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Oryza sativa
cluster # 460 cluster # 460       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_460#0 length = 1006 sequences # 2  

consensusID : consensus_460#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1006
fasta sequence
                              [CCCCGCGATTCCCTCCACTCCCCACTCGGCAGCTCGCCATTCCACCACCACCGCGCCGCCGCGGCGCATCGGGCCATGGCGCCCGCCGCCGCCGCCGCGTGCGCCGCCTCCGTCCGCGCCGACCCGCCGGGCATCCTCGACTACGGCGCCATCCACGCCTGCCTCCTGGGCGGGGACCGCCGCGCCTCCCTCCCGGCGCTCGCGCTCCTCCTCCTCCTCCACTTCCGCGTCCTCGCCGCCGCCGCGGGGACCCACTTCTCCCCCGCGGTCTCCCGCCTCGCGGCCCGCCTCCGCCTCTCCCCGTCCATGGCCGCCGTCACGCTCCTCGCGCTCGGCAACGGCGCCCCCGATGCGTTCGCCTCCGCCGCCGCGCTCGGCGGGGCCGGCGGGATGCGGCGTGCGGGGCTCGCCGCGATCCTCTCCGCCGGAGCCTTCGTCTCCGCGTTCGTCGTCGGGGCCGTCGCGCTCATCGCCGCGCCGTTCGCTGTCCCGCCCGCGTCGTTCGCCCGCGACGTCTTCTTCTACCTCCTCGCCGCCTCCGGCCTCTTCTACATCTACCTTAGCGCCGAGATATACCTCTGGCAGGCCATCGGGCTCGTGCTCTTCTACGTCTTCTTCGTGGGCTTAGTGGTATACATGGATTTGGATGCTGAGGGGAAGGCGGTGAGCACCACCGAGCTGGAGGTGGTGAATGGCATTGGTCGCGTGGTGATGGACTTGCCGGTAACAGTGGAGGATCGCAAGCAACAACACCCTACTTTGTGCACGATGTTCAGTAAGTTGCTGCAGAGCAATGGTTCATTTCGATGGGGATGGTTCACGAGGTGCAAGATGCCTCCAGGCTGCAATACAACTTCTTATCTTGGCAGCTGATGCATACAGCCCTTCACACTGAATTGGCTTGTACTGGTCTGGCATGTTCCTGTGGATTCTTCTGTACCTTCATTTTACGAGTTCATGAGTTCAGGCCAGAGGGGAGATCTTGCTGGCGATGTGCATCAGTGCA]

[+] EMBL AK108267             [CCCCGCGATTCCCTCCACTCCCCACTCGGCAGCTCGCCATTCCACCACCACCGCGCCGCCGCGGCGCATCGGGCCATGGCGCCCGCCGCCGCCGCCGCGTGCGCCGCCTCCGTCCGCGCCGACCCGCCGGGCATCCTCGACTACGGCGCCATCCACGCCTGCCTCCTGGGCGGGGACCGCCGCGCCTCCCTCCCGGCGCTCGCGCTCCTCCTCCTCCTCCACTTCCGCGTCCTCGCCGCCGCCGCGGGGACCCACTTCTCCCCCGCGGTCTCCCGCCTCGCGGCCCGCCTCCGCCTCTCCCCGTCCATGGCCGCCGTCACGCTCCTCGCGCTCGGCAACGGCGCCCCCGATGCGTTCGCCTCCGCCGCCGCGCTCGGCGGGGCCGGCGGGATGCGGCGTGCGGGGCTCGCCGCGATCCTCTCCGCCGGAGCCTTCGTCTCCGCGTTCGTCGTCGGGGCCGTCGCGCTCATCGCCGCGCCGTTCGCTGTCCCGCCCGCGTCGTTCGCCCGCGACGTCTTCTTCTACCTCCTCGCCGCCTCCGGCCTCTTCTACATCTACCTTAGCGCCGAGATATACCTCTGGCAGGCCATCGGGCTCGTGCTCTTCTACGTCTTCTTCGTGGGCTTAGTGGTATACATGGATTTGGATGCTGAGGGGAAGGCGGTGAGCACCACCGAGCTGGAGGTGGTGAATGGCATTGGTCGCGTGGTGATGGACTTGCCGGTAACAGTGGAGGATCGCAAGCAACAACACCCTACTTTGTGCACGATGTTCAGTAAGTTGCTGCAGAGCAATGGTTCATTTCGATGGGGATGGTTCACGAGGTGCAAGATGCCTCCAGGCTGCAATACAACTTCTTATCTTGGCAGCTGATGCATACAGCCCTTCACACTGAATTGGCTTGTACTGGTCTGGCATGTTCCTGTGGATTCTTCTGTACCTTCATTTTACGAGTTCATGAGTTCAGGCCAGAGGGGAGATCTTGCTGGCGATGTGCATCAGTGCA]
[+] EMBL AU181285             [             TCCACTCCCCACTCGGCAGCTCGCCATTCCACCACCACCGCGCCGCCGCGGCGCATCGGGCCATGGCGCCCGCCGCCGCCGCCGCGTGCGCCGCCTCCGTCCGCGCCGACCCGCCGGGCATCCTCGACTACGGCGCCATCCACGCCTGCCTCCTGGGCGGGGACCGCCGCGCCTCCCTCCCGGCGCTCGCGCTCCTCCTCCTCCTCCACTTCCGCGTCCTCGCCGCCGCCGCGGGGACCCACTTCTCCCCCGCGGTCTCCCGCCTCGCGGCCCGCCTCCGCCTCTCCCCGTCCATGGCCGCCGTCACGCTCCTCGCGCTCGGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]


>consensus_460#0 CCCCGCGATTCCCTCCACTCCCCACTCGGCAGCTCGCCATTCCACCACCACCGCGCCGCC GCGGCGCATCGGGCCATGGCGCCCGCCGCCGCCGCCGCGTGCGCCGCCTCCGTCCGCGCC GACCCGCCGGGCATCCTCGACTACGGCGCCATCCACGCCTGCCTCCTGGGCGGGGACCGC CGCGCCTCCCTCCCGGCGCTCGCGCTCCTCCTCCTCCTCCACTTCCGCGTCCTCGCCGCC GCCGCGGGGACCCACTTCTCCCCCGCGGTCTCCCGCCTCGCGGCCCGCCTCCGCCTCTCC CCGTCCATGGCCGCCGTCACGCTCCTCGCGCTCGGCAACGGCGCCCCCGATGCGTTCGCC TCCGCCGCCGCGCTCGGCGGGGCCGGCGGGATGCGGCGTGCGGGGCTCGCCGCGATCCTC TCCGCCGGAGCCTTCGTCTCCGCGTTCGTCGTCGGGGCCGTCGCGCTCATCGCCGCGCCG TTCGCTGTCCCGCCCGCGTCGTTCGCCCGCGACGTCTTCTTCTACCTCCTCGCCGCCTCC GGCCTCTTCTACATCTACCTTAGCGCCGAGATATACCTCTGGCAGGCCATCGGGCTCGTG CTCTTCTACGTCTTCTTCGTGGGCTTAGTGGTATACATGGATTTGGATGCTGAGGGGAAG GCGGTGAGCACCACCGAGCTGGAGGTGGTGAATGGCATTGGTCGCGTGGTGATGGACTTG CCGGTAACAGTGGAGGATCGCAAGCAACAACACCCTACTTTGTGCACGATGTTCAGTAAG TTGCTGCAGAGCAATGGTTCATTTCGATGGGGATGGTTCACGAGGTGCAAGATGCCTCCA GGCTGCAATACAACTTCTTATCTTGGCAGCTGATGCATACAGCCCTTCACACTGAATTGG CTTGTACTGGTCTGGCATGTTCCTGTGGATTCTTCTGTACCTTCATTTTACGAGTTCATG AGTTCAGGCCAGAGGGGAGATCTTGCTGGCGATGTGCATCAGTGCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)