cluster # 4787

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 4787 cluster # 4787 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4787#0 length = 1743 sequences # 3
consensusID : consensus_4787#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1743
fasta sequence
                              [GCCAAAGGAAAGGAGAAAGCGCGGCCATGGCGGAAGACGCGCCGCCGTCGTCGCTTCCGCTGCTGCTGCCGCGGAAGTCGTTGTCCTCGTCCTCCGCGCAGCGCAAGCAGCAGTACGCGCGGTGCGTGTCGCACGCTGGGGACGAGCTCCACAGCTTCCGCTCCTGCCTCGCGTGGATGTGCGTCGACCACTCCACCCGCGCCCGCGGCGCCGCGTCGTGGGCGGCCTTCCTCCTCCTCGCCGTCGCCGCCCCGTCCGCGGCCACCCTCGCGCTCCCCTCCCCGGTCGGCGGCGGGGGGTCGCCGTTCGACGGGCAGGTCCAGGTGTCGCTCACCCTGGCCGCCGCGCTCGCCTACCTCACCCTCACGGCGCTCCTCCAGGGCCGCGGCCTCCGCCGCCTGCTCTACCTCGACCGCCTCCGCGACGACTCCGAGGAGGTCCGGTCCGGCTACATCGAGGAGCTCGCGGGCTCCTTCCGCGTCCTCGCCTGCTTCCTCCTCCCCTGCACGCTCGCCGAGGCCGCCTACAAGGCGTACTGGTACCTCGCCGCGCCGCCGTTCCGCTCCCCGTGGTGGTCCGCCGCCGCGTGCGCCGTCGAGGTCGCCTCCTGGGCCTACCGCACCGCCGTCTTCTTCATGGTCTGCGTCCTCTTCCGGACCATCTGCTACCTGCAGATCCTCCGGATGAAGGGCTTCGCGCGCGAGTTCTGCAGGTTCGCCGACGTCGCCGCCGTGCTCGAGAGCCACCGCCGCATCAGGAAGCAGCTCCACAGGATCAGCCACCGCTACCGCCGCTTCATACTCTGCTGCCTCGTCCTCGTCACCACCAGCCAGTTCGCCGCCCTGCTTGCCACCACCAGGCCGCACGCGCAGATCAACCTCGCCACCGCCGGCGAGCTCGCGCTCTGCTCGCTGAGCCTCGTGGCCGGGCTGCTGGTGTGCCTCCAGAGCGCGGCGAAGATCACGCACAAGACGCAGGCGATCACGAGCGTGGCGGCGGGGTGGCACGCCGACGCCACCATCAACGCCTTCGACAACGACCAGGAGGACCCCAACCCGGACCTCCCCCGCATCGTCGGCTACCTGGTGCCCGTGAACGCCTACTGGATGGCCTCCGGCGAGTCCTCGTCGGACTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCAGCGACGACGACGACTCCGGCCACCCCAAGTCCAAGTACATCCCTTTCCAGAACAACCACTGCTTCCAGCAGAGGCAGGCACTTGTGACGTACCTGGAGAACAACCGGGCCGGCATCACGGTGTACGGCTTCGTCGTCGACCGGACGTGGCTGCACGCGCTGTTCATGATCGAGTTCTCCCTCGTCATGTGGCTGCTGGGGAAGACGGTCGGCATATCCTGAGGCCTGAAGGAGCTTTTGCCTCCTGTTGAAGCTTTCAGCTCTCTCTCTGCTCTGCAGCCGTGCCGAGATTTCTGATGATCAAAGATCTCTGCATCGTCTCATATTGCTTCCTGGATTGTACAATACAAAATCGAGTGCAGAAATTGCAGATAATAGCTCAGTTTCTGTGCCATGTCCGGCACAAAAACGAAGCAACA-GTTCTGAAGTTTTTAGCTGTATGTTTTTCTTTAAAAATTTTTATGGTTCTTTGTTTGAGGCAGATTCTGATGGAGCATTAGTTGTATGAAAAATAATGGGATGGGATAGTTGTCCAGCTTGATTTGATGAGATTATGAGAGAACAGTAATCGTTGTATACTGTAAAAAAA]

[+] EMBL AK101019             [GCCAAAGGAAAGGAGAAAGCGCGGCCATGGCGGAAGACGCGCCGCCGTCGTCGCTTCCGCTGCTGCTGCCGCGGAAGTCGTTGTCCTCGTCCTCCGCGCAGCGCAAGCAGCAGTACGCGCGGTGCGTGTCGCACGCTGGGGACGAGCTCCACAGCTTCCGCTCCTGCCTCGCGTGGATGTGCGTCGACCACTCCACCCGCGCCCGCGGCGCCGCGTCGTGGGCGGCCTTCCTCCTCCTCGCCGTCGCCGCCCCGTCCGCGGCCACCCTCGCGCTCCCCTCCCCGGTCGGCGGCGGGGGGTCGCCGTTCGACGGGCAGGTCCAGGTGTCGCTCACCCTGGCCGCCGCGCTCGCCTACCTCACCCTCACGGCGCTCCTCCAGGGCCGCGGCCTCCGCCGCCTGCTCTACCTCGACCGCCTCCGCGACGACTCCGAGGAGGTCCGGTCCGGCTACATCGAGGAGCTCGCGGGCTCCTTCCGCGTCCTCGCCTGCTTCCTCCTCCCCTGCACGCTCGCCGAGGCCGCCTACAAGGCGTACTGGTACCTCGCCGCGCCGCCGTTCCGCTCCCCGTGGTGGTCCGCCGCCGCGTGCGCCGTCGAGGTCGCCTCCTGGGCCTACCGCACCGCCGTCTTCTTCATGGTCTGCGTCCTCTTCCGGACCATCTGCTACCTGCAGATCCTCCGGATGAAGGGCTTCGCGCGCGAGTTCTGCAGGTTCGCCGACGTCGCCGCCGTGCTCGAGAGCCACCGCCGCATCAGGAAGCAGCTCCACAGGATCAGCCACCGCTACCGCCGCTTCATACTCTGCTGCCTCGTCCTCGTCACCACCAGCCAGTTCGCCGCCCTGCTTGCCACCACCAGGCCGCACGCGCAGATCAACCTCGCCACCGCCGGCGAGCTCGCGCTCTGCTCGCTGAGCCTCGTGGCCGGGCTGCTGGTGTGCCTCCAGAGCGCGGCGAAGATCACGCACAAGACGCAGGCGATCACGAGCGTGGCGGCGGGGTGGCACGCCGACGCCACCATCAACGCCTTCGACAACGACCAGGAGGACCCCAACCCGGACCTCCCCCGCATCGTCGGCTACCTGGTGCCCGTGAACGCCTACTGGATGGCCTCCGGCGAGTCCTCGTCGGACTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCAGCGACGACGACGACTCCGGCCACCCCAAGTCCAAGTACATCCCTTTCCAGAACAACCACTGCTTCCAGCAGAGGCAGGCACTTGTGACGTACCTGGAGAACAACCGGGCCGGCATCACGGTGTACGGCTTCGTCGTCGACCGGACGTGGCTGCACGCGCTGTTCATGATCGAGTTCTCCCTCGTCATGTGGCTGCTGGGGAAGACGGTCGGCATATCCTGAGGCCTGAAGGAGCTTTTGCCTCCTGTTGAAGCTTTCAGCTCTCTCTCTGCTCTGCAGCCGTGCCGAGATTTCTGATGATCAAAGATCTCTGCATCGTCTCATATTGCTTCCTGGATTGTACAATACAAAATCGAGTGCAGAAATTGCAGATAATAGCTCAGTTTCTGTGCCATGTCCGGCACAAAAACGAAGCAACA GTTCTGAAGTTTTTAGCTGTATGTTTTTCTTTAAAAATTTTTATGGTTCTTTGTTTGAGGCAGATTCTGATGGAGCATTAGTTGTATGAAAAATAATGGGATGGGATAGTT                                                           ]
[+] EMBL CB675360             [                AAGCGCGGCCATGGCGGAAGACGCGCCGCCGTCGTCGCTTCCGCTGCTGCTGCCGCGGAAGTCGTTGTCCTCGTCCTCCGCGCAGCGCAAGCAGCAGTACGCGCGGTGCGTGTCGCACGCTGGGGACGAGCTCCACAGCTTCCGCTCCTGCCTCGCGTGGATGTGCGTCGACCACTCCACCCGCGCCCGCGGCGCCGCGTCGTGGGCGGCCTTCCTCCTCCTCGCCGTCGCCGCCCCGTCCGCGGCCACCCTCGCGCTCCCCTCCCCGGTCGGCGGCGGGGGGTCGCCGTTCGACGGGCAGGTCCAGGTGTCGCTCACCCTGGCCGCCGCGCTCGCCTACCTCACCCTCACGGCGCTCCTCCAGGGCCGCGGCCTCCGCCGCCTGCTCTACCTCGACCGCCTCCGCGACGACTCCGAGGAGGTCCGGTCCGGCTACATCGAGGAGCTCGCGGGCTCCTTCCGCGTCCTCGCCTGCTTCCTCCTCCCCTGCACGCTCGCCGAGGCCGCCTACAAGGCGTACTGGTACCTCGCCGCGCCGCCGTTCCGCTCCCCGTGGTGGTCCGCCGCCGCGTGCGCCGTCGAGGTCGCCTCCTGGGCCTACCGCACCGCCGTCTTCTTCATGGTCTGCGTCCTCTTCCGGACCATCTGCTACCTGCAGATCCTCCGGATGAAGGGCTTCGCGCGCGAGTTCTGCAGGTTCGCCGACGTCGCCGCCGTGCTCGAGAGCCACCGCCGCATCAGGAAGCAGCTCCACAGGATCAGCCACCGCTACCGCCGCTTCATACTCTGCTNGCTCGTCCTCGTCACCACCAGCCAGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL BI811902             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GCCTCCTGTTGAAGCTTTCAGCTCTCTCTCTGCTCTGCA CCGTGCCGAGATTTCTGATGATC AAGATCTCTGCATCGTCTCATATTGCTTCCTGGATTGTACAATACCAAATCGAGTGCAGAAATTGCAGATAATAGTTCAGTTTCTGTGCCATGTCCGGCAC AAAACGAAGCCACACGTTCTGAAGTTTTTAGCTGTATGTTTTTCTTTAAAATTTTTTATGGTTCTTTGTTTGAGGCAGATTCTGATGGAGCATTAGTTGTATGAAAAATAATGGGATGGGATAGTTGTCCAGCTTGATTTGATGAGATTATGAGAGAACAGTAATCGTTGTATACTGTAAAAAAA]




>consensus_4787#0
GCCAAAGGAAAGGAGAAAGCGCGGCCATGGCGGAAGACGCGCCGCCGTCGTCGCTTCCGC
TGCTGCTGCCGCGGAAGTCGTTGTCCTCGTCCTCCGCGCAGCGCAAGCAGCAGTACGCGC
GGTGCGTGTCGCACGCTGGGGACGAGCTCCACAGCTTCCGCTCCTGCCTCGCGTGGATGT
GCGTCGACCACTCCACCCGCGCCCGCGGCGCCGCGTCGTGGGCGGCCTTCCTCCTCCTCG
CCGTCGCCGCCCCGTCCGCGGCCACCCTCGCGCTCCCCTCCCCGGTCGGCGGCGGGGGGT
CGCCGTTCGACGGGCAGGTCCAGGTGTCGCTCACCCTGGCCGCCGCGCTCGCCTACCTCA
CCCTCACGGCGCTCCTCCAGGGCCGCGGCCTCCGCCGCCTGCTCTACCTCGACCGCCTCC
GCGACGACTCCGAGGAGGTCCGGTCCGGCTACATCGAGGAGCTCGCGGGCTCCTTCCGCG
TCCTCGCCTGCTTCCTCCTCCCCTGCACGCTCGCCGAGGCCGCCTACAAGGCGTACTGGT
ACCTCGCCGCGCCGCCGTTCCGCTCCCCGTGGTGGTCCGCCGCCGCGTGCGCCGTCGAGG
TCGCCTCCTGGGCCTACCGCACCGCCGTCTTCTTCATGGTCTGCGTCCTCTTCCGGACCA
TCTGCTACCTGCAGATCCTCCGGATGAAGGGCTTCGCGCGCGAGTTCTGCAGGTTCGCCG
ACGTCGCCGCCGTGCTCGAGAGCCACCGCCGCATCAGGAAGCAGCTCCACAGGATCAGCC
ACCGCTACCGCCGCTTCATACTCTGCTGCCTCGTCCTCGTCACCACCAGCCAGTTCGCCG
CCCTGCTTGCCACCACCAGGCCGCACGCGCAGATCAACCTCGCCACCGCCGGCGAGCTCG
CGCTCTGCTCGCTGAGCCTCGTGGCCGGGCTGCTGGTGTGCCTCCAGAGCGCGGCGAAGA
TCACGCACAAGACGCAGGCGATCACGAGCGTGGCGGCGGGGTGGCACGCCGACGCCACCA
TCAACGCCTTCGACAACGACCAGGAGGACCCCAACCCGGACCTCCCCCGCATCGTCGGCT
ACCTGGTGCCCGTGAACGCCTACTGGATGGCCTCCGGCGAGTCCTCGTCGGACTCCTCCT
CCTCCTCCTCCTCCAGCGACGACGACGACTCCGGCCACCCCAAGTCCAAGTACATCCCTT
TCCAGAACAACCACTGCTTCCAGCAGAGGCAGGCACTTGTGACGTACCTGGAGAACAACC
GGGCCGGCATCACGGTGTACGGCTTCGTCGTCGACCGGACGTGGCTGCACGCGCTGTTCA
TGATCGAGTTCTCCCTCGTCATGTGGCTGCTGGGGAAGACGGTCGGCATATCCTGAGGCC
TGAAGGAGCTTTTGCCTCCTGTTGAAGCTTTCAGCTCTCTCTCTGCTCTGCAGCCGTGCC
GAGATTTCTGATGATCAAAGATCTCTGCATCGTCTCATATTGCTTCCTGGATTGTACAAT
ACAAAATCGAGTGCAGAAATTGCAGATAATAGCTCAGTTTCTGTGCCATGTCCGGCACAA
AAACGAAGCAACAGTTCTGAAGTTTTTAGCTGTATGTTTTTCTTTAAAAATTTTTATGGT
TCTTTGTTTGAGGCAGATTCTGATGGAGCATTAGTTGTATGAAAAATAATGGGATGGGAT
AGTTGTCCAGCTTGATTTGATGAGATTATGAGAGAACAGTAATCGTTGTATACTGTAAAA
AAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case