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Oryza sativa
cluster # 2753 cluster # 2753       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2753#0 length = 3154 sequences # 2  

consensusID : consensus_2753#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 3154
fasta sequence
                              [GCGAGCGTGATCACGAATGCCACCGGACTGGTCGCGCCTCGGACTGGAGGAGGCGCTCGCCGCGGCGGCGCTGCTGCTCCGATCGTGCTCCCCTCGCCGCGCTGTCCTCCGCCGCGCGCGCGCGGTCCACGCGCTCCTCGTGGTCTCCTGCACGCCCTCGTCGCCCGCGCTGACCACCTTCCTCGCCAACCAGCTGCTCTCCCTCTACGCCCGCCTCTCCGCCGTCCCCGACGCCCTCGCGCTCCTCCGCTCCACGCCGCGCCCCTCCGTCGTCTCCTACAACACCGTCCTCTCCGCGCTCTCCCGCGCCCCGCGCCACGCGCCCGAGGGTCTCCGCCTCTTCCGCCGCCTGCACGCGTCGGGCCTCCGCCCCACCGCACCTAGCCTCTGCGCCCTCCTGCGCACCGCCGGCGAACTGCGCGACCGTCGCGCGGGGGCCGCCGCGCACTCGCAGGCCGCGACGCTCGGCTTCCTCGCGAGCGACATCGTGCCCACTGCGCTGCTGCAGATGTACTCCCAGTGCGGCGCGCCGAGGGACGCCAACCAGGTGTTCGACGAAATGGCGACGCGGGATGGGGTGGCGTGGAACTGCGTGATGCACTGCAATGTGCGGTATGGCTACCTTGACCGCGCTCTAGGTCAGTTTTGCCGGATGGTGAGGGGTGGATTGCCACCCACCGAGAGCACGCTCTCGTCAGTGCTGAGTGGTTGTGGACGAGCTGGGGATTGCCTCCGAGGGCGTGTGCTCCATGGATGGGTGGTGAAGTTGGAGGAGCTTGATCCTGACATGCCACTACAGAACGCGCTGCTCGACATGTACTCAAGCTGTGGTGATCTGGATACTGCACTGCGCGTGTTTGAGAGAATTGAGACGCCGGACTTGGTGTCATGGAATACTCTGATTGCTGGGTTTTCTGGAGTTGGGGATGGGTGCAGCGCTGTGCATGCCTTTGTGCAGCTGAAGGCTGTACAGTTCGATGAACGAGTTGTCCCTGATGAGTACACGCTTGCAGCTGTGGTGTCTGCTTCTGCTACTTTGCCTGCAATGTTTGGTGGGAAGCCGCTTCATGCCGAAGTGATCAAAGCTGGACTGGAGAACAGCGTGTTTGTAGGGAACACACTGCTCAACATGTATTTTACAAACGATGATCCCCATTCTGCACGGATTTTGTTTGATTCCATTACCCAGGAGGATGTAATCATGTGGACTGAGATGGTTGCAGGCCACTCCTCATTGGGTGAGGGAGAATTGGCCTTAAGGTACTTTGTTAGCATGCTTCAGGAAGGTTACAAGGTCGACAGCTTCTCTTTGAGCAGTGCTTTAAACTCCACGACCGAGCTTGCAGGCCTTAAACAAGGAGAGATGCTCCATGCTCAAGTGGTAAAAAGTGGTTATGAAGGCAATATTTGTGCCTCCGGAAGCCTAGTTGACATGTATGCAAAAAATGGTGCTCTCCCAGGGGCTTATTTGGTGTTTCGTAACATACAAAGACCAGATTTGAAGTGCTGGAATTCTATAATTGGAGGATACGGTAACCATGGGAATTCTGAAATGGCATTTAAGTTATTTGGTGAGATGATTCGGGATGGGCTGCAACCTGACCATGTAACTTACATCTCCATCCTCTCTGCATGTAGCCACTGCGGACTAGTTGAGAAAGGAAAATTCTATTGGTTCTGTATGATGACTGATGGTATTGTGCCTGGGTTCAAGCACTACACTAGCATGGTCAGTTTGTTGGGTAGGGCAGGTTTGTTGGATGAAGCAGTTGATTTAATGATGAAATCCCCTTTCGCCAAGAAATGCCCTGAACTATGGAGAATTCTGCTAAGCTCCTGTATAACATTTAGAAATTTATCCATTGGTGTTCATGCTGCTGAACAGGCGCTAGAGCAGGACCCAGATGATATTTCAACACACATATTGCTTTCAAACCTTTACGCCTCTTTAGGTAAATGGGACTTTGTTGCTGAAATTAGGAAAAGAATGAGAGGGCTAATGGCTGATAAGGAGCCTGGGCTGAGCTGGGTCGAGATGAAAAATGTGGTTCATGTCTTCTCTGCAGACGATGAATGCCACTCTCATATAGATGATTGCCACAGCGAATTGCTTAGACTTAAAGGAAACATGGAATTATTGGATACTTGTGAAAATGAGTTCATGTCAAGTGGCTAAGTTGCATGAACAGATTAGAGGATTTCATTTGCTTCCTTTGGTCCTATGACTTATGGCAACAAAATAGACTTATACAAGATTTTGAGCATAAGAAAGGTATTATCTGTGAAGGGACAACCTATCGATTTAATGGTTCCAACTTTCAAATTAGCGCTCCCGGCAGCATTGGAGGCAGGAAAGAGACACTAAAGGTATCAAGCTCCATCAAACAAGATATAGATGTGCAAATAACCCAAAAAAGGGACAGAATTCTGGGTCAGTGCTCTAGTGTCTTTCTCCGTTACATCAATGCAACTGCTTGCTCCTTTTTTGTGTATATATGTGATCAGCAGCAGCATTTCTTGCTATGGATATGTTTTGAGTAAATTTCAGAAAACCCTCTGTTTTATGGTCACAGTTACAGAAAACCACAGGTATTATGACATGCGGCACCTAACCATATAGGTATAACAGTTCTAAAGTTTGACAAAACCCTACCCTTATGCATTTTGAGCACAGATTACTTACAATTCTAAATCATAGTGTGTACATGAAAATTTTAATTTTTAAGTTCTTGACTAAGGTTGATAATTAAAATTTTTACTAATTCAAAAGAATTGTTCAAGATATGCAAAATTAGGCCTAGTTCTATTTTTCAACTTCAAACTTCAACTTTCTCGTTTTCCGTTAGCACGCTTTTCAAACCGTTAAATGGTGCGTTTTTTAAAAAAGTTTTTATACATAAGTTGTTTAAAAAAGCAAATAAATTCATTTTTGAAATTTATAATACTTAATACTTAATTGATCATGTGCTAATGAGATTTCTCGTTTTGCGTCAAAAATCTATCTGCCAAACGGATGATCAAACGGGGCCTTAATCAAGATTTCAATAAATGTGGGGTTTTATGAAATATTTAGACCATAATACATGTGGTTGTGTGCCACACATCATAATATATGTGGTTTTCTGCAACTTTGATCATAAAATGTGAGATTTTC]

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>consensus_2753#0 GCGAGCGTGATCACGAATGCCACCGGACTGGTCGCGCCTCGGACTGGAGGAGGCGCTCGC CGCGGCGGCGCTGCTGCTCCGATCGTGCTCCCCTCGCCGCGCTGTCCTCCGCCGCGCGCG CGCGGTCCACGCGCTCCTCGTGGTCTCCTGCACGCCCTCGTCGCCCGCGCTGACCACCTT CCTCGCCAACCAGCTGCTCTCCCTCTACGCCCGCCTCTCCGCCGTCCCCGACGCCCTCGC GCTCCTCCGCTCCACGCCGCGCCCCTCCGTCGTCTCCTACAACACCGTCCTCTCCGCGCT CTCCCGCGCCCCGCGCCACGCGCCCGAGGGTCTCCGCCTCTTCCGCCGCCTGCACGCGTC GGGCCTCCGCCCCACCGCACCTAGCCTCTGCGCCCTCCTGCGCACCGCCGGCGAACTGCG CGACCGTCGCGCGGGGGCCGCCGCGCACTCGCAGGCCGCGACGCTCGGCTTCCTCGCGAG CGACATCGTGCCCACTGCGCTGCTGCAGATGTACTCCCAGTGCGGCGCGCCGAGGGACGC CAACCAGGTGTTCGACGAAATGGCGACGCGGGATGGGGTGGCGTGGAACTGCGTGATGCA CTGCAATGTGCGGTATGGCTACCTTGACCGCGCTCTAGGTCAGTTTTGCCGGATGGTGAG GGGTGGATTGCCACCCACCGAGAGCACGCTCTCGTCAGTGCTGAGTGGTTGTGGACGAGC TGGGGATTGCCTCCGAGGGCGTGTGCTCCATGGATGGGTGGTGAAGTTGGAGGAGCTTGA TCCTGACATGCCACTACAGAACGCGCTGCTCGACATGTACTCAAGCTGTGGTGATCTGGA TACTGCACTGCGCGTGTTTGAGAGAATTGAGACGCCGGACTTGGTGTCATGGAATACTCT GATTGCTGGGTTTTCTGGAGTTGGGGATGGGTGCAGCGCTGTGCATGCCTTTGTGCAGCT GAAGGCTGTACAGTTCGATGAACGAGTTGTCCCTGATGAGTACACGCTTGCAGCTGTGGT GTCTGCTTCTGCTACTTTGCCTGCAATGTTTGGTGGGAAGCCGCTTCATGCCGAAGTGAT CAAAGCTGGACTGGAGAACAGCGTGTTTGTAGGGAACACACTGCTCAACATGTATTTTAC AAACGATGATCCCCATTCTGCACGGATTTTGTTTGATTCCATTACCCAGGAGGATGTAAT CATGTGGACTGAGATGGTTGCAGGCCACTCCTCATTGGGTGAGGGAGAATTGGCCTTAAG GTACTTTGTTAGCATGCTTCAGGAAGGTTACAAGGTCGACAGCTTCTCTTTGAGCAGTGC TTTAAACTCCACGACCGAGCTTGCAGGCCTTAAACAAGGAGAGATGCTCCATGCTCAAGT GGTAAAAAGTGGTTATGAAGGCAATATTTGTGCCTCCGGAAGCCTAGTTGACATGTATGC AAAAAATGGTGCTCTCCCAGGGGCTTATTTGGTGTTTCGTAACATACAAAGACCAGATTT GAAGTGCTGGAATTCTATAATTGGAGGATACGGTAACCATGGGAATTCTGAAATGGCATT TAAGTTATTTGGTGAGATGATTCGGGATGGGCTGCAACCTGACCATGTAACTTACATCTC CATCCTCTCTGCATGTAGCCACTGCGGACTAGTTGAGAAAGGAAAATTCTATTGGTTCTG TATGATGACTGATGGTATTGTGCCTGGGTTCAAGCACTACACTAGCATGGTCAGTTTGTT GGGTAGGGCAGGTTTGTTGGATGAAGCAGTTGATTTAATGATGAAATCCCCTTTCGCCAA GAAATGCCCTGAACTATGGAGAATTCTGCTAAGCTCCTGTATAACATTTAGAAATTTATC CATTGGTGTTCATGCTGCTGAACAGGCGCTAGAGCAGGACCCAGATGATATTTCAACACA CATATTGCTTTCAAACCTTTACGCCTCTTTAGGTAAATGGGACTTTGTTGCTGAAATTAG GAAAAGAATGAGAGGGCTAATGGCTGATAAGGAGCCTGGGCTGAGCTGGGTCGAGATGAA AAATGTGGTTCATGTCTTCTCTGCAGACGATGAATGCCACTCTCATATAGATGATTGCCA CAGCGAATTGCTTAGACTTAAAGGAAACATGGAATTATTGGATACTTGTGAAAATGAGTT CATGTCAAGTGGCTAAGTTGCATGAACAGATTAGAGGATTTCATTTGCTTCCTTTGGTCC TATGACTTATGGCAACAAAATAGACTTATACAAGATTTTGAGCATAAGAAAGGTATTATC TGTGAAGGGACAACCTATCGATTTAATGGTTCCAACTTTCAAATTAGCGCTCCCGGCAGC ATTGGAGGCAGGAAAGAGACACTAAAGGTATCAAGCTCCATCAAACAAGATATAGATGTG CAAATAACCCAAAAAAGGGACAGAATTCTGGGTCAGTGCTCTAGTGTCTTTCTCCGTTAC ATCAATGCAACTGCTTGCTCCTTTTTTGTGTATATATGTGATCAGCAGCAGCATTTCTTG CTATGGATATGTTTTGAGTAAATTTCAGAAAACCCTCTGTTTTATGGTCACAGTTACAGA AAACCACAGGTATTATGACATGCGGCACCTAACCATATAGGTATAACAGTTCTAAAGTTT GACAAAACCCTACCCTTATGCATTTTGAGCACAGATTACTTACAATTCTAAATCATAGTG TGTACATGAAAATTTTAATTTTTAAGTTCTTGACTAAGGTTGATAATTAAAATTTTTACT AATTCAAAAGAATTGTTCAAGATATGCAAAATTAGGCCTAGTTCTATTTTTCAACTTCAA ACTTCAACTTTCTCGTTTTCCGTTAGCACGCTTTTCAAACCGTTAAATGGTGCGTTTTTT AAAAAAGTTTTTATACATAAGTTGTTTAAAAAAGCAAATAAATTCATTTTTGAAATTTAT AATACTTAATACTTAATTGATCATGTGCTAATGAGATTTCTCGTTTTGCGTCAAAAATCT ATCTGCCAAACGGATGATCAAACGGGGCCTTAATCAAGATTTCAATAAATGTGGGGTTTT ATGAAATATTTAGACCATAATACATGTGGTTGTGTGCCACACATCATAATATATGTGGTT TTCTGCAACTTTGATCATAAAATGTGAGATTTTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)