cluster # 5236

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 5236 cluster # 5236 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5236#0 length = 1637 sequences # 3
consensusID : consensus_5236#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1637
fasta sequence
                              [GCGCGGCGGCGCCGGCGGCGCCGCCGAGACCCACCGCGTGCAGCTGCCGGACACGGCCACGCTCTCCGACGTCAAGGCCTTCCTCGCCACCAAGCTGTCCGCGGCGCAGCCCGTGCCCGCCGAGTCGGTGCGCCTCACCCTCAACCGCTCCGAGGAGCTCCTCACCCCCGACCCCTCCGCTACCCTCCCGGCCCTCGGGCTCGCGTCCGGTGATCTCCTCTACTTCACGCTCTCCCCCCTCCCGTCGCCCTCGCCTCCGCCGCAGCCGCAGCCACAGGCCCAACCCCTGCCCCGTAACCCTAACCCTGATGTCCCCTCGATCGCGGGAGCTGCTGACCCGACCAAATCTCCTGTGGAGTCTGGTAGCTCCTCGTCGATGCCGCAAGCTTTGTGCACGAATCCTGGCTTACCTGTCGCATCCGATCCGCATCATCCTCCACCGGATGTGGTGATGGCGGAGGCCTTCGCCGTGATCAAGAGCAAGTCGAGTCTCGTCGTCGGGGATACGAAGAGAGAGATGGAGAATGTCGGTGGTGCGGATGGAACCGTCATCTGTCGCCTTGTCGTGGCGCTGCATGCGGCCTTGCTCGATGCCGGCTTCCTCTATGCAAACCCGGTGGGGTCTTGCCTTCAGCTGCCACAGAATTGGGCGTCAGGTTCTTTTGTCCCCGTATCGATGAAGTACACCCTGCCAGAGCTTGTAGAAGCGTTACCTGTGGTTGAGGAGGGGATGGTGGCAGTGCTGAACTACTCCTTGATGGGGAATTTTATGATGGTGTATGGGCATGTGCCTGGGGCAACATCGGGGGTGCGAAGGTTGTGCTTGGAGCTGCCGGAGCTTGCGCCTTTGTTGTACTTGGATAGTGATGAGGTGAGCACAGCAGAGGAGAGGGAAATTCATGAGCTGTGGAGGGTCCTGAAGGATGAGATGTGCTTGCCTCTGATGATATCGTTGTGTCAACTGAACAATTTGAGCTTGCCACCGTGCTTGATGGCGCTGCCAGGTGATGTCAAGGCAAAGGTCCTGGAGTTTGTTCCTGGGGTGGATCTTGCAAGGGTTCAATGCACGTGCAAGGAATTGAGGGATCTTGCTGCAGATGATAATCTTTGGAAGAAGAAGTGTGAGATGGAGTTCAATACTCAAGGTGAGAGTTCTCAGGTGGGCAGGAACTGGAAGGAAAGGTTTGGAGCAGCCTGGAAGGTTTCTAACAATAAGGGCCAGAAGAGGCCCAGTCCTTTTTTTAACTATGGCTGGGGTAATCCTTATAGTCCACATGGCTTTCCGGTGATTGGTGGGGATTCAGACATGCTCCCGTTTATCGGGCATCCCAATCTCCTTGGGCGCAGCTTTGGAAATCAGCGCAGGAACATCTCACCCAGCTGCAG-TTTTGGTGGACACCATCGCAACTTTCTTGGTTAAGTCA-TTTCGTGGGTTTTGCTAGTATGTTAAGAATATTTCATCTGAAAAGCTACATATAACAT-ATTGTACATATTTTATAGTTGGCACTTTATGCATGTTCAGTTGTTAACTGTATTACTGTACTCGTAATCTTTTC-TTTCTTTGTTGATATATCCTATATTTTCTTG-ANNANCAGNGTTATGCATGCCCGGATCATGGTAAAGTATCGTCTGTTTAA]

[+] EMBL AK068324             [GCGCGGCGGCGCCGGCGGCGCCGCCGAGACCCACCGCGTGCAGCTGCCGGACACGGCCACGCTCTCCGACGTCAAGGCCTTCCTCGCCACCAAGCTGTCCGCGGCGCAGCCCGTGCCCGCCGAGTCGGTGCGCCTCACCCTCAACCGCTCCGAGGAGCTCCTCACCCCCGACCCCTCCGCTACCCTCCCGGCCCTCGGGCTCGCGTCCGGTGATCTCCTCTACTTCACGCTCTCCCCCCTCCCGTCGCCCTCGCCTCCGCCGCAGCCGCAGCCACAGGCCCAACCCCTGCCCCGTAACCCTAACCCTGATGTCCCCTCGATCGCGGGAGCTGCTGACCCGACCAAATCTCCTGTGGAGTCTGGTAGCTCCTCGTCGATGCCGCAAGCTTTGTGCACGAATCCTGGCTTACCTGTCGCATCCGATCCGCATCATCCTCCACCGGATGTGGTGATGGCGGAGGCCTTCGCCGTGATCAAGAGCAAGTCGAGTCTCGTCGTCGGGGATACGAAGAGAGAGATGGAGAATGTCGGTGGTGCGGATGGAACCGTCATCTGTCGCCTTGTCGTGGCGCTGCATGCGGCCTTGCTCGATGCCGGCTTCCTCTATGCAAACCCGGTGGGGTCTTGCCTTCAGCTGCCACAGAATTGGGCGTCAGGTTCTTTTGTCCCCGTATCGATGAAGTACACCCTGCCAGAGCTTGTAGAAGCGTTACCTGTGGTTGAGGAGGGGATGGTGGCAGTGCTGAACTACTCCTTGATGGGGAATTTTATGATGGTGTATGGGCATGTGCCTGGGGCAACATCGGGGGTGCGAAGGTTGTGCTTGGAGCTGCCGGAGCTTGCGCCTTTGTTGTACTTGGATAGTGATGAGGTGAGCACAGCAGAGGAGAGGGAAATTCATGAGCTGTGGAGGGTCCTGAAGGATGAGATGTGCTTGCCTCTGATGATATCGTTGTGTCAACTGAACAATTTGAGCTTGCCACCGTGCTTGATGGCGCTGCCAGGTGATGTCAAGGCAAAGGTCCTGGAGTTTGTTCCTGGGGTGGATCTTGCAAGGGTTCAATGCACGTGCAAGGAATTGAGGGATCTTGCTGCAGATGATAATCTTTGGAAGAAGAAGTGTGAGATGGAGTTCAATACTCAAGGTGAGAGTTCTCAGGTGGGCAGGAACTGGAAGGAAAGGTTTGGAGCAGCCTGGAAGGTTTCTAACAATAAGGGCCAGAAGAGGCCCAGTCCTTTTTTTAACTATGGCTGGGGTAATCCTTATAGTCCACATGGCTTTCCGGTGATTGGTGGGGATTCAGACATGCTCCCGTTTATCGGGCATCCCAATCTCCTTGGGCGCAGCTTTGGAAATCAGCGCAGGAACATCTCACCCAGCTGCAG TTTTGGTGGACACCATCGCAACTTTCTTGGTTAAGTCA TTTCGTGGGTTTTGCTAGTATGTTAAGAATATTTCATCTGAAAAGCTACATATAACAT ATTGTACATATTTTATAGTTGGCACTTTATGCATGTTCAGTTGTTAACTGTATTACTGTACTCGTAATCTTTTC TTTCTTTGTTGATATATCCTAT                                                            ]
[+] EMBL CA767157             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGAACTACTCCTTGATGGGGAATTTTATGATGGTGTATGGGCATGTGCCTGGGGCAACATCGGGGGTGCGAAGGTTGTGCTTGGAGCTGCCGGAGCTTGCGCCTTTGTTGTACTTGGATAGTGATGAGGTGAGCACAGCAGAGGAGAGGGAAATTCATGAGCTGTGGAGGGTCCTGAAGGATGAGATGTGCTTGCCTCTGATGATATCGTTGTGTCAACTGAACAATTTGAGCTTGCCTCCGTGCTTGATGGCGCTGCCAGGTGATGTCAAGGCGAAGGTCCTGGAGTTTGTTCCTGGGGTGGATCTTGCAAGGGTTCAATGCACGTGCAAGGAATTGAGGGATCTTGCTGCAGATGATAATCTTTGGAAGAAGAAGTGTGAGATGGAGTTCAATACTCAAGGTGAGAGTTCTCAGGTGGGCAGGAACTGGAAGGAAAGGTTTGGAGCAGCCTGGAAGGTTTCTAACAATAAGGGCCAGAAGAGGCCCAGTCCTTTTTTTAACTATGGCTGGGGTAATCCTTATAGTCCACATGGCTTTCCGGTGATTGGTGGGGATTCAGACATGCTCCCGTTTATCGGGCATCCCAATCTCCTTGGGCGCAGCTTTGGAAATCAGCGCAGGAACATCTCACCCAGCTGCAGTTTTTGGTGGACACCATCGCAACTTTCTTGGTTAAGTCATTTTCCTGGGTTTTGCTAGTATGNTAAGAATATTTCATCTGNAAAGCTACATATAACATAATTGTACATATTTTATAGNTGGCACTTTATGCATGGTCAGTTGGTAACTGNATTACTGGACTCGGAANCCTTTCTTTTCTTTGGTGANANAACCTATATTTTCTTG ANNANCAGNGTTATGCATGCCC                            ]
[-] EMBL CB652685             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GAGGTGAGCACAGCAGAGGAGAGGGAAATTCATGAGCTGTGGAGGGTCCTGAAGGATGAGATGTGCTTGCCTCTGATGATATCGTTGTGTCAACTGAACAATTTGAGCTTGCCACCGTGCTTGATGGCGCTGCCAGGTGATGTCAAGGCAAAGGTCCTGGAGTTTGTTCCTGGGGTGGATCTTGCAAGGGTTCAATGCACGTGCAAGGAATTGAGGGATCTTGCTGCAGATGATAATCTTTGGAAGAAGAAGTGTGAGATGGAGTTCAATACTCAAGGTGAGAGTTCTCAGGTGGGCAGGAACTGGAAGGAAAGGTTTGGAGCAGCCTGGAAGGTTTCTAACAATAAGGGCCAGAAGAGGCCCAGTCCTTTTTTTAACTATGGCTGGGGTAATCCTTATAGTCCACATGGCTTTCCGGTGATTGGTGGGGATTCAGACATGCTCCCGTTTATCGGGCATCCCAATCTCCTTGGGCGCAGCTTTGGAAATCAGCGCAGGAACATCTCACCCAGCTGCAG TTTTGGTGGACACCATCGCAACTTTCTTGGTTAAGTCA TTTCGTGGGTTTTGCTAGTATGTTAAGAATATTTCATCTGAAAAGCTACATATAACAT ATTGTACATATTTTATAGTTGGCACTTTATGCATGTTCAGTTGTTAACTGTATTACTGTACTCGTAATCTTTTC TTTCTTTGTTGATATATCCTATATTTTCTTGTAGTACCAGTGTTATGCATGCATGGATCATGGTAAAGTATCGTCTGTTTAA]




>consensus_5236#0
GCGCGGCGGCGCCGGCGGCGCCGCCGAGACCCACCGCGTGCAGCTGCCGGACACGGCCAC
GCTCTCCGACGTCAAGGCCTTCCTCGCCACCAAGCTGTCCGCGGCGCAGCCCGTGCCCGC
CGAGTCGGTGCGCCTCACCCTCAACCGCTCCGAGGAGCTCCTCACCCCCGACCCCTCCGC
TACCCTCCCGGCCCTCGGGCTCGCGTCCGGTGATCTCCTCTACTTCACGCTCTCCCCCCT
CCCGTCGCCCTCGCCTCCGCCGCAGCCGCAGCCACAGGCCCAACCCCTGCCCCGTAACCC
TAACCCTGATGTCCCCTCGATCGCGGGAGCTGCTGACCCGACCAAATCTCCTGTGGAGTC
TGGTAGCTCCTCGTCGATGCCGCAAGCTTTGTGCACGAATCCTGGCTTACCTGTCGCATC
CGATCCGCATCATCCTCCACCGGATGTGGTGATGGCGGAGGCCTTCGCCGTGATCAAGAG
CAAGTCGAGTCTCGTCGTCGGGGATACGAAGAGAGAGATGGAGAATGTCGGTGGTGCGGA
TGGAACCGTCATCTGTCGCCTTGTCGTGGCGCTGCATGCGGCCTTGCTCGATGCCGGCTT
CCTCTATGCAAACCCGGTGGGGTCTTGCCTTCAGCTGCCACAGAATTGGGCGTCAGGTTC
TTTTGTCCCCGTATCGATGAAGTACACCCTGCCAGAGCTTGTAGAAGCGTTACCTGTGGT
TGAGGAGGGGATGGTGGCAGTGCTGAACTACTCCTTGATGGGGAATTTTATGATGGTGTA
TGGGCATGTGCCTGGGGCAACATCGGGGGTGCGAAGGTTGTGCTTGGAGCTGCCGGAGCT
TGCGCCTTTGTTGTACTTGGATAGTGATGAGGTGAGCACAGCAGAGGAGAGGGAAATTCA
TGAGCTGTGGAGGGTCCTGAAGGATGAGATGTGCTTGCCTCTGATGATATCGTTGTGTCA
ACTGAACAATTTGAGCTTGCCACCGTGCTTGATGGCGCTGCCAGGTGATGTCAAGGCAAA
GGTCCTGGAGTTTGTTCCTGGGGTGGATCTTGCAAGGGTTCAATGCACGTGCAAGGAATT
GAGGGATCTTGCTGCAGATGATAATCTTTGGAAGAAGAAGTGTGAGATGGAGTTCAATAC
TCAAGGTGAGAGTTCTCAGGTGGGCAGGAACTGGAAGGAAAGGTTTGGAGCAGCCTGGAA
GGTTTCTAACAATAAGGGCCAGAAGAGGCCCAGTCCTTTTTTTAACTATGGCTGGGGTAA
TCCTTATAGTCCACATGGCTTTCCGGTGATTGGTGGGGATTCAGACATGCTCCCGTTTAT
CGGGCATCCCAATCTCCTTGGGCGCAGCTTTGGAAATCAGCGCAGGAACATCTCACCCAG
CTGCAGTTTTGGTGGACACCATCGCAACTTTCTTGGTTAAGTCATTTCGTGGGTTTTGCT
AGTATGTTAAGAATATTTCATCTGAAAAGCTACATATAACATATTGTACATATTTTATAG
TTGGCACTTTATGCATGTTCAGTTGTTAACTGTATTACTGTACTCGTAATCTTTTCTTTC
TTTGTTGATATATCCTATATTTTCTTGANNANCAGNGTTATGCATGCCCGGATCATGGTA
AAGTATCGTCTGTTTAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case