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Oryza sativa
cluster # 5396 cluster # 5396       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5396#0 length = 482 sequences # 3  

consensusID : consensus_5396#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 482
fasta sequence
                              [GCCGCCACCGCCACCGACGCCGCGGCCGCCGCCGGAATGAAGGCCCTCTCCGCCGCCGACAGCGCGGCATCCCCGGCGACAAAGATCACCATCCCGTACTACTCCGCGGCGGCGGGGGCCGGCGAGGCGGGGCCGCCGTTCGGGAAGGGGCGGTACAAGGTGTGGGCCTTGGCGGCCATCGCGCTCCTC-GCGCTCTGGTCCATGTCCGCCGCCTCCGCCTCCCTCCGCTGGTCCTCCGGCCGCTTCCTCCTCGCCGCCACCGCCTCCGAGGACCTCGACGCGCCCCTCCTCGACGACCTCGACTCGCTCGTACGCTCGTTACCTCCCACTCCACTCCCCTCTTCTTCCCCTTTTGCTTATTGCCAACTGCTTGCTGCGTGGTCTCGTCTATATGCGCAATGCCTTGTTTGAGTAGGAATTGAATTTGAAACAGTTGTGAATTGCTATCGGTATTGCTTGGAGGTCTCTGAATAAGTGTGTTC]

[+] EMBL CB636410             [GCCGCCACCGCCACCGACGCCGCGGCCGCCGCCGGAATGAAGGCCCTCTCCGCCGCCGACAGCGCGGCATCCCCGGCGACAAAGATCACCATCCCGTACTACTCCGCGGCGGCGGGGGCCGGCGAGGCGGGGCCGCCGTTCGGGAAGGGGCGGTACAAGGTGTGGGCCTTGGCGGCCATCGCGCTCCTC GCGCTCTGGTCCATGTCCGCCGCCTCCGCCTCCCTCCGCTGGTCCTCCGGCCGCTTCCTCCTCGCCGCCACCGCCTCCGAGGACCTCGACGCGCCCCTCCTCGACGACCTCGACTCGCTCGTACGCTCGTTACCTCCCACTCCACTCCCCTCTTCTTCCCCTTTTGCTTATTGCCAACTGCTTGCTGCGTGGTCTCGTCTATATGCGCAATGCCTTGTTTGAGTAGGAATTGAATTTGAAACAGTTGTGAATTGCTATCGGTATTGCTTGGAGGTCTCTGAATAAGTGTGTTC]
[+] EMBL CB636422             [GCCGCCACCGCCACCGACGCCGCGGCCGCCGCCGGAATGAAGGCCCTCTCCGCCGCCGACAGCGCGGCATCCCCGGCGACAAAGATCACCATCCCGTACTACTCCGCGGCGGCGGGGGCCGGCGAGGCGGGGCCGCCGTTCGGGAAGGGGCGGTACAAGGTGTGGGCCTTGGCGGCCATCGCGCTCCTC GCGCTCTGGTCCATGTCCGCCGCCTCCGCCTCCCTCCGCTGGTCCTCCGGCCGCTTCCTCCTCGCCGCCACCGCCTCCGAGGACCTCGACGCGCCCCTCCTCGACGACCTCGACTCGCTCGTACGCTCGTTACCTCCCACTCCACTCCCCTCTTCTTCCCCTTTTGCTTATTGCCAACTGCTTGCTGCGTGGTCTCGTCTATATGCGCAATGCCTTGTTTGA                                                                       ]
[+] EMBL CB639830             [GCCGCCACCGCCACCGACGCCGCGGCCGCCGCCGGAATGAAGGCCCTCTCCGCCGCCGACAGCGCGGCATCCCCGGCGACAAAGATCACCATCCCGTACTACTCCGCGGCGGCGGGGGCCGGCGAGGCGGGGCCCCCGTTCGGGAATGGGCTGTACAAGGTGTGGGCCTTGGCGGCCATCGCGCTCCTCTTTTCTCTGGTCCATGTCCGCCGCCTTCGCCTACCTCCGCTGG                                                                                                                                                                                                                                                           ]


>consensus_5396#0 GCCGCCACCGCCACCGACGCCGCGGCCGCCGCCGGAATGAAGGCCCTCTCCGCCGCCGAC AGCGCGGCATCCCCGGCGACAAAGATCACCATCCCGTACTACTCCGCGGCGGCGGGGGCC GGCGAGGCGGGGCCGCCGTTCGGGAAGGGGCGGTACAAGGTGTGGGCCTTGGCGGCCATC GCGCTCCTCGCGCTCTGGTCCATGTCCGCCGCCTCCGCCTCCCTCCGCTGGTCCTCCGGC CGCTTCCTCCTCGCCGCCACCGCCTCCGAGGACCTCGACGCGCCCCTCCTCGACGACCTC GACTCGCTCGTACGCTCGTTACCTCCCACTCCACTCCCCTCTTCTTCCCCTTTTGCTTAT TGCCAACTGCTTGCTGCGTGGTCTCGTCTATATGCGCAATGCCTTGTTTGAGTAGGAATT GAATTTGAAACAGTTGTGAATTGCTATCGGTATTGCTTGGAGGTCTCTGAATAAGTGTGT TC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)