cluster # 3182

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Oryza sativa
cluster # 3182 cluster # 3182 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3182#0 length = 675 sequences # 2

consensusID : consensus_3182#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 675
fasta sequence

                              [GGGACCACACACCGATTTTCGCAAACTAGAAAT-AATTAAGTAAGTTCTACTCTCGATTGATATGGCGATAGCTTGGGTGAACTTGGTAATCCTAGGCCTATCCCTTGTCGCTCCCCTTGTCCTCACCACCATCCCGGAGGTCGCTGGTGGGCGACCCGGCGGCTACATCGACTACGGCGCCATGAACAAAGACCGCATCCCTGGAACTCCAGAGTTCAACCACCTGGGCGGCTCCGCCAACCAGTACACGCGTGGTTGTGAGAAGCAGTTGCATTGCAGGGGTAAAAGGCGAGGGTTCTGATCGAAGCTGCTTGCAGAGTTGCAGTTCATCATGGCCGTTGATCATGGCTATTGATCGGCTACGTAGTTTATGCTTTGTTTTGGTGCTATAATATATAGTTTTTTAATAACACTTAGAACAACACATTGTTCAGATAGCTAGGTAATTTGGTGCTACAATAGGATTTCAGTAACGCTTTAGTTATAACAGCAAATTCTTATTTGGATATGTAATCATTCCTTTAACATAAAGTGTCTGTAGTACCTTTTTGTCAGCTTAACTTTTTTTTTAAAAAAAAATGATTGGTGCATATGTGTTGAGTTTGAATATTTCCTGGCTGATGCAACCAATTTTTTTTTAGAGAAGGGATTTTTTTACCCCCGGTCTCTATCACC]

[+] EMBL CB096578             [GGGACCACACACCGATTTTCGCAAACTAGAAAT AATTAAGTAAGTTCTACTCTCGATTGATATGGCGATAGCTTGGGTGAACTTGGTAATCCTAGGCCTATCCCTTGTCGCTCCCCTTGTCCTCACCACCATCCCGGAGGTCGCTGGTGGGCGACCCGGCGGCTACATCGACTACGGCGCCATGAACAAAGACCGCATCCCTGGAACTCCAGAGTTCAACCACCTGGGCGGCTCCGCCAACCAGTACACGCGTGGTTGTGAGAAGCAGTTGCATTGCAGGGGTAAAAGGCGAGGGTTCTGATCGAAGCTGCTTGCAGAGTTGCAGTTCATCATGGCCGTTGATCATGGCTATTGATCGGCTACGTAGTTTATGCTTTGTTTTGGTGCTATAATATATAGTTTTTTAATAACACTTAGAACAACACATTGTTCAGATAGCTAGGTAATTTGGTGCTACAATAGGATTTCAGTAACGCTTTAGTTATAACAGCAAATTCTTATTTGGATATGTAATCATTCCTTTAACATAAAGTGTCTGTAGTACCTT                                                                                                                                ]
[+] EMBL CA765831             [           CCGATTTTCGCAAACTAGAAATCAATTAAGTAAGTTCTACTCTCGATTGATATGGCGATAGCTTGGGTGAACTTGGTAATCCTAGGCCTATCCCTTGTCGCTCTCCTTGTCCTCACCACCATCCCGGAGGTCGCTGGTGGGCGACCCGGCGGCTACATCGACTACGGCGCCATGAACAAAGACCGCATCCCTGGAACTCCAGAGTTCAACCACCTGGGCGGCTCCGCCAACCAGTACACGCGTGGTTGTGAGAAGCAGTTGCATTGCAGGGGTAAAAGGCGAGGGTTCTGATCGAAGCTGCTTGCAGAGTTGCAGTTCATCATGGCCGTTGATCATGGCTATTGATCGGCTACGTAGTTTATGCTTTGTTTTGGTGCTATAATATATAGTTTTTTAATAACACTTAGAACAACACATTGTTCAGATAGCTAGGTAATTTGGTGCTACAATAGGATTTCAATAACGCTTTAGTTATAACAGCAAATTCTTATTTGGATATGTAATCATTCCTTTAACATAAAGTGTCTGTAGTACTTGTTTGTCAGCTTAACTTTTTTTTTAAAAAAAAATGATTGGTGCATATGTGTTGAGTTTGAATATTTCCTGGCTGATGCAACCAATTTTTTTTTAGAGAAGGGATTTTTTTACCCCCGGTCTCTATCACC]




>consensus_3182#0
GGGACCACACACCGATTTTCGCAAACTAGAAATAATTAAGTAAGTTCTACTCTCGATTGA
TATGGCGATAGCTTGGGTGAACTTGGTAATCCTAGGCCTATCCCTTGTCGCTCCCCTTGT
CCTCACCACCATCCCGGAGGTCGCTGGTGGGCGACCCGGCGGCTACATCGACTACGGCGC
CATGAACAAAGACCGCATCCCTGGAACTCCAGAGTTCAACCACCTGGGCGGCTCCGCCAA
CCAGTACACGCGTGGTTGTGAGAAGCAGTTGCATTGCAGGGGTAAAAGGCGAGGGTTCTG
ATCGAAGCTGCTTGCAGAGTTGCAGTTCATCATGGCCGTTGATCATGGCTATTGATCGGC
TACGTAGTTTATGCTTTGTTTTGGTGCTATAATATATAGTTTTTTAATAACACTTAGAAC
AACACATTGTTCAGATAGCTAGGTAATTTGGTGCTACAATAGGATTTCAGTAACGCTTTA
GTTATAACAGCAAATTCTTATTTGGATATGTAATCATTCCTTTAACATAAAGTGTCTGTA
GTACCTTTTTGTCAGCTTAACTTTTTTTTTAAAAAAAAATGATTGGTGCATATGTGTTGA
GTTTGAATATTTCCTGGCTGATGCAACCAATTTTTTTTTAGAGAAGGGATTTTTTTACCC
CCGGTCTCTATCACC

clustalw multiple alignements is not computed in this case