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Oryza sativa
cluster # 5186 cluster # 5186       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5186#0 length = 619 sequences # 3  

consensusID : consensus_5186#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 619
fasta sequence
                              [TGAGTTCGCCGTTGTCGTTCCAGGTGTAATCGCGGTCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGACAGCCAGCCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCGGGCAGGCTGTCCGGTATACAGCGGTTCGCCAGTCCCTGTGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTTCATTCGTCTGCGGATGATGCACCGTCAGGTGTTCACTGGCGAGGCGGCCTTTACTGTCATAACCATAGTGCACCGTCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATGGCTGATGTCTGTCAGCCAGCCGCGTTCGTCATACTGCCACCGCTCTGCGGTTTCGCCATTCACGGTGCGGTGCGTGAGGCGGTCTGCTTCGTCATAGTGCCAGTGGGTGACCAGCCCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCGAGTAC]

[+] EMBL CF340069             [TGAGTTCGCCGTTGTCGTTCCAGGTGTAATCGCGGTCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGACAGCCAGCCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCGGGCAGGCTGTCCGGTATACAGCGGTTCGCCAGTCCCTGTGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTTCATTCGTCTGCGGATGATGCACCGTCAGGTGTTCACTGGCGAGGCGGCCTTTACTGTCATAACCATAGTGCACCGTCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATGGCTGATGTCTGTCAGCCAGCCGCGTTCGTCATACTGCCACCGCTCTGCGGTTTCGCCATTCACGGTGCGGTGCGTGAGGCGGTCTGCTTCGTCATAGTGCCAGTGGGTGACCAGCCCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCGAGTAC]
[+] EMBL CF339664             [TGAGTTCGCCGTTGTCGTTCCAGGTGTAATCGCGGTCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGACAGCCAGCCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCGGGCAGGCTGTCCGGTATACAGCGGTTCGCCAGTCCCTGTGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTTCATTCGTCTGCGGATGATGCACCGTCAGGTGTTCACTGGCGAGGCGGCCTTTACTGTCATAACCATAGTGCACCGTCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATGGCTGATGTCTGTCAGCCAGCCGCGTTCGTCATACTGCCACCGCTCTGCGGTTTCGCCATTCACGGTGCGGTGCGTGAGGCGGTCTGCTTCGTCATAGTGCCA                                                                                                               ]
[+] EMBL CF338269             [TGAGTTCGCCGTTGTCGTTCCAGGTGTAATCGCGGTCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGACAGCCAGCCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCGGGCAGGCTGTCCGGTATACAGCGGTTCGCCAGTCCCTGTGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTTCATTCGTCTGCGGATGATGCACCGTCAGGTGTTCACTGGCGAGGCGGCCTTTACTGTCATAACCATAGTGCACCGTCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATGGCTGATGTCTGTCAGCCAGCCGCGTTCGTCATACTGCCACCGCTCTGCGGTTTCGCCATTCACGGTGCGGTGCGTGAGGCGGTCTGCTTC                                                                                                                           ]


>consensus_5186#0 TGAGTTCGCCGTTGTCGTTCCAGGTGTAATCGCGGTCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCT GGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGC GCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTT TCATGCCTGACAGCCAGCCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCGGGCAGGCTGTCCG GTATACAGCGGTTCGCCAGTCCCTGTGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGA GCAGTTCATTCGTCTGCGGATGATGCACCGTCAGGTGTTCACTGGCGAGGCGGCCTTTAC TGTCATAACCATAGTGCACCGTCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATGGCTGATGTCTGTCA GCCAGCCGCGTTCGTCATACTGCCACCGCTCTGCGGTTTCGCCATTCACGGTGCGGTGCG TGAGGCGGTCTGCTTCGTCATAGTGCCAGTGGGTGACCAGCCCCTCATCCTCGCTGCGGA TAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCT GTATCAGCCGGTCGAGTAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)