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Oryza sativa
cluster # 2937 cluster # 2937       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2937#0 length = 1901 sequences # 2  

consensusID : consensus_2937#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1901
fasta sequence
                              [AGGAGTCCCGTTCCGTCCCGTCCGAGCCGTCGCCACCATGGGCGGAGATCCCACCGCCGACCCCTCCTCCGCATACTTCATCGACGCCGACCACCCGTACGCCGCCGCCGCCGCCTCCGCGCTCACCTCCCACCGCTCCAGGTCCAAGTGGTCCCACCTCTCCTCCCTCGCCGTGCCCGATCCCCTCCCGGCCTCCGCCGTCGCGGCGGTCCCCCTCCTGCTCCGCCGCCGCCCCCACGTGGCCCTCAGCTTCCACCTCTTCGCCACCCGCCGCCTCCTCCCCTCTGGCTCTCCGCCCCCGCTCCTCCTCTCCGTCTCCGCCGCCCATGTCGCCGCCGCTTCCCGCCTCCGCCGCGCCGCCATCTCCCTCCTCTCCTCCGCCGCCCGCCACTACCCGCATTCTCAAATCTTCGCCGCCCTGGCCGCCACCTACCGCCGGTTCGCCTCCGCGCCCTTCGTCTTTGACCTTCTCCTCCTCGCCTACCTCCGCTCCCGCCGCGACGCCCTCGCCGCGGCCTCCGTCGCCCGCCGCATCCTCGCTGCCGGCGCCCACCCCCTCCCCTCCACCTCCGCCGCCCTCCTCCGCTCCCTCCCCTCCGCCGCCGCGGCCCTCGACATGTACCGCGAAATCTACACGCGCCCGAGTTCAAGGATCAACAGCCAGCTACTGCCGACCGTTCATACCTTCAACTCCCTCCTCCTCGCTTTCTACCGTGAAGGGAAGTGCGATGTTTTCAAGGTTGTGCTCCAGGAAATGGACAGATATTCCTGCGTACACAATGTGTGCACCTACAATATCCGGATGGCCGCGTATTGTGATAGCAAGGAGGTGGAGAAGGCACGAGGGCTGTGGGATGAGATGGTTGAGGGAGGAATCCAACCGGATGTTCCCGCGTACAACACGATGATCAGTGGGTACTGTGGTGTGGGGGAGGTAGGTATGGCAGAGGAGATGTTTAAGGATATGGAGATGGGTGGGATCGACCCAAGCGTTACGACATTTGAATGGTTGGTTAGAGGGCATTGTAGGGTGGGGGATATCGATGCGGCAATGCTTGTGCGTGCAGACATGAGCAGGAGGGGGTTCCAGATGGCGGCAGAGGTTGTAGAGGAGGTGGTGAATGTACTGTGTCAGAAGAAGAGAGTGAAGGAGGCATTAGGTGTTTTGAAGGAAGAGATGAGGAAGGAAGAGTTTGTGCCAAGTCGGGAATGTTACGAGGTATTGATAAGGGAACTTTGTGAGCAAGGGGAGGTGGAGGTGGCAATGAGACTCCAGGCGGAGATGGCTGGTATGGGATTCAAGGTTGGCAGTGAGGTGTACTGTGCCTTTGTCTGTGCCTATGAGAAGGCTGAGGATTATGAGATGGCAGAGAAGTTGAGGAAAGAATTGTCGGTGATAAGCATTCAGGATGGATGATATTTTCCTTATCTTTACACAGTGATGCATGATTTTTCATCTCTGTTCATTGCAATGAAAAAGTCTGGTAAACTTCTTCTTATCCATTGCAATAGGCCCATTAAACTGTGATGTCAGATATGTCCTTCCAGCAGCTAGCAGTTTCATATCCGTCACACAGTGACACGATCCGAGATGCAACTGTTTGTTGTAATTATGTGGTTGACTTGAAGTTAGTATTTGTGGGACACCAACCACAATCCATGACGATGATTTTCTGCTCCACTATCAAGAGAGTGATATAGAAGAAGTATGGTCAAAGTGGATGGCAGTTTGCAGTTCATACAGTAGATCAGCAGTATGATTTGTTACTGAAATGCACATTTACTGGTGGGAAATCAAACCTCGCTTTGAGTTTGAAGTATTGGGTCCTTCGCTTTTGAAGGTCTAAGATAAGTCGCTTAGCTNCGTCGGGATGAAGATCAGGTTCCAGGTTCTTGAGTTT]

[+] EMBL AK106427             [AGGAGTCCCGTTCCGTCCCGTCCGAGCCGTCGCCACCATGGGCGGAGATCCCACCGCCGACCCCTCCTCCGCATACTTCATCGACGCCGACCACCCGTACGCCGCCGCCGCCGCCTCCGCGCTCACCTCCCACCGCTCCAGGTCCAAGTGGTCCCACCTCTCCTCCCTCGCCGTGCCCGATCCCCTCCCGGCCTCCGCCGTCGCGGCGGTCCCCCTCCTGCTCCGCCGCCGCCCCCACGTGGCCCTCAGCTTCCACCTCTTCGCCACCCGCCGCCTCCTCCCCTCTGGCTCTCCGCCCCCGCTCCTCCTCTCCGTCTCCGCCGCCCATGTCGCCGCCGCTTCCCGCCTCCGCCGCGCCGCCATCTCCCTCCTCTCCTCCGCCGCCCGCCACTACCCGCATTCTCAAATCTTCGCCGCCCTGGCCGCCACCTACCGCCGGTTCGCCTCCGCGCCCTTCGTCTTTGACCTTCTCCTCCTCGCCTACCTCCGCTCCCGCCGCGACGCCCTCGCCGCGGCCTCCGTCGCCCGCCGCATCCTCGCTGCCGGCGCCCACCCCCTCCCCTCCACCTCCGCCGCCCTCCTCCGCTCCCTCCCCTCCGCCGCCGCGGCCCTCGACATGTACCGCGAAATCTACACGCGCCCGAGTTCAAGGATCAACAGCCAGCTACTGCCGACCGTTCATACCTTCAACTCCCTCCTCCTCGCTTTCTACCGTGAAGGGAAGTGCGATGTTTTCAAGGTTGTGCTCCAGGAAATGGACAGATATTCCTGCGTACACAATGTGTGCACCTACAATATCCGGATGGCCGCGTATTGTGATAGCAAGGAGGTGGAGAAGGCACGAGGGCTGTGGGATGAGATGGTTGAGGGAGGAATCCAACCGGATGTTCCCGCGTACAACACGATGATCAGTGGGTACTGTGGTGTGGGGGAGGTAGGTATGGCAGAGGAGATGTTTAAGGATATGGAGATGGGTGGGATCGACCCAAGCGTTACGACATTTGAATGGTTGGTTAGAGGGCATTGTAGGGTGGGGGATATCGATGCGGCAATGCTTGTGCGTGCAGACATGAGCAGGAGGGGGTTCCAGATGGCGGCAGAGGTTGTAGAGGAGGTGGTGAATGTACTGTGTCAGAAGAAGAGAGTGAAGGAGGCATTAGGTGTTTTGAAGGAAGAGATGAGGAAGGAAGAGTTTGTGCCAAGTCGGGAATGTTACGAGGTATTGATAAGGGAACTTTGTGAGCAAGGGGAGGTGGAGGTGGCAATGAGACTCCAGGCGGAGATGGCTGGTATGGGATTCAAGGTTGGCAGTGAGGTGTACTGTGCCTTTGTCTGTGCCTATGAGAAGGCTGAGGATTATGAGATGGCAGAGAAGTTGAGGAAAGAATTGTCGGTGATAAGCATTCAGGATGGATGATATTTTCCTTATCTTTACACAGTGATGCATGATTTTTCATCTCTGTTCATTGCAATGAAAAAGTCTGGTAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CA764583             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGATGGCGGCAGAGGTTGTAGAGGAGGTGGTGAATGTACTGTGTCAGAAGAAGAGAGTGAAGGAGGCATTAGGTGTTTCGAAGGAAGAGATGAGGAAGGAAGAGTTTGTGCCAAGTCGGGAATGTTACGAGGTATTGATAAGGGAACTTTGTGAGCAAGGGGAGGTGGAGGTGGCAATGAGACTCCAGGCGGAGATGGCTGGTATGGGATTCAAGGTTGGCAGTGAGGTGTACTGTGCCTTTGTCTGTGCCAATGAGAAGGCTGAGGATTATGAGATGGCAGAGAAGTTGAGGAAAGAATTGTCGGTGATAAGCATTCAGGATGGATGATATTTTCCTTATCTTTACACAGTGATGCATGATTTTTCATCTCTGTTCATTGCAATGAAAAAGTCTGGTTTGCTTCTTCTTATCCATTGCAATAGGCCCATTAAACTGTGATGTCAGATATGTCCTTCCAGCAGCTAGCAGTTTCATATCCGTCACACAGTGACACGATCCGAGATGCAACTGTTTGTTGTAATTATGTGGTTGACTTGAAGTTAGTATTTGTGGGACACCAACCACAATCCATGACGATGATTTTCTGCTCCACTATCAAGAGAGTGATATAGAAGAAGTATGGTCAAAGTGGATGGCAGTTTGCAGTTCATACAGTAGATCAGCAGTATGATTTGTTACTGAAATGCACATTTACTGGTGGGAAATCAAACCTCGCTTTGAGTTTGAAGTATTGGGTCCTTCGCTTTTGAAGGTCTAAGATAAGTCGCTTAGCTNCGTCGGGATGAAGATCAGGTTCCAGGTTCTTGAGTTT]


>consensus_2937#0 AGGAGTCCCGTTCCGTCCCGTCCGAGCCGTCGCCACCATGGGCGGAGATCCCACCGCCGA CCCCTCCTCCGCATACTTCATCGACGCCGACCACCCGTACGCCGCCGCCGCCGCCTCCGC GCTCACCTCCCACCGCTCCAGGTCCAAGTGGTCCCACCTCTCCTCCCTCGCCGTGCCCGA TCCCCTCCCGGCCTCCGCCGTCGCGGCGGTCCCCCTCCTGCTCCGCCGCCGCCCCCACGT GGCCCTCAGCTTCCACCTCTTCGCCACCCGCCGCCTCCTCCCCTCTGGCTCTCCGCCCCC GCTCCTCCTCTCCGTCTCCGCCGCCCATGTCGCCGCCGCTTCCCGCCTCCGCCGCGCCGC CATCTCCCTCCTCTCCTCCGCCGCCCGCCACTACCCGCATTCTCAAATCTTCGCCGCCCT GGCCGCCACCTACCGCCGGTTCGCCTCCGCGCCCTTCGTCTTTGACCTTCTCCTCCTCGC CTACCTCCGCTCCCGCCGCGACGCCCTCGCCGCGGCCTCCGTCGCCCGCCGCATCCTCGC TGCCGGCGCCCACCCCCTCCCCTCCACCTCCGCCGCCCTCCTCCGCTCCCTCCCCTCCGC CGCCGCGGCCCTCGACATGTACCGCGAAATCTACACGCGCCCGAGTTCAAGGATCAACAG CCAGCTACTGCCGACCGTTCATACCTTCAACTCCCTCCTCCTCGCTTTCTACCGTGAAGG GAAGTGCGATGTTTTCAAGGTTGTGCTCCAGGAAATGGACAGATATTCCTGCGTACACAA TGTGTGCACCTACAATATCCGGATGGCCGCGTATTGTGATAGCAAGGAGGTGGAGAAGGC ACGAGGGCTGTGGGATGAGATGGTTGAGGGAGGAATCCAACCGGATGTTCCCGCGTACAA CACGATGATCAGTGGGTACTGTGGTGTGGGGGAGGTAGGTATGGCAGAGGAGATGTTTAA GGATATGGAGATGGGTGGGATCGACCCAAGCGTTACGACATTTGAATGGTTGGTTAGAGG GCATTGTAGGGTGGGGGATATCGATGCGGCAATGCTTGTGCGTGCAGACATGAGCAGGAG GGGGTTCCAGATGGCGGCAGAGGTTGTAGAGGAGGTGGTGAATGTACTGTGTCAGAAGAA GAGAGTGAAGGAGGCATTAGGTGTTTTGAAGGAAGAGATGAGGAAGGAAGAGTTTGTGCC AAGTCGGGAATGTTACGAGGTATTGATAAGGGAACTTTGTGAGCAAGGGGAGGTGGAGGT GGCAATGAGACTCCAGGCGGAGATGGCTGGTATGGGATTCAAGGTTGGCAGTGAGGTGTA CTGTGCCTTTGTCTGTGCCTATGAGAAGGCTGAGGATTATGAGATGGCAGAGAAGTTGAG GAAAGAATTGTCGGTGATAAGCATTCAGGATGGATGATATTTTCCTTATCTTTACACAGT GATGCATGATTTTTCATCTCTGTTCATTGCAATGAAAAAGTCTGGTAAACTTCTTCTTAT CCATTGCAATAGGCCCATTAAACTGTGATGTCAGATATGTCCTTCCAGCAGCTAGCAGTT TCATATCCGTCACACAGTGACACGATCCGAGATGCAACTGTTTGTTGTAATTATGTGGTT GACTTGAAGTTAGTATTTGTGGGACACCAACCACAATCCATGACGATGATTTTCTGCTCC ACTATCAAGAGAGTGATATAGAAGAAGTATGGTCAAAGTGGATGGCAGTTTGCAGTTCAT ACAGTAGATCAGCAGTATGATTTGTTACTGAAATGCACATTTACTGGTGGGAAATCAAAC CTCGCTTTGAGTTTGAAGTATTGGGTCCTTCGCTTTTGAAGGTCTAAGATAAGTCGCTTA GCTNCGTCGGGATGAAGATCAGGTTCCAGGTTCTTGAGTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)