cluster # 4438

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Oryza sativa
cluster # 4438 cluster # 4438 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4438#0 length = 641 sequences # 3

consensusID : consensus_4438#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 641
fasta sequence

                              [GAGCCCGTCTTCTTGGTGCGAGATCCAGGTTCCCGAGCAGGCCATGGGTGGTGTCTACAGTGTCCTTACCCGCCGCCGTGGTATGGTCTTCAACGAGGAGCAGCGTCCCGGTACTCCTCTGTTCACCATCAAGGCCTACCTTCCCGTCATGGAGTCTTTCGGTTTCAACGCCGATCTGCGCCAGGGTACCTCTGGCCAGGCCTTCCCCCAGTCCGTCTTCGACCACTGGCAGGTTCTGCAGGGTGGTTCTCCCCTCGACGCCACCTCCAAGACCGGTACCGTCGTCCAGAACACCAGGAAGC-GCAAGGGTCTCAAGCCCGAGGTTCCCGGTGTCGAGAACTACTACGACAAGTTGTAAACGGCTTTTGGCCAAGTTGGTATACCCGATCCTTGATCCTTTCTCTAGCATCACTCAGCAGGGCAGGCTCCACTGGCAATGAGCGCCAGTCAGGTTCCCATTTTCTCGGCGGTCGGTGGTACAAAAAAGCGGAATGGACGTATCTTTGGAGGGCTGTTTGAACAGCATATGAGGATGGCGGTGGAAGATGAGCACGTCGCTACTGGCGTCCTTAGATACGATCTGCTTGTCTTGTAGAACTTTATTTGCATTATGAACGCGTTGATGACA-CTA---AAAAAAAAAA]

[+] EMBL BQ907452             [GAGCCCGTCTTCTTGGTGCGAGATCCAGGTTCCCGAGCAGGCCATGGGTGGTGTCTACAGTGTCCTTACCCGCCGCCGTGGTATGGTCTTCAACGAGGAGCAGCGTCCCGGTACTCCTCTGTTCACCATCAAGGCCTACCTTCCCGTCATGGAGTCTTTCGGTTTCAACGCCGATCTGCGCCAGGGTACCTCTGGCCAGGCCTTCCCCCAGTCCGTCTTCGACCACTGGCAGGTTCTGCAGGGTGGTTCTCCCCTCGACGCCACCTCCAAGACCGGTACCGTCGTCCAGAACACCAGGAAGC GCAAGGGTCTCAAGCCCGAGGTTCCCGGTGTCGAGAACTACTACGACAAGTTGTAAACGGCTTTTGGCCAAGTTGGTATACCCGATCCTTGATCCTTTCTCTAGCATCACTCAGCAGGGCAGGCTCCACTGGCAATGAGCGCCAGTCAGGTTCCCATTTTCTCGGCGGTCGGTGGTACAAAAAAGCGGAATGGACGTATCTTTGGAGGGCTGTTTGAACAGCATATGAGGATGGCGGTGGAAGATGAGCACGTCGCTACTGGCGTCCTTAGATACGATCTGCTTGTCTTGTAGAACTTTATTTGCATTATGAACGCGTTGATGACA CTA   AAAAAA    ]
[+] EMBL BI813307             [                                                                                   TGGTCTTCAACGA GA CAGCGTCCCGGTACTCCTCTGTTCACCATCAA GCCTACCTTCCCGTCATGGAGTCTTTCGGTTTCAACGCCGATCTGCG CAGGGTACCTCTGGCCA GCCTTCCCCCAGTCCGTCTTCGACCACTGGCAGGTTCTGCA GGTGGTTCTCCCCTCGACGCCACCTCCAAGACCGGTACCGTCGTCCAGAACACCAGGAAGC GCAAGGGTCTCAAGCCCGAGGTTCCCGGTGTCGAGAACTACTACGACAAGTTGTAAACGGCTTTTTGCCAAGTTGGTATACCCGATCCTTGATCCTTTCTCTAGCATCACTCAGCAGGGCAGGCTCCACTGGCAATGAGCGCCAGTCAGGTTCCCATTTTCTCGGCGGTCGGTGGTACCAAAAAGCGGAATGGACGTATCTTTGGAGGGCTGTTTGAACAGCATATGAGGATGGCGGTGGAAGATGAGCACGTCGCTACTGGCGTCCTTAGATACGATCTGCTTGTCTTGTAGAACTTTATTTGCATTATGAACGCGTTGATGACACCTAGTTAAAAAAAAAA]
[+] EMBL BQ908158             [                                                                                                                                                                                                                                                       TCTCCCCTGGACGCCACCTCCAAGACCGGTACCGTCGTCCAGAACACCAGGAAGCTGCAAGGGTCTCAAGCCCGAGGTTCCCGGTGTCGAGAACTACTACGACAAGTTGTAAACGGCTTTT GCCAAGTTGGTATACCCGATCCTTGATCCTTTCTCTAGCATCACTCAGCAGGGCAGGCTCCACTGGCAATGAGCGCCAGTCAGGTTCCCATTTTCTCGGCGGTCGGTGGTAC AAAAAGCGGAATGGACGTATCTTTGGA GGCTGTTTGAACAGCATATGAGGATGGCGGTGGAAGATGAGCACGTCGCTACTGGCGTCCTTAGATACGATCTGCTTGTCTTGTAGAACTTTATTTGCATTATGAACGCGTTGATGACA CTA   AAAA      ]




>consensus_4438#0
GAGCCCGTCTTCTTGGTGCGAGATCCAGGTTCCCGAGCAGGCCATGGGTGGTGTCTACAG
TGTCCTTACCCGCCGCCGTGGTATGGTCTTCAACGAGGAGCAGCGTCCCGGTACTCCTCT
GTTCACCATCAAGGCCTACCTTCCCGTCATGGAGTCTTTCGGTTTCAACGCCGATCTGCG
CCAGGGTACCTCTGGCCAGGCCTTCCCCCAGTCCGTCTTCGACCACTGGCAGGTTCTGCA
GGGTGGTTCTCCCCTCGACGCCACCTCCAAGACCGGTACCGTCGTCCAGAACACCAGGAA
GCGCAAGGGTCTCAAGCCCGAGGTTCCCGGTGTCGAGAACTACTACGACAAGTTGTAAAC
GGCTTTTGGCCAAGTTGGTATACCCGATCCTTGATCCTTTCTCTAGCATCACTCAGCAGG
GCAGGCTCCACTGGCAATGAGCGCCAGTCAGGTTCCCATTTTCTCGGCGGTCGGTGGTAC
AAAAAAGCGGAATGGACGTATCTTTGGAGGGCTGTTTGAACAGCATATGAGGATGGCGGT
GGAAGATGAGCACGTCGCTACTGGCGTCCTTAGATACGATCTGCTTGTCTTGTAGAACTT
TATTTGCATTATGAACGCGTTGATGACACTAAAAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case