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Oryza sativa
cluster # 2876 cluster # 2876       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2876#0 length = 1434 sequences # 2  

consensusID : consensus_2876#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1434
fasta sequence
                              [TGGAAGAAAAGACTAGAGAAGATTGACAAGTGATCATATGAGAGAGATGTCAACCCTAAGCCACCAGCACCACCATGTTCTCGTCCTCCAACTCATCCTACTTCTGCCCTTTCTCCACCTCGTTGTCCCCGGAACGCCAGCCGCCGCCCGCAAGTTCTCCGACGTGTTGGCGAGCGGCCGCAACGTGAGCGACGGCGACGTGCTCGTCTCCCCCGGCGGGTCCTTCACCCTCGGCTTCTTCTCCCCCGCCGCCACCAGGAGGAGGTATCTCGGGATTTGGTTCTCCGTCTCGCCGGACGCCGCCGTCCACTGGGTGGCCAACCGTGACCACGCTCTCAACGACACCTCCGGCGCACTGATGCTGACCGACGCCGGCGTCCTCCTCCTCCTCGACGGCTCCGGCAAGGTGGTGTGGTCCTCTTCCGCCACCGCGCTGCCTTCCGCGACTACCTCCGCCGCGGCGCGGCTGCTCGATTCCGGCAACTTGGTGGTGCAAGGGCAGGGCTCCGGCACCGCCCTGTGGCAGTCGTTCGACTACCCCACCAACACCCTGCTGCCCGGCATGAAGATCGGCAAGAACCGGTGGACCGGCGCCGAGTGGTACCTGCTGTCGTGGCGCTCCCCCGCCGATCCTTCTCCGGGGAGCTACAGGTACGTCACCGACGGCGACGAGGCGCTGCCGGAGAACGTCGTGCTCGACGGCAATGGCACCGAGGTGTACCGGACCGGGGTGTGGAACGGCAGGAGGTTCAACGGCGTCCCGGAGATGGCGTCGTTCGCGGACATGTTCAGCTTCCAGCTCACGGTCAGCCCGGGCGAGGTCACCTACGGCTACGTCGCCAAGGCCGGGGCGCCGTTCTCCCGCGTGGTGGTGACCGACGACGGCGTGGTCCGGCGGCTGGTGTGGGACGCGGCGACGCGGGCGTGGAAGACGTTCTTCCAGGCGCCGGGGGACTCCTGCGACAGCTACGCCAAGTGCGGCGCGTTCGGCCTGTGCGACAGCAACGCCGGCGCGACGTCGATTTGCCGGTGCGTGAAGGGGTTCAGCCCGGCGTCGCCGGCGGAGTGGTCGATGAGGGAGTACTCCGGCGGGTGCCGCCGGGACGTGGCGCTCGACTGCGGCACGGACGGGTTCGCCGTGCTGCGCGGGGTGAAGCTCCCTGACACGCGCAACGCGTCGGTGGACATGGGCGTCAAGCTGGACGAGTGCAGGGCGAGGTGCGTTGCCAACTGCTCGTGCGTGGCGTATGCCGCGGCGGACTTGAGCGGCGGTGGGTGCATTATGTGGACAAAGCCTTTCGTCGATTTACGTTTCATCGACAATGGCCAGGACATCTACCAGCGGCTAGCGAAATCTGAAATAGGTAATTTAACCTAATTTTGATTTGTTGGTGTTCCATAAATGTGGTGGCTTTATATATCCTTAGGGAAATT]

[+] EMBL AK103894             [TGGAAGAAAAGACTAGAGAAGATTGACAAGTGATCATATGAGAGAGATGTCAACCCTAAGCCACCAGCACCACCATGTTCTCGTCCTCCAACTCATCCTACTTCTGCCCTTTCTCCACCTCGTTGTCCCCGGAACGCCAGCCGCCGCCCGCAAGTTCTCCGACGTGTTGGCGAGCGGCCGCAACGTGAGCGACGGCGACGTGCTCGTCTCCCCCGGCGGGTCCTTCACCCTCGGCTTCTTCTCCCCCGCCGCCACCAGGAGGAGGTATCTCGGGATTTGGTTCTCCGTCTCGCCGGACGCCGCCGTCCACTGGGTGGCCAACCGTGACCACGCTCTCAACGACACCTCCGGCGCACTGATGCTGACCGACGCCGGCGTCCTCCTCCTCCTCGACGGCTCCGGCAAGGTGGTGTGGTCCTCTTCCGCCACCGCGCTGCCTTCCGCGACTACCTCCGCCGCGGCGCGGCTGCTCGATTCCGGCAACTTGGTGGTGCAAGGGCAGGGCTCCGGCACCGCCCTGTGGCAGTCGTTCGACTACCCCACCAACACCCTGCTGCCCGGCATGAAGATCGGCAAGAACCGGTGGACCGGCGCCGAGTGGTACCTGCTGTCGTGGCGCTCCCCCGCCGATCCTTCTCCGGGGAGCTACAGGTACGTCACCGACGGCGACGAGGCGCTGCCGGAGAACGTCGTGCTCGACGGCAATGGCACCGAGGTGTACCGGACCGGGGTGTGGAACGGCAGGAGGTTCAACGGCGTCCCGGAGATGGCGTCGTTCGCGGACATGTTCAGCTTCCAGCTCACGGTCAGCCCGGGCGAGGTCACCTACGGCTACGTCGCCAAGGCCGGGGCGCCGTTCTCCCGCGTGGTGGTGACCGACGACGGCGTGGTCCGGCGGCTGGTGTGGGACGCGGCGACGCGGGCGTGGAAGACGTTCTTCCAGGCGCCGGGGGACTCCTGCGACAGCTACGCCAAGTGCGGCGCGTTCGGCCTGTGCGACAGCAACGCCGGCGCGACGTCGATTTGCCGGTGCGTGAAGGGGTTCAGCCCGGCGTCGCCGGCGGAGTGGTCGATGAGGGAGTACTCCGGCGGGTGCCGCCGGGACGTGGCGCTCGACTGCGGCACGGACGGGTTCGCCGTGCTGCGCGGGGTGAAGCTCCCTGACACGCGCAACGCGTCGGTGGACATGGGCGTCAAGCTGGACGAGTGCAGGGCGAGGTGCGTTGCCAACTGCTCGTGCGTGGCGTATGCCGCGGCGGACTTGAGCGGCGGTGGGTGCATTATGTGGACAAAGCCTTTCGTCGATTTACGTTTCATCGACAATGGCCAGGACATCTACCAGCGGCTAGCGAAATCTGAAATAGGTAATTTAACCTAATTTTGATTTGTTGGTGTTCCATAAATGTGGTGGCTTTATATATCCTTAGGGAAATT]
[+] EMBL AK110951             [                                            AGATGTCAACCCTAAGCCACCAGCACCACCATGTTCTCGTCCTCCAACTCATCCTACTTCTGCCCTTTCTCCACCTCGTTGTCCCCGGAACGCCAGCCGCCGCCCGCAAGTTCTCCGACGTGTTGGCGAGCGGCCGCAACGTGAGCGACGGCGACGTGCTCGTCTCCCCCGGCGGGTCCTTCACCCTCGGCTTCTTCTCCCCCGCCGCCACCAGGAGGAGGTATCTCGGGATTTGGTTCTCCGTCTCGCCGGACGCCGCCGTCCACTGGGTGGCCAACCGTGACCACGCTCTCAACGACACCTCCGGCGCACTGATGCTGACCGACGCCGGCGTCCTCCTCCTCCTCGACGGCTCCGGCAAGGTGGTGTGGTCCTCTTCCGCCACCGCGCTGCCTTCCGCGACTACCTCCGCCGCGGCGCGGCTGCTCGATTCCGGCAACTTGGTGGTGCAAGGGCAGGGCTCCGGCACCGCCCTGTGGCAGTCGTTCGACTACCCCACCAACACCCTGCTGCCCGGCATGAAGATCGGCAAGAACCGGTGGACCGGCGCCGAGTGGTACCTGCTGTCGTGGCGCTCCCCCGCCGATCCTTCTCCGGGGAGCTACAGGTACGTCACCGACGGCGACGAGGCGCTGCCGGAGAACGTCGTGCTCGACGGCAATGGCACCGAGGTGTACCGGACCGGGGTGTGGAACGGCAGGAGGTTCAACGGCGTCCCGGAGATGGCGTCGTTCGCGGACATGTTCAGCTTCCAGCTCACGGTCAGCCCGGGCGAGGTCACCTACGGCTACGTCGCCAAGGCCGGGGCGCCGTTCTCCCGCGTGGTGGTGACCGACGACGGCGTGGTCCGGCGGCTGGTGTGGGACGCGGCGACGCGGGCGTGGAAGACGTTCTTCCAGGCGCCGGGGGACTCCTGCGACAGCTACGCCAAGTGCGGCGCGTTCGGCCTGTGCGACAGCAACGCCGGCGCGACGTCGATTTGCCGGTGCGTGAAGGGGTTCAGCCCGGCGTCGCCGGCGGAGTGGTCGATGAGGGAGTACTCCGGCGGGTGCCGCCGGGACGTGGCGCTCGACTGCGGCACGGACGGGTTCGCCGTGCTGCGCGGGGTGAAGCTCCCTGACACGCGCAACGCGTCGGTGGACATGGGCGTCAAGCTGGACGAGTGCAGGGCGAGGTGCGTTGCCAACTGCTCGTGCGTGGCGTATGCCGCGGCGGACTTGAGCGGCGGTGGGTGCATTATGTGGACAAAGCCTTTCGTCGATTTACGTTTCATCGACAATGGCCAGGACATCTACCAGCGGCTAGCGAAATCTGAAATAGGTAATTTAACCT                                                          ]


>consensus_2876#0 TGGAAGAAAAGACTAGAGAAGATTGACAAGTGATCATATGAGAGAGATGTCAACCCTAAG CCACCAGCACCACCATGTTCTCGTCCTCCAACTCATCCTACTTCTGCCCTTTCTCCACCT CGTTGTCCCCGGAACGCCAGCCGCCGCCCGCAAGTTCTCCGACGTGTTGGCGAGCGGCCG CAACGTGAGCGACGGCGACGTGCTCGTCTCCCCCGGCGGGTCCTTCACCCTCGGCTTCTT CTCCCCCGCCGCCACCAGGAGGAGGTATCTCGGGATTTGGTTCTCCGTCTCGCCGGACGC CGCCGTCCACTGGGTGGCCAACCGTGACCACGCTCTCAACGACACCTCCGGCGCACTGAT GCTGACCGACGCCGGCGTCCTCCTCCTCCTCGACGGCTCCGGCAAGGTGGTGTGGTCCTC TTCCGCCACCGCGCTGCCTTCCGCGACTACCTCCGCCGCGGCGCGGCTGCTCGATTCCGG CAACTTGGTGGTGCAAGGGCAGGGCTCCGGCACCGCCCTGTGGCAGTCGTTCGACTACCC CACCAACACCCTGCTGCCCGGCATGAAGATCGGCAAGAACCGGTGGACCGGCGCCGAGTG GTACCTGCTGTCGTGGCGCTCCCCCGCCGATCCTTCTCCGGGGAGCTACAGGTACGTCAC CGACGGCGACGAGGCGCTGCCGGAGAACGTCGTGCTCGACGGCAATGGCACCGAGGTGTA CCGGACCGGGGTGTGGAACGGCAGGAGGTTCAACGGCGTCCCGGAGATGGCGTCGTTCGC GGACATGTTCAGCTTCCAGCTCACGGTCAGCCCGGGCGAGGTCACCTACGGCTACGTCGC CAAGGCCGGGGCGCCGTTCTCCCGCGTGGTGGTGACCGACGACGGCGTGGTCCGGCGGCT GGTGTGGGACGCGGCGACGCGGGCGTGGAAGACGTTCTTCCAGGCGCCGGGGGACTCCTG CGACAGCTACGCCAAGTGCGGCGCGTTCGGCCTGTGCGACAGCAACGCCGGCGCGACGTC GATTTGCCGGTGCGTGAAGGGGTTCAGCCCGGCGTCGCCGGCGGAGTGGTCGATGAGGGA GTACTCCGGCGGGTGCCGCCGGGACGTGGCGCTCGACTGCGGCACGGACGGGTTCGCCGT GCTGCGCGGGGTGAAGCTCCCTGACACGCGCAACGCGTCGGTGGACATGGGCGTCAAGCT GGACGAGTGCAGGGCGAGGTGCGTTGCCAACTGCTCGTGCGTGGCGTATGCCGCGGCGGA CTTGAGCGGCGGTGGGTGCATTATGTGGACAAAGCCTTTCGTCGATTTACGTTTCATCGA CAATGGCCAGGACATCTACCAGCGGCTAGCGAAATCTGAAATAGGTAATTTAACCTAATT TTGATTTGTTGGTGTTCCATAAATGTGGTGGCTTTATATATCCTTAGGGAAATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)