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Oryza sativa
cluster # 2515 cluster # 2515       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2515#0 length = 1587 sequences # 2  

consensusID : consensus_2515#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1587
fasta sequence
                              [TTTTTTTTTTTTTTTTTTGATTCTTGAAATGCGTGCACGCTTTATATTATGGGATGGAGAGAGTATTCATGTTTTATAATAATGGTGGAGAGACCCGGGAGGCGACAGTCGCCGAGGCCCGCTCCTCCNACGCGCGCGCA-CCTCGCCGCGGCCGGCGACGCTGCCCCCGGTGGCATTGCCGGCGGCGGCGCTCGCNTCCCCCCCCAGCACCACNACCTCCCCACACCATTAACTTCCTCTCCTTTTCTTNTCCAGATCCAAAACTCTCTTCATGCTAGCTTGTCTCCCGCCCTGTTCCTCCTGCCTCCGGCGACGGCAGCCGGCTGTGGTGGTGGGTGGCCGTCAGATCCGCCTCCTACCTCGCCCCAGCAGCCTCCGGCGACGGCAGCCGGCCGTGGTGGTGGGTGGCCATCAGATCTGCCTCCTACCACGCCCCTGCAGCCTCCGGCGACGGCAGCCGGCCGTGGTGGTGGGCAGCCGTCAGTTCCGCCTCCTACCATGTCCCCCTGCCTCCGGCAAGGTCGTGTGGTGGGGACGGCTTGCTGCCTGCAATGTCGTCGGTGGGCTGCGACGTCGCCTGTTGCCGGTGCCCAGATCCACCTTCCCCTTGGCAGCATGGCCGGAATTGGTCAGCTCAGTGGCGACCGACAACGCTGCTGACTTTGCCGATGTCTGCTCCATTTTCTTTTCTTCTTGTCTACCCGGCGGTTGGAAGCATTTTGAGCTTTGCCACGATCAGCTCAGCCCAAACCTGCATGTCTAGGAGTTTGCTGGTGCCTCGGCCGCTCTGAATCTCCTCAATTCTAGCATGCTTCTCCTTGGCTCGCTTGGGTTTGCCTATTGGTTGGAACATGTGCTTCTCCGGCGGTCGTGATGCTCCCGATCTTTGTTCTCTTCTGTTGATGTTTCATCCATCTGTAGATCCCCATCTCTTTCATTTCTCTTTTGTTCAGTCCCCTGATTGCCCTTCACCCTCTCTGCTTGGGTGTCCCTGACTGCAATGTTTAGCGGTCCTTCCTCCTATGGGGCTTTCTTCCCCCGAAGGGCGTTGAACTGGCTAGCAATTTGATAAAGCTCGATTGAAGACGGCTTGATGCGGGTGGCCTATGGCCTCAACTTTCAGTGGCCTTCCCTCTTTTGGGGCTTCCTTCCCCCAATAGACGTCGGGGGGCATTGATTCAAGTAGCAACATGACTAAGTCGTACTTCTGACGGCTTGATGCGGGTGGTCTTCGATAACCACAGTCTTTCGACTGCCAGAGAACCAAGCCGGTATGCGCGTGGCACTGAGGCCCTCCGGCACCTTCGATTCTTGGTGTTTCAAGTCTGCATGCGAAGTGGATGATGTTCAATTAGGGTTCTAGCATTAGTTTGATTTGGAATTTGGTCGGGTGTTTTTGCAGGTGGCAAACGTCAAAGCTTCTCAGTGCGTGGTAGGGAGGTTGTGATGCGTCTGTATTCTCTTCTCTGTATACCCCCGTGTATTCTTTCTTATTATCCTCCAGGGCTCCTGTATTTACGCAGGTGAAACCTGCCCTGTGTAAGATCGTTGGAAGTAATATATTCAGGTGGGCATTTCGCCCCCTGG]

[-] EMBL AU076253             [TTTTTTTTTTTTTTTTTTGATTCTTGAAATGCGTGCACGCTTTATATTATGGGATGGAGAGAGTATTCATGTTTTATAATAATGGTGGAGAGACCCGGGAGGCGACAGTCGCCGAGGCCCGCTCCTCCNACGCGCGCGCA CCTCGCCGCGGCCGGCGACGCTGCCCCCGGTGGCATTGCCGGCGGCGGCGCTCGCNTCCCCCCCCAGCACCACNACCTCCCCACACCATTAACTTCCTCTCCTTTTCTTNTCCAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AK064062             [                                                                                                                   GGCCCGCTCCTCCTACGCGCGCGCAGCCTCGCCGCGGCCGGCGACGCTGCCCCCGGTGGCATTGCCGGCGGCGGCGCTCGCCTCCCCCCCCAGCACCACGACCTCCCCACACCATTAACTTCCTCTCCTTTTCTTTTCCAGATCCAAAACTCTCTTCATGCTAGCTTGTCTCCCGCCCTGTTCCTCCTGCCTCCGGCGACGGCAGCCGGCTGTGGTGGTGGGTGGCCGTCAGATCCGCCTCCTACCTCGCCCCAGCAGCCTCCGGCGACGGCAGCCGGCCGTGGTGGTGGGTGGCCATCAGATCTGCCTCCTACCACGCCCCTGCAGCCTCCGGCGACGGCAGCCGGCCGTGGTGGTGGGCAGCCGTCAGTTCCGCCTCCTACCATGTCCCCCTGCCTCCGGCAAGGTCGTGTGGTGGGGACGGCTTGCTGCCTGCAATGTCGTCGGTGGGCTGCGACGTCGCCTGTTGCCGGTGCCCAGATCCACCTTCCCCTTGGCAGCATGGCCGGAATTGGTCAGCTCAGTGGCGACCGACAACGCTGCTGACTTTGCCGATGTCTGCTCCATTTTCTTTTCTTCTTGTCTACCCGGCGGTTGGAAGCATTTTGAGCTTTGCCACGATCAGCTCAGCCCAAACCTGCATGTCTAGGAGTTTGCTGGTGCCTCGGCCGCTCTGAATCTCCTCAATTCTAGCATGCTTCTCCTTGGCTCGCTTGGGTTTGCCTATTGGTTGGAACATGTGCTTCTCCGGCGGTCGTGATGCTCCCGATCTTTGTTCTCTTCTGTTGATGTTTCATCCATCTGTAGATCCCCATCTCTTTCATTTCTCTTTTGTTCAGTCCCCTGATTGCCCTTCACCCTCTCTGCTTGGGTGTCCCTGACTGCAATGTTTAGCGGTCCTTCCTCCTATGGGGCTTTCTTCCCCCGAAGGGCGTTGAACTGGCTAGCAATTTGATAAAGCTCGATTGAAGACGGCTTGATGCGGGTGGCCTATGGCCTCAACTTTCAGTGGCCTTCCCTCTTTTGGGGCTTCCTTCCCCCAATAGACGTCGGGGGGCATTGATTCAAGTAGCAACATGACTAAGTCGTACTTCTGACGGCTTGATGCGGGTGGTCTTCGATAACCACAGTCTTTCGACTGCCAGAGAACCAAGCCGGTATGCGCGTGGCACTGAGGCCCTCCGGCACCTTCGATTCTTGGTGTTTCAAGTCTGCATGCGAAGTGGATGATGTTCAATTAGGGTTCTAGCATTAGTTTGATTTGGAATTTGGTCGGGTGTTTTTGCAGGTGGCAAACGTCAAAGCTTCTCAGTGCGTGGTAGGGAGGTTGTGATGCGTCTGTATTCTCTTCTCTGTATACCCCCGTGTATTCTTTCTTATTATCCTCCAGGGCTCCTGTATTTACGCAGGTGAAACCTGCCCTGTGTAAGATCGTTGGAAGTAATATATTCAGGTGGGCATTTCGCCCCCTGG]


>consensus_2515#0 TTTTTTTTTTTTTTTTTTGATTCTTGAAATGCGTGCACGCTTTATATTATGGGATGGAGA GAGTATTCATGTTTTATAATAATGGTGGAGAGACCCGGGAGGCGACAGTCGCCGAGGCCC GCTCCTCCNACGCGCGCGCACCTCGCCGCGGCCGGCGACGCTGCCCCCGGTGGCATTGCC GGCGGCGGCGCTCGCNTCCCCCCCCAGCACCACNACCTCCCCACACCATTAACTTCCTCT CCTTTTCTTNTCCAGATCCAAAACTCTCTTCATGCTAGCTTGTCTCCCGCCCTGTTCCTC CTGCCTCCGGCGACGGCAGCCGGCTGTGGTGGTGGGTGGCCGTCAGATCCGCCTCCTACC TCGCCCCAGCAGCCTCCGGCGACGGCAGCCGGCCGTGGTGGTGGGTGGCCATCAGATCTG CCTCCTACCACGCCCCTGCAGCCTCCGGCGACGGCAGCCGGCCGTGGTGGTGGGCAGCCG TCAGTTCCGCCTCCTACCATGTCCCCCTGCCTCCGGCAAGGTCGTGTGGTGGGGACGGCT TGCTGCCTGCAATGTCGTCGGTGGGCTGCGACGTCGCCTGTTGCCGGTGCCCAGATCCAC CTTCCCCTTGGCAGCATGGCCGGAATTGGTCAGCTCAGTGGCGACCGACAACGCTGCTGA CTTTGCCGATGTCTGCTCCATTTTCTTTTCTTCTTGTCTACCCGGCGGTTGGAAGCATTT TGAGCTTTGCCACGATCAGCTCAGCCCAAACCTGCATGTCTAGGAGTTTGCTGGTGCCTC GGCCGCTCTGAATCTCCTCAATTCTAGCATGCTTCTCCTTGGCTCGCTTGGGTTTGCCTA TTGGTTGGAACATGTGCTTCTCCGGCGGTCGTGATGCTCCCGATCTTTGTTCTCTTCTGT TGATGTTTCATCCATCTGTAGATCCCCATCTCTTTCATTTCTCTTTTGTTCAGTCCCCTG ATTGCCCTTCACCCTCTCTGCTTGGGTGTCCCTGACTGCAATGTTTAGCGGTCCTTCCTC CTATGGGGCTTTCTTCCCCCGAAGGGCGTTGAACTGGCTAGCAATTTGATAAAGCTCGAT TGAAGACGGCTTGATGCGGGTGGCCTATGGCCTCAACTTTCAGTGGCCTTCCCTCTTTTG GGGCTTCCTTCCCCCAATAGACGTCGGGGGGCATTGATTCAAGTAGCAACATGACTAAGT CGTACTTCTGACGGCTTGATGCGGGTGGTCTTCGATAACCACAGTCTTTCGACTGCCAGA GAACCAAGCCGGTATGCGCGTGGCACTGAGGCCCTCCGGCACCTTCGATTCTTGGTGTTT CAAGTCTGCATGCGAAGTGGATGATGTTCAATTAGGGTTCTAGCATTAGTTTGATTTGGA ATTTGGTCGGGTGTTTTTGCAGGTGGCAAACGTCAAAGCTTCTCAGTGCGTGGTAGGGAG GTTGTGATGCGTCTGTATTCTCTTCTCTGTATACCCCCGTGTATTCTTTCTTATTATCCT CCAGGGCTCCTGTATTTACGCAGGTGAAACCTGCCCTGTGTAAGATCGTTGGAAGTAATA TATTCAGGTGGGCATTTCGCCCCCTGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)