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Oryza sativa
cluster # 2858 cluster # 2858       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2858#0 length = 3083 sequences # 2  

consensusID : consensus_2858#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 3083
fasta sequence
                              [GCGAACTCGCGAAGGAAGACGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGAGAGGCAGTCGCCGCCGTCCGCCCCTTCAGCTCGCCGCTGATTTTGGTCGCTGGGGAAGGAGAGGAGTGATCTGATGGGATTCACTCGCGGGGGCCGTGTAGAAGTCGACTTGATTCGGAGGGGATCGGGAGATCAGAGTCATGGTCGGAGGCAGCGATTGGCGAAGGAGGGAGGATCCAGGCACCGATTTTGAGCGGAATCGTCTGTTCGCTGCGCTGCAATAGATCTCATCAGGAATGAAAATGTTGCCATTGTTATTGGTCCTCAGAGCACTTTACAAGCAGAATTTGTGACCTACCTAGCGAACAAGACCAAGGTTCCTGTCATCACTTTCTCTGCAACCGGTGATGCAGTCACTCGGTACCATGTCCCGTACTTCATTCGTGCTTGTTCCAAGGACTCCTATCAGGTGGCCTCCATTGCTGCATTCGTCAAAGCCTATGAATGGAGAAATGTTGTTCTTGTCTATGAAGACAACAATTATGGTGTTGGCATCCTCCCTTCCATTACCGATGCTCTTCAAGGTGTCGGGGTTAATGTCATTAACCGTTCTGCCTTCCCTGCTTATTCCCCCAATAACCATATAGATGTGGAACTATACAAGCTCATGACCATGCAGACGCGTGTCTTCATTGTCCACATGTTGCCAGCCCGTGCTTCCCGCCTCTTTGCAAGGGCAAAAGCACTCGGTATGATGACTAAAGGGTATGTCTGGATTGTCACAGATAGCATTGGTATTGTCCTTGATGTGCTTCCCCAACATTCCATTGAAAGCATGGAGGGAATTGTTGGTTTCCGGCCATATATTGCAGAATCTACAAGGATCACTGATTTCAGCTCTCGATTTACCACCTTATTCAGAACTAAGTACCATCCAAATACTGATATTAGGATGGCAAAACCCACTATCTTTCAATTATGGGCTTATGATGTGGCATGGGCAGTCGCAACAGCAACTGAGAAGGTTCATAGGACCAGATCTTTGAACCCAACTTTTCATCCTCCGGGAAACATAGGCAAGAACTTAGTAGATGATCTCCCAGCATTGCCTGCTGGTCCAGAACTCCTCAATTCCATTTTGCAAGGAGAGTTTGATGGATTGGCTGGACAATTCAGGCTTATCGATAGACATCTGCAGGTTCCCACATATGAGATTGTCAATGTTATTGGAGAGAAAACTAGAGTTATCGGGTTTTATAGTCCTGATTCTGGACTCACAATGTCTGTGAACTCTAGAATTATCCATGGTGATGCTAAATTTAGCACAAGTTCTTCTGATCTGGAAAATATCGTTTGGCCTGGAGATTCAACAACAGTGCCCAAAGGCTGGGACTTCCCAGTGAATGCTAAGATACTCCAGATTGGTGTGCCAGTGAGACGTGATTTTAAAACTTTTGTGAATGTTGAGACTAATCCGAACACGAATAGATCAACTGTCAGTGGCTACAGCATTGATATGTTTGAGGCAGCTGTCAAGAAATTACCGTATGCTCTACGCTACGAGTACATTCCCTATGATTGTGCTGTTTCATATGACCTGCTAGTATCCCAGGTCTTTTACAAGAAGTTTGATGCAGCAGTCGGTGATGTGACAATTATTGCTAACCGAACTAGATATGTAGATTTCACAATGCCATACACAGAGTCTGGTGTTTCGATGCTTGTTCTATCTAAGAGTGACGATGAACCAACCACATGGATCTTCCTACAGCCACTAGCAAAGGACCTATGGATTGCCACTATGATCTTTATCTTCTTCACAGGCCTAGTTGTATGGGTGATTGAAAGACCTATAAATCGCGATTTCCAAGGGTCAAAATGGAAACAGTGCATCACTGCTTTCTACTTTGCATTCTCCACTTTGACTTTTTCACATGGTCAAAAGATCCAAAGCATTCAGTCAAAAATTGTTGTGGTAATTTGGTGCTTAGTTTTGATGATTCTGGTGCAGAGCTATACAGCAAGTTTGTCATCAATGCTAACGGCAGAGAGGCTCCAACCTTCAGTGACTGATCTAAAACAACTTTTGGCCAATGGTGATTCTGTTGGACACCAAAGTGGATCATTTGTGCAATCAATTCTGAAGAAGCTTAAATTTGATGACCACAAGATAAAGGTTTATAGCACGCAGGAGGAATATGCAAAAGCATTAAGGATGGGATCAAAGCATGGAGGGGTTTCGGCTATCTTCGATGAGATACCCTATCTAAATTCTTTCTGCTCGAAATACGGGAGGGAGTTCCAGATGGTTGGCCCCATTGACAGAACAAGTGGATTTGGTTTTGTTTTACCTAAAGGCTCTCCATTGGTACCAGACCTTTCAGAGGCCATCTTGAGCTTAACGGAAGAACCTGAAGGGTTGAAGATTGAAAAGACATGGTTCATGGATTCGTCCTTGGATTATTATGGCAGTCACAGCAAAGGCTCATCACGTATCAGTTTTCAGAGCTTCCAAGGTCTTTTCATCATTGTCGGGTGCCTTTTAGGTGCTGTGCTGTTGATAAACTTTAGCAAGTTTCTATATGACAAATGCAAAGAGATGAGAGGCTTCGGTTCAGACCGTGTCCATAGTGGCGAGAGAGTTGTTTGTTACGGTGAAGCTCAACCACAACCACCGCAGATTGTCATGGTCGATCGACGATCCTGTGCCTGCTGATACCCTCCAGATTAGGACTGAAAACAAATAAAGAGTGTGAACAGTTATCTGCACCAACTATCCCAACTCCCAAGGCACTAGAATGGCTCTGAAGCTAGAAAAAAGTTCACTTGTTTTGGCCTGCTTGTTGCATGGCCTTGCTTAACTGTGTAAGCCTCTTCTGTTGGTTTTAATTAGTCAATTGAAAGCTATTCTAAAACTCTAGATTTGCAATAATTGTAATGATAATTGTAATGTAGCACAAACATGCTGAACGATGTTCAGTTGATGTTTTTCTTTTCTTGGGACAAAACTCAATTGTAAGCTATTCTAAAAGAACTCTAGATTGACAATGATTGTAATATAGCACAAACACGACGAACGAAGTT]

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[+] EMBL AK105437             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GGGGTTAATGTCATTAACCGTTCTGCCTTCCCTGCTTATTCCCCCAATAACCATATAGATGTGGAACTATACAAGCTCATGACCATGCAGACGCGTGTCTTCATTGTCCACATGTTGCCAGCCCGTGCTTCCCGCCTCTTTGCAAGGGCAAAAGCACTCGGTATGATGACTAAAGGGTATGTCTGGATTGTCACAGATAGCATTGGTATTGTCCTTGATGTGCTTCCCCAACATTCCATTGAAAGCATGGAGGGAATTGTTGGTTTCCGGCCATATATTGCAGAATCTACAAGGATCACTGATTTCAGCTCTCGATTTACCACCTTATTCAGAACTAAGTACCATCCAAATACTGATATTAGGATGGCAAAACCCACTATCTTTCAATTATGGGCTTATGATGTGGCATGGGCAGTCGCAACAGCAACTGAGAAGGTTCATAGGACCAGATCTTTGAACCCAACTTTTCATCCTCCGGGAAACATAGGCAAGAACTTAGTAGATGATCTCCCAGCATTGCCTGCTGGTCCAGAACTCCTCAATTCCATTTTGCAAGGAGAGTTTGATGGATTGGCTGGACAATTCAGGCTTATCGATAGACATCTGCAGGTTCCCACATATGAGATTGTCAATGTTATTGGAGAGAAAACTAGAGTTATCGGGTTTTATAGTCCTGATTCTGGACTCACAATGTCTGTGAACTCTAGAATTATCCATGGTGATGCTAAATTTAGCACAAGTTCTTCTGATCTGGAAAATATCGTTTGGCCTGGAGATTCAACAACAGTGCCCAAAGGCTGGGACTTCCCAGTGAATGCTAAGATACTCCAGATTGGTGTGCCAGTGAGACGTGATTTTAAAACTTTTGTGAATGTTGAGACTAATCCGAACACGAATAGATCAACTGTCAGTGGCTACAGCATTGATATGTTTGAGGCAGCTGTCAAGAAATTACCGTATGCTCTACGCTACGAGTACATTCCCTATGATTGTGCTGTTTCATATGACCTGCTAGTATCCCAGGTCTTTTACAAGAAGTTTGATGCAGCAGTCGGTGATGTGACAATTATTGCTAACCGAACTAGATATGTAGATTTCACAATGCCATACACAGAGTCTGGTGTTTCGATGCTTGTTCTATCTAAGAGTGACGATGAACCAACCACATGGATCTTCCTACAGCCACTAGCAAAGGACCTATGGATTGCCACTATGATCTTTATCTTCTTCACAGGCCTAGTTGTATGGGTGATTGAGAGACCTATAAATCGCGATTTCCAAGGGTCAAAATGGAAACAGTGCATCACTGCTTTCTACTTTGCATTCTCCACTTTGACTTTTTCACATGGTCAAAAGATCCAAAGCATTCAGTCAAAAATTGTTGTGGTAATTTGGTGCTTAGTTTTGATGATTCTGGTGCAGAGCTATACAGCAAGTTTGTCATCAATGCTAACGGCAGAGAGGCTCCAACCTTCAGTGACTGATCTAAAACAACTTTTGGCCAATGGTGATTCTGTTGGACACCAAAGTGGATCATTTGTGCAATCAATTCTGAAGAAGCTTAAATTTGATGACCACAAGATAAAGGTTTATAGCACGCAGGAGGAATATGCAAAAGCATTAAGGATGGGATCAAAGCATGGAGGGGTTTCGGCTATCTTCGATGAGATACCCTATCTAAATTCTTTCTGCTCGAAATACGGGAGGGAGTTCCAGATGGTTGGCCCCATTGACAGAACAAGTGGATTTGGTTTTGTTTTACCTAAAGGCTCTCCATTGGTACCAGACCTTTCAGAGGCCATCTTGAGCTTAACGGAAGAACCTGAAAGGTTGAAGATTGAAAAGACATGGTTCATGGATTCGTCCTTGGATTATTATGGCAGTCACAGCAAAGGCTCATCACGTATCAGTTTTCAGAGCTTCCAAGGTCTTTTCATCATTGTCGGGTGCCTTTTAGGTGCTGTGCTGTTGATAAACTTTAGCAAGTTTCTATATGACAAATGCAAAGAGATGAGAGGCTTCGGTTCAGACCGTGTCCATAGTGGCGAGAGAGTTGTTTGTTACGGTGAAGCTCAACCACAACCACCGCAGATTGTCATGGTCGATCGACGATCCTGTGCCTGCTGATACCCTCCAGATTAGGACTGAAAACAAATAAAGAGTGTGAACAGTTATCTGCACCAACTATCCCAACTCCCAAGGCACTAGAATGGCTCTGAAGCTAGAAAAAAGTTCACTTGTTTTGGCCTGCTTGTTGCATGGCCTTGCTTAACTGTGTAAGCCTCTTCTGTTGGTTTTAATTAGTCAATTGAAAGCTATTCTAAAACTCTAGATTTGCAATAATTGTAATGATAATTGTAATGTAGCACAAACATGCTGAACGATGTTCAGTTGATGTTTTTCTTTTCTTGGGACAAAACTCAATTGTAAGCTATTCTAAAAGAACTCTAGATTGACAATGATTGTAATATAGCACAAACACGACGAACGAAGTT]


>consensus_2858#0 GCGAACTCGCGAAGGAAGACGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGAG AGGCAGTCGCCGCCGTCCGCCCCTTCAGCTCGCCGCTGATTTTGGTCGCTGGGGAAGGAG AGGAGTGATCTGATGGGATTCACTCGCGGGGGCCGTGTAGAAGTCGACTTGATTCGGAGG GGATCGGGAGATCAGAGTCATGGTCGGAGGCAGCGATTGGCGAAGGAGGGAGGATCCAGG CACCGATTTTGAGCGGAATCGTCTGTTCGCTGCGCTGCAATAGATCTCATCAGGAATGAA AATGTTGCCATTGTTATTGGTCCTCAGAGCACTTTACAAGCAGAATTTGTGACCTACCTA GCGAACAAGACCAAGGTTCCTGTCATCACTTTCTCTGCAACCGGTGATGCAGTCACTCGG TACCATGTCCCGTACTTCATTCGTGCTTGTTCCAAGGACTCCTATCAGGTGGCCTCCATT GCTGCATTCGTCAAAGCCTATGAATGGAGAAATGTTGTTCTTGTCTATGAAGACAACAAT TATGGTGTTGGCATCCTCCCTTCCATTACCGATGCTCTTCAAGGTGTCGGGGTTAATGTC ATTAACCGTTCTGCCTTCCCTGCTTATTCCCCCAATAACCATATAGATGTGGAACTATAC AAGCTCATGACCATGCAGACGCGTGTCTTCATTGTCCACATGTTGCCAGCCCGTGCTTCC CGCCTCTTTGCAAGGGCAAAAGCACTCGGTATGATGACTAAAGGGTATGTCTGGATTGTC ACAGATAGCATTGGTATTGTCCTTGATGTGCTTCCCCAACATTCCATTGAAAGCATGGAG GGAATTGTTGGTTTCCGGCCATATATTGCAGAATCTACAAGGATCACTGATTTCAGCTCT CGATTTACCACCTTATTCAGAACTAAGTACCATCCAAATACTGATATTAGGATGGCAAAA CCCACTATCTTTCAATTATGGGCTTATGATGTGGCATGGGCAGTCGCAACAGCAACTGAG AAGGTTCATAGGACCAGATCTTTGAACCCAACTTTTCATCCTCCGGGAAACATAGGCAAG AACTTAGTAGATGATCTCCCAGCATTGCCTGCTGGTCCAGAACTCCTCAATTCCATTTTG CAAGGAGAGTTTGATGGATTGGCTGGACAATTCAGGCTTATCGATAGACATCTGCAGGTT CCCACATATGAGATTGTCAATGTTATTGGAGAGAAAACTAGAGTTATCGGGTTTTATAGT CCTGATTCTGGACTCACAATGTCTGTGAACTCTAGAATTATCCATGGTGATGCTAAATTT AGCACAAGTTCTTCTGATCTGGAAAATATCGTTTGGCCTGGAGATTCAACAACAGTGCCC AAAGGCTGGGACTTCCCAGTGAATGCTAAGATACTCCAGATTGGTGTGCCAGTGAGACGT GATTTTAAAACTTTTGTGAATGTTGAGACTAATCCGAACACGAATAGATCAACTGTCAGT GGCTACAGCATTGATATGTTTGAGGCAGCTGTCAAGAAATTACCGTATGCTCTACGCTAC GAGTACATTCCCTATGATTGTGCTGTTTCATATGACCTGCTAGTATCCCAGGTCTTTTAC AAGAAGTTTGATGCAGCAGTCGGTGATGTGACAATTATTGCTAACCGAACTAGATATGTA GATTTCACAATGCCATACACAGAGTCTGGTGTTTCGATGCTTGTTCTATCTAAGAGTGAC GATGAACCAACCACATGGATCTTCCTACAGCCACTAGCAAAGGACCTATGGATTGCCACT ATGATCTTTATCTTCTTCACAGGCCTAGTTGTATGGGTGATTGAAAGACCTATAAATCGC GATTTCCAAGGGTCAAAATGGAAACAGTGCATCACTGCTTTCTACTTTGCATTCTCCACT TTGACTTTTTCACATGGTCAAAAGATCCAAAGCATTCAGTCAAAAATTGTTGTGGTAATT TGGTGCTTAGTTTTGATGATTCTGGTGCAGAGCTATACAGCAAGTTTGTCATCAATGCTA ACGGCAGAGAGGCTCCAACCTTCAGTGACTGATCTAAAACAACTTTTGGCCAATGGTGAT TCTGTTGGACACCAAAGTGGATCATTTGTGCAATCAATTCTGAAGAAGCTTAAATTTGAT GACCACAAGATAAAGGTTTATAGCACGCAGGAGGAATATGCAAAAGCATTAAGGATGGGA TCAAAGCATGGAGGGGTTTCGGCTATCTTCGATGAGATACCCTATCTAAATTCTTTCTGC TCGAAATACGGGAGGGAGTTCCAGATGGTTGGCCCCATTGACAGAACAAGTGGATTTGGT TTTGTTTTACCTAAAGGCTCTCCATTGGTACCAGACCTTTCAGAGGCCATCTTGAGCTTA ACGGAAGAACCTGAAGGGTTGAAGATTGAAAAGACATGGTTCATGGATTCGTCCTTGGAT TATTATGGCAGTCACAGCAAAGGCTCATCACGTATCAGTTTTCAGAGCTTCCAAGGTCTT TTCATCATTGTCGGGTGCCTTTTAGGTGCTGTGCTGTTGATAAACTTTAGCAAGTTTCTA TATGACAAATGCAAAGAGATGAGAGGCTTCGGTTCAGACCGTGTCCATAGTGGCGAGAGA GTTGTTTGTTACGGTGAAGCTCAACCACAACCACCGCAGATTGTCATGGTCGATCGACGA TCCTGTGCCTGCTGATACCCTCCAGATTAGGACTGAAAACAAATAAAGAGTGTGAACAGT TATCTGCACCAACTATCCCAACTCCCAAGGCACTAGAATGGCTCTGAAGCTAGAAAAAAG TTCACTTGTTTTGGCCTGCTTGTTGCATGGCCTTGCTTAACTGTGTAAGCCTCTTCTGTT GGTTTTAATTAGTCAATTGAAAGCTATTCTAAAACTCTAGATTTGCAATAATTGTAATGA TAATTGTAATGTAGCACAAACATGCTGAACGATGTTCAGTTGATGTTTTTCTTTTCTTGG GACAAAACTCAATTGTAAGCTATTCTAAAAGAACTCTAGATTGACAATGATTGTAATATA GCACAAACACGACGAACGAAGTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)