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Oryza sativa
cluster # 49 cluster # 49       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_49#0 length = 1093 sequences # 2  

consensusID : consensus_49#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1093
fasta sequence
                              [GCGGATCTGCCCCAATGCCACAGCATCATCACCGTCTCTAGCCAGAGCCGCGAAGGCCGCGGCGTAGCTGCTCCTGCACCAGGGACGCTCCCATCCACGAATCGTGGGTAACGCACCGAGAGCGGCGGCGCACGGAAGCCACGGCCATGGGCGGCGGCGGCGGCGACGACGCGCTGTACGCGCGATGCCTGGTGATCCTGTACCTGATCAGCCCGATCACCGTGTTCCTGCTCCGGTTCGTGTCGGCGCCGTACGGGAAGCTCTCCCGCCCCGGGTGGGGTCCCGCCGTGCCGGCGGCGCTCGCGTGGTTCCTCATGGAGAGCCCCACCATGTGCCTCCCGCCCCTCGTCCTCTCCGCCGCCGCCTCCTCGTCGGCGCTGCGCGCCGCCGCTCTCCTCCCGGCCGCGCTGTACGCGCTCCACTACGTGAACCGCACGCTCGTCCACCCGCTCCGGCTCCTCCGCCTCCGCCGCGCGCCGGCGCCCGTTCCGATCCTCGTCGCCGCCTTCGCCTTCGGCTTCAACCTCCTCAACGCCTACGTCCAGGCGCGCTCCTGGGCGCTCGACGCCGCCGCTCCCCACAGCACCGCCACCGCCACCGCCACGCCCGCGGCCGTCGCCCGCTGCCTCGTCGGGCTAGCCCTCTTCGCGTGGGGGATGCGGACCAACATCGCGGCGGACAAGGCGCTCCTGAGGCTGAAGGAGGCCGGGAAAGGGTACCAGATTCCCCGCGGCGGGCTGTTCGACGTGGTCACCTGCCCCAACTACTTCGGCGAGGCCGTGGAGTGGCTCGGCTACGCGCTGGTGGCGTGGACGCCGGCGGCCTGGGCCTTCTTCCTCTACACCTGCTCCAACCTCGGGCCGAGGGCCAGGGATCACCGCCGGTGGTACGTCGGCAAGTTCGGCGACAAGTACCCGGCGTCGCGCAAGGCGTTCGTCCCGTACATCTACTGATTCCTCTGTTATTGCTGATGGATACGTATCGGCCAGGGAGTGATGCGCATTGTGCTTCACCTCGAAACAGCTTTTGATTCATACTGTTGGCATGCGCATGTGGTTCTGTTGGATTGGAATAAAAATGAGCCGTATCGTGG]

[+] EMBL AK101345             [GCGGATCTGCCCCAATGCCACAGCATCATCACCGTCTCTAGCCAGAGCCGCGAAGGCCGCGGCGTAGCTGCTCCTGCACCAGGGACGCTCCCATCCACGAATCGTGGGTAACGCACCGAGAGCGGCGGCGCACGGAAGCCACGGCCATGGGCGGCGGCGGCGGCGACGACGCGCTGTACGCGCGATGCCTGGTGATCCTGTACCTGATCAGCCCGATCACCGTGTTCCTGCTCCGGTTCGTGTCGGCGCCGTACGGGAAGCTCTCCCGCCCCGGGTGGGGTCCCGCCGTGCCGGCGGCGCTCGCGTGGTTCCTCATGGAGAGCCCCACCATGTGCCTCCCGCCCCTCGTCCTCTCCGCCGCCGCCTCCTCGTCGGCGCTGCGCGCCGCCGCTCTCCTCCCGGCCGCGCTGTACGCGCTCCACTACGTGAACCGCACGCTCGTCCACCCGCTCCGGCTCCTCCGCCTCCGCCGCGCGCCGGCGCCCGTTCCGATCCTCGTCGCCGCCTTCGCCTTCGGCTTCAACCTCCTCAACGCCTACGTCCAGGCGCGCTCCTGGGCGCTCGACGCCGCCGCTCCCCACAGCACCGCCACCGCCACCGCCACGCCCGCGGCCGTCGCCCGCTGCCTCGTCGGGCTAGCCCTCTTCGCGTGGGGGATGCGGACCAACATCGCGGCGGACAAGGCGCTCCTGAGGCTGAAGGAGGCCGGGAAAGGGTACCAGATTCCCCGCGGCGGGCTGTTCGACGTGGTCACCTGCCCCAACTACTTCGGCGAGGCCGTGGAGTGGCTCGGCTACGCGCTGGTGGCGTGGACGCCGGCGGCCTGGGCCTTCTTCCTCTACACCTGCTCCAACCTCGGGCCGAGGGCCAGGGATCACCGCCGGTGGTACGTCGGCAAGTTCGGCGACAAGTACCCGGCGTCGCGCAAGGCGTTCGTCCCGTACATCTACTGATTCCTCTGTTATTGCTGATGGATACGTATCGGCCAGGGAGTGATGCGCATTGTGCTTCACCTCGAAACAGCTTTTGATTCATACTGTTGGCATGCGCATGTGGTTCTGTTGGATTGGAATAAAAATGAGCCGTATCGTGG]
[+] EMBL CA755918             [                                             AGCCGCGAAGGCCGCGGCGTAGCTGCTCCTGCACCAGGGACGCTCCCATCCACGAATCGTGGGTAACGCACCGAGAGCGGCGGCGCACGGAAGCCACGGCCATGGGCGGCGGCGGCGGCGACGACGCGCTGTACGCGCGATGCCTGGTGATCCTGTACCTGATCAGCCCGATCACCGTGTTCCTGCTCCGGTTCGTGTCGGCGCCGTACGGGAAGCTCTCCCGCCCCGGGTGGGGTCCCGCCGTGCCGGCGGCGCTCGCGTGGTTCCTCATGGAGAGCCCCACCATGTGCCTCCCGCCCCTCGTCCTCTCCGCCGCCGCCTCCTCGTCGGCGCTGCGCGCCGCCGCTCTCCTCCCGGCCGCGCTGTACGCGCTCCACTACGTGAACCGCACGCTCGTCCACCCGCTCCGGCTCCTCCGCCTCCGCCGCGCGCCGGCGCCCGTTCCGATCCTCGTCGCCGCCTTCGCCTTCGGCTTCAACCTCCTCAACGCCTACGTCCAGGCGCGCTCCTGGGCGCTCGACGCCGCCGCTCCCCACAGCACCGCCACCGCCACCGCCACGCCCGCGGNCGTCGCCCGCTGCCTCGTCGGGCTA CCCTCTTCGCGTGGGGGATGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]


>consensus_49#0 GCGGATCTGCCCCAATGCCACAGCATCATCACCGTCTCTAGCCAGAGCCGCGAAGGCCGC GGCGTAGCTGCTCCTGCACCAGGGACGCTCCCATCCACGAATCGTGGGTAACGCACCGAG AGCGGCGGCGCACGGAAGCCACGGCCATGGGCGGCGGCGGCGGCGACGACGCGCTGTACG CGCGATGCCTGGTGATCCTGTACCTGATCAGCCCGATCACCGTGTTCCTGCTCCGGTTCG TGTCGGCGCCGTACGGGAAGCTCTCCCGCCCCGGGTGGGGTCCCGCCGTGCCGGCGGCGC TCGCGTGGTTCCTCATGGAGAGCCCCACCATGTGCCTCCCGCCCCTCGTCCTCTCCGCCG CCGCCTCCTCGTCGGCGCTGCGCGCCGCCGCTCTCCTCCCGGCCGCGCTGTACGCGCTCC ACTACGTGAACCGCACGCTCGTCCACCCGCTCCGGCTCCTCCGCCTCCGCCGCGCGCCGG CGCCCGTTCCGATCCTCGTCGCCGCCTTCGCCTTCGGCTTCAACCTCCTCAACGCCTACG TCCAGGCGCGCTCCTGGGCGCTCGACGCCGCCGCTCCCCACAGCACCGCCACCGCCACCG CCACGCCCGCGGCCGTCGCCCGCTGCCTCGTCGGGCTAGCCCTCTTCGCGTGGGGGATGC GGACCAACATCGCGGCGGACAAGGCGCTCCTGAGGCTGAAGGAGGCCGGGAAAGGGTACC AGATTCCCCGCGGCGGGCTGTTCGACGTGGTCACCTGCCCCAACTACTTCGGCGAGGCCG TGGAGTGGCTCGGCTACGCGCTGGTGGCGTGGACGCCGGCGGCCTGGGCCTTCTTCCTCT ACACCTGCTCCAACCTCGGGCCGAGGGCCAGGGATCACCGCCGGTGGTACGTCGGCAAGT TCGGCGACAAGTACCCGGCGTCGCGCAAGGCGTTCGTCCCGTACATCTACTGATTCCTCT GTTATTGCTGATGGATACGTATCGGCCAGGGAGTGATGCGCATTGTGCTTCACCTCGAAA CAGCTTTTGATTCATACTGTTGGCATGCGCATGTGGTTCTGTTGGATTGGAATAAAAATG AGCCGTATCGTGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)