cluster # 3624

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Oryza sativa
cluster # 3624 cluster # 3624 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3624#0 length = 862 sequences # 2

consensusID : consensus_3624#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 862
fasta sequence

                              [CACTGCCGATCTTGCTGCCATACACATTTGCTTGCAACAAGGGGCACTCGCGATATTCAGGCTCATGTACAGCATCGACCAATGACGCTCAGATCCTCACATTTCTCGTGGCACACTCTCAAGAGTCAAGACACAAAAAGAAGTTTGTTCCTTGCTGATGTTTCACGGTTTCTTGTAGGTATCATGCCAACAGGATGCTAAGCTTTTATGCTCCAGGTAAGCATATCTCGTGTACTCTATACCTGAATCTAATACCGAGCTAACGGTGCTGAACATTAATTTGTAATTACAAAATCGATGCCAGTCACTGGTTCACCCCTTCTGTGCTTGCTCTTTTGAATGCAACATGAGCAAATAAAGTTACATAAGTAGTATGTGTTGTATACATAACCTACATATGTACTAGCTTCCAGGATGCTGAATAAGTACCGTGTGTTGTACACATAAACTGCATATGCCGTTTTCAGGATGCTAAATAAGTAGTGTGTGTTGGTACACATAACCTGCATATGTAGCTTTCAGGATGCTGAATATGTAGTGTGTACTGTACACATAACCTTTATAGGCAGCTTAAAGGATGCTGTCATGATGAATAAGTGTATTTTGTACGCATAACTTGCAAATGCTGCTTCCAGGTGCTGAATAAGTAGTGTGTTTTGTACACATAACCTGCATATGCAGCTTCCGGGATGCTGAATTCTCTCTCATTTCAACTTATAATTGTTTCCTTCTGATGATTGTCAACATTTACTTGCTCTACCTGTCCTATGTCTGTTGAAATACTCCAACGACTACCAAATTTAACACCTTTAATCATTTCCAGTGGATGATAGTCACATTTCCTTGCTTGATCTATCCTTTA]

[+] EMBL CB627306             [CACTGCCGATCTTGCTGCCATACACATTTGCTTGCAACAAGGGGCACTCGCGATATTCAGGCTCATGTACAGCATCGACCAATGACGCTCAGATCCTCACATTTCTCGTGGCACACTCTCAAGAGTCAAGACACAAAAAGAAGTTTGTTCCTTGCTGATGTTTCACGGTTTCTTGTAGGTATCATGCCAACAGGATGCTAAGCTTTTATGCTCCAGGTAAGCATATCTCGTGTACTCTATACCTGAATCTAATACCGAGCTAACGGTGCTGAACATTAATTTGTAATTACAAAATCGATGCCAGTCACTGGTTCACCCCTTCTGTGCTTGCTCTTTTGAATGCAACATGAGCAAATAAAGTTACATAAGTAGTATGTGTTGTATACATAACCTACATATGTACTAGCTTCCAGGATGCTGAATAAGTACCGTGTGTTGTACACATAAACTGCATATGCCGTTTTCAGGATGCTAAATAAGTAGTGTGTGTTGGTACACATAACCTGCATATGTAGCTTTCAGGATGCTGAATATGTAGTGTGTACTGTACACATAACCTTTATAGGCAGCTTAAAGGATGCTGTCATGATGAATAAGTGTATTTTGTACGCATAACTTGCAAATGCTGCTTCCAGGTGCTGAATAAGTAGTGTGTTTTGTACACATAACCTGCATATGCAGCTTCCGGGATGCTGAATTCTCTCTCATTTCAACTTATAATTGTTTCCTTCTGATGATTGTCAACATTTACTTGCTCTACCTGTCCTATGTCTGTTGAAATACTCCAACGACTACCAAATTTAACACCTTTAATCATTTCCAGTGGATGATAGTCACATTTCCTTGCTTGATCTATCCTTTA]
[+] EMBL CB629551             [CACTGCAGATCTTGCTGCCATACACATTTGCTTGCAACAAGGGGCACTCGCGATATTCAGGCTCATGTACAGCATCGACCAATGACGCTCAGATCCTCACATTTCTCGTGGCACACTCTCAAGAGTCAAGACACAAAAAGAAGTTTGTTCCTTGCTGATGTTTCACGGTTTCTTGTAGGTATCATGCCAACAGGATGCTAAGCTTTTATGCTCCAGGTAAGCATATCTCGTGTACTCTATACCTGAATCTAATACCGAGCTAACGGTGCTGAACATTAATTTGTAATTACAAAATCGATGCCAGTCACTGGTTCACCCCTTCTGTGCTTGCTCTTTTGAATGCAACATGAGCAAATAAAGTTACATAAGTAGTATGTGTTGTATACATAACCTACATATGTACTAGCTTCCAGGATGCTGAATAAGTACCGTGTGTTGTACACATAAACTGCATATGCCGTTTTCAGGATGCTAAATAAGTAGTGTGTGTTGGTACACATAACCTGCATATGTAGCTTTCAGGATGCTGAATATGTAGTGTGTACTGTACACATAACCTTTATAGGCAGCTTAAAGGATGCTGTCATGATGAATAAGTGTATTTTGTACGCATAACTTGCAAATGCTGCTTCCAGGTGCTGAATAAGTAGTGTGTTTTGTACACATAACCTGCATATGCAGCTTCCGGGATGCTGAATTCTCTCTCATTTCAACTTATAATTGTTTCCTTCTGATGATTGTCAACATTTACTTGCTCTACCTGTCCTATGTCTGTTGAAATACTCCAACGACTACCAAATTTAACACCTTTAATCATTTCCAGTGGATGATAGTCACATTTCCTT                 ]




>consensus_3624#0
CACTGCCGATCTTGCTGCCATACACATTTGCTTGCAACAAGGGGCACTCGCGATATTCAG
GCTCATGTACAGCATCGACCAATGACGCTCAGATCCTCACATTTCTCGTGGCACACTCTC
AAGAGTCAAGACACAAAAAGAAGTTTGTTCCTTGCTGATGTTTCACGGTTTCTTGTAGGT
ATCATGCCAACAGGATGCTAAGCTTTTATGCTCCAGGTAAGCATATCTCGTGTACTCTAT
ACCTGAATCTAATACCGAGCTAACGGTGCTGAACATTAATTTGTAATTACAAAATCGATG
CCAGTCACTGGTTCACCCCTTCTGTGCTTGCTCTTTTGAATGCAACATGAGCAAATAAAG
TTACATAAGTAGTATGTGTTGTATACATAACCTACATATGTACTAGCTTCCAGGATGCTG
AATAAGTACCGTGTGTTGTACACATAAACTGCATATGCCGTTTTCAGGATGCTAAATAAG
TAGTGTGTGTTGGTACACATAACCTGCATATGTAGCTTTCAGGATGCTGAATATGTAGTG
TGTACTGTACACATAACCTTTATAGGCAGCTTAAAGGATGCTGTCATGATGAATAAGTGT
ATTTTGTACGCATAACTTGCAAATGCTGCTTCCAGGTGCTGAATAAGTAGTGTGTTTTGT
ACACATAACCTGCATATGCAGCTTCCGGGATGCTGAATTCTCTCTCATTTCAACTTATAA
TTGTTTCCTTCTGATGATTGTCAACATTTACTTGCTCTACCTGTCCTATGTCTGTTGAAA
TACTCCAACGACTACCAAATTTAACACCTTTAATCATTTCCAGTGGATGATAGTCACATT
TCCTTGCTTGATCTATCCTTTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case