cluster # 3554

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Oryza sativa
cluster # 3554 cluster # 3554 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3554#0 length = 804 sequences # 2

consensusID : consensus_3554#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 804
fasta sequence

                              [GCCACCGCCTCGGCCTTCCCCCGTTTCGAGGACCTCCGTGTCGGCGCTGACGATGATGCTGCCGCTATCACCGCCGTCACGCCAGAAGGACGTTATGGTGGCGGCGGTGGTGGGTCTAGTGATAATGGCGGCGGTGATGGCGGTGGCGGCGAGGTGGGGGAGGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGGGGGAGGGTTCTTCCCCCAGATTCTGGGGCTGGGGAGTAGGAGGAAGGGTGCACCCCACAGATCACCCCTGTCCTAAGCCTAATCACCACTTTGCCCCCCTAGCTACATATATGTGCCATTAATAGCAGCTAGCTGTTAATTAATTACTAGTAGTAGCTAAGCTAGCCCCTAGCTGTACTAGCTAGTTCTAGCTTTTAGTGTGTCATGTCATTATAGCCCTATGATTAGCCATGTAGAGAGAGATGAGTGTGTGTGTTAATTTGTGTGTTGGTTGGTTGGTTGGATGGGTTCTTTGGGAGGTAGGGGCTTTTGTTTGTGTGATCTAGCTTAGCTTAAGGTTAATTAGCTTAGCTAGGGCCACTTCCAAGCTAATAGGCACTTAGGCAGTGTTTTGATGGGAGACAGAGAGGGAGGGAGAAAGAGAGGAAAAAAGCAAGCAATTCTCCTACTGTTACAGGCCTAGGTAGCTGAGTCACAGGTATGTGGGGCCCAGGTTGCATGGCTTCCCCTACATGATAGTGTGTGGCTACCAATTTTGTACTTGATGTAACAGCAGGGTTACTTGCATACACTTCCATAACCACATATATAATTAATTAATATCGTTCCTCAAAAAAAA]

[+] EMBL AK103838             [GCCACCGCCTCGGCCTTCCCCCGTTTCGAGGACCTCCGTGTCGGCGCTGACGATGATGCTGCCGCTATCACCGCCGTCACGCCAGAAGGACGTTATGGTGGCGGCGGTGGTGGGTCTAGTGATAATGGCGGCGGTGATGGCGGTGGCGGCGAGGTGGGGGAGGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGGGGGAGGGTTCTTCCCCCAGATTCTGGGGCTGGGGAGTAGGAGGAAGGGTGCACCCCACAGATCACCCCTGTCCTAAGCCTAATCACCACTTTGCCCCCCTAGCTACATATATGTGCCATTAATAGCAGCTAGCTGTTAATTAATTACTAGTAGTAGCTAAGCTAGCCCCTAGCTGTACTAGCTAGTTCTAGCTTTTAGTGTGTCATGTCATTATAGCCCTATGATTAGCCATGTAGAGAGAGATGAGTGTGTGTGTTAATTTGTGTGTTGGTTGGTTGGTTGGATGGGTTCTTTGGGAGGTAGGGGCTTTTGTTTGTGTGATCTAGCTTAGCTTAAGGTTAATTAGCTTAGCTAGGGCCACTTCCAAGCTAATAGGCACTTAGGCAGTGTTTTGATGGGAGACAGAGAGGGAGGGAGAAAGAGAGGAAAAAAGCAAGCAATTCTCCTACTGTTACAGGCCTAGGTAGCTGAGTCACAGGTATGTGGGGCCCAGGTTGCATGGCTTCCCCTACATGATAGTGTGTGGCTACCAATTTTGTACTTGATGTAACAGCAGGGTTACTTGCATACACTTCCATAACCACATATATAATTAATTAAT                  ]
[+] EMBL AU092215             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGTTAATTAATTACTAGTAGTAGCTAAGCTAGCCCCGAGCTGTACTAGCTAGTTCTAGCTTTTAGTGTGTCATGTCATTATNGCCCTATGATTAGCCATGTAGAGAGAGATGAGTGTGTGTGTTAATTTGTGTGTTGGTTGGTTGGTTGGATGGGTTCTTTGGGAGGTAGGGGCTTTTGTTTGTGTGATCTAGCTTAGCTTAAGGTTAATTAGCTTAGCTAGGGCCACTTCCAAGCTAATAGGCACTTAGGCAGTGTTTTGATGGGAGACAGAGAGGGAGGGAGAAAGAGAGGAAAAAAGCAAGCAATTCTCCTACTGTTACAGGCCTAGGTAGCTGAGTCACAGGTATGTGGGGCCCAGGTTGCATGGCTTCCCCTACATGATAGTGTGTGGCTACCAATTTTGTACTTGATGTAACAGCAGGGTTACTTGCATANACTTCCATAACCACATATATAATTAATTAATATCGTTCCTCAAAAAAAA]




>consensus_3554#0
GCCACCGCCTCGGCCTTCCCCCGTTTCGAGGACCTCCGTGTCGGCGCTGACGATGATGCT
GCCGCTATCACCGCCGTCACGCCAGAAGGACGTTATGGTGGCGGCGGTGGTGGGTCTAGT
GATAATGGCGGCGGTGATGGCGGTGGCGGCGAGGTGGGGGAGGTGAAGAGGAAGAAGAAG
AAGGGGGGAGGGTTCTTCCCCCAGATTCTGGGGCTGGGGAGTAGGAGGAAGGGTGCACCC
CACAGATCACCCCTGTCCTAAGCCTAATCACCACTTTGCCCCCCTAGCTACATATATGTG
CCATTAATAGCAGCTAGCTGTTAATTAATTACTAGTAGTAGCTAAGCTAGCCCCTAGCTG
TACTAGCTAGTTCTAGCTTTTAGTGTGTCATGTCATTATAGCCCTATGATTAGCCATGTA
GAGAGAGATGAGTGTGTGTGTTAATTTGTGTGTTGGTTGGTTGGTTGGATGGGTTCTTTG
GGAGGTAGGGGCTTTTGTTTGTGTGATCTAGCTTAGCTTAAGGTTAATTAGCTTAGCTAG
GGCCACTTCCAAGCTAATAGGCACTTAGGCAGTGTTTTGATGGGAGACAGAGAGGGAGGG
AGAAAGAGAGGAAAAAAGCAAGCAATTCTCCTACTGTTACAGGCCTAGGTAGCTGAGTCA
CAGGTATGTGGGGCCCAGGTTGCATGGCTTCCCCTACATGATAGTGTGTGGCTACCAATT
TTGTACTTGATGTAACAGCAGGGTTACTTGCATACACTTCCATAACCACATATATAATTA
ATTAATATCGTTCCTCAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case