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Oryza sativa
cluster # 2990 cluster # 2990       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2990#0 length = 2437 sequences # 2  

consensusID : consensus_2990#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 2437
fasta sequence
                              [CGTCGTCTCGACTCAACCAGTAGCACGCCAGCCTTCAGCCTTCTCCTTCCTTCGGCCGCCCGCCTCTCCACTCCTCCACCCACCGCCATGGCCAACCTCCATCTCCTCCCCCTCCTCCTCCTCGCCCTCCTCTCCCCCGCCGGCGCGGCCTCCGGCGAGGCGCACGCCTCCGCGGTGGTGGCAGAGAAGGGCCTGGACTTCGCCAAGGGCGTGCTGATCGGGGAGGCGGTGCGGTCGCTGACCCCGCTGCGCCTCCCCGGCGTGGAGAAGGCCGTGCGGGTGCCCTTCCTGGGCGCCATCCGCGTCGCCGCCACCAACATCACGCTCTTCCACCTCGACGTCGGCGACGACTCCGCCATCCACCCCGGGGACACCGCCCTCGTCGTCGTCGCCTCCGGCGTCAGCGCCAACCTCAGCATGGCATGGAGCTACTACTACGATTCCTGGCTCTTCCCCATCGAGATCTCCGACAGAGGCACCGCTTCTATCCTGGTAGTACTAACCTTTTGCCTAGTTCTCGTGTTGATTGTTGCCTAAGAAAGGATTCAATTCGATGTGGATTGGGCTAGATTTGGTTTGGGCATCATGGTAGAAAATTAGATTATGGTGCATTTGCTGCAAATGCTGCTAGTTTTGTTGCTTTTGTAGGAAAAATTGCTCACGATGAATGTTTTTTCCCCTTAAAAAAGAACTGTGGCACTAGTTCGATGAATTGTGCGGGAGTTTGATAAGCAACTTGTTTTATTAAACTTTTAGGTGGGCATTTGTATGTTGGTATAGTACCTTATAAATTTAGCTAGGTATTAGGTCCATGGTAATACTGAACTATTGATTATAATTCTTGAAGCAATCTCATATTTGTAATGTCTTAAGTAATAAGGGTCAGAAGTGAAAAAATTGCATAGTTAATTGCAATTTCATGGGGGACAACATCTTCGTGGCTTCCCTGTCCACTCTTTCCTGCATGGATCACCCTCCAGATTCAGACATCTATCACATTTTGCTCAACTTGATGGGGCTGTTGATCCCATTGGCAAATGATGCCTATAGCTGTGACTTATGAAATGTGATGTTGTATCATTCATGTTTCATGTAAATATCATAGGGTGAACAAGCTGTTTTAGGTAATTTTCTGCTTTATCTTTTACTTTTGTTCTTTGTTAGTAACTCATAAGTGCTTTCTGTGTCTAAGGTTCAAGGAATGGAAGTTGGTATAACCATGCAAATTAAGAATTATAACGGGAGTTTGTCTCTCTCTGTGTTGCAATGTGGATGTAATGTCAAGGACCTAGTGATATCCCTGGATGGTGGAGCATCTTGGTTTTATCAGGGGTTAATAAATGCTTTCGAGGACCATATTGGAGCTGCAGTTGAGAAGGCAATACCAGAAAATATTATTGACGGCACATCCAAACTTGACTCGTTGCTTCAAAGCCTTCCTAGGAGTGTCAATCTGGACAATATTTCTGCTTTGAACATGACTTTTGTTAACGATCCGCAGTATGGAAATTCCTCAATTGAGTTTGATATCAATGGATTATTCTCTTCTGCAACTGCTAAGCTTAGCAATTCGCAGAAGCATCCCCAACTTTCATTATCATGTGGTGGGGCATCCAAAATGCTTCTGCTTTCACTTGATGAAGCTGTTTTCAATTCTGCATTAGAGGTTTACTTCAAGGCAGGTTCAATGCATTGGGTAGTTGACAAAATTCCCGATCAATCTCTACTAAATACAGCTAGTTGGAAATTTATCATTCCTCGCTTGTACTGGAGCTATCCCAATGATGACATGCTGTTAAACATTTCAATGGCTTCACCCCCGGTGATGAGGATTACGTCTGAAAAGATTGGTGCTACTATATATGCGGACATGATAATTGATGTTTTACATGACAAAGAGACAATTCCAGTTGCATGCATCTCTGTAGTAGTAAGTGCCTCAGGTGTCGCAGAGGCAGCAGGCAATAAAGTATATGGTAAGGTTGAATTGGGCAATTTCTCCCTTGCCTTGAAGTGGAGCAAAATTGGTAACTTCCACATGTCATTGATTCAGGGAGTGATTCGTGTTTTCTTGAACACGGTTTGCATGCCCTATTTGAACTCACGGCTGGGGCATGGAGTTATCTTACCTGTGGTCCATGGTTTCACACTCAAAGACATCTACGTTCTTACTTCTCCTGAGAAGTTGACACTTTGTTCTGATGTTGCCTTCGCTAATGCAAGCAGCCTGGCAACTTTACCAATTTTGAGATCCCCTCGGGTTTTATAGGGTATATGTGTACCTCACGTTTGGGCCAAAAAGGGCCTTGGGCATAATAGTAAGTGCACACTTGTACATATACATCTGTACATTAAGATAAATGTACATAGTTTCTCCTTCATTGATATATTCACATTCATGATTCATTTATACAAATTCTCTTCGTATGTTCAAAAA]

[+] EMBL AK103132             [CGTCGTCTCGACTCAACCAGTAGCACGCCAGCCTTCAGCCTTCTCCTTCCTTCGGCCGCCCGCCTCTCCACTCCTCCACCCACCGCCATGGCCAACCTCCATCTCCTCCCCCTCCTCCTCCTCGCCCTCCTCTCCCCCGCCGGCGCGGCCTCCGGCGAGGCGCACGCCTCCGCGGTGGTGGCAGAGAAGGGCCTGGACTTCGCCAAGGGCGTGCTGATCGGGGAGGCGGTGCGGTCGCTGACCCCGCTGCGCCTCCCCGGCGTGGAGAAGGCCGTGCGGGTGCCCTTCCTGGGCGCCATCCGCGTCGCCGCCACCAACATCACGCTCTTCCACCTCGACGTCGGCGACGACTCCGCCATCCACCCCGGGGACACCGCCCTCGTCGTCGTCGCCTCCGGCGTCAGCGCCAACCTCAGCATGGCATGGAGCTACTACTACGATTCCTGGCTCTTCCCCATCGAGATCTCCGACAGAGGCACCGCTTCTATCCTGGTAGTACTAACCTTTTGCCTAGTTCTCGTGTTGATTGTTGCCTAAGAAAGGATTCAATTCGATGTGGATTGGGCTAGATTTGGTTTGGGCATCATGGTAGAAAATTAGATTATGGTGCATTTGCTGCAAATGCTGCTAGTTTTGTTGCTTTTGTAGGAAAAATTGCTCACGATGAATGTTTTTTCCCCTTAAAAAAGAACTGTGGCACTAGTTCGATGAATTGTGCGGGAGTTTGATAAGCAACTTGTTTTATTAAACTTTTAGGTGGGCATTTGTATGTTGGTATAGTACCTTATAAATTTAGCTAGGTATTAGGTCCATGGTAATACTGAACTATTGATTATAATTCTTGAAGCAATCTCATATTTGTAATGTCTTAAGTAATAAGGGTCAGAAGTGAAAAAATTGCATAGTTAATTGCAATTTCATGGGGGACAACATCTTCGTGGCTTCCCTGTCCACTCTTTCCTGCATGGATCACCCTCCAGATTCAGACATCTATCACATTTTGCTCAACTTGATGGGGCTGTTGATCCCATTGGCAAATGATGCCTATAGCTGTGACTTATGAAATGTGATGTTGTATCATTCATGTTTCATGTAAATATCATAGGGTGAACAAGCTGTTTTAGGTAATTTTCTGCTTTATCTTTTACTTTTGTTCTTTGTTAGTAACTCATAAGTGCTTTCTGTGTCTAAGGTTCAAGGAATGGAAGTTGGTATAACCATGCAAATTAAGAATTATAACGGGAGTTTGTCTCTCTCTGTGTTGCAATGTGGATGTAATGTCAAGGACCTAGTGATATCCCTGGATGGTGGAGCATCTTGGTTTTATCAGGGGTTAATAAATGCTTTCGAGGACCATATTGGAGCTGCAGTTGAGAAGGCAATACCAGAAAATATTATTGACGGCACATCCAAACTTGACTCGTTGCTTCAAAGCCTTCCTAGGAGTGTCAATCTGGACAATATTTCTGCTTTGAACATGACTTTTGTTAACGATCCGCAGTATGGAAATTCCTCAATTGAGTTTGATATCAATGGATTATTCTCTTCTGCAACTGCTAAGCTTAGCAATTCGCAGAAGCATCCCCAACTTTCATTATCATGTGGTGGGGCATCCAAAATGCTTCTGCTTTCACTTGATGAAGCTGTTTTCAATTCTGCATTAGAGGTTTACTTCAAGGCAGGTTCAATGCATTGGGTAGTTGACAAAATTCCCGATCAATCTCTACTAAATACAGCTAGTTGGAAATTTATCATTCCTCGCTTGTACTGGAGCTATCCCAATGATGACATGCTGTTAAACATTTCAATGGCTTCACCCCCGGTGATGAGGATTACGTCTGAAAAGATTGGTGCTACTATATATGCGGACATGATAATTGATGTTTTACATGACAAAGAGACAATTCCAGTTGCATGCATCTCTGTAGTAGTAAGTGCCTCAGGTGTCGCAGAGGCAGCAGGCAATAAAGTATATGGTAAGGTTGAATTGGGCAATTTCTCCCTTGCCTTGAAGTGGAGCAAAATTGGTAACTTCCACATGTCATTGATTCAGGGAGTGATTCGTGTTTTCTTGAACACGGTTTGCATGCCCTATTTGAACTCACGGCTGGGGCATGGAGTTATCTTACCTGTGGTCCATGGTTTCACACTCAAAGACATCTACGTTCTTACTTCTCCTGAGAAGTTGACACTTTGTTCTGATGTTGCCTTCGCTAATGCAAGCAGCCTGGCAACTTTACCAATTTTGAGATCCCCTCGGGTTTTATAGGGTATATGTGTACCTCACGTTTGGGCCAAAAAGGGCCTTGGGCATAATAGTAAGTGCACACTTGTACATATACATCTGTACATTAAGATAAATGTACATAGTTTCTCCTTCATTGATATATTCACATTCA                                      ]
[+] EMBL AU162394             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTCCTGAGAAGTTGACACTTTGTTCTGATGTTGCCTTCGCTAATGCAAGCAGCCTGGCAACTTTACCAATTTTGAGATCCCCTCGGGTTTTATAGGGTATATGTGTACCTCACGTTTGGGCCAAAAAGGGCCTTGGGCATAATAGTAAGTGCACACTTGTACATATACATCTGTACATTAAGATAAATGTACATAGTTTCTCCTTCATTGATATATTCACATTCATGATTCATTTATACAAATTCTCTTCGTATGTTCAAAAA]


>consensus_2990#0 CGTCGTCTCGACTCAACCAGTAGCACGCCAGCCTTCAGCCTTCTCCTTCCTTCGGCCGCC CGCCTCTCCACTCCTCCACCCACCGCCATGGCCAACCTCCATCTCCTCCCCCTCCTCCTC CTCGCCCTCCTCTCCCCCGCCGGCGCGGCCTCCGGCGAGGCGCACGCCTCCGCGGTGGTG GCAGAGAAGGGCCTGGACTTCGCCAAGGGCGTGCTGATCGGGGAGGCGGTGCGGTCGCTG ACCCCGCTGCGCCTCCCCGGCGTGGAGAAGGCCGTGCGGGTGCCCTTCCTGGGCGCCATC CGCGTCGCCGCCACCAACATCACGCTCTTCCACCTCGACGTCGGCGACGACTCCGCCATC CACCCCGGGGACACCGCCCTCGTCGTCGTCGCCTCCGGCGTCAGCGCCAACCTCAGCATG GCATGGAGCTACTACTACGATTCCTGGCTCTTCCCCATCGAGATCTCCGACAGAGGCACC GCTTCTATCCTGGTAGTACTAACCTTTTGCCTAGTTCTCGTGTTGATTGTTGCCTAAGAA AGGATTCAATTCGATGTGGATTGGGCTAGATTTGGTTTGGGCATCATGGTAGAAAATTAG ATTATGGTGCATTTGCTGCAAATGCTGCTAGTTTTGTTGCTTTTGTAGGAAAAATTGCTC ACGATGAATGTTTTTTCCCCTTAAAAAAGAACTGTGGCACTAGTTCGATGAATTGTGCGG GAGTTTGATAAGCAACTTGTTTTATTAAACTTTTAGGTGGGCATTTGTATGTTGGTATAG TACCTTATAAATTTAGCTAGGTATTAGGTCCATGGTAATACTGAACTATTGATTATAATT CTTGAAGCAATCTCATATTTGTAATGTCTTAAGTAATAAGGGTCAGAAGTGAAAAAATTG CATAGTTAATTGCAATTTCATGGGGGACAACATCTTCGTGGCTTCCCTGTCCACTCTTTC CTGCATGGATCACCCTCCAGATTCAGACATCTATCACATTTTGCTCAACTTGATGGGGCT GTTGATCCCATTGGCAAATGATGCCTATAGCTGTGACTTATGAAATGTGATGTTGTATCA TTCATGTTTCATGTAAATATCATAGGGTGAACAAGCTGTTTTAGGTAATTTTCTGCTTTA TCTTTTACTTTTGTTCTTTGTTAGTAACTCATAAGTGCTTTCTGTGTCTAAGGTTCAAGG AATGGAAGTTGGTATAACCATGCAAATTAAGAATTATAACGGGAGTTTGTCTCTCTCTGT GTTGCAATGTGGATGTAATGTCAAGGACCTAGTGATATCCCTGGATGGTGGAGCATCTTG GTTTTATCAGGGGTTAATAAATGCTTTCGAGGACCATATTGGAGCTGCAGTTGAGAAGGC AATACCAGAAAATATTATTGACGGCACATCCAAACTTGACTCGTTGCTTCAAAGCCTTCC TAGGAGTGTCAATCTGGACAATATTTCTGCTTTGAACATGACTTTTGTTAACGATCCGCA GTATGGAAATTCCTCAATTGAGTTTGATATCAATGGATTATTCTCTTCTGCAACTGCTAA GCTTAGCAATTCGCAGAAGCATCCCCAACTTTCATTATCATGTGGTGGGGCATCCAAAAT GCTTCTGCTTTCACTTGATGAAGCTGTTTTCAATTCTGCATTAGAGGTTTACTTCAAGGC AGGTTCAATGCATTGGGTAGTTGACAAAATTCCCGATCAATCTCTACTAAATACAGCTAG TTGGAAATTTATCATTCCTCGCTTGTACTGGAGCTATCCCAATGATGACATGCTGTTAAA CATTTCAATGGCTTCACCCCCGGTGATGAGGATTACGTCTGAAAAGATTGGTGCTACTAT ATATGCGGACATGATAATTGATGTTTTACATGACAAAGAGACAATTCCAGTTGCATGCAT CTCTGTAGTAGTAAGTGCCTCAGGTGTCGCAGAGGCAGCAGGCAATAAAGTATATGGTAA GGTTGAATTGGGCAATTTCTCCCTTGCCTTGAAGTGGAGCAAAATTGGTAACTTCCACAT GTCATTGATTCAGGGAGTGATTCGTGTTTTCTTGAACACGGTTTGCATGCCCTATTTGAA CTCACGGCTGGGGCATGGAGTTATCTTACCTGTGGTCCATGGTTTCACACTCAAAGACAT CTACGTTCTTACTTCTCCTGAGAAGTTGACACTTTGTTCTGATGTTGCCTTCGCTAATGC AAGCAGCCTGGCAACTTTACCAATTTTGAGATCCCCTCGGGTTTTATAGGGTATATGTGT ACCTCACGTTTGGGCCAAAAAGGGCCTTGGGCATAATAGTAAGTGCACACTTGTACATAT ACATCTGTACATTAAGATAAATGTACATAGTTTCTCCTTCATTGATATATTCACATTCAT GATTCATTTATACAAATTCTCTTCGTATGTTCAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)