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Oryza sativa
cluster # 3695 cluster # 3695       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3695#0 length = 794 sequences # 2  

consensusID : consensus_3695#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 794
fasta sequence
                              [AAATAACATTGAACATACATCTCTTTGTTGATTTGAGCAGTTTAGTTCGAGGGGTTTTTATATTATGTATTTGCTCTGTTTTCATATTGCAAATTATTCGACTTTATTTTTGTGTCCAGGGTTTTCGATTCTAAAAAAAAACTAT-GGGAACATAAATGGTAGAGGTGGTTTCCGTCCGTTTTCAAGCCGTCCAGTACGATGGATCCTTGTAGCCATACCTTTATCTTATATCAATCCCACAAGGACGTAGGATGGGTCTATTGTACTAAAATATACATGAAGTCTAGATTGTTTTGTGCAATTTTATATCCCAGCTCACTCCGACTATGGCACCTCCAACTCACTACCATATATATGTAGACCCTACAGATACTTGGGCCAACATGTTAGTGAGCAGTACTAAACATGAAATACTGAGATCTCAATTGTGAAAATAAGGATGAAAGTTTAAGTGCGGTGTTATGTGCATTGGGCCCATGATATTTCGACAAACTATATGGTACCAGTGTTTTGCTATAGAATATGTTGATAAATGTATGCTAAATATTATATATAGATGAATATAAGTTGAAATATTGTGAAAATGATGTGAGGATGATGATTTGATATGCTCTTGTATGTTGAGTTCTAGACTGAAACAAATTATAAATGATATTGCGTGCTTGCATGAGGTTTAAGATGTAATAATTGCTAGTTGATAATAATGTATCATGTTTAGATTGTACTTTTTTTTCTTACTGGGTGCATATATGACCGCGCAATTCATCAAGATTTAAATATTGGTGCTCTCATTT]

[+] EMBL CB630041             [AAATAACATTGAACATACATCTCTTTGTTGATTTGAGCAGTTTAGTTCGAGGGGTTTTTATATTATGTATTTGCTCTGTTTTCATATTGCAAATTATTCGACTTTATTTTTGTGTCCAGGGTTTTCGATTCTAAAAAAAAACTAT GGGAACATAAATGGTAGAGGTGGTTTCCGTCCGTTTTCAAGCCGTCCAGTACGATGGATCCTTGTAGCCATACCTTTATCTTATATCAATCCCACAAGGACGTAGGATGGGTCTATTGTACTAAAATATACATGAAGTCTAGATTGTTTTGTGCAATTTTATATCCCAGCTCACTCCGACTATGGCACCTCCAACTCACTACCATATATATGTAGACCCTACAGATACTTGGGCCAACATGTTAGTGAGCAGTACTAAACATGAAATACTGAGATCTCAATTGTGAAAATAAGGATGAAAGTTTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CB635082             [                                     CAGTTCATTTCGAGGGGTTTTTATATTATGTATTTGCTCTGTTTTCATATTGCAAATTATTCGACTTTATTTTTGTGTCCAGGGTTTTCGATTCTAAAAAAAAACTATCGGGAACATAAATGGTAGAGGTGGTTTCCGTCCGTTTTCAAGCCGTCCAGTACGATGGATCCTTGTAGCCATACCTTTATCTTATATCAATCCCACAAGGACGTAGGATGGGTCTATTGTACTAAAATATACATGAAGTCTAGATTGTTTTGTGCAATTTTATATCCCAGCTCACTCCGACTATGGCACCTCCAACTCACTACCATATATATGTAGACCCTACAGATACTTGGGCCAACATGTTAGTGAGCAGTACTAAACATGAAATACTGAGATCTCAATTGTGAAAATAAGGATGAAAGTTTAAGTGCGGTGTTATGTGCATTGGGCCCATGATATTTCGACAAACTATATGGTACCAGTGTTTTGCTATAGAATATGTTGATAAATGTATGCTAAATATTATATATAGATGAATATAAGTTGAAATATTGTGAAAATGATGTGAGGATGATGATTTGATATGCTCTTGTATGTTGAGTTCTAGACTGAAACAAATTATAAATGATATTGCGTGCTTGCATGAGGTTTAAGATGTAATAATTGCTAGTTGATAATAATGTATCATGTTTAGATTGTACTTTTTTTTCTTACTGGGTGCATATATGACCGCGCAATTCATCAAGATTTAAATATTGGTGCTCTCATTT]


>consensus_3695#0 AAATAACATTGAACATACATCTCTTTGTTGATTTGAGCAGTTTAGTTCGAGGGGTTTTTA TATTATGTATTTGCTCTGTTTTCATATTGCAAATTATTCGACTTTATTTTTGTGTCCAGG GTTTTCGATTCTAAAAAAAAACTATGGGAACATAAATGGTAGAGGTGGTTTCCGTCCGTT TTCAAGCCGTCCAGTACGATGGATCCTTGTAGCCATACCTTTATCTTATATCAATCCCAC AAGGACGTAGGATGGGTCTATTGTACTAAAATATACATGAAGTCTAGATTGTTTTGTGCA ATTTTATATCCCAGCTCACTCCGACTATGGCACCTCCAACTCACTACCATATATATGTAG ACCCTACAGATACTTGGGCCAACATGTTAGTGAGCAGTACTAAACATGAAATACTGAGAT CTCAATTGTGAAAATAAGGATGAAAGTTTAAGTGCGGTGTTATGTGCATTGGGCCCATGA TATTTCGACAAACTATATGGTACCAGTGTTTTGCTATAGAATATGTTGATAAATGTATGC TAAATATTATATATAGATGAATATAAGTTGAAATATTGTGAAAATGATGTGAGGATGATG ATTTGATATGCTCTTGTATGTTGAGTTCTAGACTGAAACAAATTATAAATGATATTGCGT GCTTGCATGAGGTTTAAGATGTAATAATTGCTAGTTGATAATAATGTATCATGTTTAGAT TGTACTTTTTTTTCTTACTGGGTGCATATATGACCGCGCAATTCATCAAGATTTAAATAT TGGTGCTCTCATTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)