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Oryza sativa
cluster # 3356 cluster # 3356       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3356#0 length = 868 sequences # 2  

consensusID : consensus_3356#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 868
fasta sequence
                              [CACTGAACAGTGAACACCAGTGCAGTTTAAGCCACAGCTAGCTGAAGAAGAAGACGAAGAAGGAAGAGGAGGAGAGGAGGGTTGAGCTAGCTCTAGATCAGCAATGGCGAACGCAGCAGGAGGTCTACTTCGTGTTCATGAACTTCGACCCTGTCTATGAGCGCCTCAGAGCTGACCGGTCCAAGGAGGGGTCGGCCACGCTGGACGCCTACCTGAGCCACAAGCACGACAAGCTCCTCGCCAAGCTCCTGCAGCCGGACACCTACCGGAAGAAGTCGTCTCTCGCCATCGTCGACGGCTTCGCCTNAGGATAACCGATGCTCAGGCGAGCATACTGAGGTTGGCGAAGGAAGTGAGGGTGGTGGAGAAGAACCAGGAGCTTGCTTGATCGATATGACCGGTCAAATTGATAGAGATTATTACACATATATATAATACATATGTGTGTGCCAATCAATCAACTACTAGATGCTTAATTTAATTTGGCATCAGCTATATATGGCTATATATGTAGCTATATATATAGCAGTAAATGGTTGCAGTTAATTACTAATTAATTAAGCTAAATTGAAGGAGTTGATCGATCGAGTCAATTGCCTTTGCTGCATGTGTCGGTGTGTGTGTGACAGTGTGAGCTCCCATATATATATTATGGATTTGTTGACTCCATTGTCAAGCATAGCTGCTAGTATGTGTATATTAATACTGCTTAGCAGTGATAATAATAAATTAATATATGTAGTTCTTAGGTTCTAATTATTGTCAGAGGACGACGACTTCTAGCTATGTCCAACCTAGCAATGTAATGGTTAATTCTGCATGGTTTTGTTCAAAACCTATTTGTATTAGTAGTATAAATTATAGCTAA]

[+] EMBL C27640               [CACTGAACAGTGAACACCAGTGCAGTTTAAGCCACAGCTAGCTGAAGAAGAAGACGAAGAAGGAAGAGGAGGAGAGGAGGGTTGAGCTAGCTCTAGATCAGCAATGGCGAACGCAGCAGGAGGTCTACTTCGTGTTCATGAACTTCGACCCTGTCTATGAGCGCCTCAGAGCTGACCGGTCCAAGGAGGGGTCGGCCACGCTGGACGCCTACCTGAGCCACAAGCACGACAAGCTCCTCGCCAAGCTCCTGCAGCCGGACACCTACCGGAAGAAGTCGTCTCTCGCCATCGTCGACGGCTTCGCCTNAGGATAACCGATGCTCAGGCGAGCATACTGAGGTTGGCGAAGGAAGTGAGGGTGGTGGAGAAGAACCAGGAGCTTGCTTGATCGATATGACCGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AU090461             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gaGATAACCGATGCTCAGGCGAGCATACTGAGGTTGGCGAAGGAAGTGAGGGTGGTGGAGAAGAACCAGGAGCTTGCTTGATCGATATGACCGGTCAAATTGATAGAGATTATTACACATATATATAATACATATGTGTGTGCCAATCAATCAACTACTAGATGCTTAATTTAATTTGGCATCAGCTATATATGGCTATATATGTAGCTATATATATAGCAGTAAATGGTTGCAGTTAATTACTAATTAATTAAGCTAAATTGAAGGAGTTGATCGATCGAGTCAATTGCCTTTGCTGCATGTGTCGGTGTGTGTGTGACAGTGTGAGCTCCCATATATATATTATGGATTTGTTGACTCCATTGTCAAGCATAGCTGCTAGTATGTGTATATTAATACTGCTTAGCAGTGATAATAATAAATTAATATATGTAGTTCTTAGGTTCTAATTATTGTCAGAGGACGACGACTTCTAGCTATGTCCAACCTAGCAATGTAATGGTTAATTCTGCATGGTTTTGTTCAAAACCTATTTGTATTAGTAGTATAAATTATAGCTAA]


>consensus_3356#0 CACTGAACAGTGAACACCAGTGCAGTTTAAGCCACAGCTAGCTGAAGAAGAAGACGAAGA AGGAAGAGGAGGAGAGGAGGGTTGAGCTAGCTCTAGATCAGCAATGGCGAACGCAGCAGG AGGTCTACTTCGTGTTCATGAACTTCGACCCTGTCTATGAGCGCCTCAGAGCTGACCGGT CCAAGGAGGGGTCGGCCACGCTGGACGCCTACCTGAGCCACAAGCACGACAAGCTCCTCG CCAAGCTCCTGCAGCCGGACACCTACCGGAAGAAGTCGTCTCTCGCCATCGTCGACGGCT TCGCCTNAGGATAACCGATGCTCAGGCGAGCATACTGAGGTTGGCGAAGGAAGTGAGGGT GGTGGAGAAGAACCAGGAGCTTGCTTGATCGATATGACCGGTCAAATTGATAGAGATTAT TACACATATATATAATACATATGTGTGTGCCAATCAATCAACTACTAGATGCTTAATTTA ATTTGGCATCAGCTATATATGGCTATATATGTAGCTATATATATAGCAGTAAATGGTTGC AGTTAATTACTAATTAATTAAGCTAAATTGAAGGAGTTGATCGATCGAGTCAATTGCCTT TGCTGCATGTGTCGGTGTGTGTGTGACAGTGTGAGCTCCCATATATATATTATGGATTTG TTGACTCCATTGTCAAGCATAGCTGCTAGTATGTGTATATTAATACTGCTTAGCAGTGAT AATAATAAATTAATATATGTAGTTCTTAGGTTCTAATTATTGTCAGAGGACGACGACTTC TAGCTATGTCCAACCTAGCAATGTAATGGTTAATTCTGCATGGTTTTGTTCAAAACCTAT TTGTATTAGTAGTATAAATTATAGCTAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)