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Oryza sativa
cluster # 4749 cluster # 4749       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4749#0 length = 2079 sequences # 3  

consensusID : consensus_4749#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 2079
fasta sequence
                              [TTTTCACTTATCTTCTGCCATTTGATGGTTTAAAGTACAGTTACCAGTATGGTAAATATTATTTCTTTTCAGAAATAACTGAGCGGTGATTATGTATTGCTTTAATTTCATCTGTCTTGTGCCTTCTGACTGGTTCTATTTGTGCTTTACGTCATTCACCTGAATGAGACTAGACCATTTTTTAGTTTATCTTTTCTATGAAGGATTTACCCATTTAGGTTATAGACTACTACATTGAAATGATTTGACTTCTCAGCATTATTGTCATGACCAGAGTTTTCATAATAAACTGATGAACACTAGAGATGTTTCCAAGAAGTGGGTTTAATGAGATCTTAGCTGTTTCATGCCTGATGCTGTAGTTTTAAGCTAATATAATTAAAATCTAGTATCCTGTTGTAATTGCCCCCTATATATAATAGCCCACGTCAATACCAAGGAGCCAATGAGTTTTCTGATTTTATAATTTAACTGCAAGGAATCAAACTGTACTTAGGTCTTACGCGATGTAACGAAAAGGGGAATAAATAAGTGCCTGTTTTTGGCATGCATAATTCAAAGCTTGATGAAAGCATTGACCTGCATAGCTATAATAATTGTTACGTGGTTGTCCAAACTACTGCTACAGGCTGCTGTTTCAAGTTATTCTCAATTCAATTTTCATATGGGCTGCTATTTCAATTGGTCTTTCCTGACTGTGGAAAAAATGAAATAATGTAGAGATGACATTGGGCCAGCGCCTTGTAGAGATGACATAATCTGAGCAATGTAATGTTCAGAAGTTAAATGTTTCTAGTAGGTCTAGTTTGATGGATCACACCGAGTCTAGCTTGATGGGTCACACTGAGTCTAGTTTGACATATTTAAGATACAATTGTTGTGGCTACAGTTGCCTTTTGCATTCCTCCTCAATTTACTGGATACATCCTAAACCAGATTTGGATGCTATTCCATTACATCTCTAAGTTAAACCCAAGTTCGATATCTCTTATGCTACTCCATTTGCAGAAAGTATATTATTGAATTTTCTGTGCATCTACAACTTGTAAGTCTCGAGCAATTTGCTTTGTTATTGCTGAATGCATTATGTCGTTGCATACTTGAAAAACTGAGAATTGCACATTCAAATATCTAGATATAACTTGCATTTATCAATAGTTGTTTGATATGCTAAAATCCTGGCAGGTGCCTGCCAGTTGCTGCCATTGGAAAATTTTCCCTGGTAGGCCGAAGTAGCTATGGTGCTGATGATGAGGGCATGGTACTTCTCTTGCAATTATGTGTTGTTTGAATTTGAAACTTCTTGAACCTTAAGAGAAACTTTTTTGATGAAAACATCAGACTTCAGAGGAAACTGGTCGAAAAGAAAATCTGATTGCACGTGCATATTCAGTCAACTATCTCATGTTCAGCATGATGGAGGCAGTTACGAGTTTCAGAACTCATGACCTATCTGTTGTACATTTGTTGACATTTGCATTAAACAATACCGTATGAAGTTAGTACCATTTAAATCAAGCAGAGACAGAAACCCAAATTGGATCTGAAAAGGAGTCCATGTTGGGTGGTAGGGGGTGACCCACCCCTTTCAACCCAAATGATATGAGCCTACTTCAAATTAAGTAAAAGGTACTTTACCGGAGTCCTGTTTATCCAATTGTTACGTTTACGCAAAAGCGTTGAATTTATATGTTTCTAAACTGTGTCTATGTCCTAGTCAGCCAGAAACCAGCAGTTAGATATTCCCCTTTATTTTACCAGCTACAGGATAGGTGTTCTTTGGTCATATTTGCTCGTCTACTTTACTCATGTCCATGATCAACTGTTTGTATGAGATAATCCTATTTAAAGGGCAACTTGATTAACTTGGACAAGATCCATAGCTACGTTTTGTTTCTAAATAATGAACTGACTTATTGCTCTCCATTTTTTTTTTTCTGTCAACATGGTTGTGCTCTATTGGTTTGCAGTTGCAGCCAAACTAAGGTACAGTTTGTTTATTCATCTATTCTCCTATCCTATATTACGTCCTGTAACTTCTTGAAGGTTTGGAAATTAGATACATGTATACAGCTAGGT]

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[-] EMBL CB638578             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCATGGTACTTCTCTTGCAATTATGTGTTGTTTGAATTTGAAACTTCTTGAACTTTAAGAGAAACTTTTTTGATGAAAACATCAGACTTCAGAGGAAACTGGTCGAAAAGAAAATCTGATTGCACGTGCATATTCAGTCAACTATCTCATGTTCAGCATGATGGAGGCAGTTACGAGTTTCAGAACTCATGACCTATCTGTTGTACATTTGTTGACATTTGCATTAAACAATACCGTATGAAGTTAGTACCATTTAAATCAAGCAGAGACAGAAACCCAAATTGGATCTGAAAAGGAGTCCATGTTGGGTGGTAGGGGGTGACCCACCCCTTTCAACCCAAATGATATGAGCTTACTTCAAATTAAGTAAAAGGTACTTTACCGGAGTCCTGTTTATCCAATTGTTACGTTTACGCAAAAGCGTTGAATTTATATGTTTCTAAACTGTGTCTATGTCCTAGTCAGCCAGAAACCAGCAGTTAGATATTCCCCTTTATTTTACCAGCTACAGGATAGGTGTTCTTTGGTCATATTTGCTCGTCTACTTTACTCATGTCCATGATCAACTGTTTGTATGAGATAAT CTATTTAAAGGGCAACTTGATTAACTTG                                                                                                                                                                                                                  ]


>consensus_4749#0 TTTTCACTTATCTTCTGCCATTTGATGGTTTAAAGTACAGTTACCAGTATGGTAAATATT ATTTCTTTTCAGAAATAACTGAGCGGTGATTATGTATTGCTTTAATTTCATCTGTCTTGT GCCTTCTGACTGGTTCTATTTGTGCTTTACGTCATTCACCTGAATGAGACTAGACCATTT TTTAGTTTATCTTTTCTATGAAGGATTTACCCATTTAGGTTATAGACTACTACATTGAAA TGATTTGACTTCTCAGCATTATTGTCATGACCAGAGTTTTCATAATAAACTGATGAACAC TAGAGATGTTTCCAAGAAGTGGGTTTAATGAGATCTTAGCTGTTTCATGCCTGATGCTGT AGTTTTAAGCTAATATAATTAAAATCTAGTATCCTGTTGTAATTGCCCCCTATATATAAT AGCCCACGTCAATACCAAGGAGCCAATGAGTTTTCTGATTTTATAATTTAACTGCAAGGA ATCAAACTGTACTTAGGTCTTACGCGATGTAACGAAAAGGGGAATAAATAAGTGCCTGTT TTTGGCATGCATAATTCAAAGCTTGATGAAAGCATTGACCTGCATAGCTATAATAATTGT TACGTGGTTGTCCAAACTACTGCTACAGGCTGCTGTTTCAAGTTATTCTCAATTCAATTT TCATATGGGCTGCTATTTCAATTGGTCTTTCCTGACTGTGGAAAAAATGAAATAATGTAG AGATGACATTGGGCCAGCGCCTTGTAGAGATGACATAATCTGAGCAATGTAATGTTCAGA AGTTAAATGTTTCTAGTAGGTCTAGTTTGATGGATCACACCGAGTCTAGCTTGATGGGTC ACACTGAGTCTAGTTTGACATATTTAAGATACAATTGTTGTGGCTACAGTTGCCTTTTGC ATTCCTCCTCAATTTACTGGATACATCCTAAACCAGATTTGGATGCTATTCCATTACATC TCTAAGTTAAACCCAAGTTCGATATCTCTTATGCTACTCCATTTGCAGAAAGTATATTAT TGAATTTTCTGTGCATCTACAACTTGTAAGTCTCGAGCAATTTGCTTTGTTATTGCTGAA TGCATTATGTCGTTGCATACTTGAAAAACTGAGAATTGCACATTCAAATATCTAGATATA ACTTGCATTTATCAATAGTTGTTTGATATGCTAAAATCCTGGCAGGTGCCTGCCAGTTGC TGCCATTGGAAAATTTTCCCTGGTAGGCCGAAGTAGCTATGGTGCTGATGATGAGGGCAT GGTACTTCTCTTGCAATTATGTGTTGTTTGAATTTGAAACTTCTTGAACCTTAAGAGAAA CTTTTTTGATGAAAACATCAGACTTCAGAGGAAACTGGTCGAAAAGAAAATCTGATTGCA CGTGCATATTCAGTCAACTATCTCATGTTCAGCATGATGGAGGCAGTTACGAGTTTCAGA ACTCATGACCTATCTGTTGTACATTTGTTGACATTTGCATTAAACAATACCGTATGAAGT TAGTACCATTTAAATCAAGCAGAGACAGAAACCCAAATTGGATCTGAAAAGGAGTCCATG TTGGGTGGTAGGGGGTGACCCACCCCTTTCAACCCAAATGATATGAGCCTACTTCAAATT AAGTAAAAGGTACTTTACCGGAGTCCTGTTTATCCAATTGTTACGTTTACGCAAAAGCGT TGAATTTATATGTTTCTAAACTGTGTCTATGTCCTAGTCAGCCAGAAACCAGCAGTTAGA TATTCCCCTTTATTTTACCAGCTACAGGATAGGTGTTCTTTGGTCATATTTGCTCGTCTA CTTTACTCATGTCCATGATCAACTGTTTGTATGAGATAATCCTATTTAAAGGGCAACTTG ATTAACTTGGACAAGATCCATAGCTACGTTTTGTTTCTAAATAATGAACTGACTTATTGC TCTCCATTTTTTTTTTTCTGTCAACATGGTTGTGCTCTATTGGTTTGCAGTTGCAGCCAA ACTAAGGTACAGTTTGTTTATTCATCTATTCTCCTATCCTATATTACGTCCTGTAACTTC TTGAAGGTTTGGAAATTAGATACATGTATACAGCTAGGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)