cluster # 4514

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Oryza sativa
cluster # 4514 cluster # 4514 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4514#0 length = 700 sequences # 3

consensusID : consensus_4514#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 700
fasta sequence

                              [ACAAATCACAGCTGCTGCTGCTGCTGCTCTGCTCCCCTCCTACCACCTGCCCTTTTGCCCCCACGCACAACACACGTCGTCAGCCTCTGCCTTTCACGCTGCCGCCGCCGCCGCGAGCCTGAGCTCCGGTCTCCTCGCTCTGCACCGACTGTCTGCGTCATCAGCTCCGGCCACGGCGTGGCGATGGACAGTCTGAACACGAAGCTGTACCTGCAGAACTGCTACATGCTCAAGGAGAACGAGCGGCTGCGCAAGGCGGCCGTGCTTCTCAACCAGGAGAACCAGGCCCTGCTCTCCGAGCTCAAGCACCGCCTCGCCAGGTCGCCGTCGCCGGCCGCCGCGGCACCCGGCGTCGCCAACGACAGCAAGAACGCCGCCGCCGCCGCCGGCCGCCACGCTGGCCCGCCTCCGGTGCAGGACAAGTCAGCCTCCAAGTCCAAGTAGGCTATAGCCACGAGCTCACAGCTGCTTGGTCACAGAGAAGCGGATGCTTGCTTGAGCCACTGTGGATGCATGGTGATGGTGCTGCAGGTGTTTGGGGGTGTGTGTGTTTTAACTTTAGCCGTGGATGTCAACTAGGAAGGCGTTTTTAATTACTTTCAGTTGCTGAATTCTGGATTCTCTGCTCACTGGTATGTAGTCTTAACATGATATCCTTGTAATGGATAGCCAGGTTAATTGGAGGTACATATACATAGCT]

[+] EMBL AK107488             [ACAAATCACAGCTGCTGCTGCTGCTGCTCTGCTCCCCTCCTACCACCTGCCCTTTTGCCCCCACGCACAACACACGTCGTCAGCCTCTGCCTTTCACGCTGCCGCCGCCGCCGCGAGCCTGAGCTCCGGTCTCCTCGCTCTGCACCGACTGTCTGCGTCATCAGCTCCGGCCACGGCGTGGCGATGGACAGTCTGAACACGAAGCTGTACCTGCAGAACTGCTACATGCTCAAGGAGAACGAGCGGCTGCGCAAGGCGGCCGTGCTTCTCAACCAGGAGAACCAGGCCCTGCTCTCCGAGCTCAAGCACCGCCTCGCCAGGTCGCCGTCGCCGGCCGCCGCGGCACCCGGCGTCGCCAACGACAGCAAGAACGCCGCCGCCGCCGCCGGCCGCCACGCTGGCCCGCCTCCGGTGCAGGACAAGTCAGCCTCCAAGTCCAAGTAGGCTATAGCCACGAGCTCACAGCTGCTTGGTCACAGAGAAGCGGATGCTTGCTTGAGCCACTGTGGATGCATGGTGATGGTGCTGCAGGTGTTTGGGGGTGTGTGTGTTTTAACTTTAGCCGTGGATGTCAACTAGGAAGGCGTTTTTAATTACTTTCAGTTGCTGAATTCTGGATTCTCTGCTCACTGGTATGTAGTCTTAACATGATATCCTTGTAATGGATAGCCAGGTTAATTGGAGGTACATATACATAGCT]
[+] EMBL AU064503             [                GCTGCTGCTGCTCTGCTCCCCTCCTACCACCTGCCCTTTTGCCCCCACGCACAACACACGTCGTCAGCCTCTGCCTTTCACGCTGCCGCCGCCGNCGCGAGCCTGAGCTCCGGTCTCCTCGCTCTGCACCGACTGTCTGCGTCATCAGCTCCGGCCACGGCGTGGCGATGGACAGTCTGAACACGAAGCTGTACCTGCAGAACTGCTACATGCTCAAGGAGAACGAGCGGCTGCCCAAGGCGGCCGTGCTTCTCAACCAGGAGAACCAGGCCCTGCTCTTCGAGCTCAAGCACCGTCTCGGCAGGTCGCCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL AU094782             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAGTCCAAGTAGGCTATAGCCACGAGCTCNCAGCTGCTTGGTCACAGAGAAGCGGATGCTTGCTTGAGCCACTGTGGATGCATGGTGATGGTGCTGCAGGTGTTTGGGGGTGTGTGTGTTTTAACTTTAGCCGTGGATGTCAACTAGGAAGGCGTTTTTAATTACTTTCAGTTGCTGAATTCTGGATTCTCTGCTCACTGGTATGTAGTCTTAACATGATATCCTTGTAATGGATAGCCAGGTTAATTGGAGGTACAaaaa       ]




>consensus_4514#0
ACAAATCACAGCTGCTGCTGCTGCTGCTCTGCTCCCCTCCTACCACCTGCCCTTTTGCCC
CCACGCACAACACACGTCGTCAGCCTCTGCCTTTCACGCTGCCGCCGCCGCCGCGAGCCT
GAGCTCCGGTCTCCTCGCTCTGCACCGACTGTCTGCGTCATCAGCTCCGGCCACGGCGTG
GCGATGGACAGTCTGAACACGAAGCTGTACCTGCAGAACTGCTACATGCTCAAGGAGAAC
GAGCGGCTGCGCAAGGCGGCCGTGCTTCTCAACCAGGAGAACCAGGCCCTGCTCTCCGAG
CTCAAGCACCGCCTCGCCAGGTCGCCGTCGCCGGCCGCCGCGGCACCCGGCGTCGCCAAC
GACAGCAAGAACGCCGCCGCCGCCGCCGGCCGCCACGCTGGCCCGCCTCCGGTGCAGGAC
AAGTCAGCCTCCAAGTCCAAGTAGGCTATAGCCACGAGCTCACAGCTGCTTGGTCACAGA
GAAGCGGATGCTTGCTTGAGCCACTGTGGATGCATGGTGATGGTGCTGCAGGTGTTTGGG
GGTGTGTGTGTTTTAACTTTAGCCGTGGATGTCAACTAGGAAGGCGTTTTTAATTACTTT
CAGTTGCTGAATTCTGGATTCTCTGCTCACTGGTATGTAGTCTTAACATGATATCCTTGT
AATGGATAGCCAGGTTAATTGGAGGTACATATACATAGCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case