cluster # 4281

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 4281 cluster # 4281 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4281#0 length = 711 sequences # 3

consensusID : consensus_4281#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 711
fasta sequence

                              [CCGATTCTTCTCCTTCTCCTTCTTCTTCTTCCTCCTCTCATTATTCGCTGTGCCAGCTATGGTTAATTGCCNAAGATGAAATTAAGCAGCTAGCCGGGAATCGCCGGCGGCCTGACATTGGGATCGGAGGCCATGGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGATCGATCGATCTATCTATGAAGCTAAGCTAGCTGGCCATGGATCCATCCATCAATTGGCAAGTTGTTCTTGGCTACATCTTGGCCCCTGCTCCTCATGTAAGGCCGGCCTGTGGCGACGACGATCGAAGGCGAGCGCTTCAGCTTTGTTAATTAGCTCTTGTTCTTGGCCAAATCC-ACGCAATATTTGCAAGCCTAATCGCAGNCGTGAAGTTAATTTGATGATCAGTTAGCTTAATTAGTTATAATGTTGCTGCCATTGCATGCGTATTTCAGATCGAGCGTACTGTATCATGTTAATTAGTAATCATGTTCTTCTATAATTTAACTTCAATTTGATAAGTACTACCTCCTCCANCCAAAAGTCTAATCTATTCTAGAAAAAAATCTGGATGTATGGCGTTCATATTTACCTTTAGCATTGGACTTCTAGAGACAGAGGGAACAGTATATGCAGCGATTAGTTAGCGTATAGATGAACATTGACGAACCATCATTAACCATCTGTAGCTAGTCGTAGTACATCTCTGCTTGGCTGGCTTGGCTTTGTCTTTT]

[+] EMBL BQ906497             [CCGATTCTTCTCCTTCTCCTTCTTCTTCTTCCTCCTCTCATTATTCGCTGTGCCAGCTATGGTTAATTGCCNAAGATGAAATTAAGCAGCTAGCCGGGAATCGCCGGCGGCCTGACATTGGGATCGGAGGCCATGGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGATCGATCGATCTATCTATGAAGCTAAGCTAGCTGGCCATGGATCCATCCATCAATTGGCAAGTTGTTCTTGGCTACATCTTGGCCCCTGCTCCTCATGTAAGGCCGGCCTGTGGCGACGACGATCGAAGGCGAGCGCTTCAGCTTTGTTAATTAGCTCTTGTTCTTGGCCAAATCC ACGCAATATTTGCAAGCCTAATCGCAGNCGTGAAGTTAATTTGATGATCAGTTAGCTTAATTAGTTATAATGTTGCTGCCATTGCATGCGTATTTCAGATCGAGCGTACTGTATCATGTTAATTAGTAATCATGTTCTTCTATAATTTAACTTCAATTTGATAAGTACTACCTCCTCCANCCAAAAGTCTAATCTATTCTAGAAAAAA                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CF280503             [       TTCTCCTTCTCCTTCTTCTTCTTCCTCCTCTCATTATTCGCTGTGCCAGCTATGGTTAATTGCCAAAGATGAAATTAAGCAGCTAGCCGGGAATCGCCGGCGGCCTGACATTGGGATCGGAGGCCATGGTGCAGCCAAGGATGACTTGC    CGATCGATCTATCTATGAAGCTAAGCTAGCTGGCCATGGATCCATCCATCAATTGGCAAGTTGTTCTTGGCTACATCTTGGCCCCTGCTCCTCATGTAAGGCCGGCCTGTGGCGACGACGATCGAAGGCGAGCGCTTCAGCTTTGTTAATTAGCTCTTGTTCTTGGCCAAATCCAACGCAAT TTTGCAAGCCTAATCGCAG TGT AAGTTAATTTGATGATCAGTTAGCTTAATTAGTTATAAT TTGCTGCCATT CATGCGTATTTCAGATCGAGCGTACTGTATCATGTTAATTAGTAATCATGTTCTTCT                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CB238467             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATCATGTTAATTAGTAATCATGTTCTTCTATAATTTAACTTCAATTTGATAAGTACTACCTCCTCTATAAAAAAGTCTAATCTATTCTAGAAATGAATCTGGATGTATGGCGTTCATATTTACCTTTAGCATTGGACTTCTAGAGACAGAGGGAACAGTATATGCAGCGATTAGTTAGCGTATAGATGAACATTGACGAACCATCATTAACCATCTGTAGCTAGTCGTAGTACATCTCTGCTTGGCTGGCTTGGCTTTGTCTTTT]




>consensus_4281#0
CCGATTCTTCTCCTTCTCCTTCTTCTTCTTCCTCCTCTCATTATTCGCTGTGCCAGCTAT
GGTTAATTGCCNAAGATGAAATTAAGCAGCTAGCCGGGAATCGCCGGCGGCCTGACATTG
GGATCGGAGGCCATGGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGATCGATCGATCTATCTATGAAG
CTAAGCTAGCTGGCCATGGATCCATCCATCAATTGGCAAGTTGTTCTTGGCTACATCTTG
GCCCCTGCTCCTCATGTAAGGCCGGCCTGTGGCGACGACGATCGAAGGCGAGCGCTTCAG
CTTTGTTAATTAGCTCTTGTTCTTGGCCAAATCCACGCAATATTTGCAAGCCTAATCGCA
GNCGTGAAGTTAATTTGATGATCAGTTAGCTTAATTAGTTATAATGTTGCTGCCATTGCA
TGCGTATTTCAGATCGAGCGTACTGTATCATGTTAATTAGTAATCATGTTCTTCTATAAT
TTAACTTCAATTTGATAAGTACTACCTCCTCCANCCAAAAGTCTAATCTATTCTAGAAAA
AAATCTGGATGTATGGCGTTCATATTTACCTTTAGCATTGGACTTCTAGAGACAGAGGGA
ACAGTATATGCAGCGATTAGTTAGCGTATAGATGAACATTGACGAACCATCATTAACCAT
CTGTAGCTAGTCGTAGTACATCTCTGCTTGGCTGGCTTGGCTTTGTCTTTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case