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Oryza sativa
cluster # 2789 cluster # 2789       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2789#0 length = 578 sequences # 2  

consensusID : consensus_2789#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 578
fasta sequence
                              [TGAGTTGTATTTTAATAATATTTCGTGTCCATTTACAAAGCTGGTAAAACAGTGCCTGTGCAGTTGCCAAATCCAATGCGATAGTCCTTTCCTTGGGCGTATCCTGAGATTGTGATGGTGTCGTTATCTTGAATAAATTTTCTTTCTTCGCCAGAGGGCAAGGTAATTGGCTTAGTACCGCGCCAGGTGAGTTCCAACAGAGAGCCATACGAGTCTGGTGTAGGACCAGAGATGGTACCAGAGCCACACAAATCACCGGTTCTCATGTTGCACCCAGTGATGGTGTGGTGAGCAAGTTGTTGTCTCATGCTCCAGTACATATATTTAAAGTTAGAGCGGGCAATGAGGAATGGTTCGGTTTGCTTTTGAGTTTGAATAGTGACTTCTAAGTTGATGTCATAAGCACCACCCTTGTTATCCTTTGTGTACTTAAGATAATCAAGAGGGACAGGCTCTTGCACAGGTTGGTCTACTCTAAATTCTTCCAAAGCATCAAGAGTTACGATCCAAGCAGAGATTGTGGTACCAAAAGTTCTTTGCCAAGGAATGGACCAAGGGGAACATATTCCCATTTTTGC]

[+] EMBL CB965070             [TGAGTTGTATTTTAATAATATTTCGTGTCCATTTACAAAGCTGGTAAAACAGTGCCTGTGCAGTTGCCAAATCCAATGCGATAGTCCTTTCCTTGGGCGTATCCTGAGATTGTGATGGTGTCGTTATCTTGAATAAATTTTCTTTCTTCGCCAGAGGGCAAGGTAATTGGCTTAGTACCGCGCCAGGTGAGTTCCAACAGAGAGCCATACGAGTCTGGTGTAGGACCAGAGATGGTACCAGAGCCACACAAATCACCGGTTCTCATGTTGCACCCAGTGATGGTGTGGTGAGCAAGTTGTTGTCTCATGCTCCAGTACATATATTTAAAGTTAGAGCGGGCAATGAGGAATGGTTCGGTTTGCTTTTGAGTTTGAATAGTGACTTCTAAGTTGATGTCATAAGCACCACCCTTGTTATCCTTTGTGTACTTAAGATAATCAAGAGGGACAGGCTCTTGCACAGGTTGGTCTACTCTAAATTCTTCCAAAGCATCAAGAGTTACGATCCAAGCAGAGATTGTGGTACCAAAAGTTCTTTGCCAAGGAATGGACCAAGGGGAACATATTCCCATTTTTGC]
[+] EMBL CB966971             [TGAGTTGTATTTTAATAATATTTCGTGTCCATTTACAAAGCTGGTAAAACAGTGCCTGTGCAG TGCCAAATCCAATGCGATAGTCCTTTCCTTGGGCGTATCCTGAGATTGTGATGGTGTCGTTATCTTGAATAAATTTTCTTTCTTCGCCAGAGGGCAAGGTAATTGGCTTAGTACCGCGCCAGGTGAGTTCCAACAGAGAGCCATACGAGTCTGGTGTAGGACCAGAGATGGTACCAGAGCCACACAAATCACCGGTTCTCATGTTGCACCCAGTGATGGTGTGGTGAGCAAGTTGTTGTCTCATGCTCCAGTACATATATTTAAAGTTAGAGCGGGCAATGAGGAATGGTTCGGTTTGCTTTTGAGTTTGAATAGTGACTTCTAAGTTGATGTCATAAGCACCACCCTTGTTATCCTTTGTGTACTTAAGATAATCAAGAGGGACAGGGTCTTGCACAGGTTGGTCTACTCTAAATTCTTCCAAAGCATCAAGAGTTACGATCCAAGCAGAGATTGTGGTACC AAAGTTCTTT CCCAGGAATGGACCAAGGGGAACATATTC          ]


>consensus_2789#0 TGAGTTGTATTTTAATAATATTTCGTGTCCATTTACAAAGCTGGTAAAACAGTGCCTGTG CAGTTGCCAAATCCAATGCGATAGTCCTTTCCTTGGGCGTATCCTGAGATTGTGATGGTG TCGTTATCTTGAATAAATTTTCTTTCTTCGCCAGAGGGCAAGGTAATTGGCTTAGTACCG CGCCAGGTGAGTTCCAACAGAGAGCCATACGAGTCTGGTGTAGGACCAGAGATGGTACCA GAGCCACACAAATCACCGGTTCTCATGTTGCACCCAGTGATGGTGTGGTGAGCAAGTTGT TGTCTCATGCTCCAGTACATATATTTAAAGTTAGAGCGGGCAATGAGGAATGGTTCGGTT TGCTTTTGAGTTTGAATAGTGACTTCTAAGTTGATGTCATAAGCACCACCCTTGTTATCC TTTGTGTACTTAAGATAATCAAGAGGGACAGGCTCTTGCACAGGTTGGTCTACTCTAAAT TCTTCCAAAGCATCAAGAGTTACGATCCAAGCAGAGATTGTGGTACCAAAAGTTCTTTGC CAAGGAATGGACCAAGGGGAACATATTCCCATTTTTGC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)