cluster # 5153

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Oryza sativa
cluster # 5153 cluster # 5153 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_5153#0 length = 1775 sequences # 3
consensusID : consensus_5153#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1775
fasta sequence
                              [CTCCCTCCGCGATGATATAAAGAATCTGTCTTCTGGAGATGTTCACTTGTACTGCAAAGCATGCTCAGCAAGATTGACAAAACAGCCACTAAGGAACATCGAGGAAATGCCATCGTTAAACTGGGAAGATGTGGCTGACAATTGGTTTGGTGGATGTTGCACCTCATTTGGAGGTGCAAGCGAAAAGCTAGTATCACAGTATATCAATGCATATGGGCGTCTAGAGGGAACAAGTCTACTAAATGCTACCTCCATTAGCATAGAAAAGGATTATCTTGAGAAGGATTTAGCATCTGGGTTAGTTAGTTCAGTGCCCAGTAACGATTGTGATGCTCTGCAGGAAGATATATGTGATGTTCACATAGGAGAAGATCATACCACGGGGAACATGGAATTTAATAGTTCAGAAGAGAAAGCATATCATGAAAAGCAGATTGGTTGTAATCATGTGCAATGTTCTGTTGTTCCTGAAGAGGGTCCTTGTGTCAGTAATAGTGAAAAAGATGGAGACACTCTTTGGACTGATCAATCTGGCATCATTAAAGTGAACCCCGAGGAGTCTAAAAATGACTCTTGTGTTGATGACATAGAGAAACCTACCAAAGAGACCGATTTGTTGTCTGTAGATCCATGCAATTGCTGTTGTGACGGTGGAAACAGCAGAAAATCTGAAGACAATCCTTCGAACGTGCCCTCTGGGAACCTGGAAATGCAGGCTAAATTGGACACCCAAAGAGATTACAAATTAACAAAAAGTATATCTCTTGGTTGTAGCTTCATTGTGAAAGCATCTAACCTTGTAAATGATGTTGAATGGCTTGAACTTCTATGTGCTCATTGCTCATCACCTATTGGGTCATACCCTTCACAACATTCACATGCTCCAGCAGATGGCCGTGTACGACTATTTAAATGCTATGCATCGTCAGACCTTCATGTTGGGGGACCTCATGATGTGTTCAGGGGGCATACATTAGAAAGACTTTTTGTTAATTTGTTGCTTGAAGTTGCAGAAGATGAAATATCTTTTCGTACATTAGTCAGAGATCTGAAAACCAAAAGGCCCATCCTTCAAATAGTCCTCCTTAGTTCAAAAGCGTGGCTGTTTTCTGGCTACTGCTATGAAAATGATATGGATGGTTCACATGGGGCAGCACATCTGCAGCCCTCTGTTAAGATCTTGTATTCTAATTGCAGTAATGCTTTGGAAGAAGACTTAAGGACAGTAGAGGAGTGGTCATCCAAATATAGGGCTGAAGAGTTGTACATGATGAGGCGTCAAATAGATGAGCTTATTCTAAGCCTCAACTCAGCTAGGGATAATTTTCCACTTTCTTGCTCTTCCCTCCAGGGAATGTACCTCTCATCCCTAGAGCGTTGACTTGAAAATGAGATAAGCTCGGATCATGTCCTCATGCCCTAATACCTGTGCATACACAGTTTTAATATTCTTTCAGTGAACTCATTGACCATCTCATAAGTAAACTGCAATACATTGGGCTTGTCTTTTGCCGTCAAAAGACAGAGTGGCATCGAAATGGAGTAATGGAACAGAGCAATGGTGGATCCAGCTACCAGTGAATTCTGGCTCATTATGCTTTCGGTAGTAGGTTGTTTTATTCAACCATCTGGTTATCTACTTCATACAGTATTTGACATCTCGCTGTATCTCTGAAGAATTAGGTGATCCTGCTTGCAGTCTGTATCCTGGTATACGTTTAGATTTTCTCCCTTAATGGAGCTAATTTTGATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGG]

[+] EMBL AK102856             [CTCCCTCCGCGATGATATAAAGAATCTGTCTTCTGGAGATGTTCACTTGTACTGCAAAGCATGCTCAGCAAGATTGACAAAACAGCCACTAAGGAACATCGAGGAAATGCCATCGTTAAACTGGGAAGATGTGGCTGACAATTGGTTTGGTGGATGTTGCACCTCATTTGGAGGTGCAAGCGAAAAGCTAGTATCACAGTATATCAATGCATATGGGCGTCTAGAGGGAACAAGTCTACTAAATGCTACCTCCATTAGCATAGAAAAGGATTATCTTGAGAAGGATTTAGCATCTGGGTTAGTTAGTTCAGTGCCCAGTAACGATTGTGATGCTCTGCAGGAAGATATATGTGATGTTCACATAGGAGAAGATCATACCACGGGGAACATGGAATTTAATAGTTCAGAAGAGAAAGCATATCATGAAAAGCAGATTGGTTGTAATCATGTGCAATGTTCTGTTGTTCCTGAAGAGGGTCCTTGTGTCAGTAATAGTGAAAAAGATGGAGACACTCTTTGGACTGATCAATCTGGCATCATTAAAGTGAACCCCGAGGAGTCTAAAAATGACTCTTGTGTTGATGACATAGAGAAACCTACCAAAGAGACCGATTTGTTGTCTGTAGATCCATGCAATTGCTGTTGTGACGGTGGAAACAGCAGAAAATCTGAAGACAATCCTTCGAACGTGCCCTCTGGGAACCTGGAAATGCAGGCTAAATTGGACACCCAAAGAGATTACAAATTAACAAAAAGTATATCTCTTGGTTGTAGCTTCATTGTGAAAGCATCTAACCTTGTAAATGATGTTGAATGGCTTGAACTTCTATGTGCTCATTGCTCATCACCTATTGGGTCATACCCTTCACAACATTCACATGCTCCAGCAGATGGCCGTGTACGACTATTTAAATGCTATGCATCGTCAGACCTTCATGTTGGGGGACCTCATGATGTGTTCAGGGGGCATACATTAGAAAGACTTTTTGTTAATTTGTTGCTTGAAGTTGCAGAAGATGAAATATCTTTTCGTACATTAGTCAGAGATCTGAAAACCAAAAGGCCCATCCTTCAAATAGTCCTCCTTAGTTCAAAAGCGTGGCTGTTTTCTGGCTACTGCTATGAAAATGATATGGATGGTTCACATGGGGCAGCACATCTGCAGCCCTCTGTTAAGATCTTGTATTCTAATTGCAGTAATGCTTTGGAAGAAGACTTAAGGACAGTAGAGGAGTGGTCATCCAAATATAGGGCTGAAGAGTTGTACATGATGAGGCGTCAAATAGATGAGCTTATTCTAAGCCTCAACTCAGCTAGGGATAATTTTCCACTTTCTTGCTCTTCCCTCCAGGGAATGTACCTCTCATCCCTAGAGCGTTGACTTGAAAATGAGATAAGCTCGGATCATGTCCTCATGCCCTAATACCTGTGCATACACAGTTTTAATATTCTTTCAGTGAACTCATTGACCATCTCATAAGTAAACTGCAATACATTGGGCTTGTCTTTTGCCGTCAAAAGACAGAGTGGCATCGAAATGGAGTAATGGAACAGAGCAATGGTGGATCCAGCTACCAGTGAATTCTGGCTCATTATGCTTTCGGTAGTAGGTTGTTTTATTCAACCATCTGGTTATCTACTTCATACAGTATTTGACATCTCGCTGTATCTCTGAAGAATTAGGTGATCCTGCTTGCAGTCTGTATCCTGGTATACGTTTAGATTTTCTCCCTTAATGGAGCTAATTT                           ]
[+] EMBL CA766725             [                                                                                                                                                                                 AAGCGAAAAGCTAGTATNACAGTATATNAATGCATATGGGCGTCTAGAGGGAACAAGTCTACTAAATGCTACCTCCATTAGCATAGAAAAGGATTATCTTGAGAAGGATTTAGCATCTGGGTTAGTTAGTTCAGTGCCCAGTAACGATTGTGATGCTCTGCAGGAAGATATATGTGATGTTCACATAGGAGAAGATCATACCACGGGGAACATGGAATTTAATAGTTCAGAAGAGAAAGCATATCATGAAAAGCAGATTGGTTGTAATCATGTGCAATGTTCTGTTGTTCCTGAAGAGGGTCCTTGTGTCAGTAATAGTGAAAAAGATGGAGACACTCTTTGGACTGATCAATCTGGCATCATTAAAGTGAACCCCGAGGAGTCTAAAAATGACTCTTGTGTTGATGACATAGAGAAACCTACCAAAGAGACCGATTTGTTGTCTGTAGATCCATGCAATTGCTGTTGTGACGGTGGAAACAGCAGAAAATCTGAAGACAATCCTTCGAACGTGCCCTCTGGGAACCTGGAAATGCAGGCTAAATTGGACACCCAAAGAGATTACAAATTAACAAAAAGTATATCTCTTGGTTGTAGCTTCATTGTGAAAGCATCTAACCTTGTAAATGATGTTGAATGGCTTGAACTTCTATGTGCTCATTGCTCATCACCTATTGGGTCATACCCTTCACAACATTCACATGCTCCAGCAGATGGCCGTGTACGACTATTTAAATGCTATGCATCGTCAGACCCTCATGNTGGGGGACCTCATGATGTGNTCAn                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CB646043             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TAATTTGTTGCTTGAAGTTGCAGAAGATGAAATATCTTTTCGTACATTAGTCAGAGATCTGAAAACCAAAAGGCCCATCCTTCAAATAGTCCTCCTTAGTTCAAAAGCGTGGCTGTTTTCTGGCTACTGCTATGAAAATGATATGGATGGTTCACATGGGGCAGCACATCTGCAGCCCTCTGTTAAGATCTTGTATTCTAATTGCAGTAATGCTTTGGAAGAAGACTTAAGGACAGTAGAGGAGTGGTCATCCAAATATAGGGCTGAAGAGTTGTACATGATGAGGCGTCAAATAGATGAGCTTATTTTAAGCCTCAACTCAGCTAGGGATAATTTTCCACTTTCTTGCTCTTCCCTCCAGGGAATGTACCTCTCATCCCTAGAGCGTTGACTTGAAAATGAGATAAGCTCGGATCATGTCCTCATGCCCTAATACCTGTGCATACACAGTTTTAATATTCTTTCAGTGAACTCATTGACCATCTCATAAGTAAACTGCAATACATTGGGCTTGTCTTTTGCCGTCAAAAGACAGAGTGGCATCGAAATGGAGTAATGGAACAGAGCAATGGTGGATCCAGCTACCAGTGAATTCTGGCTCATTATGCTTTCGGTAGTAGGTTGTTTTATTCAACCATCTGGTTATCTACTTCATACAGTATTTGACATCTCGCTGTATCTCTGAAGAATTAGGTGATCCTGCTTGCAGTCTGTATCCTGGTATACGTTTAGATTTTCTCCCTTAATGGAGCTAATTTTGATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGG]




>consensus_5153#0
CTCCCTCCGCGATGATATAAAGAATCTGTCTTCTGGAGATGTTCACTTGTACTGCAAAGC
ATGCTCAGCAAGATTGACAAAACAGCCACTAAGGAACATCGAGGAAATGCCATCGTTAAA
CTGGGAAGATGTGGCTGACAATTGGTTTGGTGGATGTTGCACCTCATTTGGAGGTGCAAG
CGAAAAGCTAGTATCACAGTATATCAATGCATATGGGCGTCTAGAGGGAACAAGTCTACT
AAATGCTACCTCCATTAGCATAGAAAAGGATTATCTTGAGAAGGATTTAGCATCTGGGTT
AGTTAGTTCAGTGCCCAGTAACGATTGTGATGCTCTGCAGGAAGATATATGTGATGTTCA
CATAGGAGAAGATCATACCACGGGGAACATGGAATTTAATAGTTCAGAAGAGAAAGCATA
TCATGAAAAGCAGATTGGTTGTAATCATGTGCAATGTTCTGTTGTTCCTGAAGAGGGTCC
TTGTGTCAGTAATAGTGAAAAAGATGGAGACACTCTTTGGACTGATCAATCTGGCATCAT
TAAAGTGAACCCCGAGGAGTCTAAAAATGACTCTTGTGTTGATGACATAGAGAAACCTAC
CAAAGAGACCGATTTGTTGTCTGTAGATCCATGCAATTGCTGTTGTGACGGTGGAAACAG
CAGAAAATCTGAAGACAATCCTTCGAACGTGCCCTCTGGGAACCTGGAAATGCAGGCTAA
ATTGGACACCCAAAGAGATTACAAATTAACAAAAAGTATATCTCTTGGTTGTAGCTTCAT
TGTGAAAGCATCTAACCTTGTAAATGATGTTGAATGGCTTGAACTTCTATGTGCTCATTG
CTCATCACCTATTGGGTCATACCCTTCACAACATTCACATGCTCCAGCAGATGGCCGTGT
ACGACTATTTAAATGCTATGCATCGTCAGACCTTCATGTTGGGGGACCTCATGATGTGTT
CAGGGGGCATACATTAGAAAGACTTTTTGTTAATTTGTTGCTTGAAGTTGCAGAAGATGA
AATATCTTTTCGTACATTAGTCAGAGATCTGAAAACCAAAAGGCCCATCCTTCAAATAGT
CCTCCTTAGTTCAAAAGCGTGGCTGTTTTCTGGCTACTGCTATGAAAATGATATGGATGG
TTCACATGGGGCAGCACATCTGCAGCCCTCTGTTAAGATCTTGTATTCTAATTGCAGTAA
TGCTTTGGAAGAAGACTTAAGGACAGTAGAGGAGTGGTCATCCAAATATAGGGCTGAAGA
GTTGTACATGATGAGGCGTCAAATAGATGAGCTTATTCTAAGCCTCAACTCAGCTAGGGA
TAATTTTCCACTTTCTTGCTCTTCCCTCCAGGGAATGTACCTCTCATCCCTAGAGCGTTG
ACTTGAAAATGAGATAAGCTCGGATCATGTCCTCATGCCCTAATACCTGTGCATACACAG
TTTTAATATTCTTTCAGTGAACTCATTGACCATCTCATAAGTAAACTGCAATACATTGGG
CTTGTCTTTTGCCGTCAAAAGACAGAGTGGCATCGAAATGGAGTAATGGAACAGAGCAAT
GGTGGATCCAGCTACCAGTGAATTCTGGCTCATTATGCTTTCGGTAGTAGGTTGTTTTAT
TCAACCATCTGGTTATCTACTTCATACAGTATTTGACATCTCGCTGTATCTCTGAAGAAT
TAGGTGATCCTGCTTGCAGTCTGTATCCTGGTATACGTTTAGATTTTCTCCCTTAATGGA
GCTAATTTTGATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGG
clustalw multiple alignements is not computed in this case