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Oryza sativa
cluster # 3641 cluster # 3641       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3641#0 length = 1514 sequences # 2  

consensusID : consensus_3641#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1514
fasta sequence
                              [TGTGCTGTAGAAGATATGAACTGAAGTTGCCAATTGGGTGTGATCCTAAACAGTACATTGTTGACTTGATTCTAGAGTTGGAAGGTACTTTGGAGGCTCTGGGTGATTATTGTTTCCTGTGTCAGGGAGTATGGTCTGAATTCATAGTTGGCAATAATTTAGATTTTTTGAAGCAGCTAGAATTAACATCTGATAAGCTGGTGCAAGTAACCTCGAATCTAGTAAGAACATGTTATATGCAGAAGTTAGGAACTGGAGAGGAACACATACTCAAATTCAAATATGCTTGTAATGGATGGCCCACAAGGAAGTTCAGAAAGATGCCAAAGAATGATTGTAATGGACACTGGAAGATGTCTAGATTGTTTGTGAACCTACATTACTTCTCCTTTGGCTTATCGACTGCTAAAACAGTTCAAAAGGGCAGCTGCTATCTAAGGGGCTCTGACAAGGTGTTGTTAACTAAGTTGGAAATGCAGAGTTGTGTGAACCTGGGCGATGATAATGTTTCTTGTCACACGATGGCTCCTAGTGAAGGAATGGATTTTTGTGAGTTAAAAGTGCTTGAGGTAACAAGTGATGGATGCCCAATATTCTGGATTTTGGTTCTAGCAGCTACTGAATGG-AAGGTTGGAAATTATACAATTCTAACTGAAGGGACTTATACCAAGATGG-CTGTTTGTTCAGAGCAGAAATTACAATGTGATGCATTAAAAAGAAACCAGACAGGGGCAAAGCATGTTATCCAGAGGAACACATTTGTTGCTCCTGGGAATTTAGCCTACTCAGTAACCAACAACTATCTACCAGAAGGCAACAAACATAGAACTATGGCCACAAGGGTGAATGTTTTTGGACATGGTATCCACTCAACAGAAAACCAAGGATTTTATTCAGAAGGGATTCAGGTGCATTCGAGTGTCCAGAAAATTCCTGCTCTTGTACTGAACCGTGAATTAAGTATGGATTTTAGCAAAGATATTGCAGCTCCAATGAAATATGCTCTACAAGTTTCTGAATCTTTTGAGCTCAACAGGAGCAAAAAGGTACATGATCTATTCCATTTCGACGATGGTTTACTGTCTAGCAGCCAAGAATTGGAGCACCCATGGGATCCAGGAGGTTTGCTTCATCGGCTTGGGGACAAGACGATTTTCAAGGAGAGGGGATTGTTAGGACCGGATGGGCTATGGTTGGACCGTTACAACAATCCTCCAATCCAGCCCAAGAAGGCCCAGTTGGAGAGGCAACAAAAGCAGCAGCAGCAGGAAGGTTGGGGGCATCGATTGATCACTTGGACTTGGTGGAGCTGAAGCTCTCGACGGCGGCGGCGACCTGGGCAGCCGGTGGGCACCCTTGTCGATCTCTCTCCCCTACCTCTCCTCCTACTTACAGCCTTCTCTCTCAGCTCTAGAAGCTTCCAGAATTTGTATTACTTAGTTTCTTCTTCTCTTTTCATCCCAAAACAATTGTTCCTTGTATGGTGGATGCTTGCTATTAAGTTGAAAGAAGTG]

[+] EMBL AK063257             [TGTGCTGTAGAAGATATGAACTGAAGTTGCCAATTGGGTGTGATCCTAAACAGTACATTGTTGACTTGATTCTAGAGTTGGAAGGTACTTTGGAGGCTCTGGGTGATTATTGTTTCCTGTGTCAGGGAGTATGGTCTGAATTCATAGTTGGCAATAATTTAGATTTTTTGAAGCAGCTAGAATTAACATCTGATAAGCTGGTGCAAGTAACCTCGAATCTAGTAAGAACATGTTATATGCAGAAGTTAGGAACTGGAGAGGAACACATACTCAAATTCAAATATGCTTGTAATGGATGGCCCACAAGGAAGTTCAGAAAGATGCCAAAGAATGATTGTAATGGACACTGGAAGATGTCTAGATTGTTTGTGAACCTACATTACTTCTCCTTTGGCTTATCGACTGCTAAAACAGTTCAAAAGGGCAGCTGCTATCTAAGGGGCTCTGACAAGGTGTTGTTAACTAAGTTGGAAATGCAGAGTTGTGTGAACCTGGGCGATGATAATGTTTCTTGTCACACGATGGCTCCTAGTGAAGGAATGGATTTTTGTGAGTTAAAAGTGCTTGAGGTAACAAGTGATGGATGCCCAATATTCTGGATTTTGGTTCTAGCAGCTACTGAATGG AAGGTTGGAAATTATACAATTCTAACTGAAGGGACTTATACCAAGATGG CTGTTTGTTCAGAGCAGAAATTACAATGTGATGCATTAAAAAGAAACCAGACAGGGGCAAAGCATGTTATCCAGAGGAACACATTTGTTGCTCCTGGGAATTTAGCCTACTCAGTAACCAACAACTATCTACCAGAAGGCAACAAACATAGAACTATGGCCACAAGGGTGAATGTTTTTGGACATGGTATCCACTCAACAGAAAACCAAGGATTTTATTCAGAAGGGATTCAGGTGCATTCGAGTGTCCAGAAAATTCCTGCTCTTGTACTGAACCGTGAATTAAGTATGGATTTTAGCAAAGATATTGCAGCTCCAATGAAATATGCTCTACAAGTTTCTGAATCTTTTGAGCTCAACAGGAGCAAAAAGGTACATGATCTATTCCATTTCGACGATGGTTTACTGTCTAGCAGCCAAGAATTGGAGCACCCATGGGATCCAGGAGGTTTGCTTCATCGGCTTGGGGACAAGACGATTTTCAAGGAGAGGGGATTGTTAGGACCGGATGGGCTATGGTTGGACCGTTACAACAATCCTCCAATCCAGCCCAAGAAGGCCCAGTTGGAGAGGCAACAAAAGCAGCAGCAGCAGGAAGGTTGGGGGCATCGATTGATCACTTGGACTTGGTGGAGCTGAAGCTCTCGACGGCGGCGGCGACCTGGGCAGCCGGTGGGCACCCTTGTCGATCTCTCTCCCCTACCTCTCCTCCTACTTACAGCCTTCTCTCTCAGCTCTAGAAGCTTCCAGAATTTGTATTACTTAGTTTCTTCTTCTCTTTTCATCCCAAAACAATTGTTCCTTGTATGGTGGATGCTTGCTATTAAGTTGAAAGAAGTG]
[+] EMBL D43093               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAAGATGCCAAAGAATGATTGTAATGGACACTGGAAGATGTCTAGATTGTTTGTGAACCTACATTACTTCTCCTTTGGCTTATCGACTGCTAAAACAGTTCAAAAGGGCAGCTGCTATCTAAGGGGCTCTGACAAGGTGTTGTTAACTAAGTTGGAAATGCAGAGTTGTGTGAACCTGGGCGATGATAATGTTTCTTGTCACACGATGGCTCCTAGTGAAGGAATGGATTTTTGTGAGTTAAAAGTGCTTGAGGTAACAAGTGATGGATGCCCAATATTCTGGATTTTGGTTCTAGCAGCTACTGAATGGAAAGGTTGGAAATTATACAATTCTAACTGAAGGGCCTTNTTCCAAGATGGNTTGTTTGTTCAGAGCAGGAATTACAATGTGAT CATTAAAAAG NACCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]


>consensus_3641#0 TGTGCTGTAGAAGATATGAACTGAAGTTGCCAATTGGGTGTGATCCTAAACAGTACATTG TTGACTTGATTCTAGAGTTGGAAGGTACTTTGGAGGCTCTGGGTGATTATTGTTTCCTGT GTCAGGGAGTATGGTCTGAATTCATAGTTGGCAATAATTTAGATTTTTTGAAGCAGCTAG AATTAACATCTGATAAGCTGGTGCAAGTAACCTCGAATCTAGTAAGAACATGTTATATGC AGAAGTTAGGAACTGGAGAGGAACACATACTCAAATTCAAATATGCTTGTAATGGATGGC CCACAAGGAAGTTCAGAAAGATGCCAAAGAATGATTGTAATGGACACTGGAAGATGTCTA GATTGTTTGTGAACCTACATTACTTCTCCTTTGGCTTATCGACTGCTAAAACAGTTCAAA AGGGCAGCTGCTATCTAAGGGGCTCTGACAAGGTGTTGTTAACTAAGTTGGAAATGCAGA GTTGTGTGAACCTGGGCGATGATAATGTTTCTTGTCACACGATGGCTCCTAGTGAAGGAA TGGATTTTTGTGAGTTAAAAGTGCTTGAGGTAACAAGTGATGGATGCCCAATATTCTGGA TTTTGGTTCTAGCAGCTACTGAATGGAAGGTTGGAAATTATACAATTCTAACTGAAGGGA CTTATACCAAGATGGCTGTTTGTTCAGAGCAGAAATTACAATGTGATGCATTAAAAAGAA ACCAGACAGGGGCAAAGCATGTTATCCAGAGGAACACATTTGTTGCTCCTGGGAATTTAG CCTACTCAGTAACCAACAACTATCTACCAGAAGGCAACAAACATAGAACTATGGCCACAA GGGTGAATGTTTTTGGACATGGTATCCACTCAACAGAAAACCAAGGATTTTATTCAGAAG GGATTCAGGTGCATTCGAGTGTCCAGAAAATTCCTGCTCTTGTACTGAACCGTGAATTAA GTATGGATTTTAGCAAAGATATTGCAGCTCCAATGAAATATGCTCTACAAGTTTCTGAAT CTTTTGAGCTCAACAGGAGCAAAAAGGTACATGATCTATTCCATTTCGACGATGGTTTAC TGTCTAGCAGCCAAGAATTGGAGCACCCATGGGATCCAGGAGGTTTGCTTCATCGGCTTG GGGACAAGACGATTTTCAAGGAGAGGGGATTGTTAGGACCGGATGGGCTATGGTTGGACC GTTACAACAATCCTCCAATCCAGCCCAAGAAGGCCCAGTTGGAGAGGCAACAAAAGCAGC AGCAGCAGGAAGGTTGGGGGCATCGATTGATCACTTGGACTTGGTGGAGCTGAAGCTCTC GACGGCGGCGGCGACCTGGGCAGCCGGTGGGCACCCTTGTCGATCTCTCTCCCCTACCTC TCCTCCTACTTACAGCCTTCTCTCTCAGCTCTAGAAGCTTCCAGAATTTGTATTACTTAG TTTCTTCTTCTCTTTTCATCCCAAAACAATTGTTCCTTGTATGGTGGATGCTTGCTATTA AGTTGAAAGAAGTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)