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Oryza sativa
cluster # 3050 cluster # 3050       Sequences # 2       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3050#0 length = 2265 sequences # 1  
consensus_3050#1 length = 1912 sequences # 1  

consensusID : consensus_3050#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 2265
fasta sequence
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[+] EMBL AK111212             [GCACGCACTCTTTCTCCATCAAAAAGAGCCCCAATCTCGTTACTTCGAGATATTATATTGCGTTCCCCACGACTCTCTTCCTTCTAATAATCCCTTTTCTCCCTTCCAAGACGGGCTATTGTAACCAGCTCCGTCTTATCCTTTACTCCTTATCATAATGTCTGGCTACGACGGCGGATACGGCGGCGGTGGCCGCGGAGGCGGTGGCTACGGCGGTGGTGGTTATGGCCGTGATCGCGGCGGCGACCGTGGTGGTGACCGCAATGGTCACGGTGGTGGTTACGGAGGCCGAAGCAACGGAAATGGCTACGGCGGCGGCGGTGGCGGCTACGGTGGTGGTGGTTACGGCGGCGGTGGTTACGGAGGAGGTGCTGGCGGCGACCGTATGGGCGCTCTCGGCTCCGGTCTCAAGAACCAGGAATGGGATGTCAGCGCTCTGCCCAAGTTCGAGAAGTCCTTCTACAAGGAGCACCCCGATGTTGCAAACCGATCTGATGCCGACGTTGAGGCTTTCCGCCGCAAGCACCAGATGACCATTGCTGGCACCGAGGTTCCCAAGCCCGTCGAGACTTTCGATGAGGCCGGCTTCCCACGATATGTTATGGACGAGGTCAAGGCTCAGGGATTCCCTGCTCCCACCGCCATTCAGTCCCAGGGTTGGCCTATGGCCCTCTCTGGTCGTGATGTCGTTGGTATTGCCGAGACTGGTTCCGGAAAGACCCTCACATACTGCCTTCCCTCCATCGTTCACATCAACGCCCAGCCTCTCCTCGCCCCCGGCGATGGTCCTATTGTCCTTGTCCTTGCTCCCACTCGTGAGCTTGCTGTTCAGATCCAGGAAGAGATGAAGAAGTTCGGTCGATCTTCTCGCATCCGCAACACCTGTGTCTACGGTGGTGTCCCCAAGGGTCCTCAAATCCGTGACCTTTCCCGAGGAGTCGAGGTCTGCATTGCCACCCCCGGTCGTTTGATTGACATGCTCGAGGCCGGTAAGACCAACCTGCGTCGTGTTACCTACCTCGTCCTCGACGAGGCTGATCGCATGCTCGACATGGGTTTCGAGCCCCAGATCCGCAAGATTATTGGCCAGATTCGACCCGACCGACAGACTCTCACGTGGTCTGCTGCCTGGCCCAAGGAGGTTCGTGCTCTGGCTTCCGACTTCCTCAACGACTTCATCCAAGTCAACATCGGTTCCATGGAGCTTGCCGCCAACCACCGAATTACCCAAATTGTCGAGGTTGTTACCGATATGGAGAAGCGTGACCGTATGATTAAGCATCTCGAGAAGACCATGGAGAATAAGGAGAACAAGATCCTCATCTTTGTCGGTACTAAGCGAATTGCTGACGAGATCACCCGATTCCTTCGCCAGGACGGCTGGCCTGCGCTTTCCATTCACGGTGACAAGCAGCAGAACGAGCGTGATTGGGTCCTTGACCAGTTCAAGACCGGAAAGTCCCCCATCATGGTGGCCACTGATGTTGCCTCGCGTGGTATTGATGTGCGCAACATCACTCATGTGTTGAACTACGATTACCCCCACAACTCGGAAGACTACATTCACCGAATTGGTCGTACCGGTCGTGCTGGTGCCAAGGGTACCGCTATTACCCTTTTCACTACTGACAACCAGAAGCAGGCTCGTGATCTTGTCAATGTCCTCACTGAGGCTAAGCAGCAGATTGATCCTCGTCTTGTTGAGATGACTCGATACGGCGGCGGTGGCGGTCGCGGTTACGGTGGATGGGGACGTGGCCGTGGCGGTGGTAGAGGTGGGTTCCGCCGTCGCTAAAGCAGCAAGACGCCTATCGAGCTGACTCGACCTCCAGCCAACGCCAACAACATGCCCATCGGTAACCGTCGATGGTAAGGTATCCCTCCATCTTGGGGGTTCGACCTTTTGCGGTATGGGTCAGACAGCCTCGCATTTCGGATCTTCAGATTCTCAAAAAGTACATGACATCAAGGCGTTTGTTTGTTAGAGGACAGGTGGCTCGATTAGATTTGACTCGTTATTTGCGAGTCTGGATTCATGGTTTGACTGCGCCAATTTGGTCGCACTTAGTTGCATTTATGCGTTTACATGTTTACCTCAAATAATGGCTTTAGACTAGGTTGACGATATCGTGCTGAGTGGTGTGAAAACACTCAACGACGGAGATGAGGAGAAAATATCCATTTATTGGAGGCCTCGTGCTTTGGAGGTCGATGACAATTGGGCTGGGTGTTTACTTAGACTTTATGTAGTTCGCACAAAAAGCA]


>consensus_3050#0 GCACGCACTCTTTCTCCATCAAAAAGAGCCCCAATCTCGTTACTTCGAGATATTATATTG CGTTCCCCACGACTCTCTTCCTTCTAATAATCCCTTTTCTCCCTTCCAAGACGGGCTATT GTAACCAGCTCCGTCTTATCCTTTACTCCTTATCATAATGTCTGGCTACGACGGCGGATA CGGCGGCGGTGGCCGCGGAGGCGGTGGCTACGGCGGTGGTGGTTATGGCCGTGATCGCGG CGGCGACCGTGGTGGTGACCGCAATGGTCACGGTGGTGGTTACGGAGGCCGAAGCAACGG AAATGGCTACGGCGGCGGCGGTGGCGGCTACGGTGGTGGTGGTTACGGCGGCGGTGGTTA CGGAGGAGGTGCTGGCGGCGACCGTATGGGCGCTCTCGGCTCCGGTCTCAAGAACCAGGA ATGGGATGTCAGCGCTCTGCCCAAGTTCGAGAAGTCCTTCTACAAGGAGCACCCCGATGT TGCAAACCGATCTGATGCCGACGTTGAGGCTTTCCGCCGCAAGCACCAGATGACCATTGC TGGCACCGAGGTTCCCAAGCCCGTCGAGACTTTCGATGAGGCCGGCTTCCCACGATATGT TATGGACGAGGTCAAGGCTCAGGGATTCCCTGCTCCCACCGCCATTCAGTCCCAGGGTTG GCCTATGGCCCTCTCTGGTCGTGATGTCGTTGGTATTGCCGAGACTGGTTCCGGAAAGAC CCTCACATACTGCCTTCCCTCCATCGTTCACATCAACGCCCAGCCTCTCCTCGCCCCCGG CGATGGTCCTATTGTCCTTGTCCTTGCTCCCACTCGTGAGCTTGCTGTTCAGATCCAGGA AGAGATGAAGAAGTTCGGTCGATCTTCTCGCATCCGCAACACCTGTGTCTACGGTGGTGT CCCCAAGGGTCCTCAAATCCGTGACCTTTCCCGAGGAGTCGAGGTCTGCATTGCCACCCC CGGTCGTTTGATTGACATGCTCGAGGCCGGTAAGACCAACCTGCGTCGTGTTACCTACCT CGTCCTCGACGAGGCTGATCGCATGCTCGACATGGGTTTCGAGCCCCAGATCCGCAAGAT TATTGGCCAGATTCGACCCGACCGACAGACTCTCACGTGGTCTGCTGCCTGGCCCAAGGA GGTTCGTGCTCTGGCTTCCGACTTCCTCAACGACTTCATCCAAGTCAACATCGGTTCCAT GGAGCTTGCCGCCAACCACCGAATTACCCAAATTGTCGAGGTTGTTACCGATATGGAGAA GCGTGACCGTATGATTAAGCATCTCGAGAAGACCATGGAGAATAAGGAGAACAAGATCCT CATCTTTGTCGGTACTAAGCGAATTGCTGACGAGATCACCCGATTCCTTCGCCAGGACGG CTGGCCTGCGCTTTCCATTCACGGTGACAAGCAGCAGAACGAGCGTGATTGGGTCCTTGA CCAGTTCAAGACCGGAAAGTCCCCCATCATGGTGGCCACTGATGTTGCCTCGCGTGGTAT TGATGTGCGCAACATCACTCATGTGTTGAACTACGATTACCCCCACAACTCGGAAGACTA CATTCACCGAATTGGTCGTACCGGTCGTGCTGGTGCCAAGGGTACCGCTATTACCCTTTT CACTACTGACAACCAGAAGCAGGCTCGTGATCTTGTCAATGTCCTCACTGAGGCTAAGCA GCAGATTGATCCTCGTCTTGTTGAGATGACTCGATACGGCGGCGGTGGCGGTCGCGGTTA CGGTGGATGGGGACGTGGCCGTGGCGGTGGTAGAGGTGGGTTCCGCCGTCGCTAAAGCAG CAAGACGCCTATCGAGCTGACTCGACCTCCAGCCAACGCCAACAACATGCCCATCGGTAA CCGTCGATGGTAAGGTATCCCTCCATCTTGGGGGTTCGACCTTTTGCGGTATGGGTCAGA CAGCCTCGCATTTCGGATCTTCAGATTCTCAAAAAGTACATGACATCAAGGCGTTTGTTT GTTAGAGGACAGGTGGCTCGATTAGATTTGACTCGTTATTTGCGAGTCTGGATTCATGGT TTGACTGCGCCAATTTGGTCGCACTTAGTTGCATTTATGCGTTTACATGTTTACCTCAAA TAATGGCTTTAGACTAGGTTGACGATATCGTGCTGAGTGGTGTGAAAACACTCAACGACG GAGATGAGGAGAAAATATCCATTTATTGGAGGCCTCGTGCTTTGGAGGTCGATGACAATT GGGCTGGGTGTTTACTTAGACTTTATGTAGTTCGCACAAAAAGCA



consensusID : consensus_3050#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
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consensus length = 1912
fasta sequence
                              [TTCATCCTCTTTTCAGGAGAACCAAGCTTACTTCTTCCCTGAATCCATATCACAACACGAAAACTACCGCACATCATGTCTTACGGTGGATACAGCAACGGTCCTAGCCGCGGTGGCTGCGGCGGCGGCGCTCCTCGCGGCGGCCCCAGCAGCTACGGTGGCGGAGGTGGCGGCTACGGCGGTGGCTCTTACGGCGGCGGTTCCTCCTCGTACGGCGGTGGAGGATACGGCGGCGGAGCTGGCGGCGGCTACGGCGGTGGCTACGGCGGTGGCTTTGGCGGCGGAGACCGCATGAGCAACCTCGGTGCTAACCTCGGTGCTGTCGACTGGAACAGCGTCGACCTCGTCAACTTCGAGAAGAACTTTTACATCGAAGACCCGCGCGTCGCTGGCCGCTCCGACCGCGAGGTGCAGGACTACCGCGCCTCCAAGCAGATGACCATCCAGGGTCAGAACGTCCCTAAGCCCGTCACCTCGTTCGACGAGGCCGGCTTCCCGGACTACATCCTTTCCGAAATCAAGAAGATGGGCTTTGCTGAGCCTTCGGCTATCCAGTCGCAGGCCTGGCCCATGGCGCTCAGCGGTCGCGACCTGGTCGCCATCGCCGAGACCGGTTCCGGTAAGACCATCGGCTTTGCCCTCCCCGCCATGGTCCACATCAACGCCCAGCCCCTCCTCAAGCCCGGCGATGGTCCCATCGCCCTCATCCTGGCTCCCACCCGTGAGCTCGCCAACCAGATCCAGGTCGAGTGCAACCGCTTCGGTGGCTCGAGCCGCCTGCGCACTTGCGCCGTCTACGGTGGTGTGCCCAAGGGCCCCCAGACCCGCGACCTGCAGCGTGGTGCCGAGATTGTCATCGCCACCCCTGGTCGTCTGATCGACATGGTCGACGCCGGCAAGACCAACCTCCGCCGCGTCACCTACCTCGTCATGGACGAGGCCGACCGCATGCTCGACATGGGTTTCGAGCCCCAGATCCGCAAGATTCTCCAGCAGATCCGCCCCGACCGTCAGACGCTCATGTTCTCGGCCACCTGGCCCAAGGAGGTGCAGCGTCTTGCCGGCGACTTCCTCAACGACTTTGCCCAGGTCAACATTGGCTCCACCGAGCTCGCCGCCAACCACAACGTCAAGCAGATCATCGAGGTCTGCTCCGAGTTTGAGAAGAAGGGCAAGCTCATCGGCCACCTCGAGACCATCTCGCAGGAGAACGGCAAGGTTATCATCTTCACCAGCACCAAGCGCGTCGCCGACGACCTCACCAAGTACCTCCGCCAGGACGGCTGGCCTGCGCTTGCCATCCACGGTGACAAGCAGCAGCAGGAGCGTGACTGGGTGCTGGCCGAGTTCAAGTCGGGTCGTAGCCCGATCATGGTCGCTACCGCTGTGGCGTCCCGAGGTCTCGACGTCAAGGACATTTCTTATGTCATCAACTACGACTTCCCCACCAACACGGAGGACTACGTGCACCAGATCGGCCGTACCGGACGTGCCGGCCGCACGGGTACCGCTTACACCTTCTTCACGCCCGAGAACTCCAAGTCGGCGCGCGAGCTGGTTGGCATTCTGCGTGAGGCCAAGCAGGAGATCCCGCGTGAGATCGAGGAGATGGGCCGCTTCGGCGGTGGAGGAGGCGGCCGTGGCTTCCGAGGCCGTGGTCGTGGCCGTGGCCGCGGTGGCTACGGCGGCGGAGGACGCACGGGTGCCAACTCGTTCGCTGTCGGCAACTCCCGATGGTAGATATGCACCTTGCTCGTCGTTCTTCTGAGCTGCTTTCTCGGCATGGTCGCTGGTCGCTTGAACTTTGTCGTCTCTACACCCACCGAGTCGTTTGGGTCTCACTCAAGGTATCACGTCGACTTTAGCTGGCTCAGCTCTCTTCCATGCTTTCCTGTAATGTGGTCATTTTGTT]

[+] EMBL AK107287             [TTCATCCTCTTTTCAGGAGAACCAAGCTTACTTCTTCCCTGAATCCATATCACAACACGAAAACTACCGCACATCATGTCTTACGGTGGATACAGCAACGGTCCTAGCCGCGGTGGCTGCGGCGGCGGCGCTCCTCGCGGCGGCCCCAGCAGCTACGGTGGCGGAGGTGGCGGCTACGGCGGTGGCTCTTACGGCGGCGGTTCCTCCTCGTACGGCGGTGGAGGATACGGCGGCGGAGCTGGCGGCGGCTACGGCGGTGGCTACGGCGGTGGCTTTGGCGGCGGAGACCGCATGAGCAACCTCGGTGCTAACCTCGGTGCTGTCGACTGGAACAGCGTCGACCTCGTCAACTTCGAGAAGAACTTTTACATCGAAGACCCGCGCGTCGCTGGCCGCTCCGACCGCGAGGTGCAGGACTACCGCGCCTCCAAGCAGATGACCATCCAGGGTCAGAACGTCCCTAAGCCCGTCACCTCGTTCGACGAGGCCGGCTTCCCGGACTACATCCTTTCCGAAATCAAGAAGATGGGCTTTGCTGAGCCTTCGGCTATCCAGTCGCAGGCCTGGCCCATGGCGCTCAGCGGTCGCGACCTGGTCGCCATCGCCGAGACCGGTTCCGGTAAGACCATCGGCTTTGCCCTCCCCGCCATGGTCCACATCAACGCCCAGCCCCTCCTCAAGCCCGGCGATGGTCCCATCGCCCTCATCCTGGCTCCCACCCGTGAGCTCGCCAACCAGATCCAGGTCGAGTGCAACCGCTTCGGTGGCTCGAGCCGCCTGCGCACTTGCGCCGTCTACGGTGGTGTGCCCAAGGGCCCCCAGACCCGCGACCTGCAGCGTGGTGCCGAGATTGTCATCGCCACCCCTGGTCGTCTGATCGACATGGTCGACGCCGGCAAGACCAACCTCCGCCGCGTCACCTACCTCGTCATGGACGAGGCCGACCGCATGCTCGACATGGGTTTCGAGCCCCAGATCCGCAAGATTCTCCAGCAGATCCGCCCCGACCGTCAGACGCTCATGTTCTCGGCCACCTGGCCCAAGGAGGTGCAGCGTCTTGCCGGCGACTTCCTCAACGACTTTGCCCAGGTCAACATTGGCTCCACCGAGCTCGCCGCCAACCACAACGTCAAGCAGATCATCGAGGTCTGCTCCGAGTTTGAGAAGAAGGGCAAGCTCATCGGCCACCTCGAGACCATCTCGCAGGAGAACGGCAAGGTTATCATCTTCACCAGCACCAAGCGCGTCGCCGACGACCTCACCAAGTACCTCCGCCAGGACGGCTGGCCTGCGCTTGCCATCCACGGTGACAAGCAGCAGCAGGAGCGTGACTGGGTGCTGGCCGAGTTCAAGTCGGGTCGTAGCCCGATCATGGTCGCTACCGCTGTGGCGTCCCGAGGTCTCGACGTCAAGGACATTTCTTATGTCATCAACTACGACTTCCCCACCAACACGGAGGACTACGTGCACCAGATCGGCCGTACCGGACGTGCCGGCCGCACGGGTACCGCTTACACCTTCTTCACGCCCGAGAACTCCAAGTCGGCGCGCGAGCTGGTTGGCATTCTGCGTGAGGCCAAGCAGGAGATCCCGCGTGAGATCGAGGAGATGGGCCGCTTCGGCGGTGGAGGAGGCGGCCGTGGCTTCCGAGGCCGTGGTCGTGGCCGTGGCCGCGGTGGCTACGGCGGCGGAGGACGCACGGGTGCCAACTCGTTCGCTGTCGGCAACTCCCGATGGTAGATATGCACCTTGCTCGTCGTTCTTCTGAGCTGCTTTCTCGGCATGGTCGCTGGTCGCTTGAACTTTGTCGTCTCTACACCCACCGAGTCGTTTGGGTCTCACTCAAGGTATCACGTCGACTTTAGCTGGCTCAGCTCTCTTCCATGCTTTCCTGTAATGTGGTCATTTTGTT]


>consensus_3050#1 TTCATCCTCTTTTCAGGAGAACCAAGCTTACTTCTTCCCTGAATCCATATCACAACACGA AAACTACCGCACATCATGTCTTACGGTGGATACAGCAACGGTCCTAGCCGCGGTGGCTGC GGCGGCGGCGCTCCTCGCGGCGGCCCCAGCAGCTACGGTGGCGGAGGTGGCGGCTACGGC GGTGGCTCTTACGGCGGCGGTTCCTCCTCGTACGGCGGTGGAGGATACGGCGGCGGAGCT GGCGGCGGCTACGGCGGTGGCTACGGCGGTGGCTTTGGCGGCGGAGACCGCATGAGCAAC CTCGGTGCTAACCTCGGTGCTGTCGACTGGAACAGCGTCGACCTCGTCAACTTCGAGAAG AACTTTTACATCGAAGACCCGCGCGTCGCTGGCCGCTCCGACCGCGAGGTGCAGGACTAC CGCGCCTCCAAGCAGATGACCATCCAGGGTCAGAACGTCCCTAAGCCCGTCACCTCGTTC GACGAGGCCGGCTTCCCGGACTACATCCTTTCCGAAATCAAGAAGATGGGCTTTGCTGAG CCTTCGGCTATCCAGTCGCAGGCCTGGCCCATGGCGCTCAGCGGTCGCGACCTGGTCGCC ATCGCCGAGACCGGTTCCGGTAAGACCATCGGCTTTGCCCTCCCCGCCATGGTCCACATC AACGCCCAGCCCCTCCTCAAGCCCGGCGATGGTCCCATCGCCCTCATCCTGGCTCCCACC CGTGAGCTCGCCAACCAGATCCAGGTCGAGTGCAACCGCTTCGGTGGCTCGAGCCGCCTG CGCACTTGCGCCGTCTACGGTGGTGTGCCCAAGGGCCCCCAGACCCGCGACCTGCAGCGT GGTGCCGAGATTGTCATCGCCACCCCTGGTCGTCTGATCGACATGGTCGACGCCGGCAAG ACCAACCTCCGCCGCGTCACCTACCTCGTCATGGACGAGGCCGACCGCATGCTCGACATG GGTTTCGAGCCCCAGATCCGCAAGATTCTCCAGCAGATCCGCCCCGACCGTCAGACGCTC ATGTTCTCGGCCACCTGGCCCAAGGAGGTGCAGCGTCTTGCCGGCGACTTCCTCAACGAC TTTGCCCAGGTCAACATTGGCTCCACCGAGCTCGCCGCCAACCACAACGTCAAGCAGATC ATCGAGGTCTGCTCCGAGTTTGAGAAGAAGGGCAAGCTCATCGGCCACCTCGAGACCATC TCGCAGGAGAACGGCAAGGTTATCATCTTCACCAGCACCAAGCGCGTCGCCGACGACCTC ACCAAGTACCTCCGCCAGGACGGCTGGCCTGCGCTTGCCATCCACGGTGACAAGCAGCAG CAGGAGCGTGACTGGGTGCTGGCCGAGTTCAAGTCGGGTCGTAGCCCGATCATGGTCGCT ACCGCTGTGGCGTCCCGAGGTCTCGACGTCAAGGACATTTCTTATGTCATCAACTACGAC TTCCCCACCAACACGGAGGACTACGTGCACCAGATCGGCCGTACCGGACGTGCCGGCCGC ACGGGTACCGCTTACACCTTCTTCACGCCCGAGAACTCCAAGTCGGCGCGCGAGCTGGTT GGCATTCTGCGTGAGGCCAAGCAGGAGATCCCGCGTGAGATCGAGGAGATGGGCCGCTTC GGCGGTGGAGGAGGCGGCCGTGGCTTCCGAGGCCGTGGTCGTGGCCGTGGCCGCGGTGGC TACGGCGGCGGAGGACGCACGGGTGCCAACTCGTTCGCTGTCGGCAACTCCCGATGGTAG ATATGCACCTTGCTCGTCGTTCTTCTGAGCTGCTTTCTCGGCATGGTCGCTGGTCGCTTG AACTTTGTCGTCTCTACACCCACCGAGTCGTTTGGGTCTCACTCAAGGTATCACGTCGAC TTTAGCTGGCTCAGCTCTCTTCCATGCTTTCCTGTAATGTGGTCATTTTGTT



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_3050#0      GCACGCACTCTTTCTCCATCAAAAAGAGCCCCAATCTCGTTACTTCGAGATATTATATTG 60
consensus_3050#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_3050#0      CGTTCCCCACGACTCTCTTCCTTCTAATAATCCCTTTTCTCCCTTCCAAGACGGGCTATT 120
consensus_3050#1      -------------------------TTCATCCTCTTTTCAGGAGAACCAAGCTTACT-TC 34
                                                  *  * ******       * *  *   ** * 

consensus_3050#0      GTAACCAGCTCCGTCTTATCCTTTACTCCTTATCATAATGTCTGGCTACGACGGCGGATA 180
consensus_3050#1      TTCCCTGAATCCATATCACAACACGAAAACTACCGCACATCATGTCT--TACGGTGGATA 92
                       *  *    *** * * *            ** *  *     ** **   **** *****

consensus_3050#0      CGGCGGCGGTGGCCGCGGAGGCGGTGGCTACGGCGGTGGTGGTTATGGCCGTGATCGCGG 240
consensus_3050#1      CAGCAACGGT---CCTAGCCGCGGTGGCTGCGGCGGCGGCGCTCCTCGCGGCGGCCCCAG 149
                      * **  ****   *   *  ********* ****** ** * *  * ** * *  * * *

consensus_3050#0      CGGCGACCGTGGTGGTGACCGCAATGGTCACGGTGGTGGTTACGGAGGCCGAAGCAACGG 300
consensus_3050#1      CAGCTACGGTGGCGGAGGTGGCGGCTACGGCGGTGGCTCTTACGGCGGCGGTTCCTCCTC 209
                      * ** ** **** ** *   **        ******   ****** *** *   *  *  

consensus_3050#0      AAATGGCTACGGCGGCGGCGGTGGCGGCTACGGTGGTGGTGGTTACGGCGGCGGTGGTTA 360
consensus_3050#1      GTACGG---CGGTGGAGGATACGGCGGCGGAGCTGGCGGCGGCTACGGCGGTGGCTACGG 266
                        * **   *** ** **    ******   * *** ** ** ******** **      

consensus_3050#0      CGGAGGAGGTGCTGGCGGCGACCGTATGGGCGCTCTCGGCTCCGGTCTCAAGAACCAGGA 420
consensus_3050#1      CGGTGGCTTTGGCGGCGGAGACCGCATGAGCAACCTCGGTGCTAACCTCGGTGCTGTCGA 326
                      *** **   **  ***** ***** *** **   *****  *    ***         **

consensus_3050#0      ATGGGATGTCAGCGCTCTGCCCAAGTTCGAGAAGTCCTTCTACAAGGAGCACCCCGATGT 480
consensus_3050#1      CTGGAACAGCGTCGACCTCGTCAACTTCGAGAAGAACTTTTACATCGAAGACCCGCGCGT 386
                       *** *   *  **  **   *** *********  *** ****  **  ****    **

consensus_3050#0      TGCAAACCGATCTGATGCCGACGTTGAGGCTTTCCGCCGCAAGCACCAGATGACCATTGC 540
consensus_3050#1      CGCTGGCCGCTCCGACCGCGAGGTGCAGGACTACCGCGCCTCCAAGCAGATGACCATCCA 446
                       **   *** ** **   *** **  ***  * ****  *    * ***********   

consensus_3050#0      TGGCACCGAGGTTCCCAAGCCCGTCGAGACTTTCGATGAGGCCGGCTTCCCACGATATGT 600
consensus_3050#1      GGGTCAGAACGTCCCTAAGCCCGTCACCTCGTTCGACGAGGCCGGCTTCCCGGACTACAT 506
                       **     * ** ** *********    * ***** **************    **  *

consensus_3050#0      TATGGACGAGGTCAAGGCTCAGGGATTCCCTGCTCCCACCGCCATTCAGTCCCAGGGTTG 660
consensus_3050#1      CCTTTCCGAAATCAAGAAGATGGGCTTTGCTGAGCCTTCGGCTATCCAGTCGCAGGCCTG 566
                        *   ***  *****     *** **  ***  **  * ** ** ***** ****  **

consensus_3050#0      GCCTATGGCCCTCTCTGGTCGTGATGTCGTTGGTATTGCCGAGACTGGTTCCGGAAAGAC 720
consensus_3050#1      GCCCATGGCGCTCAGCGGTCGCGACCTGGTCGCCATCGCCGAGACCGGTTCCGGTAAGAC 626
                      *** ***** ***   ***** **  * ** *  ** ******** ******** *****

consensus_3050#0      CCTCACATACTGCCTTCCCTCCATCGTTCACATCAACGCCCAGCCTCTCCTCGCCCCCGG 780
consensus_3050#1      CATCGGCTTTGCCCTCCCCGCCATGGTCCACATCAACGCCCAGCCCCTCCTCAAGCCCGG 686
                      * **   *    *** *** **** ** ***************** ******   *****

consensus_3050#0      CGATGGTCCTATTGTCCTTGTCCTTGCTCCCACTCGTGAGCTTGCTGTTCAGATCCAGGA 840
consensus_3050#1      CGATGGTCCCATCGCCCTCATCCTGGCTCCCACCCGTGAGCTCGCCAACCAGATCCAGGT 746
                      ********* ** * ***  **** ******** ******** **    ********** 

consensus_3050#0      AGAGATGAAGAAGTTCGGTCGATCTTCTCGCATCCGCAACACCTGTGTCTACGGTGGTGT 900
consensus_3050#1      CGAGTGCAACCGCTTCGGTGGCTCGAGCCGCCTGCGCACTTGCGCCGTCTACGGTGGTGT 806
                       ***   **    ****** * **    *** * ****    *   **************

consensus_3050#0      CCCCAAGGGTCCTCAAATCCGTGACCTTTCCCGAGGAGTCGAGGTCTGCATTGCCACCCC 960
consensus_3050#1      GCCCAAGGGCCCCCAGACCCGCGACCTGCAGCGTGGTGCCGAGATTGTCATCGCCACCCC 866
                       ******** ** ** * *** *****    ** ** * **** *   *** ********

consensus_3050#0      CGGTCGTTTGATTGACATGCTCGAGGCCGGTAAGACCAACCTGCGTCGTGTTACCTACCT 1020
consensus_3050#1      TGGTCGTCTGATCGACATGGTCGACGCCGGCAAGACCAACCTCCGCCGCGTCACCTACCT 926
                       ****** **** ****** **** ***** *********** ** ** ** ********

consensus_3050#0      CGTCCTCGACGAGGCTGATCGCATGCTCGACATGGGTTTCGAGCCCCAGATCCGCAAGAT 1080
consensus_3050#1      CGTCATGGACGAGGCCGACCGCATGCTCGACATGGGTTTCGAGCCCCAGATCCGCAAGAT 986
                      **** * ******** ** *****************************************

consensus_3050#0      TATTGGCCAGATTCGACCCGACCGACAGACTCTCACGTGGTCTGCTGCCTGGCCCAAGGA 1140
consensus_3050#1      TCTCCAGCAGATCCGCCCCGACCGTCAGACGCTCATGTTCTCGGCCACCTGGCCCAAGGA 1046
                      * *    ***** ** ******** ***** **** **  ** **  *************

consensus_3050#0      GGTTCGTGCTCTGGCTTCCGACTTCCTCAACGACTTCATCCAAGTCAACATCGGTTCCAT 1200
consensus_3050#1      GGTGCAGCGTCTTGCCGGCGACTTCCTCAACGACTTTGCCCAGGTCAACATTGGCTCCAC 1106
                      *** *    *** **   ******************   *** ******** ** **** 

consensus_3050#0      GGAGCTTGCCGCCAACCACCGAATTACCCAAATTGTCGAGGTTGTTACCGATATGGAGAA 1260
consensus_3050#1      CGAGCTCGCCGCCAACCACAACGTCAAGCAGATCATCGAGGTCTGCTCCGAGTTTGAGAA 1166
                       ***** ************    * *  ** **  *******     ****  * *****

consensus_3050#0      GCGTGACCGTATGATTAAGCATCTCGAGAAGACCATGGAGAATAAGGAGAACAAGATCCT 1320
consensus_3050#1      GAAGGGCAAGCTCATCGGCCACCTCGAGACCATCTCGCAGGAGAACGG---CAAGGTTAT 1223
                      *   * *    * **    ** *******  * *  * ** * ** *    **** *  *

consensus_3050#0      CATCTTTGTCGGTACTAAGCGAATTGCTGACGAGATCACCCGATTCCTTCGCCAGGACGG 1380
consensus_3050#1      CATCTTCACCAGCACCAAGCGCGTCGCCGACGACCTCACCAAGTACCTCCGCCAGGACGG 1283
                      ******   * * ** *****  * ** *****  *****   * *** ***********

consensus_3050#0      CTGGCCTGCGCTTTCCATTCACGGTGACAAGCAGCAGAACGAGCGTGATTGGGTCCTTGA 1440
consensus_3050#1      CTGGCCTGCGCTTGCCATCCACGGTGACAAGCAGCAGCAGGAGCGTGACTGGGTGCTGGC 1343
                      ************* **** ****************** * ******** ***** ** * 

consensus_3050#0      CCAGTTCAAGACCGGAAAGTCCCCCATCATGGTGGCCACTGATGTTGCCTCGCGTGGTAT 1500
consensus_3050#1      CGAGTTCAAGTCGGGTCGTAGCCCGATCATGGTCGCTACCGCTGTGGCGTCCCGAGGTCT 1403
                      * ******** * **      *** ******** ** ** * *** ** ** ** *** *

consensus_3050#0      TGATGTGCGCAACATCACTCATGTGTTGAACTACGATTACCCCCACAACTCGGAAGACTA 1560
consensus_3050#1      CGACGTCAAGGACATTTCTTATGTCATCAACTACGACTTCCCCACCAACACGGAGGACTA 1463
                       ** **     ****  ** ****  * ******** * ****  **** **** *****

consensus_3050#0      CATTCACCGAATTGGTCGTACCGGTCGTGCTGGTGCCAAGGGTACCGCTATTACCCTTTT 1620
consensus_3050#1      CGTGCACCAGATCGGCCGTACCGGACGTGCCGGCCGCACGGGTACCGCTTACACCTTCTT 1523
                      * * ****  ** ** ******** ***** **   ** **********   *** * **

consensus_3050#0      CACTACTGACAACCAGAAGCAGGCTCGTGATCTTGTCAATGTCCTCACTGAGGCTAAGCA 1680
consensus_3050#1      CACGCCCGAGAACTCCAAGTCGGCGCGCGAGCTGGTTGGCATTCTGCGTGAGGCCAAGCA 1583
                      ***  * ** ***   ***  *** ** ** ** **     * **   ****** *****

consensus_3050#0      GCAGATTGATCCTCGTCTTGTTGAGATGACTCGATACGGCGGCGGTGGCGGTCGCGGTTA 1740
consensus_3050#1      GGAGAT---CCCGCGTGAGATCGAGGAGATGGGCCGCTTCGGCGGTGGAGGAGGCGGCCG 1640
                      * ****    ** ***    * ***  **   *   *  ********* **  ****   

consensus_3050#0      CGGTGGATGGGGACGTGGCCGTGGCGGTGGTAGAGGTGGGTTCCGCCGTCGCTAAAGCAG 1800
consensus_3050#1      TGGCTTCCGAGGCCGTGGTCGTGGCCGTGGCCGCGGTGGCTACGGCGGCGGAGGACGCAC 1700
                       **     * ** ***** ****** ****  * ***** * * ** *  *   * *** 

consensus_3050#0      CAAGACGCCTATCGAGCTGACTCGACCTCCAGCCAACGCCAACAACATGCCCATCGGTAA 1860
consensus_3050#1      --GGGTGCCAACTCGTTCGCTGTCGGCAACTCCCGATGGTA--GATATGCACCTTGCTCG 1756
                         *  *** *       *       *  *  ** * *  *   * **** * * * *  

consensus_3050#0      CCGTCGATGGTAAGGTATCCCTCCATCTTGGGGGTTCGACCTTTTGCGGTATGGGTCAGA 1920
consensus_3050#1      TCGTTCTTC-TGAGCTGCTTTCTCGGCATGGTCGCT-GGTCGCTTGAACTTT--GTCG-- 1810
                       ***   *  * ** *       *  * ***  * * *  *  ***   * *  ***   

consensus_3050#0      CAGCCTCGCATTTCGGATCTTCAGATTCTCAAAAAGTACATGACATCAAGGCGTTTGTTT 1980
consensus_3050#1      TCTCTACACCCACCGAGTCGTTTGGGTCTCACTCAAGGTATCACGTCGA--CTTTAGCTG 1868
                         *  * *    **  ** *  *  *****   *    ** ** ** *  * ** * * 

consensus_3050#0      GTTAGAGGACAGGTGGCTCGATTAGATTTGACTCGTTATTTGCGAGTCTGGATTCATGGT 2040
consensus_3050#1      GCT------CAGCT--CTCTTCCATGCTTT-CCTGTAATGTGGTCATTTTGTT------- 1912
                      * *      *** *  ***    *   **  *  ** ** **    * * * *       

consensus_3050#0      TTGACTGCGCCAATTTGGTCGCACTTAGTTGCATTTATGCGTTTACATGTTTACCTCAAA 2100
consensus_3050#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_3050#0      TAATGGCTTTAGACTAGGTTGACGATATCGTGCTGAGTGGTGTGAAAACACTCAACGACG 2160
consensus_3050#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_3050#0      GAGATGAGGAGAAAATATCCATTTATTGGAGGCCTCGTGCTTTGGAGGTCGATGACAATT 2220
consensus_3050#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_3050#0      GGGCTGGGTGTTTACTTAGACTTTATGTAGTTCGCACAAAAAGCA 2265
consensus_3050#1      ---------------------------------------------
                                                                   




Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)