cluster # 5004

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Oryza sativa
cluster # 5004 cluster # 5004 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_5004#0 length = 1891 sequences # 3
consensusID : consensus_5004#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1891
fasta sequence
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[+] EMBL AK120225             [TTGTTAGTGGCCGACCGGGGTTGAACCCTAGCCCCCGGCCGCAGCCACCCTCCCTTCCTCTCCCCCGCCTCGCCGCCGCTAGAGCGTGTCGCCGGAAACCGTGCGACCTGCCGGGATGGCAGCAGCGAGGCTACAAACCCCGGTGCGCGTGGCCGTCCCGGCGTGAAGGGGTGGCGCGGAGAGCCGGGAAGGCCACGCGACGCCGGCGCATGGCGGCTGATCCGGCGCCGCCATCGCCAGATCTGGCACCCCCGTAGCTGGATCCGATGTCCCCGCCGCTGGATCTGGGCTGTGGCGGTGCGGGCGCGGCGTCGGCGGTTGCGGCAGGCATGGAGGCGCGGCTGCTATGGTCGACAGCGGGCTGTGGCAGGGCGGTGGGAAGATGGCATCGGGGTGGGTCGCCCGTGCGAGCGAGCTGGCGCGTGGATGTAGGCGGCGGGCGGCGGTGGCTGCCAGATCCAGAGGAAGCTACGAAGGTGGAGGACGCTATGCTCGCTATGGCCTTCTTCATGGCGGCGGGGTGGCAATGGTGGCAATGTCGGCAGGGTTGGTGGTGGCGATGACCACGGATCTGATGGCGGGGCTCCCGGATCTGCCCCCCTNCCCTTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAGCGCCAGATCCGGCCGTGGCGCTGTTGGTGGTGGGCTAGTGGCGCTGGGGGTGGAGGACTGGGGCGGTGACGGCTGTGGCTATGGTTGCTGTGGCGACCGTGGCCGTGGTTGCGCTGGGAGGAAGCACGATGGTCTCGGACGACTAGCCGGGGGCATGGTAGACGGTCGCATCTGGCTGGCACCGCAGTGGTTGGAGGAGGGGGCGGAGGCCAGCTCGGCGCAGAGAGGCGTAGCTGATGGCAGCGGAGGCCAGCACGGCGCGAGGAAGCGCGGCCAGCAGCGGTGAAGGCTGGCTTGGCGCGAGAGGCACGGTCGGCGGTGGAGGAGGCGACCATGGTGCGAGGAGGAGCTGTCGGTGGGTGTGGCACGGTCTACGGCGCATGAAGGCTGACTGACGGGGGGTGCCGGTGCAGTGGTCCCACATGTCAGCAGAGGTTAGATGGTGGTGGAGCATCGGTGCGTTAGTCGTGGACTCGCAGGTGGTGAGTGGCAGGTGAAAACCTAGCCCGGCCTTGGCCGGACCGACAACGATGGCACCCGAGTGTCATTCCCCCTCCTGAGGGCTTTGTCATGCCGTCTCACCCCTCAAGGGTGGTTGCCGGGCGAAAGCCCAGTCTGGGCTCTTTTGAGACCTTGACGGACAGCGGTGGCGGTTTTCCGTCGCTTCTCTTCTTGGAGACGTCGTTTAGGCATCCCCTTGCCGAAACCACTCGAGCAATTGGTGCAATCACGCTCTAGATTCTCATCCTCTTGTGGCGGCGTCGTAGTTTCTACAAGTTGGCCACCTCGGAGGACCTAGGGGGCAGAGGTGTTCCATCTTCTCTCTCACCCTCTCCCTAAATCCGAAAGACGTGGATAGAGTTGGGCTTTGTATTGGTTGTAAGAGCGTTTTTTGGGCGATCTTGTATGTGTTCCGTTGTTGGCCTAGCGGCGATCGGTCATGCTTAGCGGCGGCTGGTCTGGTGCTAGCCTTCTCCCCAACCTGTGTGTTGACACTGTCGGTGTGTGGGTGTGGTGGTATATTTTTTCCTTTTTCCTGGTTACGACCTTCCTAGGTTGTAATCTTGTAATTTTTTTCCAGCCATATCAATAGAACTTCGCACCGTCTCGT                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CB654585             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGTGTCATTCCCCCTCCTGAGGGCTTTGTCATGCCGTCTCACCCCTCAAGGGTGGTTCCCGGGCGAAAGCCCAGTCTGGGCTCTTTTGAGACCTTGACGGACAGCGGTGGCGGTTTTCCGTCGCTTCTCTTCTTGGAGACGTCGTTTAGGCATCCCCTTGCCGAAACCACTCGAGCAATTGGTGCAATCACGCTCTAGATTCTCATCCTCTTGTGGCGGCGTAAAAATTTCTACAAGTTGTCCACCTCGGAGGACCTAGGGGGCAGAGGTGTTCCATCTTCTCTCTCACCCTCTCCCTAAATCCGAAAGACGTGGATAGAGTTGGGCTTTGTATTCGTTGTAAGAGCGTTTTTTGGGCGATCTTGTATGTGTTCCGTTGTTGGCCTAGCGGCGATCGGTCATGCTTAGCGGCGGCTGGTCTGGTGCTAGCCTTCTCCCCAACCTGTGTGTAAACACTGTCGGTGTGTGGGTGGGGGGATATATTTTTTCCTTTTTCCTGGTTACGACCTTCCTAGGTTGTAATCTTGTAATTTTTTTCCAGCCTTA AGGTAGAACTTCGCCCCCTCTC                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL AU067901             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GGTATATTTTNTCCTTTTTCCTGGTTACGACCTTCCTAGGTTGTAATCTTGTAATTTTTTTCCAGCCATATCAATAGAACTTCGCACCGTCTCGTGCGAGTTGTTAAAAAAAAGCTATGTTGTTATCAGGAATAATCCTGAGGAGATAGTGTCTCTATGTCTTTAATAATTTTCCATTAGAAAATGGATTAATTGGATCATGCCATTATGAATTTACTGAACAAGTTCTTTTTTTACATAAAAAA]




>consensus_5004#0
TTGTTAGTGGCCGACCGGGGTTGAACCCTAGCCCCCGGCCGCAGCCACCCTCCCTTCCTC
TCCCCCGCCTCGCCGCCGCTAGAGCGTGTCGCCGGAAACCGTGCGACCTGCCGGGATGGC
AGCAGCGAGGCTACAAACCCCGGTGCGCGTGGCCGTCCCGGCGTGAAGGGGTGGCGCGGA
GAGCCGGGAAGGCCACGCGACGCCGGCGCATGGCGGCTGATCCGGCGCCGCCATCGCCAG
ATCTGGCACCCCCGTAGCTGGATCCGATGTCCCCGCCGCTGGATCTGGGCTGTGGCGGTG
CGGGCGCGGCGTCGGCGGTTGCGGCAGGCATGGAGGCGCGGCTGCTATGGTCGACAGCGG
GCTGTGGCAGGGCGGTGGGAAGATGGCATCGGGGTGGGTCGCCCGTGCGAGCGAGCTGGC
GCGTGGATGTAGGCGGCGGGCGGCGGTGGCTGCCAGATCCAGAGGAAGCTACGAAGGTGG
AGGACGCTATGCTCGCTATGGCCTTCTTCATGGCGGCGGGGTGGCAATGGTGGCAATGTC
GGCAGGGTTGGTGGTGGCGATGACCACGGATCTGATGGCGGGGCTCCCGGATCTGCCCCC
CTNCCCTTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAGCGCCAGATCCGGCCGTGGCGCTGTTGGTGG
TGGGCTAGTGGCGCTGGGGGTGGAGGACTGGGGCGGTGACGGCTGTGGCTATGGTTGCTG
TGGCGACCGTGGCCGTGGTTGCGCTGGGAGGAAGCACGATGGTCTCGGACGACTAGCCGG
GGGCATGGTAGACGGTCGCATCTGGCTGGCACCGCAGTGGTTGGAGGAGGGGGCGGAGGC
CAGCTCGGCGCAGAGAGGCGTAGCTGATGGCAGCGGAGGCCAGCACGGCGCGAGGAAGCG
CGGCCAGCAGCGGTGAAGGCTGGCTTGGCGCGAGAGGCACGGTCGGCGGTGGAGGAGGCG
ACCATGGTGCGAGGAGGAGCTGTCGGTGGGTGTGGCACGGTCTACGGCGCATGAAGGCTG
ACTGACGGGGGGTGCCGGTGCAGTGGTCCCACATGTCAGCAGAGGTTAGATGGTGGTGGA
GCATCGGTGCGTTAGTCGTGGACTCGCAGGTGGTGAGTGGCAGGTGAAAACCTAGCCCGG
CCTTGGCCGGACCGACAACGATGGCACCCGAGTGTCATTCCCCCTCCTGAGGGCTTTGTC
ATGCCGTCTCACCCCTCAAGGGTGGTTGCCGGGCGAAAGCCCAGTCTGGGCTCTTTTGAG
ACCTTGACGGACAGCGGTGGCGGTTTTCCGTCGCTTCTCTTCTTGGAGACGTCGTTTAGG
CATCCCCTTGCCGAAACCACTCGAGCAATTGGTGCAATCACGCTCTAGATTCTCATCCTC
TTGTGGCGGCGTCGTAGTTTCTACAAGTTGGCCACCTCGGAGGACCTAGGGGGCAGAGGT
GTTCCATCTTCTCTCTCACCCTCTCCCTAAATCCGAAAGACGTGGATAGAGTTGGGCTTT
GTATTGGTTGTAAGAGCGTTTTTTGGGCGATCTTGTATGTGTTCCGTTGTTGGCCTAGCG
GCGATCGGTCATGCTTAGCGGCGGCTGGTCTGGTGCTAGCCTTCTCCCCAACCTGTGTGT
TGACACTGTCGGTGTGTGGGTGTGGTGGTATATTTTTTCCTTTTTCCTGGTTACGACCTT
CCTAGGTTGTAATCTTGTAATTTTTTTCCAGCCATATCAATAGAACTTCGCACCGTCTCG
TGCGAGTTGTTAAAAAAAAGCTATGTTGTTATCAGGAATAATCCTGAGGAGATAGTGTCT
CTATGTCTTTAATAATTTTCCATTAGAAAATGGATTAATTGGATCATGCCATTATGAATT
TACTGAACAAGTTCTTTTTTTACATAAAAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case