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Oryza sativa
cluster # 5038 cluster # 5038       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5038#0 length = 2195 sequences # 3  

consensusID : consensus_5038#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 2195
fasta sequence
                              [AAGAGACTTCTCTCTCCCCCCGCGTCGCCCACGCGCAGGCGACACGGGGGGCGAACCCTACCTCCGCCGCCGTCCCCCTTCCCCTCCCCCTACCTCGCCGCCGGAGCTCTCCACCGGCAAAGCCAGCTGGCGAGCTAGGATGGCGGCGGCGGGGCCTTCTTCGCGGTGGCGTCCCTTCTCAGGCGCGGGAGAGGAGACGTTCGCCGGCGTCGGGGAGAGGCGGCGGCGAGGCCTCCGGACTAGGCGGCGGTAGATCTGGTGCCGCTGTCGCCGGATCTGGCCAGCCCCTCCGGTTTTCGGCCGGAGTGCTGGCGGCGGTGCCGTGGGGGCAGCGCGTGCGGAGGCGGCACGGTCGGTGGCGGCTGGTGCACGAGTGGCAGCGGAGTCCGGCGCGCGCGTGGGTGATGGCCGGTGCGCGCATGGCGGCGCGGAGGCCGGCACTCACGAGGCGGCATAGCGGCGCCTACCAGCTCCGGCGGTCGGCGAGGCGCGCCTGGCCCTGCCGGGGCTGCTCCGCTGGGGGCGCCGGGGGTGTTGGCGACACCGGCGTTTCTCCAGCCGCCCCTCACCCCCACACCCACCCCGTCACGGCGTCACCCCTCCGGCGTCGACAGCAGCCACAACCACCCTCTCCTCTCTTGGCTCCTTCTTGCAAGCAGAAGGGGGTGAGCTCCGACGCCTCCCCCTACCCCACCCTTGTCTCCCTTCCTCGCTTCCTATCTGGCTACTCTGTTGCCTAGTTGTTTAGTTGCTTTGCTTCTCACCCCAGCGCTCCTCTCTCTGTGCTGGTGGTGAAGTTGGAGGTGGTTTATCGCTGCTGTAAGGGTTGTCCTGCGAAGGCCGGTGGTCCTTGCTGGATACATGGATGACACAGAGGTCTTCGATGCCCCTGTCTTCAGCTTTCAGTTCCTCTTCAGGGTGGCCAGGCCTCCTCCCCTCCTTGATGCTCCTCCCTTCTTTTGGCTGTCTGCTTCCAGACTCGGCCATGGAGTCTTTCGGTGGTTGAGGAGAAGTGTTCGTCCGTGAAGGTGGTTTAGTCTGTCTATAGTCAGGGCTCTCGGGCCTCGCAAGTGCTTCTAGTGCCCTGTGACTGAGTGAACCTGTCGTAGTGCCGAGTTTGGAGTAGTGTACTTATCTTCAGTGACAGAGTTTTTGTGTTTGGCGGAGTCGGAGCTACTGCATCAGGCTTAGCCGATGAGCTAGGCAACGATAACACAAACACTTTTGCTCTCGCTCCTTGTAAATCCACCTTTGGAGGGAGTCTCGGGTGAAAGCCCTGTCTGGTCTTCCAGGATCGGTGACATCGATTCCTGCGACTCTGTGAGTGCCGTATCCTCCTTGGAGGTGTTGCTCTGTGGGCTCCCTCCCCCTTTGGGTGAAAACCCAGTCCAGTTTATGGGCGGGCGTCGACAACGGCTTCTGTCGTTGTTCCCCTCCTTGGAGGTCGACAACGGCTTCTGTCGTTGTTAGGCTTTGCCTTGAAGGTCTTGCTCTTCCCTTGGTCACTTTTGTGGTTTGGTCGTTTTGTCTCAAGCTTTTTGTGTCTTCTGTGTAAGGTTTCGCCAATTTTCCTTTAGCAAAATGTGCAGTTGTAAGGTTTTTGGGTCCGGTTTTCCTTATAAACAGGGTCAACTCTTTTCTTCTTGTAATATCCGGTAGATCTCCTACCGTCGGTTCTTCAAAAAAGATATGAAGCGTCTAGATCCAGCCGAATCAGGTTGGGGAAAAGCAAAATCAGGGAGGATACTGGTGGCTGTGCCGACTGGCCCAAGACCCCAAGTATCCAAAGTGGCCCACTCCCACACGTACGTGTGCTGTGCAGTGCACCCACTCACTCACCGACCGGTTCTGTTTTAGTTTCAGGCTCCATCATCTCATATATGGAACAAATATGTTTAAATGATCAGCATCCTCATTTCTCATTGATCGGTCAGATCGTCTCCCACAGATCCAACATCCCAAGTCACTCCCACCTCCCTCACGGCCTCACTCCGTCAATCACGCCGTCATGCGTACATCACTCACCTACCGCCCTCGCCAGAAACTGTGCTCCGCTCCATCCTCTCCCTCTCCATCGCTTCGCTGCAACGCCAACCGGCGCGCCGCCGCCGATTTCCGCTTCCCCTCCATCGCGCCTCCAAATCGGTGCCTCCAGATCGACGTTGCCAGCGCCCGTCACAACCGTCGACAGGTAA]

[+] EMBL AK120925             [AAGAGACTTCTCTCTCCCCCCGCGTCGCCCACGCGCAGGCGACACGGGGGGCGAACCCTACCTCCGCCGCCGTCCCCCTTCCCCTCCCCCTACCTCGCCGCCGGAGCTCTCCACCGGCAAAGCCAGCTGGCGAGCTAGGATGGCGGCGGCGGGGCCTTCTTCGCGGTGGCGTCCCTTCTCAGGCGCGGGAGAGGAGACGTTCGCCGGCGTCGGGGAGAGGCGGCGGCGAGGCCTCCGGACTAGGCGGCGGTAGATCTGGTGCCGCTGTCGCCGGATCTGGCCAGCCCCTCCGGTTTTCGGCCGGAGTGCTGGCGGCGGTGCCGTGGGGGCAGCGCGTGCGGAGGCGGCACGGTCGGTGGCGGCTGGTGCACGAGTGGCAGCGGAGTCCGGCGCGCGCGTGGGTGATGGCCGGTGCGCGCATGGCGGCGCGGAGGCCGGCACTCACGAGGCGGCATAGCGGCGCCTACCAGCTCCGGCGGTCGGCGAGGCGCGCCTGGCCCTGCCGGGGCTGCTCCGCTGGGGGCGCCGGGGGTGTTGGCGACACCGGCGTTTCTCCAGCCGCCCCTCACCCCCACACCCACCCCGTCACGGCGTCACCCCTCCGGCGTCGACAGCAGCCACAACCACCCTCTCCTCTCTTGGCTCCTTCTTGCAAGCAGAAGGGGGTGAGCTCCGACGCCTCCCCCTACCCCACCCTTGTCTCCCTTCCTCGCTTCCTATCTGGCTACTCTGTTGCCTAGTTGTTTAGTTGCTTTGCTTCTCACCCCAGCGCTCCTCTCTCTGTGCTGGTGGTGAAGTTGGAGGTGGTTTATCGCTGCTGTAAGGGTTGTCCTGCGAAGGCCGGTGGTCCTTGCTGGATACATGGATGACACAGAGGTCTTCGATGCCCCTGTCTTCAGCTTTCAGTTCCTCTTCAGGGTGGCCAGGCCTCCTCCCCTCCTTGATGCTCCTCCCTTCTTTTGGCTGTCTGCTTCCAGACTCGGCCATGGAGTCTTTCGGTGGTTGAGGAGAAGTGTTCGTCCGTGAAGGTGGTTTAGTCTGTCTATAGTCAGGGCTCTCGGGCCTCGCAAGTGCTTCTAGTGCCCTGTGACTGAGTGAACCTGTCGTAGTGCCGAGTTTGGAGTAGTGTACTTATCTTCAGTGACAGAGTTTTTGTGTTTGGCGGAGTCGGAGCTACTGCATCAGGCTTAGCCGATGAGCTAGGCAACGATAACACAAACACTTTTGCTCTCGCTCCTTGTAAATCCACCTTTGGAGGGAGTCTCGGGTGAAAGCCCTGTCTGGTCTTCCAGGATCGGTGACATCGATTCCTGCGACTCTGTGAGTGCCGTATCCTCCTTGGAGGTGTTGCTCTGTGGGCTCCCTCCCCCTTTGGGTGAAAACCCAGTCCAGTTTATGGGCGGGCGTCGACAACGGCTTCTGTCGTTGTTCCCCTCCTTGGAGGTCGACAACGGCTTCTGTCGTTGTTAGGCTTTGCCTTGAAGGTCTTGCTCTTCCCTTGGTCACTTTTGTGGTTTGGTCGTTTTGTCTCAAGCTTTTTGTGTCTTCTGTGTAAGGTTTCGCCAATTTTCCTTTAGCAAAATGTGCAGTTGTAAGGTTTTTGGGTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CB660109             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAGGTTTCGCCAATTTTCCTTTAGCAAAATGTGCAGTTGTAAGGTTTTTGGGTCCGGTTTTCCTTATAAACAGGGTCAACTCTTTTCTTCTTGTAATATCCGGTAGATCTCCTACCGTCGGTTCTTCAAAAAAGATATGAAGCGTCTAGATCCAGCCGAATCAGGTTGGGGAAAAGCAAAATCAGGGAGGATACTGGTGGCTGTGCCGACTGGCCCAAGACCCCAAGTATCCAAAGTGGCCCACTCCCACACGTACGTGTGCTGTGCAGTGCACCCACTCACTCACCGACCGGTTCTGTTTTAGTTTCAGGCTCCATCATCTCATATATGGAACAAATATGTTTAAATGATCAGCATCCTCATTTCTCATTGATCGGTCAGATCGTCTCCCACAGATCCAACATCCCAAGTCACTCCCACCTCCCTCACGGCCTCACTCCGTCAATCACGCCGTCATGCGTACATCACTCACCTACCGCCCTCGCCAGAAACTGTGCTCCGCTCCATCCTCTCCCTCTCCATCGCTTCGCTGCAACGCCAACCGGCGCGCCGCCGCCGATTTCCGCTTCCCCTCCATCGCGCCTCCAAATCGGTGCCTCCAGATCGACGTTGCCAGCGCCCGTCACAACCGTCGACAGGTAA]
[+] EMBL CB660148             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAGGTTTCGCCAATTTTCCTTTAGCAAAATGTGCAGTTGTAAGGTTTTTGGGTCCGGTTTTCCTTATAAACAGGGTCAACTCTTTTCTTCTTGTAATATCCGGTAGATCTCCTACCGTCGGTTCTTCAAAAAAGATATGAAGCGTCTAGATCCAGCCGAATCAGGTTGGGGAAAAGCAAAATCAGGGAGGATACTGGTGGCTGTGCCGACTGGCCCAAGACCCCAAGTATCCAAAGTGGCCCACTCCCACACGTACGTGTGCTGTGCAGTGCACCCACTCACTCACCGACCGGTTCTGTTTTAGTTTCAGGCTCCATCATCTCATATATGGAACAAATATGTTTAAATGATCAGCATCCTCATTTCTCATTGATCGGTCAGATCGTCTCCCACAGATCCAACATCCCAAGTCACTCCCACCTCCCTCACGGCCTCACTCCGTCAATCACGCCGTCATGCGTACATCACTCACCTACCGCCCTCGCCAGAAACTGTGCTCCGCTCCATCCTCTCCCTCTCCATCGCTTCGCTGCAACGCCAACCGGCGCGCCGCCGCCGATTTCCGCTTCCCCTCCATCGCGCCTCCAAATCGGTGCCTCCAGATCGACGTTGCCAGCGCCCGTCACAACCGTCGACAGGTAA]


>consensus_5038#0 AAGAGACTTCTCTCTCCCCCCGCGTCGCCCACGCGCAGGCGACACGGGGGGCGAACCCTA CCTCCGCCGCCGTCCCCCTTCCCCTCCCCCTACCTCGCCGCCGGAGCTCTCCACCGGCAA AGCCAGCTGGCGAGCTAGGATGGCGGCGGCGGGGCCTTCTTCGCGGTGGCGTCCCTTCTC AGGCGCGGGAGAGGAGACGTTCGCCGGCGTCGGGGAGAGGCGGCGGCGAGGCCTCCGGAC TAGGCGGCGGTAGATCTGGTGCCGCTGTCGCCGGATCTGGCCAGCCCCTCCGGTTTTCGG CCGGAGTGCTGGCGGCGGTGCCGTGGGGGCAGCGCGTGCGGAGGCGGCACGGTCGGTGGC GGCTGGTGCACGAGTGGCAGCGGAGTCCGGCGCGCGCGTGGGTGATGGCCGGTGCGCGCA TGGCGGCGCGGAGGCCGGCACTCACGAGGCGGCATAGCGGCGCCTACCAGCTCCGGCGGT CGGCGAGGCGCGCCTGGCCCTGCCGGGGCTGCTCCGCTGGGGGCGCCGGGGGTGTTGGCG ACACCGGCGTTTCTCCAGCCGCCCCTCACCCCCACACCCACCCCGTCACGGCGTCACCCC TCCGGCGTCGACAGCAGCCACAACCACCCTCTCCTCTCTTGGCTCCTTCTTGCAAGCAGA AGGGGGTGAGCTCCGACGCCTCCCCCTACCCCACCCTTGTCTCCCTTCCTCGCTTCCTAT CTGGCTACTCTGTTGCCTAGTTGTTTAGTTGCTTTGCTTCTCACCCCAGCGCTCCTCTCT CTGTGCTGGTGGTGAAGTTGGAGGTGGTTTATCGCTGCTGTAAGGGTTGTCCTGCGAAGG CCGGTGGTCCTTGCTGGATACATGGATGACACAGAGGTCTTCGATGCCCCTGTCTTCAGC TTTCAGTTCCTCTTCAGGGTGGCCAGGCCTCCTCCCCTCCTTGATGCTCCTCCCTTCTTT TGGCTGTCTGCTTCCAGACTCGGCCATGGAGTCTTTCGGTGGTTGAGGAGAAGTGTTCGT CCGTGAAGGTGGTTTAGTCTGTCTATAGTCAGGGCTCTCGGGCCTCGCAAGTGCTTCTAG TGCCCTGTGACTGAGTGAACCTGTCGTAGTGCCGAGTTTGGAGTAGTGTACTTATCTTCA GTGACAGAGTTTTTGTGTTTGGCGGAGTCGGAGCTACTGCATCAGGCTTAGCCGATGAGC TAGGCAACGATAACACAAACACTTTTGCTCTCGCTCCTTGTAAATCCACCTTTGGAGGGA GTCTCGGGTGAAAGCCCTGTCTGGTCTTCCAGGATCGGTGACATCGATTCCTGCGACTCT GTGAGTGCCGTATCCTCCTTGGAGGTGTTGCTCTGTGGGCTCCCTCCCCCTTTGGGTGAA AACCCAGTCCAGTTTATGGGCGGGCGTCGACAACGGCTTCTGTCGTTGTTCCCCTCCTTG GAGGTCGACAACGGCTTCTGTCGTTGTTAGGCTTTGCCTTGAAGGTCTTGCTCTTCCCTT GGTCACTTTTGTGGTTTGGTCGTTTTGTCTCAAGCTTTTTGTGTCTTCTGTGTAAGGTTT CGCCAATTTTCCTTTAGCAAAATGTGCAGTTGTAAGGTTTTTGGGTCCGGTTTTCCTTAT AAACAGGGTCAACTCTTTTCTTCTTGTAATATCCGGTAGATCTCCTACCGTCGGTTCTTC AAAAAAGATATGAAGCGTCTAGATCCAGCCGAATCAGGTTGGGGAAAAGCAAAATCAGGG AGGATACTGGTGGCTGTGCCGACTGGCCCAAGACCCCAAGTATCCAAAGTGGCCCACTCC CACACGTACGTGTGCTGTGCAGTGCACCCACTCACTCACCGACCGGTTCTGTTTTAGTTT CAGGCTCCATCATCTCATATATGGAACAAATATGTTTAAATGATCAGCATCCTCATTTCT CATTGATCGGTCAGATCGTCTCCCACAGATCCAACATCCCAAGTCACTCCCACCTCCCTC ACGGCCTCACTCCGTCAATCACGCCGTCATGCGTACATCACTCACCTACCGCCCTCGCCA GAAACTGTGCTCCGCTCCATCCTCTCCCTCTCCATCGCTTCGCTGCAACGCCAACCGGCG CGCCGCCGCCGATTTCCGCTTCCCCTCCATCGCGCCTCCAAATCGGTGCCTCCAGATCGA CGTTGCCAGCGCCCGTCACAACCGTCGACAGGTAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)