cluster # 3640

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Oryza sativa
cluster # 3640 cluster # 3640 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3640#0 length = 810 sequences # 2

consensusID : consensus_3640#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 810
fasta sequence

                              [AAATTCTTCGGAGGAAACTCATTAAAAATTTTCATTTTCATTTTCCACTGTTTTTAATGCTTCCTTTCTATAAATGAGAAATGAGTCGTACTAATTGATTATCTTTAATCTGACAATATTAAGACAGGCGAAAGCATGTTCTGCGACTATCCAATCAACTGCATATAACAAATTTAATGTATTGTATATTGCGTAAAATAAAAAAACTCGCACACCTAATTAGGATAGTTAGCTTTAAACATCATTAGTCCTTTAGGATCAAGCATTCAAGTCACATTTTGTAATATCATTGTCAACTATTTTCTTGGATAGCTTAGCCCATATTGATATATTGAATGGCATTGTTGTTACTTCACCACAAGGAATTAATAATCACTTCAAGAAAATGGATGATATTAATCGTGACATTGAAATACTAAATAAGTAACCAATGAGAAATATATGCTGCCATATTGATGTTAGGTTTTATTTGTGCAAATTAAATATTTGATATTTCTATTGTCTTTGATTTGTTTCACTATTCCCTTGATTTTTTAGCACTATTTGGTGAAAACGATGTAGTTTAAAAACAAGCTGAAAGTATGATTTTAATATTATAGGTAGGCAGTAGCACATCAATTATTTTAGTCTACAGTTCGTAGTTTACAACAAAGATAATCATCCACCTGACATCGCTAAGGTAGGTGGAAGCACCCCTGATCCATCTTGTGCAGCCACCCAATTCACTCAATGGATGGCATTAATGCATATTTTAAAGTGATTTTACATACCTAAATAACGTATTGATGACAGGGGTATGATTTCACTATA]

[+] EMBL CB627947             [AAATTCTTCGGAGGAAACTCATTAAAAATTTTCATTTTCATTTTCCACTGTTTTTAATGCTTCCTTTCTATAAATGAGAAATGAGTCGTACTAATTGATTATCTTTAATCTGACAATATTAAGACAGGCGAAAGCATGTTCTGCGACTATCCAATCAACTGCATATAACAAATTTAATGTATTGTATATTGCGTAAAATAAAAAAACTCGCACACCTAATTAGGATAGTTAGCTTTAAACATCATTAGTCCTTTAGGATCAAGCATTCAAGTCACATTTTGTAATATCATTGTCAACTATTTTCTTGGATAGCTTAGCCCATATTGATATATTGAATGGCATTGTTGTTACTTCACCACAAGGAATTAATAATCACTTCAAGAAAATGGATGATATTAATCGTGACATTGAAATACTAAATAAGTAACCAATGAGAAATATATGCTGCCATATTGATGTTAGGTTTTATTTGTGCAAATTAAATATTTGATATTTCTATTGTCTTTGATTTGTTTCACTATTCCCTTGATTTTTTAGCACTATTTGGTGAAAACGATGTAGTTTAAAAACAAGCTGAAAGTATGATTTTAATATTATAGGTAGGCAGTAGCACATCAATTATTTTAGTCTACAGTTCGTAGTTTACAACAAAGATAATCATCCACCTGACATCGCTAAGGTAGGTGGAAGCACCCCTGATCCATCTTGTGCAGCCACCCAATTCACTCAATGGATGGCATTAATGCATATTTTAAAGTGATTTTACATACCTAAATAACGTATTGATGACAGGGGTATGATTTCACTATA]
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>consensus_3640#0
AAATTCTTCGGAGGAAACTCATTAAAAATTTTCATTTTCATTTTCCACTGTTTTTAATGC
TTCCTTTCTATAAATGAGAAATGAGTCGTACTAATTGATTATCTTTAATCTGACAATATT
AAGACAGGCGAAAGCATGTTCTGCGACTATCCAATCAACTGCATATAACAAATTTAATGT
ATTGTATATTGCGTAAAATAAAAAAACTCGCACACCTAATTAGGATAGTTAGCTTTAAAC
ATCATTAGTCCTTTAGGATCAAGCATTCAAGTCACATTTTGTAATATCATTGTCAACTAT
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TAAGTAACCAATGAGAAATATATGCTGCCATATTGATGTTAGGTTTTATTTGTGCAAATT
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TAGGCAGTAGCACATCAATTATTTTAGTCTACAGTTCGTAGTTTACAACAAAGATAATCA
TCCACCTGACATCGCTAAGGTAGGTGGAAGCACCCCTGATCCATCTTGTGCAGCCACCCA
ATTCACTCAATGGATGGCATTAATGCATATTTTAAAGTGATTTTACATACCTAAATAACG
TATTGATGACAGGGGTATGATTTCACTATA

clustalw multiple alignements is not computed in this case