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Oryza sativa
cluster # 3082 cluster # 3082       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3082#0 length = 1003 sequences # 2  

consensusID : consensus_3082#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1003
fasta sequence
                              [TGTGTTTAGTGGTACGGAACCAATTTTTCCTCCTTAATATCGAATTGTTAATTTTCGGTATGGAACCAATTTTTTCTCCTTAATAGCGAATTGCTAATTTTCTGGGCTTGGTTCCACGCTTCCAGTAGTAAGTAAGTACTGTGATTGGTAATTGTGATGTCATTACTCACAGCCACTGAAAACTTAGACATGGTCGAAGGGAAGGCATTTGATGTCATCCTTCCCCTTAGGCACAACATTGAGGTGACTCAGTTACTTGCTACCTTAAATCCTTAATGAGGCGCGACTTTCAAATGGGAGCGCAA---TTTTTTTTAAAATTCTAGTGGTAATTGATTGATGGTGCGAACCGGCAGCAACTAGCAATCTTGAAAATGCCAAAGCGTTGAGATAACTGCTGGTTGGCTTGAGTTACAGTGTTGGTGAGCCGTTTGAATATAGGCTGTGCTTGGTGGGTCCAATCTCCAGTGAGAAGCATTTTATACAGCATGCGTGCAGTGTTTCATGGATTGGTTAGTAATCTAACACAATCACGAGGAGTTTTGGTTCTTTTGGTTTAAGTTATTTTGGATCTGACTTGGTCAGGCTGGGCATTATTGTTCAGCAACTTGGTGTGNTGGTTACATTGGAGTTTCTTAGTTCTGTACAGCAAGNTGCTCTGTAATTTTTAATTCTACCGGCATGTGCAAGTGTTGATTGNCTATCTAGGAGCTTAAGGGGATAAACAAAAAGCTTTATTTTAATCTTTGCTTTGGTCACACCTTGATTNCACANGGANTTTTCTGANTTCTTANCTTCCTGGAGGTGGAGNCTTTAAGNTTTCACCCCAATT-TNTCAATTGGGTTGGCTACCTGGGNTCAAGAAATTAACGAAGATTTCCTAGTTGCTTTGGCTTGGTTGCCTCTTTTGGTCTGCAGTATGTCAATATTTGTACTCTTTGTTGTACATTTCTTTTTCTTGTCAGATCACTTAAACTTCTCTTGACAGGCTTCTTTTGTAAAAGGGA]

[+] EMBL CA765322             [TGTGTTTAGTGGTACGGAACCAATTTTTCCTCCTTAATATCGAATTGTTAATTTTCGGTATGGAACCAATTTTTTCTCCTTAATAGCGAATTGCTAATTTTCTGGGCTTGGTTCCACGCTTCCAGTAGTAAGTAAGTACTGTGATTGGTAATTGTGATGTCATTACTCACAGCCACTGAAAACTTAGACATGGTCGAAGGGAAGGCATTTGATGTCATCCTTCCCCTTAGGCACAACATTGAGGTGACTCAGTTACTTGCTACCTTAAATCCTTAATGAGGCGCGACTTTCAAATGGGAGCGCAA   TTTTTTTTAAAATTCTAGTGGTAATTGATTGATGGTGCGAACCGGCAGCAACTAGCAATCTTGAAAATGCCAAAGCGTTGAGATAACTGCTGGTTGGCTTGAGTTACAGTGTTGGTGAGCCGTTTGAATATAGGCTGTGCTTGGTGGGTCCAATCTCCAGTGAGAAGCATTTTATACAGCATGCGTGCAGTGTTTCATGGATTGGTTAGTAATCTAACACAATCACGAGGAGTTTTGGTTCTTTTGGTTTAAGTTATTTTGGATCTGACTTGGTCAGGCTGGGCATTATTGTTCAGCAACTTGGTGTGNTGGTTACATTGGAGTTTCTTAGTTCTGTACAGCAAGNTGCTCTGTAATTTTTAATTCTACCGGCATGTGCAAGTGTTGATTGNCTATCTAGGAGCTTAAGGGGATAAACAAAAAGCTTTATTTTAATCTTTGCTTTGGTCACACCTTGATTNCACANGGANTTTTCTGANTTCTTANCTTCCTGGAGGTGGAGNCTTTAAGNTTTCACCCCAATT TNTCAATTGGGTTGGCTACCTGGGN                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CB654591             [                                                                                                                                                                                                                TTGATGTCATCCTTCCCCTTAGGCACAACATTGAGGTGACTCAGTTACTTGCTACCTTAAATCCTTAATGAGGCGCGACTTTCAAATGGGAGCGCAATTTTTTTTTTTAAAATTCTAGTGGTAATTGATTGATGGTGCGAACCGACAGCAACTAGCAATCTTGAAGATGCCAAAGCGTTGAGATAACTGCTGGTTGGCTTGAGTTACAGTGTTGGTGAGCCGTTTGAATATAGGCTGTGCTTGGTGGGTCCAATCTCCAGTGAGAAGCATTTTATACAGCATGCGTGCAGTGTTTCATGGATTGGTTAGTAATCTAACACAATCACGAGGAGTTTTGGTTCTTTTGGTTTAAGTTATTTTGGATCTGACTTGGTCAGGCTGGGCATTATTGTTCAGCAACTTGGTGTGTTGGTTACATTGGAGTTTCTTAGTTCTGTACAGCAAGTTGCTCTGTAATTTTTAATTCTACTGGTATGTGCAAGTGTTGATTGTCTATCTAGGAGCTT AGTGTATAGAC AAAAGCTTTA TTTAATCTTTGCTTTGTTCACA CTTGATTCCACATGTA TTTTCTGATTTCTTAGCTTCCTGTAGTTGGAGTCTTTAAGTTTTCACCCTAATTCTCTCAGTTGGTTTGCCTACCTGGGTTCAAGAAATTAACGAAGATTTCCTAGTTGCTTTGGCTTGGTTGCCTCTTTTGGTCTGCAGTATGTCAATATTTGTACTCTTTGTTGTACATTTCTTTTTCTTGTCAGATCACTTAAACTTCTCTTGACAGGCTTCTTTTGTAAAAGGGA]


>consensus_3082#0 TGTGTTTAGTGGTACGGAACCAATTTTTCCTCCTTAATATCGAATTGTTAATTTTCGGTA TGGAACCAATTTTTTCTCCTTAATAGCGAATTGCTAATTTTCTGGGCTTGGTTCCACGCT TCCAGTAGTAAGTAAGTACTGTGATTGGTAATTGTGATGTCATTACTCACAGCCACTGAA AACTTAGACATGGTCGAAGGGAAGGCATTTGATGTCATCCTTCCCCTTAGGCACAACATT GAGGTGACTCAGTTACTTGCTACCTTAAATCCTTAATGAGGCGCGACTTTCAAATGGGAG CGCAATTTTTTTTAAAATTCTAGTGGTAATTGATTGATGGTGCGAACCGGCAGCAACTAG CAATCTTGAAAATGCCAAAGCGTTGAGATAACTGCTGGTTGGCTTGAGTTACAGTGTTGG TGAGCCGTTTGAATATAGGCTGTGCTTGGTGGGTCCAATCTCCAGTGAGAAGCATTTTAT ACAGCATGCGTGCAGTGTTTCATGGATTGGTTAGTAATCTAACACAATCACGAGGAGTTT TGGTTCTTTTGGTTTAAGTTATTTTGGATCTGACTTGGTCAGGCTGGGCATTATTGTTCA GCAACTTGGTGTGNTGGTTACATTGGAGTTTCTTAGTTCTGTACAGCAAGNTGCTCTGTA ATTTTTAATTCTACCGGCATGTGCAAGTGTTGATTGNCTATCTAGGAGCTTAAGGGGATA AACAAAAAGCTTTATTTTAATCTTTGCTTTGGTCACACCTTGATTNCACANGGANTTTTC TGANTTCTTANCTTCCTGGAGGTGGAGNCTTTAAGNTTTCACCCCAATTTNTCAATTGGG TTGGCTACCTGGGNTCAAGAAATTAACGAAGATTTCCTAGTTGCTTTGGCTTGGTTGCCT CTTTTGGTCTGCAGTATGTCAATATTTGTACTCTTTGTTGTACATTTCTTTTTCTTGTCA GATCACTTAAACTTCTCTTGACAGGCTTCTTTTGTAAAAGGGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)