cluster # 5366

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Oryza sativa
cluster # 5366 cluster # 5366 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5366#0 length = 882 sequences # 3

consensusID : consensus_5366#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 882
fasta sequence

                              [TTACATTCATAATTTAAGCTTCAACTAATCGCTTCTGTTTTTGGCTAAGAAGTGTTCCAACAATTTGCTAATTGTATTCATAAAACTTTATTGGATGTATCTTCATTGCACACCTTCTTCATTTTTTTAATTTATAACTCTAGAGGCCAAACCGCCAAAGCATGAAAATTATGAAGGAAAAAAAGGGCTTGCATGTTGATAGATATATATGCGCTTCATTGGTTTTTCTATACGAGCTTTCAATTTTTTGATGCTACTTGTTTGAGTATAACGCATACATCTGCTGGAGTCACAGACAACCTCAAAATCCTTAATTCCTTTTTTGTCATCTAAAAATTGACAAATTGTATTCTTTTTGTGTCACGGGATCTTTAGTGGACATGACACATGAGTTAAAGCAAAAGGCAGATGCTTGTATGAGAGCAGTTCTTGCAGAGTTCAGAAAGCAGAAGGTTTAGGTGTTTAAATGGAAGCGATTCTTCAAAGTTCTGGTATCTTCATAGAATAGCTTTGTTATCCCTTGTAAAATTTTTAATGTAATTTTATGGAATATACATATGGTTATCGACAAATCCAAATTTAACTTAAGGTACACTATTATGCTATGCAACAAGCGAGGGAACCAGTTGTCTCCTACATGTCTGGGGTGAAAAAATATCATATGTAGAATTGCTTCTACAGATTCCCTATCGATATCCATTCCTATTTGCTTGATTATATTTTTTGTGGATATAGATCAGTACATTTTAGACATGGAGTCACAGTGATCATCGTATGACTAGGAGCTGGTTCATTGTTGCAGATTAATTACAGTTTATATATGAAGAAAATTTGTCGGTGTTAATGATTATATGTTTAATGTAAAATTCAGTTATTTGGATC]

[+] EMBL CB000437             [TTACATTCATAATTTAAGCTTCAACTAATCGCTTCTGTTTTTGGCTAAGAAGTGTTCCAACAATTTGCTAATTGTATTCATAAAACTTTATTGGATGTATCTTCATTGCACACCTTCTTCATTTTTTTAATTTATAACTCTAGAGGCCAAACCGCCAAAGCATGAAAATTATGAAGGAAAAAAAGGGCTTGCATGTTGATAGATATATATGCGCTTCATTGGTTTTTCTATACGAGCTTTCAATTTTTTGATGCTACTTGTTTGAGTATAACGCATACATCTGCTGGAGTCACAGACAACCTCAAAATCCTTAATTCCTTTTTTGTCATCTAAAAATTGACAAATTGTATTCTTTTTGTGTCACGGGATCTTTAGTGGACATGACACATGAGTTAAAGCAAAAGGCAGATGCTTGTATGAGAGCAGTTCTTGCAGAGTTCAGAAAGCAGAAGGTTTAGGTGTTTAAATGGAAGCGATTCTTCAAAGTTCTGGTATCTTCATAGAATAGCTTTGTTATCCCTTGTAAAATTTTTAATGTAATTTTATGGAATATACATATGGTTATCGACAAATCCAAATTTAACTTAAGGTACACTATTATGCTATGCAACAAGCGAGGGAACCAGTTGTCTCCTACATGTCTGGGGTGAAAAAATATCATATGTAGAATTGCTTCTACAGATTCCCTATCGATATCCATTCCTATTTGCTTGATTATATTTTTTGTGGATATAGATCAGTACATTTTAGACATGGAGTCACAGTGATCAT                                                                                                               ]
[+] EMBL CA999091             [  ACATTCATAATTTAAGCTTCAACTAATCGCTTGCGTTTTTGGCTAAGAAGTGTTCCAACAATTTGCTAATTGTATTCATAAAACTTTATTGGATGTATCTTCATTGCACACCTTCTTCATTTTTTTAATTTATAACTCTAGAGGCCAAACCGCCAAAGCATGAAAATTATGAAGGAAAAAAAGGGCTTGCATGTTGATAGATATATATGCGCTTCATTGGTTTTTCTATACGAGCTTTCAATTTTTTGATGCTACTTGTTTGAGTATAACGCATACATCTGCTGGAGTCACAGACAACCTCAAAATCCTTAATTCCTTTTTTGTCATCTAAAAATTGACAAATTGTATTCTTTTTGTGTCACGGGATCTTTAGTGGACATGACACATGAGTTAAAGCAAAAGGCAGATGCTTGTATGAGAGCAGTTCTTGCAGAGTTCAGAAAGCAGAAGGTTTAGGTGTTTAAATGGAAGCGATTCTTCAAAGTTCTGGTATCTTCATAGAATAGCTTTGTTATCCCTTGTAAAATTTTTAATGTAATTTTATGGAATATACATATGGTTATCGACAAATCCAAATTTAACTTAAGGTACACTATTATGCTATGCAACAAGCGAGGGAACCAGTTGTCT                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CB000510             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATTATATTTTTTGTGGATATAGATAAGTACATTTTAGAGATGGAGTCACAGTGATCATCGTATGACTAGGAGCTGGTTCATTGTTGCAGATTAATTACAGTTTATATATGAAGAAAATTTGTCGGTGTTAATGATTATATGTTTAATGTAAAATTCAGTTATTTGGATC]




>consensus_5366#0
TTACATTCATAATTTAAGCTTCAACTAATCGCTTCTGTTTTTGGCTAAGAAGTGTTCCAA
CAATTTGCTAATTGTATTCATAAAACTTTATTGGATGTATCTTCATTGCACACCTTCTTC
ATTTTTTTAATTTATAACTCTAGAGGCCAAACCGCCAAAGCATGAAAATTATGAAGGAAA
AAAAGGGCTTGCATGTTGATAGATATATATGCGCTTCATTGGTTTTTCTATACGAGCTTT
CAATTTTTTGATGCTACTTGTTTGAGTATAACGCATACATCTGCTGGAGTCACAGACAAC
CTCAAAATCCTTAATTCCTTTTTTGTCATCTAAAAATTGACAAATTGTATTCTTTTTGTG
TCACGGGATCTTTAGTGGACATGACACATGAGTTAAAGCAAAAGGCAGATGCTTGTATGA
GAGCAGTTCTTGCAGAGTTCAGAAAGCAGAAGGTTTAGGTGTTTAAATGGAAGCGATTCT
TCAAAGTTCTGGTATCTTCATAGAATAGCTTTGTTATCCCTTGTAAAATTTTTAATGTAA
TTTTATGGAATATACATATGGTTATCGACAAATCCAAATTTAACTTAAGGTACACTATTA
TGCTATGCAACAAGCGAGGGAACCAGTTGTCTCCTACATGTCTGGGGTGAAAAAATATCA
TATGTAGAATTGCTTCTACAGATTCCCTATCGATATCCATTCCTATTTGCTTGATTATAT
TTTTTGTGGATATAGATCAGTACATTTTAGACATGGAGTCACAGTGATCATCGTATGACT
AGGAGCTGGTTCATTGTTGCAGATTAATTACAGTTTATATATGAAGAAAATTTGTCGGTG
TTAATGATTATATGTTTAATGTAAAATTCAGTTATTTGGATC

clustalw multiple alignements is not computed in this case