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Oryza sativa
cluster # 5185 cluster # 5185       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5185#0 length = 652 sequences # 3  

consensusID : consensus_5185#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 652
fasta sequence
                              [CATGTGCCCCTCCTGCCGCCGCGTCGCCACCGCCGGCGCGCCGCACCAGCCTAACCACCAACAATGCCATCCCAAATCTAACACCACCATCTCCTCCTCCTCCACCGCCGCCGCCGCCGTCGCCGTCGCCGGCGGCAACGTGCTGCCCAGCCACTGCCAGTTCTTCCCGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGACCGGACAAGCCAGAGCACGTGGAACGCCGCCGCGCCGCTCGTCACCAGAGAGCTCTTCTAGAAACAATCCATCCATCGCCATGACAAACTTGGGAAAGGATCAAGCTTTGATTGGTCAAGACAGTGTTTTTACCAGGTGGTGATTTGGTTAATTAATTAATTATAATTAATCACTCAAGAGGAGGGGATTAATTGCCTTGATTTGGTACCTAATTACTAGTATGATTAGCAGTAGTAGTAGTAGCAGCAAATTTGGTTTGGATTAATTCAGTTTGATTCCATGATATGAACAAAGGAACAAAGCAACAAAAAAATGGCCGTCTGCTTTTTCTTGGACGGCATTCTTATATGTACCAATTCACCAAATCTGCTGGTTGGTGGATTAACAGCTTGATAATTGGTATATTGATTGTACTACTACCACTAATTGATTGAATTATGAGAAAAGTTAATGAAATCTTTT]

[+] EMBL AK105150             [CATGTGCCCCTCCTGCCGCCGCGTCGCCACCGCCGGCGCGCCGCACCAGCCTAACCACCAACAATGCCATCCCAAATCTAACACCACCATCTCCTCCTCCTCCACCGCCGCCGCCGCCGTCGCCGTCGCCGGCGGCAACGTGCTGCCCAGCCACTGCCAGTTCTTCCCGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGACCGGACAAGCCAGAGCACGTGGAACGCCGCCGCGCCGCTCGTCACCAGAGAGCTCTTCTAGAAACAATCCATCCATCGCCATGACAAACTTGGGAAAGGATCAAGCTTTGATTGGTCAAGACAGTGTTTTTACCAGGTGGTGATTTGGTTAATTAATTAATTATAATTAATCACTCAAGAGGAGGGGATTAATTGCCTTGATTTGGTACCTAATTACTAGTATGATTAGCAGTAGTAGTAGTAGCAGCAAATTTGGTTTGGATTAATTCAGTTTGATTCCATGATATGAACAAAGGAACAAAGCAACAAAAAAATGGCCGTCTGCTTTTTCTTGGACGGCATTCTTATATGTACCAATTCACCAAATCTGCTGGTTGGTGGATTAACAGCTTGATAATTGGTATATTGATTGTACTACTACCACTAATTGATTGAATTATGAGAAAAGTTAATGAAATCTTTT]
[+] EMBL AF145726             [CATGTGCCCCTCCTGCCGCCGAGTCGCCACCGCCGGCGCGCCGCACCAGCCTAACCACCAACAATGCCATCCCAAATCTAACATCACCATCTCCTCCTCCTCCACCGCCGCCGCCGCCGTCGCCGTCGCCGGCGGCAACGTGCTGCCCAGCCACTGCCAGTTCTTCCCGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGACCGGACAAGCCAGAGCACGTGGAACGCCGCCGCGCCGCTCGTCACCAGAGAGCTCTTCTAGAAACAATCCATCCATCGCCATGACAAACTTGGGAAAGGATCAAGCTTTGATTGGTCAAGACAGTGTTTTTACCAGGTGGTGATTTGGTTAATTAATTAATTATAATTAATCACTCAAGAGGAGGGGATTAATTGCCTTGATTTGGTACCTAATTACTAGTATGATTAGCAGTAGTAGTAGT   AGCAAATTTGGTTTGGATTAATTCAGTTTGATTCCATGATATGAACAAAGGAACAAAGCAACAAAAAAATGGCCGTCTGCTTTTTCTTGGACGGCATTCTTATATGTACCAATTCACCAAATCTGCTGGTTGGTGGATTAACAGCTTGATAATTGGTATATTGATTGTACTACTACCACTAATTGATTGAATTATGAGAAAAGTTAATGAAAaaaaa ]
[+] EMBL AY206864             [CATGTGCCCCTCCTGCCGCCGCGTCGCCACCGCCGGCGCGCCGCACCAGCCTAACCACCAACAATGCCATCCCAAATCTAACACCACCATCTCCTCCTCCTCCACCGCCGCCGCCGCCGTCGCCGTCGCCGGCGGCAACGTGCTGCCCAGCCACTGCCAGTTCTTCCCGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGACCGGACAAGCCAGAGCACGTGGAACGCCGCCGCGCCGCTCGTCACCAGAGAGCTCTTCTAGAAACAATCCATCCATCGCCATGACAAACTTGGGAAAGGATCAAGCTTTGATTGGTCAAGACAGTGTTTTTACCAGGTGGTGATTTGGTTAATTAATTAATTATAATTAATCACTCAAGAGGAGGGGATTAATTGCCTTGATTTGGTACCTAATTACTAGTATGATTAGCAGTAGTAGTAGTAGCAGCAAATTTGGTTTGGATTAATTCAGTTTGATTCCATGATATGAACAAAGGAACAAAGCAACAAAAAAATGGCCGTCTGCTTTTTCTTGGACGGCATTCTTATATGTACCAATTCACCAAATCTGCTGGTTGGTGGATTAACAGCTTGATAATTGGTATATTGATTGTACTACTACCACTAATTGATTGAATTATGAGAAAAGTTA            ]


>consensus_5185#0 CATGTGCCCCTCCTGCCGCCGCGTCGCCACCGCCGGCGCGCCGCACCAGCCTAACCACCA ACAATGCCATCCCAAATCTAACACCACCATCTCCTCCTCCTCCACCGCCGCCGCCGCCGT CGCCGTCGCCGGCGGCAACGTGCTGCCCAGCCACTGCCAGTTCTTCCCGGCCGCCGCCGC CGCCGCCGACCGGACAAGCCAGAGCACGTGGAACGCCGCCGCGCCGCTCGTCACCAGAGA GCTCTTCTAGAAACAATCCATCCATCGCCATGACAAACTTGGGAAAGGATCAAGCTTTGA TTGGTCAAGACAGTGTTTTTACCAGGTGGTGATTTGGTTAATTAATTAATTATAATTAAT CACTCAAGAGGAGGGGATTAATTGCCTTGATTTGGTACCTAATTACTAGTATGATTAGCA GTAGTAGTAGTAGCAGCAAATTTGGTTTGGATTAATTCAGTTTGATTCCATGATATGAAC AAAGGAACAAAGCAACAAAAAAATGGCCGTCTGCTTTTTCTTGGACGGCATTCTTATATG TACCAATTCACCAAATCTGCTGGTTGGTGGATTAACAGCTTGATAATTGGTATATTGATT GTACTACTACCACTAATTGATTGAATTATGAGAAAAGTTAATGAAATCTTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)