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Oryza sativa
cluster # 2957 cluster # 2957       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2957#0 length = 3218 sequences # 2  

consensusID : consensus_2957#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 3218
fasta sequence
                              [CTTTGCCTGCCTTCATTCGTGAATTAAAAGCTTTGGGTGCACATTGCCTTCAAAGTTCAAACGGTGCAAGGGCAGGGCAGCTATTGTTATTTGGGTTCATCTGTTGCTCGGTCGAGGCTACTCTCACTGGTCAGAAATCTAAGCTTCATTGAGGAAGCACCGGTGGACCAAAGAGAGGCATGTCGACGATGGTGGTGAGCGCATACAAGGGGGTGATTGACTCTGTTCTTGCAAAGCTCAGAGAGCTGATGGGAGGGGACATGTGTGCCAACCTCATAGGCGTGTCCAGCAGGGACATTTTGTTCCTCAGGGATGAGCTGCCTGCCATGAGTGCTCTCCTGGAGAAGCTGGATGATGCCGAAGAACTCGATTCGGAGGCGAAAAATTGGAGGAACCAAGTGAGGGAGATGACCTACGACATCGAGGACTGCATCGATGATTTCAGTAACAACATCACAAGCGTAGACGCTAAGACGGGGTTCCTCTACAAGGCTTCCCAATTTCTCAAGACTTGCAGGGCTCATCTTGAGGCTGCCTGGCAAATCAAAGAGCTCAAGACTCGTCTACAGGAGATAAACGAGCGGCGTAAGAGGTACAAGGTTGGACATTACATCTCTAATACTACCTCAGTGACAGTTGACCCTCGCATCTCGGCATTCTATAAGGAGACAGCCGGCCTTGTAGGCATTGACAGCCCAAAGAGAGAGCTCACTAAATTGGTGATGGACGAAGAGACGCAATTGAAGGTTATGTCAATAGTTGGATTTGGAGGCCTAGGCAAGACCACCCTAGCTAGTCAGGTGTATCGTGAAGTTGGAGTGCAGTTCAACTGTAAGGCATTTGTATCTGTTTCTCAAAAACCAGACATGGTAAGGCTACTCACAAGTTTGCTGTTACAACTCAAGCAACATCCCTCTCATGCTTGTGGGGTGCAAGAACTCATCGACAATCTCAGGGAATATCTAATGGATAAAAGGTACTTCATTGTAGTTGATGATTTGTGGGATGTTCCTTCATGGAATATTATTACATGTGCTTTTCCACAAAATAATCAACATAGCAGAGTTATAATAACTACAAGACACGGGGATGTGGCTAGGACATGTTCCAGTGACCATGGAAGCATTAACAATATGAAGCCCCTAAGTGCCCAAAACTCAAGAGAACTATTCTTCAACAGAATATTTGGGTCTAAAGATTAATGTCCCTCTTACTTGGAAGAAGTCTCATGTAAAATACTGAAGAAGTGTGGTGGCCTACCGCTTGCAATTGTTACTGTAGCTAGTATTTTAGCTTGCCAACCCACAAGACTGAAGGAGGAATGGGAGTACATTCAAAGTTCTCTAGCCACTAACAAATTTGCAAGGAAGTCCACCTTGGAAGACATGATGCAAATCTTGGAGCTCAGCTACAAGAGTCTGCCACATCATCTCAAAGCATGCTTTCTTTATCTTGGTGCTTACCCAGAGGATTGTGTGATTAGCAAGGTTGATCTTATTAAAAGGTGGGTAGCAGAAGGTTTTGTGAGTCACTCTCCTGGGCAAGATGCATGGGTTGTTGCAGAGAGCTATTTCAATGAGCTGGTGAATAGAAGCATGATTCAACTTCCATATCAGGGCTACTACAATGAAGTATCTCATTGCAAGGTTCATGATATGATGCTAGACATGATTCTAATGAGGTGCAAGGAAGATAATTTCATCAGTGTGATACAAGATCCACGAGCGGCGATAGAAGTTCAAGACAA-GATTCGTCGGCTCACCATTGACTTGAATGGTGCCATGGGTGACACAATGGATATGAACATTACTA-GGAAAGTGTCACAAGTTCGTTCTCTTGGTGTATTT-GGAGGATCAAAGTGGATACCT-CCTTTGTTGGAGTTTAAGTTTCT--GCGGGTGTTATTCCTTGAATTCTTTCTACGAGAGATGATAATTGACCTCACTGGTATCAACCAACTGTCCCAGCTGAGATATTTAAAGGTTGAATGCAAGGAATGCCTAATGGATGGTGACATACCATCACAAGTTTCCATAGTGTTACCAAGTCAAATCCGAAGGCTACAACATTTGGAAACCTTGGAGTTACCCTGGGTATCAAAATGCAGCATCCCATCAATATCAGGCATCATTGATTTGCCGCGCTTGACCCATCTAGTGTTGCGACAGCATAAGGGGGGATTACCGGATGGGATTAGAAAATTGAAGTCATTGCGCACTTTGCATGGCTTTAATCTACCAGTAAGCTCATTGGAAAATATTGATGCCCTGGGTGAGCTCACTAGTCTAGCAGATATGTCACTCCATTGTGGCAAACAAGACACAAAATCTACTACTCCAGGATGGATGACTGCTCTGAGTTGTTCCATCGAGAAACTCGGTAATCTCAAAGGTCTTTATGTGAGGTCTAATAGTCCTAGCTGTTGCGCCGATGCGATGAGCAGCTGGTTTTCACCTCCATTTCTCAACCTTGAGAAGCTTGATCTGCTAGATTGGACATTCTCCAAAGTTCCTAGATGGATTGGCCAACTCCATAGCCTCCGTGAGTTGGCACTTGGGGGCAAGAAGATACTCCAGGAAGATGTTAGTATGATCGGCACAATGCTACCCTTCCTCACCCATCTAAGCCTACGTATTGTTACATGCAATATCGCGGTGAAGGAAATCAGGATCATGATAGAAGGCTCCATAGGATTCGCTGCTCTCCGGTTTTTCTGTTTTGACTCTAATAGGATGTCACACCTAGAGTTTGGGGTAGGTGCTATGCCCCAGCTCAAGAGGCTGCTATTAGCACTTGATCCATGGGAATGGGATGAGGCCACACCTGTTGGACTTAAACACCTCTTGTACCTCGAGGAAATACGAGTATTGACAGCATCAACAGCTGTTGCTTCTGCAGGATCTGAATCAATGAATGGCAAGTCTGCACTAGTCAAGGGTGTGTTCCATGATGCCGCTAATGCTCTCCAGAGTCGCCCAGCATTTACCGTGCTCCCAAGGATCCGTTCTCTCTCTGATCACGTAAATTGTTGTAAAATTATTATGGAAACAGTTGCATGTAAGTAGGATTTTTAGGGAATGTATATGTAATTGTTGTAGCAAGATTTGTTCTTGTTCCAACTGAACATGGTTGTTAATGTTCTTACTTGTAATTGTAAGTTCTAATCTTACATCAAAAGGATGCTTAGCCTAACACATGATCACCAAGATAATCTAATGTGG]

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[+] EMBL CA764655             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GGACATGTTCCAGTGACC TGGAAGCATTAACAATATGAAGCCCCTAAGTGCCCAAAACTCAAGAGAACTATTCTTCAACAGAATATTTGGGTCTAAAGATTATTGTCCCTCTTACTTGGAAGAAGTCTCATGTAAAATACTGAAGAAGTGTGGTGGCCTACCGCTTGCAATTGTTACTGTAGCTAGTATTTTAGCTTGCCAACCCACAAGACTGAAGGAGGAATGGGAGTACATTCAAAGTTCTCTAGCCACTAACAAATTTGCAAGGAAGTCTACCTTGGAAGACATGATGCAAATCTTGGAGCTCAGCTACAAGAGTCTGCCACATCATCTCAAAGCATGCTTTCTTTATCTTGGTGCTTACCCAGAGGATTGTGTGATTAGCAAGGTTGATCTTATTAAAAGGTGGGTAGCAGAAGGTTTTGTGAGTCACTCTCCTGGGCAAGATGCATGGGTTGTTGCAGAGAGCTATTTCAATGAGCTGGTGAATAGAAGCATGATTCAACTTCCATATCAGGGCTACTACAATGAAGTATCTCATTGCAAGGTTCATGATATGATGCTAGACATGATTCTAATGAGGTGCAAGGAAGATAATTTCATCAGTGTGATACAAGATCCACGAGCGGCGATAGAAGTTCAAGACAAGGATTCGTCGGCTCACCATTGACTTGAATGGTGCCATGGGTGACACAATGGATATGAACATTACTAGGGAAAGTGTCACAAGTTCGNTCTCTTGGTGTATTTGGGAGGATCAAAGNGGATACCTNCNTTGGTTGGAANTTAAGNTTCTGGGNGGGNGNTATTCCNTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]


>consensus_2957#0 CTTTGCCTGCCTTCATTCGTGAATTAAAAGCTTTGGGTGCACATTGCCTTCAAAGTTCAA ACGGTGCAAGGGCAGGGCAGCTATTGTTATTTGGGTTCATCTGTTGCTCGGTCGAGGCTA CTCTCACTGGTCAGAAATCTAAGCTTCATTGAGGAAGCACCGGTGGACCAAAGAGAGGCA TGTCGACGATGGTGGTGAGCGCATACAAGGGGGTGATTGACTCTGTTCTTGCAAAGCTCA GAGAGCTGATGGGAGGGGACATGTGTGCCAACCTCATAGGCGTGTCCAGCAGGGACATTT TGTTCCTCAGGGATGAGCTGCCTGCCATGAGTGCTCTCCTGGAGAAGCTGGATGATGCCG AAGAACTCGATTCGGAGGCGAAAAATTGGAGGAACCAAGTGAGGGAGATGACCTACGACA TCGAGGACTGCATCGATGATTTCAGTAACAACATCACAAGCGTAGACGCTAAGACGGGGT TCCTCTACAAGGCTTCCCAATTTCTCAAGACTTGCAGGGCTCATCTTGAGGCTGCCTGGC AAATCAAAGAGCTCAAGACTCGTCTACAGGAGATAAACGAGCGGCGTAAGAGGTACAAGG TTGGACATTACATCTCTAATACTACCTCAGTGACAGTTGACCCTCGCATCTCGGCATTCT ATAAGGAGACAGCCGGCCTTGTAGGCATTGACAGCCCAAAGAGAGAGCTCACTAAATTGG TGATGGACGAAGAGACGCAATTGAAGGTTATGTCAATAGTTGGATTTGGAGGCCTAGGCA AGACCACCCTAGCTAGTCAGGTGTATCGTGAAGTTGGAGTGCAGTTCAACTGTAAGGCAT TTGTATCTGTTTCTCAAAAACCAGACATGGTAAGGCTACTCACAAGTTTGCTGTTACAAC TCAAGCAACATCCCTCTCATGCTTGTGGGGTGCAAGAACTCATCGACAATCTCAGGGAAT ATCTAATGGATAAAAGGTACTTCATTGTAGTTGATGATTTGTGGGATGTTCCTTCATGGA ATATTATTACATGTGCTTTTCCACAAAATAATCAACATAGCAGAGTTATAATAACTACAA GACACGGGGATGTGGCTAGGACATGTTCCAGTGACCATGGAAGCATTAACAATATGAAGC CCCTAAGTGCCCAAAACTCAAGAGAACTATTCTTCAACAGAATATTTGGGTCTAAAGATT AATGTCCCTCTTACTTGGAAGAAGTCTCATGTAAAATACTGAAGAAGTGTGGTGGCCTAC CGCTTGCAATTGTTACTGTAGCTAGTATTTTAGCTTGCCAACCCACAAGACTGAAGGAGG AATGGGAGTACATTCAAAGTTCTCTAGCCACTAACAAATTTGCAAGGAAGTCCACCTTGG AAGACATGATGCAAATCTTGGAGCTCAGCTACAAGAGTCTGCCACATCATCTCAAAGCAT GCTTTCTTTATCTTGGTGCTTACCCAGAGGATTGTGTGATTAGCAAGGTTGATCTTATTA AAAGGTGGGTAGCAGAAGGTTTTGTGAGTCACTCTCCTGGGCAAGATGCATGGGTTGTTG CAGAGAGCTATTTCAATGAGCTGGTGAATAGAAGCATGATTCAACTTCCATATCAGGGCT ACTACAATGAAGTATCTCATTGCAAGGTTCATGATATGATGCTAGACATGATTCTAATGA GGTGCAAGGAAGATAATTTCATCAGTGTGATACAAGATCCACGAGCGGCGATAGAAGTTC AAGACAAGATTCGTCGGCTCACCATTGACTTGAATGGTGCCATGGGTGACACAATGGATA TGAACATTACTAGGAAAGTGTCACAAGTTCGTTCTCTTGGTGTATTTGGAGGATCAAAGT GGATACCTCCTTTGTTGGAGTTTAAGTTTCTGCGGGTGTTATTCCTTGAATTCTTTCTAC GAGAGATGATAATTGACCTCACTGGTATCAACCAACTGTCCCAGCTGAGATATTTAAAGG TTGAATGCAAGGAATGCCTAATGGATGGTGACATACCATCACAAGTTTCCATAGTGTTAC CAAGTCAAATCCGAAGGCTACAACATTTGGAAACCTTGGAGTTACCCTGGGTATCAAAAT GCAGCATCCCATCAATATCAGGCATCATTGATTTGCCGCGCTTGACCCATCTAGTGTTGC GACAGCATAAGGGGGGATTACCGGATGGGATTAGAAAATTGAAGTCATTGCGCACTTTGC ATGGCTTTAATCTACCAGTAAGCTCATTGGAAAATATTGATGCCCTGGGTGAGCTCACTA GTCTAGCAGATATGTCACTCCATTGTGGCAAACAAGACACAAAATCTACTACTCCAGGAT GGATGACTGCTCTGAGTTGTTCCATCGAGAAACTCGGTAATCTCAAAGGTCTTTATGTGA GGTCTAATAGTCCTAGCTGTTGCGCCGATGCGATGAGCAGCTGGTTTTCACCTCCATTTC TCAACCTTGAGAAGCTTGATCTGCTAGATTGGACATTCTCCAAAGTTCCTAGATGGATTG GCCAACTCCATAGCCTCCGTGAGTTGGCACTTGGGGGCAAGAAGATACTCCAGGAAGATG TTAGTATGATCGGCACAATGCTACCCTTCCTCACCCATCTAAGCCTACGTATTGTTACAT GCAATATCGCGGTGAAGGAAATCAGGATCATGATAGAAGGCTCCATAGGATTCGCTGCTC TCCGGTTTTTCTGTTTTGACTCTAATAGGATGTCACACCTAGAGTTTGGGGTAGGTGCTA TGCCCCAGCTCAAGAGGCTGCTATTAGCACTTGATCCATGGGAATGGGATGAGGCCACAC CTGTTGGACTTAAACACCTCTTGTACCTCGAGGAAATACGAGTATTGACAGCATCAACAG CTGTTGCTTCTGCAGGATCTGAATCAATGAATGGCAAGTCTGCACTAGTCAAGGGTGTGT TCCATGATGCCGCTAATGCTCTCCAGAGTCGCCCAGCATTTACCGTGCTCCCAAGGATCC GTTCTCTCTCTGATCACGTAAATTGTTGTAAAATTATTATGGAAACAGTTGCATGTAAGT AGGATTTTTAGGGAATGTATATGTAATTGTTGTAGCAAGATTTGTTCTTGTTCCAACTGA ACATGGTTGTTAATGTTCTTACTTGTAATTGTAAGTTCTAATCTTACATCAAAAGGATGC TTAGCCTAACACATGATCACCAAGATAATCTAATGTGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)