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Oryza sativa
cluster # 2585 cluster # 2585       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2585#0 length = 1305 sequences # 2  

consensusID : consensus_2585#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1305
fasta sequence
                              [GGTGATAATATACAAATCGGAGGGATCTAAAAGATGGATTGGCAATGGATATACACCGCGGACCGATGGTCGAAAGAGTTTGTTGACGGCGTGCATTTTTTTTTAGTGTGGCCGATGCTAACAAGCATAAGGGTTTTATATGTTGTCCATGTGATAAGTGCAAAAATCAGAAGGAGTATTCTACATTAAAAACTATTATTTCCGCTTGTTTAAGTCGGGGTTCATGTCTAGCTATAATTGGTGGACCTAGCACGGAGAGCTAGGGGTTGAAATGGAAGAAAATGAAGTAAAAGACGAGAACATTCCGAACTGGGCTCGGTACAGTGGATTTGAAGAAAATACAACGGGTGATGTGGATGGGGCTGTTGAAGATAACAACGCTATAAATGATCTTGGTCAGATGTTGCGGGACATCAAAGAGAACTGGGAAAGTGAAAAGGAGGTCCAGCGGGACGCCCTCGACGTCTCTCTTCTCAACGCATGGGCTTTATTCAAAAGGGCCGTAGGCAAGGTAATTACAATACTGGATTCATCGACCCCCACAAAGTTAACACGAAATGATCACCAAGTATGAGAAAGACACAGAGGACAATCTTCTCCATTTCCTAGTGCAACAGCATTTCAAGTCGTTCATATTACTGCCGTACAACACAGAATTCCATTGGGTCCTTTTTCTTTTCGGCCTTGACACATGCAGAGTCCATGTATATGACTCAATGGATAAACCGGAGTCTACGTTCACAAAGATTTTTGAAGTGATAGACAGATAATGCCATCTATTCCACTGTCATTATGAAATTTGCTATTGCTACTATGCTGATCTTAGATAATAATTAATCAGAGCTTGCAACTGTACGTATGGTATGGGCTTGGTTCCGTGAATTGGTCACAGGGTCTTAGAAAGAAAAACTTAGTCAGAGGTTTGATTTTCCATGTGCAAAGCAGGACCAGGGGAATAACTTCTGCAGCTACTACATCACGTCTGCAAGTATACCCACTGCCTATCAACCCAAATCTACGGTAACAAGGAATTGAATATTATTTATATGAGGGACAGACTCATCCATGAAGATTTTATAAGGGCAGTCCAAGAACAACTGATGGGTTTTATCAACGAACAAATTATTGATCCTGCGGGTGAATTCTACTACGACGGGTAGTGTCGGTCCTTCTTCTTCTGAGATAACATCGAAGTAGTATATGATGGAAACATTAGATATAAGGTCTGAAGGAATTGTAATATATGTATATATTTATATATGTAGACATTTGCTTAATTGTAAATATATATTTTGGTAATATATG]

[+] EMBL CB674880             [GGTGATAATATACAAATCGGAGGGATCTAAAAGATGGATTGGCAATGGATATACACCGCGGACCGATGGTCGAAAGAGTTTGTTGACGGCGTGCATTTTTTTTTAGTGTGGCCGATGCTAACAAGCATAAGGGTTTTATATGTTGTCCATGTGATAAGTGCAAAAATCAGAAGGAGTATTCTACATTAAAAACTATTATTTCCGCTTGTTTAAGTCGGGGTTCATGTCTAGCTATAATTGGTGGACCTAGCACGGAGAGCTAGGGGTTGAAATGGAAGAAAATGAAGTAAAAGACGAGAACATTCCGAACTGGGCTCGGTACAGTGGATTTGAAGAAAATACAACGGGTGATGTGGATGGGGCTGTTGAAGATAACAACGCTATAAATGATCTTGGTCAGATGTTGCGGGACATCAAAGAGAACTGGGAAAGTGAAAAGGAGGTCCAGCGGGACGCCCTCGACGTCTCTCTTCTCAACGCATGGGCTTTATTCAAAAGGGCCGTAGGCAAGGTAATTACAATACTGGATTCATCGACCCCCACAAAGTTAACACGAAATGATCACCAAGTATGAGAAAGACACAGAGGACAATCTTCTCCATTTCCTAGTGCAACAGCATTTCAAGTCGTTCATATTACTGCCGTACAACACAGAATTCCATTGGGTCCTTTTTCTTTTCGGCCTTGACACATGCAGAGTCCATGTATATGACTCAATGGATAAACCGGAGTCTACGTTCACAAAGATTTTTGAAGTGATAGACAGATAATGCCATCTATTCCACTGTCATTATGAAATTTGCTATTGCTACTATGCTGATCTTAGATAATAATTAATCAGAGCTTGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CB674881             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CGTCTCTCTTCTCAACGCATGGGCTTTATTCAAAAGGGCCGTAGGCAAGGTAATTACAATACTGGATTCATCGACCCCCACAAAGTTAACACGAAATGATCACCAAGTATGAGAAAGACACAGAGGACAATCTTCTCCATTTCCTAGTGCAACAGCATTTCAAGTCGTTCATATTACTGCCGTACAACACAGAATTCCATTGGGTCCTTTTTCTTTTCGGCCTTGACACATGCAGAGTCCATGTATATGACTCAATGGATAAACCGGAGTCTACGTTCACAAAGATTTTTGAAGTGATAGACAGATAATGCCATCTATTCCACTGTCATTATGAAATTTGCTATTGCTACTATGCTGATCTTAGATAATAATTAATCAGAGCTTGCAACTGTACGTATGGTATGGGCTTGGTTCCGTGAATTGGTCACAGGGTCTTAGAAAGAAAAACTTAGTCAGAGGTTTGATTTTCCATGTGCAAAGCAGGACCAGGGGAATAACTTCTGCAGCTACTACATCACGTCTGCAAGTATACCCACTGCCTATCAACCCAAATCTACGGTAACAAGGAATTGAATATTATTTATATGAGGGACAGACTCATCCATGAAGATTTTATAAGGGCAGTCCAAGAACAACTGATGGGTTTTATCAACGAACAAATTATTGATCCTGCGGGTGAATTCTACTACGACGGGTAGTGTCGGTCCTTCTTCTTCTGAGATAACATCGAAGTAGTATATGATGGAAACATTAGATATAAGGTCTGAAGGAATTGTAATATATGTATATATTTATATATGTAGACATTTGCTTAATTGTAAATATATATTTTGGTAATATATG]


>consensus_2585#0 GGTGATAATATACAAATCGGAGGGATCTAAAAGATGGATTGGCAATGGATATACACCGCG GACCGATGGTCGAAAGAGTTTGTTGACGGCGTGCATTTTTTTTTAGTGTGGCCGATGCTA ACAAGCATAAGGGTTTTATATGTTGTCCATGTGATAAGTGCAAAAATCAGAAGGAGTATT CTACATTAAAAACTATTATTTCCGCTTGTTTAAGTCGGGGTTCATGTCTAGCTATAATTG GTGGACCTAGCACGGAGAGCTAGGGGTTGAAATGGAAGAAAATGAAGTAAAAGACGAGAA CATTCCGAACTGGGCTCGGTACAGTGGATTTGAAGAAAATACAACGGGTGATGTGGATGG GGCTGTTGAAGATAACAACGCTATAAATGATCTTGGTCAGATGTTGCGGGACATCAAAGA GAACTGGGAAAGTGAAAAGGAGGTCCAGCGGGACGCCCTCGACGTCTCTCTTCTCAACGC ATGGGCTTTATTCAAAAGGGCCGTAGGCAAGGTAATTACAATACTGGATTCATCGACCCC CACAAAGTTAACACGAAATGATCACCAAGTATGAGAAAGACACAGAGGACAATCTTCTCC ATTTCCTAGTGCAACAGCATTTCAAGTCGTTCATATTACTGCCGTACAACACAGAATTCC ATTGGGTCCTTTTTCTTTTCGGCCTTGACACATGCAGAGTCCATGTATATGACTCAATGG ATAAACCGGAGTCTACGTTCACAAAGATTTTTGAAGTGATAGACAGATAATGCCATCTAT TCCACTGTCATTATGAAATTTGCTATTGCTACTATGCTGATCTTAGATAATAATTAATCA GAGCTTGCAACTGTACGTATGGTATGGGCTTGGTTCCGTGAATTGGTCACAGGGTCTTAG AAAGAAAAACTTAGTCAGAGGTTTGATTTTCCATGTGCAAAGCAGGACCAGGGGAATAAC TTCTGCAGCTACTACATCACGTCTGCAAGTATACCCACTGCCTATCAACCCAAATCTACG GTAACAAGGAATTGAATATTATTTATATGAGGGACAGACTCATCCATGAAGATTTTATAA GGGCAGTCCAAGAACAACTGATGGGTTTTATCAACGAACAAATTATTGATCCTGCGGGTG AATTCTACTACGACGGGTAGTGTCGGTCCTTCTTCTTCTGAGATAACATCGAAGTAGTAT ATGATGGAAACATTAGATATAAGGTCTGAAGGAATTGTAATATATGTATATATTTATATA TGTAGACATTTGCTTAATTGTAAATATATATTTTGGTAATATATG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)