
clustalw multiple alignements is not computed in this case