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Oryza sativa
cluster # 4697 cluster # 4697       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4697#0 length = 1624 sequences # 3  
consensusID : consensus_4697#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1624
fasta sequence 
                              [TCTTCCTCCTCCTCCTCCCCGGTTCGCCGGCGACGCCCTCACCACCGGTGGCCGGTGGGCGGTGGCGCCAACCCCCATCCATGGACCCTCCACGGAGGCAACGCCGCGTGTCTAGGAGGGCTCGGATGGCCCCGCCCCCTCTGCACGTCGAACTGCCCTTCATGGATCGGCAAATACTAGTCTCACGCAATTCTCGCGGGTATTTCGCCTTGGGATACAGTCTTCCCGGCGAGCCGTTCCCAAGCTTGCATGAGCTCTTGGGCGCAATCTATGACCACTATCACCCCCAGAGGGAGTCCCGTGATCCAGCCCCGCCGCCCCTGCTTCCACAGTGTGAGGAGCATGTTGAAGGCAATACTCAGCTTTCATTAGAACAAACGCTTGAAGAACCAGAAGTTGCAACCATGGAGGAGTCGCCTGAACCTACAACATTAGGAGATCCATTTACTGCTACTACCTCTTCCTTACCATCCGCACCACATGGCACTAGCGAGGTCTCACCATCATCAAGGCTCCGCCATCACACTTCTCCTGAATCAACCATTTGGACAAGAGACCCTGCTGACTGGCCATGGATATATCACATTAGGATGGATCGTGGAGGATCTTTTCACACATATCCTGCTCTAGATGGACCATTTCTGAACTTATATGAAGCTGAGGATGCTATCAATCGTCATCTTGAGAGCCTGAAGTGTCCAATGTTCAAGGAGCAAGATGGAGTTTCTCCTGTGGAGAGGATGATACAAAAATCACTTTATTGGCCTGATGGTACTAGAAAGAAATATTCCAGATCACAAGCTAGTCAAAACGTTGATAAGAGAAGACGTCAAATGGTTCAAGTGCTATTAGACAAGTATAATGATGATCATGACCTTGTTGAGGATCTTGCTTATGAGCTTCAAGATGTTGTTCACTATCAATTGATTGTTGAGGGAATTAAGTGGTTCAATCACTTCAATTTCACAGCAAAGACCAGTGGAGCTGATATTGACAATTTATTTTTTGCTGAAGTGATGTCTTCGCAAGGGGAGGAAGATTGGGTAGTGACTTGTTGCTGCTTGATTAAATCTGCTGATAATGGTATCTGCTATGGTTGCAAGAACGATCGAAATCTGGATATGAAGCACCCAAATGATAGCGATACATATGTGGGCGGTCACAAGGACATAGTTATGCCATTTGAAACTGAAAATTGGACTGAATCTGAATCTGATGATGATGAGGATGAGGAAGAGGAAGTGAAGGCGAGTAGGATAAGAAGGATGATTGAGGGTCTTGATGATTCAGATGAACCAGAAGATATTTTTGATCCAGTTTTCAAGCCATGAGTTGGAACTGCATCTTTACATTTCTACACTATTAACCTATCTTAAGTTTATTTAAACATAAATTTTGAGTTTCAAATTTTAGAATAGAGTAACGGAATGTAAATTCTCATGTATGCGTTGACATATAACCTTACACCTCGTCGTCCATTTCTGCCTACCGTGGCTTTGGTTCTTAATGGATGGTCGTAATGGTGTAGTGTTTTATTTGAAATGTTTTTTTTCTTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK071534             [TCTTCCTCCTCCTCCTCCCCGGTTCGCCGGCGACGCCCTCACCACCGGTGGCCGGTGGGCGGTGGCGCCAACCCCCATCCATGGACCCTCCACGGAGGCAACGCCGCGTGTCTAGGAGGGCTCGGATGGCCCCGCCCCCTCTGCACGTCGAACTGCCCTTCATGGATCGGCAAATACTAGTCTCACGCAATTCTCGCGGGTATTTCGCCTTGGGATACAGTCTTCCCGGCGAGCCGTTCCCAAGCTTGCATGAGCTCTTGGGCGCAATCTATGACCACTATCACCCCCAGAGGGAGTCCCGTGATCCAGCCCCGCCGCCCCTGCTTCCACAGTGTGAGGAGCATGTTGAAGGCAATACTCAGCTTTCATTAGAACAAACGCTTGAAGAACCAGAAGTTGCAACCATGGAGGAGTCGCCTGAACCTACAACATTAGGAGATCCATTTACTGCTACTACCTCTTCCTTACCATCCGCACCACATGGCACTAGCGAGGTCTCACCATCATCAAGGCTCCGCCATCACACTTCTCCTGAATCAACCATTTGGACAAGAGACCCTGCTGACTGGCCATGGATATATCACATTAGGATGGATCGTGGAGGATCTTTTCACACATATCCTGCTCTAGATGGACCATTTCTGAACTTATATGAAGCTGAGGATGCTATCAATCGTCATCTTGAGAGCCTGAAGTGTCCAATGTTCAAGGAGCAAGATGGAGTTTCTCCTGTGGAGAGGATGATACAAAAATCACTTTATTGGCCTGATGGTACTAGAAAGAAATATTCCAGATCACAAGCTAGTCAAAACGTTGATAAGAGAAGACGTCAAATGGTTCAAGTGCTATTAGACAAGTATAATGATGATCATGACCTTGTTGAGGATCTTGCTTATGAGCTTCAAGATGTTGTTCACTATCAATTGATTGTTGAGGGAATTAAGTGGTTCAATCACTTCAATTTCACAGCAAAGACCAGTGGAGCTGATATTGACAATTTATTTTTTGCTGAAGTGATGTCTTCGCAAGGGGAGGAAGATTGGGTAGTGACTTGTTGCTGCTTGATTAAATCTGCTGATAATGGTATCTGCTATGGTTGCAAGAACGATCGAAATCTGGATATGAAGCACCCAAATGATAGCGATACATATGTGGGCGGTCACAAGGACATAGTTATGCCATTTGAAACTGAAAATTGGACTGAATCTGAATCTGATGATGATGAGGATGAGGAAGAGGAAGTGAAGGCGAGTAGGATAAGAAGGATGATTGAGGGTCTTGATGATTCAGATGAACCAGAAGATATTTTTGATCCAGTTTTCGAGCCATGAGTTGGAACTGCATCTTTACATTTCTACACTATTAACCTATCTTAAGTTTATTTAAACATAAATTTTGAGTTTCAAATTTTAGAATAGAGTAACGGAATGTAAATTCTCATGTATGCGTTGACATATAACCTTACACCTCGTCGTCCATTTCTGCCTACCGTGGCTTTGGTTCTTAATGGATGGTCGTAATGGTGTAGTGTTTTATTTGAAATGTTT                                                                             ]
[+] EMBL CA766445             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aggggCAAATGGTT NAGTGCTATTAGACAAGTATAATGATGATCCTGACCTTGTTGAGNATCTTGCTTATGAGCTTCAAGATGTTGTTCACTATCAATTGATTGTTGAGGGAATTAAGTGGTTCAATCACTTCAATTTCACAGCAAAGACCAGTGGAGCTGATATTGACAATTTATTTTTTGCTGAAGTGATGTCTTCGCAAGGGGAGGAAGATTGGGTAGTGACTTGTTGCTGCTTGATTAAATCTGCTGATAATGGTATCTGCTATGGTTGCAAGAACGATCGAAATCTGGATATGAAGCACCCAAATGATAGCGATACATATGTGGGCGGTCACAAGGACATAGTTATGCCATTTGAAACTGAAAATTGGACTGAATCTGAATCTGATGATGATGAGGATGAGGAAGAGGAAGTGAAGGCGAGTAGGATAAGAAGGATGATTGAGGGTCTTGATGATTCAGATGAACCAGAAGATATTTTTGATCCAGTTTTCAAGCCATGAGTTGGAACTGCATCTTTACATTTCTACACTATTAACCTATCTTAAGTTTATTTAAACATAAATTTTGAGTTTCAGATTTTAGAATAGAGTAACGGAATGTAAATTCTCATGTATGCGTTGACATATAACCTTACACCTCGTCGTCCATTTCTGCCTACCGTGGCTTTGGTTCTTAATGGATGGTCGTAATGGTGTAGTG                                                                                              ]
[+] EMBL CF328482             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TCCAGTTTTCAAGCCATGAGTTGGAACTGCATCTTTACATTTCTACACTATTAACCTATCTTAAGTTTATTTAAACATAAATTTTGAGTTTCAAATTTTAGAATAGAGTAACGGAATGTAAATTCTCATGTATGCGTTGACATATAACCTTACACCTCGTCGTCCATTTCTGCCTACCGTGGCTTTGGTTCTTAATGGATGGTCGTAATGGTGTAGTGTTTTATTTGAAATGTTTTTTTTCTTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]




>consensus_4697#0
TCTTCCTCCTCCTCCTCCCCGGTTCGCCGGCGACGCCCTCACCACCGGTGGCCGGTGGGC
GGTGGCGCCAACCCCCATCCATGGACCCTCCACGGAGGCAACGCCGCGTGTCTAGGAGGG
CTCGGATGGCCCCGCCCCCTCTGCACGTCGAACTGCCCTTCATGGATCGGCAAATACTAG
TCTCACGCAATTCTCGCGGGTATTTCGCCTTGGGATACAGTCTTCCCGGCGAGCCGTTCC
CAAGCTTGCATGAGCTCTTGGGCGCAATCTATGACCACTATCACCCCCAGAGGGAGTCCC
GTGATCCAGCCCCGCCGCCCCTGCTTCCACAGTGTGAGGAGCATGTTGAAGGCAATACTC
AGCTTTCATTAGAACAAACGCTTGAAGAACCAGAAGTTGCAACCATGGAGGAGTCGCCTG
AACCTACAACATTAGGAGATCCATTTACTGCTACTACCTCTTCCTTACCATCCGCACCAC
ATGGCACTAGCGAGGTCTCACCATCATCAAGGCTCCGCCATCACACTTCTCCTGAATCAA
CCATTTGGACAAGAGACCCTGCTGACTGGCCATGGATATATCACATTAGGATGGATCGTG
GAGGATCTTTTCACACATATCCTGCTCTAGATGGACCATTTCTGAACTTATATGAAGCTG
AGGATGCTATCAATCGTCATCTTGAGAGCCTGAAGTGTCCAATGTTCAAGGAGCAAGATG
GAGTTTCTCCTGTGGAGAGGATGATACAAAAATCACTTTATTGGCCTGATGGTACTAGAA
AGAAATATTCCAGATCACAAGCTAGTCAAAACGTTGATAAGAGAAGACGTCAAATGGTTC
AAGTGCTATTAGACAAGTATAATGATGATCATGACCTTGTTGAGGATCTTGCTTATGAGC
TTCAAGATGTTGTTCACTATCAATTGATTGTTGAGGGAATTAAGTGGTTCAATCACTTCA
ATTTCACAGCAAAGACCAGTGGAGCTGATATTGACAATTTATTTTTTGCTGAAGTGATGT
CTTCGCAAGGGGAGGAAGATTGGGTAGTGACTTGTTGCTGCTTGATTAAATCTGCTGATA
ATGGTATCTGCTATGGTTGCAAGAACGATCGAAATCTGGATATGAAGCACCCAAATGATA
GCGATACATATGTGGGCGGTCACAAGGACATAGTTATGCCATTTGAAACTGAAAATTGGA
CTGAATCTGAATCTGATGATGATGAGGATGAGGAAGAGGAAGTGAAGGCGAGTAGGATAA
GAAGGATGATTGAGGGTCTTGATGATTCAGATGAACCAGAAGATATTTTTGATCCAGTTT
TCAAGCCATGAGTTGGAACTGCATCTTTACATTTCTACACTATTAACCTATCTTAAGTTT
ATTTAAACATAAATTTTGAGTTTCAAATTTTAGAATAGAGTAACGGAATGTAAATTCTCA
TGTATGCGTTGACATATAACCTTACACCTCGTCGTCCATTTCTGCCTACCGTGGCTTTGG
TTCTTAATGGATGGTCGTAATGGTGTAGTGTTTTATTTGAAATGTTTTTTTTCTTGGAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)