These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_4501#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 537 fasta sequence [GTNCCCCGTGGCTGGNCTTCGGCCAGACCTTNAGCGGGGCCNAGTTCAACTGATTCCGCTCAATTTTACTCGAGCATCGTCGTGGTAGTTGCAGTAGTACTCCCAACTGGACCGTGCTGGGAAGTGCCATTGTTTTATGATTGGTACTCAGTCTCGCCTTGGTTCTTGGGAAAGTATTTAGTGGGTAGTTTGGCCTAGTATCAACATGGGCTTTGTGCTGGTGTCACTGCTAGTGGTAGTTTGTTACAAGTACCATTAGTTGAGCTTTTGTGGTATCTTTTGGCTAGGGATTGGAAGTGGTGGTAAGGCT-GTGGCTTGATTG-ACAGAGGCCGCCTTGTATCACCCGCCAAAATAGCAAAATTGGGCCTAATGGGAATGGCCTTCTGCTAGTAATGGTTTTGCCTGGTTGTTGTCTGTACC-GGACCCCAGTACCGGACCTCATTTTGGGGGTGCCAAACAGTTTAGGCATCTGGGGTATGCCCTGTGTGC-TGCTTATGAACAATTTCTTTTTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL AU078691 [GTNCCCCGTGGCTGGNCTTCGGCCAGACCTTNAGCGGGGCCNAGTTCAACTGATTCCGCTCAATTTTACTCGAGCATCGTCGTGGTAGTTGCAGTAGTACTCCCAACTGGACCGTGCTGGGAAGTGCCATTGTTTTATGATTGGTACTCAGTCTCGCCTTGGTTCTTGGGAAAGTATTTAGTGGGTAGTTTGGCCTAGTATCAACATGGGCTTTGTGCTGGTGTCACTGCTAGTGGTAGTTTGTTACAAGTACCATTAGTTGAGCTTTTGTGGTATCTTTTGGCTAGGGATTGGAAGTGGTGGTAAGGCT GTGGCTTGATTG ACAGAGGCCGCCTTGTATCACCCGCCAAAATAGCAAAATTGGGCCTAATGGGAATGGCCTTCTGCTAGTAATGGTTTTGCCTGGTTGTTGTCTGTACC GGACCCCAGTACCGGACCTCATTTTGGGGGTGCCAAACAGTTTAGGCATCTGGGGTATGCCCTGTGTGC TGCTTATGAACAATTTCTTTTTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [-] EMBL CB645780 [ TCGGCCAGACCTTCAGCGGGGCCCAGTTCAACTGATTCCGCTCAATTTTACTCGAGCATCGTCGTGGTAGTTGCAGTAGTACTCCCAACTGGACCGTGCTGGGAAGTGCCATTGTTTTATGATTGGTACTCAGTCTCGCCTTGGTTCTTGGGAAAGTATTTAGTGGGTAGTTTGGCCTAGTATCAACATGGGCTTTGTGCTGGTGTCACTGCTAGTGGTAGTTTGTTACAAGTACCATTAGTTGAGCTTTTGTGGTATCTTTTGGCTAGGGATTGGAAGTGGTGGTAAGGCT GTGGCTTGATTG ACAGAGGCCGCCTTGTATCACCCGCCAAAATAGCAAAATTGGGCCTAATGGGAATGGCCTTATGCTAGTAATGGTTTTGCCTGGTTGTTGTCTGTACC GGACCCCAGTACCGGACCTCATTTTGGGGGTGCCAAACAGTAAGGGCATCTGGG ] [+] EMBL AU183760 [ ntTCTTTTGGCTAGGNATTGAAAGTGGTGGTAAGGCTCGTGGCTTNATTGAACAAAGGCCGCCNTG ATCACCCNCCAAAATAAGAAAATTGGGCCTAATGGGAATGGCCTTCTCCNAGTAATGGTTTTGCCTGGTTGTTGTTTGTACCGGGACCCCAGTACCGGACCTCATTTTGGGGGTGCCAAACAGTTTAGGCATCTGGGGTATGCCCTGTGTGCTTGCTTATGAACAATTTCTTTTTA AAAAAAAAAAAAAAAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||