cluster # 3474

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 3474 cluster # 3474 Sequences # 2 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3474#0 length = 2695 sequences # 2
consensusID : consensus_3474#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 2695
fasta sequence
                              [CCCATGGAAAACACTCAAACCTTCTCTCTGGCGGCTGGCGGCGGCTCTGCTTAAACCCCGCCGCCCGCGCGCCTTCTTCCCCAACTCCGGCGGCCGCGCCACCATTCCTCGCAGCTCCGGTGTTCTCTGCTGTTGTCTGGGGCTCCCCCGCGCAGGATAAGGGGACCCACCTCCGCCGCCCGCGCGCCTGCTCCCCCCCAACTCCGGCGCCCCCGCGCCTCCTTCCCAACTCCGGTGGTGCCGGCTGAGGAGCTTGAGCACGCCGGGAGGGGAGGGGTGGGGGGTTTACGGGGACGGCTGTGGCATGGCGGCCGCCCGAGCTTGCCCTATGGGAGTATCGGTCGACCAGCGGCGCGCGGCCGTTGCCGTGCTCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGGCGAGCTTTCGTTAGGGAAGGCGGTTCACGCGAGGGTTGTCAGGGCCGCGCGCTTCGACGTCGTCCAGTACAACAACCTCATTGCCCTGTACGTCAAGTGCGGCCGCCTAGGCCTCGCCCGCCAGGTGTTCGACGCAATGCCCTCCCGGAACCCCGTGTCTGGGAACCTGCTCATGTCCGGGTACGCTTCTTCCGGGCGCCACAGGGACGCCCTCGCGCTCCTCAGGGTGGCTGACTTTGGTCTGAATGAGTACGTGCTGTCGTCGGCTGTGGCCGCGACTGCCCATGTCCGGAGCTATGATATGGGGAGGCAGTGCCATGGATATGCTATCAAGGCTGGACTAGCAGAGCACCCTTACGTTTGTAGTGCGGTGCTGCATATGTATTGCCAATGTGCACACATGGACGAAGCGGTGAAGGTATTTGATAATGTTTCCAGTTTTAATGTATTCGCGTTCAACTCAATGATAAATGGGTTTCTTGATCGGGGCCAGATGGATGGTTCCACCAGTATAGTAAGAAGCATGGTGAGAAATGTCGGGCAATGGGATCATGTGTCATATGTCGCAGTTCTTGGGCATTGTGCTAGCACGAAAGAGGTGGTGCTTGGGAGTCAGGTGCATACCCAAGCGTTGAAGAGGAGGCTTGAGCTGAATGTGTATGTGGGGAGTGCACTCGTTGATATGTATGGGAAATGTGACTTTCCCCATGAAGCTAATCGCGTGTTTGAGGTTTTGCCAGAAAAGAATATTGTTTCCTGGACAGCCATTATGACTGCTTATACACAAAATGAGCTGTTTGAAGATGCATTGCAGTTGTTCTTGGATATGGAAATGGAAGGAGTTCGGCCTAATGAGTTCACTTATGCTGTTGCTCTCAACAGTTGCGCTGGTCTTGCCACCTTGAAAAATGGTAATGCCCTTGGTGCATGTACTATGAAAACTGGGCATTGGGGCCTTTTGCCTGTCTGTAATGCCCTCATGAACATGTACTCAAAGAGTGGCAGTGTTGAGGATGCACGGAGAGTCTTCCTTTCTATGCCATGTCGTGATGTGGTTTCTTGGAATTCAATCATCATTGGCTACGCTCATCATGGCCGTGCAAGAGAAGCCATGGAAGCATTTCATGATATGTTGTTTGCAGAAGAAGTCCCATCTTATGTAACTTTCATTGGGGTGCTGTCAGCCTGTGCTCAGTTGGGTCTTGTAGATGAAGGGTTCTACTACCTGAATATTATGATGAAGGAAGTGGGAGTAAAACCTGGTAAGGAACATTACACTTGCATGGTCGGTTTGCTGTGCAGAGTTGGACGGCTTGACGAGGCAGAACGATTCATAGAAAGTAACTGCATTGGTACCGATGTTGTTGCATGGAGATCACTTCTAAGTTCTTGCCAAGTATATAGAAATTATGGTCTTGGTCATCGAGTAGCTGAACAGATTTTTCAGTTAAAGCCCAAAGATGTTGGAACCTATGTTTTGCTTTCTAATATGTATGCGAAAGCAAACCGGTGGGATGGTGTCGTGAAGGTTCGGAGGCTGATGAGAGAGTTGGGCGTTAGGAAGGAGCCTGGTGTTAGTTGGATTCAAGTGGGTAGTGAGGTCCATGTTTTCACATCTGAGGACAAAAAACACCCATATATGGAGCAGATCACCAAAAAACTCCAAGAGCTGATAGACAAGATAAAAGTGATTGGATATGTTCCAAACATTGCAGTGGCCCTACATGATGTTGAGGATGAACAAAAGGAAGAACATCTTATGTATCACAGTGAGAAATTAGCTCTTGCATTTGGCCTTATTCGCACCCCCAAGGGAGAAGCTATTCGTATAATGAAAAACGTCAGGATATGTGATGATTGCCATGTTGCCATCAAACTCATTTCACTTGCCACAGGCAGAAGAATAGTTGTAAGGGACACTGTTCGGTTTCATTGTATAGAAGATGGAGTCTGCTCATGTGATGACTATTGGTGATTCAATCTATATAATATGTCAATATAAAAGTGGCAAAGCTTTTGCCCTTTCTTAAAAAAAAACTATATAATATGTGGTTCTCAAAGGTCGATTGCATAAAGCCTCGTGAATCAGCTGAATGGAGCTGATTGGCCATATATGTGATTCAAGAGCATTTTTGCTGAGTATAAATGTTGAGGTGGGACCAGAGAGTCATTAAAGTCGCAGCTCCAGAGGACAAGTGAAGTTAGGACATGGACATGGAAATGCAATCATTTTTTTGAAGAACAAAGTTAAAAGATGTAAATATGTGAATTATTTTAACGACTAACAAGGGAGGATATGCTA]

[+] EMBL AK103180             [CCCATGGAAAACACTCAAACCTTCTCTCTGGCGGCTGGCGGCGGCTCTGCTTAAACCCCGCCGCCCGCGCGCCTTCTTCCCCAACTCCGGCGGCCGCGCCACCATTCCTCGCAGCTCCGGTGTTCTCTGCTGTTGTCTGGGGCTCCCCCGCGCAGGATAAGGGGACCCACCTCCGCCGCCCGCGCGCCTGCTCCCCCCCAACTCCGGCGCCCCCGCGCCTCCTTCCCAACTCCGGTGGTGCCGGCTGAGGAGCTTGAGCACGCCGGGAGGGGAGGGGTGGGGGGTTTACGGGGACGGCTGTGGCATGGCGGCCGCCCGAGCTTGCCCTATGGGAGTATCGGTCGACCAGCGGCGCGCGGCCGTTGCCGTGCTCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGGCGAGCTTTCGTTAGGGAAGGCGGTTCACGCGAGGGTTGTCAGGGCCGCGCGCTTCGACGTCGTCCAGTACAACAACCTCATTGCCCTGTACGTCAAGTGCGGCCGCCTAGGCCTCGCCCGCCAGGTGTTCGACGCAATGCCCTCCCGGAACCCCGTGTCTGGGAACCTGCTCATGTCCGGGTACGCTTCTTCCGGGCGCCACAGGGACGCCCTCGCGCTCCTCAGGGTGGCTGACTTTGGTCTGAATGAGTACGTGCTGTCGTCGGCTGTGGCCGCGACTGCCCATGTCCGGAGCTATGATATGGGGAGGCAGTGCCATGGATATGCTATCAAGGCTGGACTAGCAGAGCACCCTTACGTTTGTAGTGCGGTGCTGCATATGTATTGCCAATGTGCACACATGGACGAAGCGGTGAAGGTATTTGATAATGTTTCCAGTTTTAATGTATTCGCGTTCAACTCAATGATAAATGGGTTTCTTGATCGGGGCCAGATGGATGGTTCCACCAGTATAGTAAGAAGCATGGTGAGAAATGTCGGGCAATGGGATCATGTGTCATATGTCGCAGTTCTTGGGCATTGTGCTAGCACGAAAGAGGTGGTGCTTGGGAGTCAGGTGCATACCCAAGCGTTGAAGAGGAGGCTTGAGCTGAATGTGTATGTGGGGAGTGCACTCGTTGATATGTATGGGAAATGTGACTTTCCCCATGAAGCTAATCGCGTGTTTGAGGTTTTGCCAGAAAAGAATATTGTTTCCTGGACAGCCATTATGACTGCTTATACACAAAATGAGCTGTTTGAAGATGCATTGCAGTTGTTCTTGGATATGGAAATGGAAGGAGTTCGGCCTAATGAGTTCACTTATGCTGTTGCTCTCAACAGTTGCGCTGGTCTTGCCACCTTGAAAAATGGTAATGCCCTTGGTGCATGTACTATGAAAACTGGGCATTGGGGCCTTTTGCCTGTCTGTAATGCCCTCATGAACATGTACTCAAAGAGTGGCAGTGTTGAGGATGCACGGAGAGTCTTCCTTTCTATGCCATGTCGTGATGTGGTTTCTTGGAATTCAATCATCATTGGCTACGCTCATCATGGCCGTGCAAGAGAAGCCATGGAAGCATTTCATGATATGTTGTTTGCAGAAGAAGTCCCATCTTATGTAACTTTCATTGGGGTGCTGTCAGCCTGTGCTCAGTTGGGTCTTGTAGATGAAGGGTTCTACTACCTGAATATTATGATGAAGGAAGTGGGAGTAAAACCTGGTAAGGAACATTACACTTGCATGGTCGGTTTGCTGTGCAGAGTTGGACGGCTTGACGAGGCAGAACGATTCATAGAAAGTAACTGCATTGGTACCGATGTTGTTGCATGGAGATCACTTCTAAGTTCTTGCCAAGTATATAGAAATTATGGTCTTGGTCATCGAGTAGCTGAACAGATTTTTCAGTTAAAGCCCAAAGATGTTGGAACCTATGTTTTGCTTTCTAATATGTATGCGAAAGCAAACCGGTGGGATGGTGTCGTGAAGGTTCGGAGGCTGATGAGAGAGTTGGGCGTTAGGAAGGAGCCTGGTGTTAGTTGGATTCAAGTGGGTAGTGAGGTCCATGTTTTCACATCTGAGGACAAAAAACACCCATATATGGAGCAGATCACCAAAAAACTCCAAGAGCTGATAGACAAGATAAAAGTGATTGGATATGTTCCAAACATTGCAGTGGCCCTACATGATGTTGAGGATGAACAAAAGGAAGAACATCTTATGTATCACAGTGAGAAATTAGCTCTTGCATTTGGCCTTATTCGCACCCCCAAGGGAGAAGCTATTCGTATAATGAAAAACGTCAGGATATGTGATGATTGCCATGTTGCCATCAAACTCATTTCACTTGCCACAGGCAGAAGAATAGTTGTAAGGGACACTGTTCGGTTTCATTGTATAGAAGATGGAGTCTGCTCATGTGATGACTATTGGTGATTCAATCTATATAATATGTCAATATAAAAGTGGCAAAGCTTTTGCCCTTTCTTAAAAAAAAACTATATAATATGTGGTTCTCAAAGGTCGATTGCATAAAGCCTCGTGAATCAGCTGAATGGAGCTGATTGGCCATATATGTGATTCAAGAGCATTTTTGCTGAGTATAAATGTTGAGGTGGGACCAGAGAGTCATTAAAGTCGCAGCTCCAGAGGACAAGTGAAGTTAGGACATGGACATGGAAATGCAATCATTTTTTTGAAGAACAAAGTTAAAAGATGTAAATATGTGAATTATTTTAACGACTAACAAGGGAGGATATGCTA]
[+] EMBL CB000774             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TACTCAAAGAGTGGCAGTGTTGAGGATGCACGGAGAGTCTTCCTTTCTATGCCATGTCGTGATGTGGTTTCTTGGAATTCAATCATCATTGGCTACGCTCATCATGGCCGTGCAAGAGAAGCCATGGAAGCATTTCATGATATGTTGTTTGCAGAAGAAGTCCCATCTTATGTAACTTTCATTGGGGTGCTGTCAGCCTGTGCTCAGTTGGGTCTTGTAGATGAAGGGTTCTACTACCTGAATATTATGATGAAGGAAGTGGGAGTAAAACCTGGTAAGGAACATTACACTTGCATGGTCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]




>consensus_3474#0
CCCATGGAAAACACTCAAACCTTCTCTCTGGCGGCTGGCGGCGGCTCTGCTTAAACCCCG
CCGCCCGCGCGCCTTCTTCCCCAACTCCGGCGGCCGCGCCACCATTCCTCGCAGCTCCGG
TGTTCTCTGCTGTTGTCTGGGGCTCCCCCGCGCAGGATAAGGGGACCCACCTCCGCCGCC
CGCGCGCCTGCTCCCCCCCAACTCCGGCGCCCCCGCGCCTCCTTCCCAACTCCGGTGGTG
CCGGCTGAGGAGCTTGAGCACGCCGGGAGGGGAGGGGTGGGGGGTTTACGGGGACGGCTG
TGGCATGGCGGCCGCCCGAGCTTGCCCTATGGGAGTATCGGTCGACCAGCGGCGCGCGGC
CGTTGCCGTGCTCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGGCGAGCTTTCGTTAGGGAAGGCGGTTCA
CGCGAGGGTTGTCAGGGCCGCGCGCTTCGACGTCGTCCAGTACAACAACCTCATTGCCCT
GTACGTCAAGTGCGGCCGCCTAGGCCTCGCCCGCCAGGTGTTCGACGCAATGCCCTCCCG
GAACCCCGTGTCTGGGAACCTGCTCATGTCCGGGTACGCTTCTTCCGGGCGCCACAGGGA
CGCCCTCGCGCTCCTCAGGGTGGCTGACTTTGGTCTGAATGAGTACGTGCTGTCGTCGGC
TGTGGCCGCGACTGCCCATGTCCGGAGCTATGATATGGGGAGGCAGTGCCATGGATATGC
TATCAAGGCTGGACTAGCAGAGCACCCTTACGTTTGTAGTGCGGTGCTGCATATGTATTG
CCAATGTGCACACATGGACGAAGCGGTGAAGGTATTTGATAATGTTTCCAGTTTTAATGT
ATTCGCGTTCAACTCAATGATAAATGGGTTTCTTGATCGGGGCCAGATGGATGGTTCCAC
CAGTATAGTAAGAAGCATGGTGAGAAATGTCGGGCAATGGGATCATGTGTCATATGTCGC
AGTTCTTGGGCATTGTGCTAGCACGAAAGAGGTGGTGCTTGGGAGTCAGGTGCATACCCA
AGCGTTGAAGAGGAGGCTTGAGCTGAATGTGTATGTGGGGAGTGCACTCGTTGATATGTA
TGGGAAATGTGACTTTCCCCATGAAGCTAATCGCGTGTTTGAGGTTTTGCCAGAAAAGAA
TATTGTTTCCTGGACAGCCATTATGACTGCTTATACACAAAATGAGCTGTTTGAAGATGC
ATTGCAGTTGTTCTTGGATATGGAAATGGAAGGAGTTCGGCCTAATGAGTTCACTTATGC
TGTTGCTCTCAACAGTTGCGCTGGTCTTGCCACCTTGAAAAATGGTAATGCCCTTGGTGC
ATGTACTATGAAAACTGGGCATTGGGGCCTTTTGCCTGTCTGTAATGCCCTCATGAACAT
GTACTCAAAGAGTGGCAGTGTTGAGGATGCACGGAGAGTCTTCCTTTCTATGCCATGTCG
TGATGTGGTTTCTTGGAATTCAATCATCATTGGCTACGCTCATCATGGCCGTGCAAGAGA
AGCCATGGAAGCATTTCATGATATGTTGTTTGCAGAAGAAGTCCCATCTTATGTAACTTT
CATTGGGGTGCTGTCAGCCTGTGCTCAGTTGGGTCTTGTAGATGAAGGGTTCTACTACCT
GAATATTATGATGAAGGAAGTGGGAGTAAAACCTGGTAAGGAACATTACACTTGCATGGT
CGGTTTGCTGTGCAGAGTTGGACGGCTTGACGAGGCAGAACGATTCATAGAAAGTAACTG
CATTGGTACCGATGTTGTTGCATGGAGATCACTTCTAAGTTCTTGCCAAGTATATAGAAA
TTATGGTCTTGGTCATCGAGTAGCTGAACAGATTTTTCAGTTAAAGCCCAAAGATGTTGG
AACCTATGTTTTGCTTTCTAATATGTATGCGAAAGCAAACCGGTGGGATGGTGTCGTGAA
GGTTCGGAGGCTGATGAGAGAGTTGGGCGTTAGGAAGGAGCCTGGTGTTAGTTGGATTCA
AGTGGGTAGTGAGGTCCATGTTTTCACATCTGAGGACAAAAAACACCCATATATGGAGCA
GATCACCAAAAAACTCCAAGAGCTGATAGACAAGATAAAAGTGATTGGATATGTTCCAAA
CATTGCAGTGGCCCTACATGATGTTGAGGATGAACAAAAGGAAGAACATCTTATGTATCA
CAGTGAGAAATTAGCTCTTGCATTTGGCCTTATTCGCACCCCCAAGGGAGAAGCTATTCG
TATAATGAAAAACGTCAGGATATGTGATGATTGCCATGTTGCCATCAAACTCATTTCACT
TGCCACAGGCAGAAGAATAGTTGTAAGGGACACTGTTCGGTTTCATTGTATAGAAGATGG
AGTCTGCTCATGTGATGACTATTGGTGATTCAATCTATATAATATGTCAATATAAAAGTG
GCAAAGCTTTTGCCCTTTCTTAAAAAAAAACTATATAATATGTGGTTCTCAAAGGTCGAT
TGCATAAAGCCTCGTGAATCAGCTGAATGGAGCTGATTGGCCATATATGTGATTCAAGAG
CATTTTTGCTGAGTATAAATGTTGAGGTGGGACCAGAGAGTCATTAAAGTCGCAGCTCCA
GAGGACAAGTGAAGTTAGGACATGGACATGGAAATGCAATCATTTTTTTGAAGAACAAAG
TTAAAAGATGTAAATATGTGAATTATTTTAACGACTAACAAGGGAGGATATGCTA
clustalw multiple alignements is not computed in this case