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Oryza sativa
cluster # 3805 cluster # 3805       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3805#0 length = 1259 sequences # 2  

consensusID : consensus_3805#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1259
fasta sequence
                              [GGTCCTTGTGCACGTGACATCTACTACATCCGTCTCAAAATAAGTGCGGCCATAAGTTTCCACGCTCAACTTTGATCGTCCGTTCTACTTGATTTTTTTTATAATTAGTATTTTTATTGTTATGAAATGATAAAACGTGAATAGTACTTTGCTCGTGACTTATGTTTTTAATTTTTTTAAAAAAAATTAAATAAGATGAACAATCAAAGTTGGACATGGAAAATCATGGCTGCACTTATTTTGGGACAGAGGGAGTATTTGTTAATATATGAAATGATTAATTTTAATTTTGAATCCCACTATAGGGCTATGTAGTGTTAGTAGAAAATAATATAAATAATCGAAGTGATCATATATCTATTTATACTACAACCTCATTACATGGTAGTAGAAACGTGGAGCAATATTATTATAAGAAAAATGTGTGGAGAGACAATCATTATTTAGTAGTGACTTTTTTTTTTGCTTTTCGATGGAATATGAGCGATGTCATTGCCAGCGCAATGAATGACCTCGGATTGATCTAGCCATGATAAACATAAAAGATAAATTTGTCCCTCGTCATTGTATAAATAAATTGGATTGATCTAGCCATGAAAAACATAAAAGATAAATTTGTCCCTCGTCATTGTATAAATAAATTACTAACTTATTCTTAATAATGAACGGTTAATATTATTTTTATTGTAGTATAATACTACTTAGTANAGAGAGCATTGGAATCGTTCATTAGTTTTATTAGTGGTCTTTTTTAAAAAAAAATAAAACATAGATAGAAACTCACATGACCGCGACAACTAGAAGCTAGGTACTATGGGTATCGAGCGATCTCTCTCATCTCATTACAAATTGGGCAGTCGACCGACGGAGACTTGAACAACTTGATCCGGGGCTTACATGCATGCATGCACATCCATATCTAGATTTTGAAGGATTTAATTTTCTTGTGATTCGTGAGTTGTGATTACTTTTCTCATAGTCCATACAAGGACAAAATGTGATCAGTGCATGAAGCAATATACTTGGACATTTTTCAGAGTTTACTAGAACCTATAGGAAAAATAACTACGGCGGGTATTAATACGGATGAACTAATTAAAGATTTTCATTTGCATTATTTCCCCTGTACAACCATCTAACATCTTCCATTAAGAAAGATACCAATTTGTGTACCAATTTTATTTAACATTAATATTATGTACCAATTTGTGTGACTGTTCAATCTCTGTTTCCTAGGGCCAACTTGCTGTTGGATCTCC]

[+] EMBL CB633288             [GGTCCTTGTGCACGTGACATCTACTACATCCGTCTCAAAATAAGTGCGGCCATAAGTTTCCACGCTCAACTTTGATCGTCCGTTCTACTTGATTTTTTTTATAATTAGTATTTTTATTGTTATGAAATGATAAAACGTGAATAGTACTTTGCTCGTGACTTATGTTTTTAATTTTTTTAAAAAAAATTAAATAAGATGAACAATCAAAGTTGGACATGGAAAATCATGGCTGCACTTATTTTGGGACAGAGGGAGTATTTGTTAATATATGAAATGATTAATTTTAATTTTGAATCCCACTATAGGGCTATGTAGTGTTAGTAGAAAATAATATAAATAATCGAAGTGATCATATATCTATTTATACTACAACCTCATTACATGGTAGTAGAAACGTGGAGCAATATTATTATAAGAAAAATGTGTGGAGAGACAATCATTATTTAGTAGTGACTTTTTTTTTTGCTTTTCGATGGAATATGAGCGATGTCATTGCCAGCGCAATGAATGACCTCGGATTGATCTAGCCATGATAAACATAAAAGATAAATTTGTCCCTCGTCATTGTATAAATAAATTGGATTGATCTAGCCATGAAAAACATAAAAGATAAATTTGTCCCTCGTCATTGTATAAATAAATTACTAACTTATTCTTAATAATGAACGGTTAATATTATTTTTATTGTAGTATAATACTACTTAGTANAGAGAGCATTGGAATCGTTCATTAGTTTTATTAGTGGTCTTTTTTAAAAAAAAATAAAACATAGATAGAAACTCACATGACCGCGACAACTAGAAGCTAGGTACTATGGGTATCGAGCGATCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CB633289             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTAGTGAC TTTTTTTTTGCTTTTCGATGGAATATGAGCGATGTCATTGCCAGCGCAATGAATGACCTCGGATTGATCTAGCCATGATAAACATAAAAGATAAATTTGTCCCTCGTCATTGTATAAATAAATTGGATTGATCTAGCCATGAAAAACATAAAAGATAAATTTGTCCCTCGTCATTGTATAAATAAATTACTAACTTATTCTTAATAATGAACGGTTAATATTATTTTTATTGTAGTATAATACTACTTAGTAAAGAGAGCATTGGAATCGTTCATTAGTTTTATTAGTGGTCTTTTTTAAAAAAAAATAAAACATAGATAGAAACTCACATGACCGCGACAACTAGAAGCTAGGTACTATGGGTATCGAGCGATCTCTCTCATCTCATTACAAATTGGGCAGTCGACCGACGGAGACTTGAACAACTTGATCCGGGGCTTACATGCATGCATGCACATCCATATCTAGATTTTGAAGGATTTAATTTTCTTGTGATTCGTGAGTTGTGATTACTTTTCTCATAGTCCATACAAGGACAAAATGTGATCAGTGCATGAAGCAATATACTTGGACATTTTTCAGAGTTTACTAGAACCTATAGGAAAAATAACTACGGCGGGTATTAATACGGATGAACTAATTAAAGATTTTCATTTGCATTATTTCCCCTGTACAACCATCTAACATCTTCCATTAAGAAAGATACCAATTTGTGTACCAATTTTATTTAACATTAATATTATGTACCAATTTGTGTGACTGTTCAATCTCTGTTTCCTAGGGCCAACTTGCTGTTGGATCTCC]


>consensus_3805#0 GGTCCTTGTGCACGTGACATCTACTACATCCGTCTCAAAATAAGTGCGGCCATAAGTTTC CACGCTCAACTTTGATCGTCCGTTCTACTTGATTTTTTTTATAATTAGTATTTTTATTGT TATGAAATGATAAAACGTGAATAGTACTTTGCTCGTGACTTATGTTTTTAATTTTTTTAA AAAAAATTAAATAAGATGAACAATCAAAGTTGGACATGGAAAATCATGGCTGCACTTATT TTGGGACAGAGGGAGTATTTGTTAATATATGAAATGATTAATTTTAATTTTGAATCCCAC TATAGGGCTATGTAGTGTTAGTAGAAAATAATATAAATAATCGAAGTGATCATATATCTA TTTATACTACAACCTCATTACATGGTAGTAGAAACGTGGAGCAATATTATTATAAGAAAA ATGTGTGGAGAGACAATCATTATTTAGTAGTGACTTTTTTTTTTGCTTTTCGATGGAATA TGAGCGATGTCATTGCCAGCGCAATGAATGACCTCGGATTGATCTAGCCATGATAAACAT AAAAGATAAATTTGTCCCTCGTCATTGTATAAATAAATTGGATTGATCTAGCCATGAAAA ACATAAAAGATAAATTTGTCCCTCGTCATTGTATAAATAAATTACTAACTTATTCTTAAT AATGAACGGTTAATATTATTTTTATTGTAGTATAATACTACTTAGTANAGAGAGCATTGG AATCGTTCATTAGTTTTATTAGTGGTCTTTTTTAAAAAAAAATAAAACATAGATAGAAAC TCACATGACCGCGACAACTAGAAGCTAGGTACTATGGGTATCGAGCGATCTCTCTCATCT CATTACAAATTGGGCAGTCGACCGACGGAGACTTGAACAACTTGATCCGGGGCTTACATG CATGCATGCACATCCATATCTAGATTTTGAAGGATTTAATTTTCTTGTGATTCGTGAGTT GTGATTACTTTTCTCATAGTCCATACAAGGACAAAATGTGATCAGTGCATGAAGCAATAT ACTTGGACATTTTTCAGAGTTTACTAGAACCTATAGGAAAAATAACTACGGCGGGTATTA ATACGGATGAACTAATTAAAGATTTTCATTTGCATTATTTCCCCTGTACAACCATCTAAC ATCTTCCATTAAGAAAGATACCAATTTGTGTACCAATTTTATTTAACATTAATATTATGT ACCAATTTGTGTGACTGTTCAATCTCTGTTTCCTAGGGCCAACTTGCTGTTGGATCTCC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)