cluster # 4217

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 4217 cluster # 4217 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4217#0 length = 1878 sequences # 3
consensusID : consensus_4217#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1878
fasta sequence
                              [AGCTGCTCTCTCTTGCTCGTAGCGAGGTCGCAGATCCTCACCGCCGGCGATCCCCCGCCTCCGTTTCGGTACCGCCGCCGCCGCCGCCGCGAGAGAGGGGAGCAGAATGTTGCAGTGCGTCTTCCTCCTCTCTGATTCCGGGGAGGTGATGGTGGAGAAGCAGATGACGGCGCACCGCGTGGACCGCGGCATCTGCGGCTGGTTCTGGGACTACGTGCTCGCCCACGCCGCCGGCGACGCTTCCAAGGTCTTGCAGGTGGTGGTCTCACCGACGCATTACTTGTTTCAAGTTTATCGAAATGGGGTGACATTCTTGGCATGCACCCAAGTGGAGATGCCCCCGTTGTTGGCTATCGAGTTTCTCTCACGGGTTGCTGATGTCCTAACTGACTATCTTGGAGATTTAAATGAAGACATAATCAAAGACAACTTCGTACTTGTGTATCAGATTTTAGATGAGATGATGGACAACGGTTTTCCACTCACTACTGAGCCAGACATCTTGAAAGAGATGATTGCCCCACCAAATATTGTCAGCAAAATGTTGAATGTTGTGACTGGTAAGAGTTCTAATCTTGGTAACAAACTTCCAGATGCAGCTGCTTCTTTTGTACCATGGAGAACAACTGTTGTCAAGGATGCAAGTAATGAAGTCTATGTTAACATAGTTGAAGAACTAGATGCATGTGTAAACAGAGAAGGAGCTCTAGTGAAATGTGAAGCATATGGTAAAATTCAAGTAAATTCTAGCCTTCCAGGTGTACCAGAACTGACCTTGTCATTCTCTAATCCTACAATTATCAACGATGTGAGGTTTCACCCTTGTGTCCGATTCAGACCTTGGGAGTCCAATCAGATCCTTTCGTTTGTTCCCCCTGACGGGCAGTTCGAGCTCATGAGTTACAGAGTTAAGAAATTGAAGACCACACCAATTTATGTGAAACCTCAGTTAACATCAGATTCGGGGAATTGCCGTGTCAATGTGATGGTGGGGATTAAAAATGATCCTGGGAAAACTATTGATTCTATAACAGTGCAGTTTCGATTGCCCCCACTTATTGCTTCTGCTGATTTGACTGCAAACTATGGCACAGTTGATATTCTTGCTGACCAGACCTGCTTTTGGACAATAGGGCAGATTCCAAAAGACAAAGCCCCGTCTCTCTCTGGGAATTTACGCCTTGAAGAAGGGCTTACTCATTTGCATACATTCCCAACGTTTGAGGTGAAATTCAAGATTATGGGGGTTGCACTATCTGGGCTTCAAATTGATAAGCTGGAAGTCAAAAACACTCCCAATGCTCCTTACAAAGGTTTTCGAGCCCAGACTCAAGCCGGAAGGTATGAGGTCAGATCTTAAGTTTCTGTGTAATTCACAGCTGTTGTCTGCACGTCGA-AACCAACATGATACCATAACCCCGGGGGGTGGGCTGGCAAGGCATCACGATCAGTCAGTTCGTCCATGGGCAGTCTGCTCCCTAGATCAATCTTTCTTCTCCTCGTCGGCAAAGCCACAGAATCTTCGCTGTGTTTATGAAGGCGAAGATTTCTTCGTATAGATGTTCAGTGCCTGAGATCAAGATTTTGAGTTCTGCCATAT-CCCTTCTGTTCACCATCCATTTCACTGAGTAAATCTGTTAATGTTGAGTATTTCCTTTGAACTACACATTGAAAAGCGGTGGGTGTTTTTGAAGTGAATAGGTTTTGAACCCCCAACTCC--TCAACAACCAGGGCTATTATTTCCAT-GGGCGTC-ATAGCTGTTGTGTTTGCATTTGTAATTTGTAAACAGCTGTACAAAAATTAGCAGGTGCCTGTAACTCTTATTTAAAGGAAAAATACTACAACTAGTTTAGATGTGATCTGCAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK121835             [AGCTGCTCTCTCTTGCTCGTAGCGAGGTCGCAGATCCTCACCGCCGGCGATCCCCCGCCTCCGTTTCGGTACCGCCGCCGCCGCCGCCGCGAGAGAGGGGAGCAGAATGTTGCAGTGCGTCTTCCTCCTCTCTGATTCCGGGGAGGTGATGGTGGAGAAGCAGATGACGGCGCACCGCGTGGACCGCGGCATCTGCGGCTGGTTCTGGGACTACGTGCTCGCCCACGCCGCCGGCGACGCTTCCAAGGTCTTGCAGGTGGTGGTCTCACCGACGCATTACTTGTTTCAAGTTTATCGAAATGGGGTGACATTCTTGGCATGCACCCAAGTGGAGATGCCCCCGTTGTTGGCTATCGAGTTTCTCTCACGGGTTGCTGATGTCCTAACTGACTATCTTGGAGATTTAAATGAAGACATAATCAAAGACAACTTCGTACTTGTGTATCAGATTTTAGATGAGATGATGGACAACGGTTTTCCACTCACTACTGAGCCAGACATCTTGAAAGAGATGATTGCCCCACCAAATATTGTCAGCAAAATGTTGAATGTTGTGACTGGTAAGAGTTCTAATCTTGGTAACAAACTTCCAGATGCAGCTGCTTCTTTTGTACCATGGAGAACAACTGTTGTCAAGGATGCAAGTAATGAAGTCTATGTTAACATAGTTGAAGAACTAGATGCATGTGTAAACAGAGAAGGAGCTCTAGTGAAATGTGAAGCATATGGTAAAATTCAAGTAAATTCTAGCCTTCCAGGTGTACCAGAACTGACCTTGTCATTCTCTAATCCTACAATTATCAACGATGTGAGGTTTCACCCTTGTGTCCGATTCAGACCTTGGGAGTCCAATCAGATCCTTTCGTTTGTTCCCCCTGACGGGCAGTTCGAGCTCATGAGTTACAGAGTTAAGAAATTGAAGACCACACCAATTTATGTGAAACCTCAGTTAACATCAGATTCGGGGAATTGCCGTGTCAATGTGATGGTGGGGATTAAAAATGATCCTGGGAAAACTATTGATTCTATAACAGTGCAGTTTCGATTGCCCCCACTTATTGCTTCTGCTGATTTGACTGCAAACTATGGCACAGTTGATATTCTTGCTGACCAGACCTGCTTTTGGACAATAGGGCAGATTCCAAAAGACAAAGCCCCGTCTCTCTCTGGGAATTTACGCCTTGAAGAAGGGCTTACTCATTTGCATACATTCCCAACGTTTGAGGTGAAATTCAAGATTATGGGGGTTGCACTATCTGGGCTTCAAATTGATAAGCTGGAAGTCAAAAACACTCCCAATGCTCCTTACAAAGGTTTTCGAGCCCAGACTCAAGCCGGAAGGTATGAGGTCAGATCTTAAGTTTCTGTGTAATTCACAGCTGTTGTCTGCACGTCGA AACCAACATGATACCATAACCCCGGGGGGTGGGCTGGCAAGGCATCACGATCAGTCAGTTCGTCCATGGGCAGTCTGCTCCCTAGATCAATCTTTCTTCTCCTCGTCGGCAAAGCCACAGAATCTTCGCTGTGTTTATGAAGGCGAAGATTTCTTCGTATAGATGTTCAGTGCCTGAGATCAAGATTTTGAGTTCTGCCATAT CCCTTCTGTTCACCATCCATTTCACTGAGTAAATCTGTTAATGTTGAGTATTTCCTTTGAACTACACATTGAAAAGCGGTGGGTGTTTTTGAAGTGAATAGGTTTTGAACCCCCAACTCC  TCAACAACCAGGGCTATTATTTCCAT GGGCGTC ATAGCTGTTGTGTTTGCATTTGTAATTTGTAAACAGCTGTACAAAAATTAGCAGGTGCCTGTAACTCTTATTTAAAGGAAAAATACTACAACTAGTTTAGATGTGA                   ]
[+] EMBL C98884               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gntnCGANAACCAACATGATACCATAACCCCGGGGGGTGGGCTGGCAAGGCATCACGATCAGTCAGTTCGTCCATGGGCAGTCTGCTCCCTAGATCAATCTTTCTTCTCCTCGTCGGCAAAGCCACAGAATCTTCGCTGTGTTTATGAAGGCGAAGATTTCTTCGTATAGATGTTCAGTGCCTGAGATCAAGATTTTGAGTTCTGCCATAT CCCTTCTGTTCACCATCCATTTCACTGAGTAAATCTGTTAATGTTGAGTATTTCCTTTGAACTACACATTGAAAAGCGGTGGGTGTTTTTGAAGTGAATANGTTTTGAACCCCCAACTCCCTTCAACAACCAGGGGAATAATTTCCATGGGGGGTCNAAACCTGTGGGGTTGCCATTTGGAAat                                                                                                  ]
[+] EMBL C98885               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGTGTTTATGAAGNCGAAGA TTCTTCGTATAGATGTTCAGTGCCTGAGATCAAGATTTGGAGTTCTGCCATATCCCCTTCTGTTCACCATCCATTTCACTGAGTAAATCTGTTAATGTTGAGTATTTCCTTTGAACTACACATTGAAAAGCGGTGGGTGTTTTTGAAGTGAATAGGTTTTGAACCCCCAACTCC  TCAACAACCAGGGCTATTATTTCCAT GGGCGTC ATAGCTGTTGTGTTTGCATTTGTAATTTGTAAACAGCTGTACAAAAATTAGCAGGTGCCTGTAACTCTTATTTAAAGGAAAAATACTACAACTAGTTTAGATGTGATCTGCAAAAAAAAAAAAAA]




>consensus_4217#0
AGCTGCTCTCTCTTGCTCGTAGCGAGGTCGCAGATCCTCACCGCCGGCGATCCCCCGCCT
CCGTTTCGGTACCGCCGCCGCCGCCGCCGCGAGAGAGGGGAGCAGAATGTTGCAGTGCGT
CTTCCTCCTCTCTGATTCCGGGGAGGTGATGGTGGAGAAGCAGATGACGGCGCACCGCGT
GGACCGCGGCATCTGCGGCTGGTTCTGGGACTACGTGCTCGCCCACGCCGCCGGCGACGC
TTCCAAGGTCTTGCAGGTGGTGGTCTCACCGACGCATTACTTGTTTCAAGTTTATCGAAA
TGGGGTGACATTCTTGGCATGCACCCAAGTGGAGATGCCCCCGTTGTTGGCTATCGAGTT
TCTCTCACGGGTTGCTGATGTCCTAACTGACTATCTTGGAGATTTAAATGAAGACATAAT
CAAAGACAACTTCGTACTTGTGTATCAGATTTTAGATGAGATGATGGACAACGGTTTTCC
ACTCACTACTGAGCCAGACATCTTGAAAGAGATGATTGCCCCACCAAATATTGTCAGCAA
AATGTTGAATGTTGTGACTGGTAAGAGTTCTAATCTTGGTAACAAACTTCCAGATGCAGC
TGCTTCTTTTGTACCATGGAGAACAACTGTTGTCAAGGATGCAAGTAATGAAGTCTATGT
TAACATAGTTGAAGAACTAGATGCATGTGTAAACAGAGAAGGAGCTCTAGTGAAATGTGA
AGCATATGGTAAAATTCAAGTAAATTCTAGCCTTCCAGGTGTACCAGAACTGACCTTGTC
ATTCTCTAATCCTACAATTATCAACGATGTGAGGTTTCACCCTTGTGTCCGATTCAGACC
TTGGGAGTCCAATCAGATCCTTTCGTTTGTTCCCCCTGACGGGCAGTTCGAGCTCATGAG
TTACAGAGTTAAGAAATTGAAGACCACACCAATTTATGTGAAACCTCAGTTAACATCAGA
TTCGGGGAATTGCCGTGTCAATGTGATGGTGGGGATTAAAAATGATCCTGGGAAAACTAT
TGATTCTATAACAGTGCAGTTTCGATTGCCCCCACTTATTGCTTCTGCTGATTTGACTGC
AAACTATGGCACAGTTGATATTCTTGCTGACCAGACCTGCTTTTGGACAATAGGGCAGAT
TCCAAAAGACAAAGCCCCGTCTCTCTCTGGGAATTTACGCCTTGAAGAAGGGCTTACTCA
TTTGCATACATTCCCAACGTTTGAGGTGAAATTCAAGATTATGGGGGTTGCACTATCTGG
GCTTCAAATTGATAAGCTGGAAGTCAAAAACACTCCCAATGCTCCTTACAAAGGTTTTCG
AGCCCAGACTCAAGCCGGAAGGTATGAGGTCAGATCTTAAGTTTCTGTGTAATTCACAGC
TGTTGTCTGCACGTCGAAACCAACATGATACCATAACCCCGGGGGGTGGGCTGGCAAGGC
ATCACGATCAGTCAGTTCGTCCATGGGCAGTCTGCTCCCTAGATCAATCTTTCTTCTCCT
CGTCGGCAAAGCCACAGAATCTTCGCTGTGTTTATGAAGGCGAAGATTTCTTCGTATAGA
TGTTCAGTGCCTGAGATCAAGATTTTGAGTTCTGCCATATCCCTTCTGTTCACCATCCAT
TTCACTGAGTAAATCTGTTAATGTTGAGTATTTCCTTTGAACTACACATTGAAAAGCGGT
GGGTGTTTTTGAAGTGAATAGGTTTTGAACCCCCAACTCCTCAACAACCAGGGCTATTAT
TTCCATGGGCGTCATAGCTGTTGTGTTTGCATTTGTAATTTGTAAACAGCTGTACAAAAA
TTAGCAGGTGCCTGTAACTCTTATTTAAAGGAAAAATACTACAACTAGTTTAGATGTGAT
CTGCAAAAAAAAAAAAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case